Selectively expanding subsets of T cells in mice by injection of interleukin-2/antibody complexes: implications for transplantation tolerance.

The biological activity of interleukin (IL)-2 and other cytokines in vivo can be augmented by binding to certain anti-cytokine monoclonal antibodies (mAb). Here, we review evidence on how IL-2/anti-IL-2 mAb complexes can be used to cause selective stimulation and expansion of certain T-cell subsets. With some anti-IL-2 mAbs, injection of IL-2/mAb complexes leads to expansion of CD8 T effector cells but not CD4 T regulatory cells (Tregs); these complexes exert less adverse side effects than soluble IL-2 and display powerful antitumor activity. Other IL-2/mAb complexes have minimal effects on CD8 T cells but cause marked expansion of Tregs. Preconditioning mice with these complexes leads to permanent acceptance of MHC-disparate pancreatic islets in the absence of immunosuppression.

Expertises croisées dans la dégénérescence maculaire liée à l'âge. Focus sur la physiopathologie, l'angiogenèse, les données pharmacologiques et cliniques [Review and expert opinion in age related macular degeneration. Focus on the pathophysiology, angiogenesis and pharmacological and clinical data].

Age related macular degeneration (AMD) is a pathological aging of the macula, brought about by the interaction of genetic and environmental factors. It induces geographic atrophy of the retina and/or choroidal neovascularization. In the latter, abnormal vessels develop from the choriocapillaris, with the involvement of VEGF (vascular endothelial growth factor). The VEGF family includes several factors, including VEGF-A, B, C, D, F and PlGF (placental growth factor). Their biological properties and their affinities to the VEGFR1, VEGFR2 and VEGFR3 receptors found on endothelial cells differ. Exudative AMD involves mainly VEGF-A and VEGF-R2. Anti-VEGF agents used in ophthalmology (ranibizumab, bevacizumab and aflibercept) are designed to primarily target this pathway. In vitro, all have sufficient affinity to their ligands. Their therapeutic efficacy must therefore be judged based on clinical criteria. In clinical practice, the minimum number of injections required for a satisfactory result appears to be comparable with all the three. The few available studies on therapeutic substitutions of anti-VEGF compounds suggest that some patients may benefit from substituting the anti-VEGF in cases of an unsatisfactory response to an initial molecule. Although local side effects, including increased risk of geographic atrophy, and systemic effects, including vascular accidents, have been suggested, these risks remain low, specially compared to the benefits of the treatment. Differences in safety between anti-VEGF are theoretically possible but unproven.

Postgraduate Symposium: Positive influence of nutritional alkalinity on bone health.

There is growing evidence that consumption of a Western diet is a risk factor for osteoporosis through excess acid supply, while fruits and vegetables balance the excess acidity, mostly by providing K-rich bicarbonate-rich foods. Western diets consumed by adults generate approximately 50-100 mEq acid/d; therefore, healthy adults consuming such a diet are at risk of chronic low-grade metabolic acidosis, which worsens with age as a result of declining kidney function. Bone buffers the excess acid by delivering cations and it is considered that with time an overstimulation of this process will lead to the dissolution of the bone mineral content and hence to reduced bone mass. Intakes of K, Mg and fruit and vegetables have been associated with a higher alkaline status and a subsequent beneficial effect on bone health. In healthy male volunteers an acid-forming diet increases urinary Ca excretion by 74% and urinary C-terminal telopeptide of type I collagen (C-telopeptide) excretion by 19% when compared with an alkali (base-forming) diet. Cross-sectional studies have shown that there is a correlation between the nutritional acid load and bone health measured by bone ultrasound or dual-energy X-ray absorptiometry. Few studies have been undertaken in very elderly women (>75 years), whose osteoporosis risk is very pertinent. The EVAluation of Nutrients Intakes and Bone Ultra Sound Study has developed and validated (n 51) an FFQ for use in a very elderly Swiss population (mean age 80.4 (sd 2.99) years), which has shown intakes of key nutrients (energy, fat, carbohydrate, Ca, Mg, vitamin C, D and E) to be low in 401 subjects. A subsequent study to assess net endogenous acid production (NEAP) and bone ultrasound results in 256 women aged > or = 75 years has shown that lower NEAP (P=0.023) and higher K intake (P=0.033) are correlated with higher bone ultrasound results. High acid load may be an important additional risk factor that may be particularly relevant in very elderly patients with an already-high fracture risk. The latter study adds to knowledge by confirming a positive link between dietary alkalinity and bone health indices in the very elderly. In a further study to complement these findings it has also been shown in a group of thirty young women that in Ca sufficiency an acid Ca-rich water has no effect on bone resorption, while an alkaline bicarbonate-rich water leads to a decrease in both serum parathyroid hormone and serum C-telopeptide. Further investigations need to be undertaken to study whether these positive effects on bone loss are maintained over long-term treatment. Mineral-water consumption could be an easy and inexpensive way of helping to prevent osteoporosis and could be of major interest for long-term prevention of bone loss.

Establishment of models to study mouse and human retinogenesis "in vitro" : isolation and characterization of retinal stem cells

SUMMARY IN FRENCH Les cellules souches sont des cellules indifférenciées capables a) de proliférer, b) de s'auto¬renouveller, c) de produire des cellules différenciées, postmitotiques et fonctionnelles (multipotencialité), et d) de régénérer le tissu après des lésions. Par exemple, les cellules de souches hematopoiétiques, situées dans la moelle osseuse, peuvent s'amplifier, se diviser et produire diverses cellules différenciées au cours de la vie, les cellules souches restant dans la moelle osseuse et consentant leur propriété. Les cellules souches intestinales, situées dans la crypte des microvillosités peuvent également régénérer tout l'intestin au cours de la vie. La rétine se compose de six classes de neurones et d'un type de cellule gliale. Tous ces types de cellules sont produits par un progéniteur rétinien. Le pic de production des photorécepteurs se situe autour des premiers jours postnatals chez la souris. A cette période la rétine contient les cellules hautement prolifératives. Dans cette étude, nous avons voulu analyser le phénotype de ces cellules et leur potentiel en tant que cellules souches ou progénitrices. Nous nous sommes également concentrés sur l'effet de certains facteurs épigéniques sur leur destin cellulaire. Nous avons observé que toutes les cellules prolifératives isolées à partir de neurorétines postnatales de souris expriment le marqueur de glie radiaire RC2, ainsi que des facteurs de transcription habituellement trouvés dans la glie radiaire (Mash1, Pax6), et répondent aux critères des cellules souches : une capacité élevée d'expansion, un état indifférencié, la multipotencialité (démontrée par analyse clonale). Nous avons étudié la différentiation des cellules dans différents milieux de culture. En l'absence de sérum, l'EGF induit l'expression de la β-tubulin-III, un marqueur neuronal, et l'acquisition d'une morphologie neuronale, ceci dans 15% des cellules présentes. Nous avons également analysé la prolifération de cellules. Seulement 20% des cellules incorporent le bromodéoxyuridine (BrdU) qui est un marqueur de division cellulaire. Ceci démontre que l'EGF induit la formation des neurones sans une progression massive du cycle cellulaire. Par ailleurs, une stimulation de 2h d'EGF est suffisante pour induire la différentiation neuronale. Certains des neurones formés sont des cellules ganglionnaires rétiniennes (GR), comme l'indique l'expression de marqueurs de cellules ganglionnaires (Ath5, Brn3b et mélanopsine), et dans de rare cas d'autres neurones rétiniens ont été observés (photorécepteurs (PR) et cellules bipolaires). Nous avons confirmé que les cellules souches rétiniennes tardives n'étaient pas restreintes au cours du temps et qu'elles conservent leur multipotencialité en étant capables de générer des neurones dits précoces (GR) ou tardifs (PR). Nos résultats prouvent que l'EGF est non seulement un facteur contrôlant le développement glial, comme précédemment démontré, mais également un facteur efficace de différentiation pour les neurones rétiniens, du moins in vitro. D'autre part, nous avons voulu établir si l'oeil adulte humain contient des cellules souches rétiniennes (CSRs). L'oeil de certains poissons ou amphibiens continue de croître pendant l'âge adulte du fait de l'activité persistante des cellules souches rétiniennes. Chez les poissons, le CSRs se situe dans la marge ciliaire (CM) à la périphérie de la rétine. Bien que l'oeil des mammifères ne se développe plus pendant la vie d'adulte, plusieurs groupes ont prouvé que l'oeil de mammifères adultes contient des cellules souches rétiniennes également dans la marge ciliaire plus précisément dans l'épithélium pigmenté et non dans la neurorétine. Ces CSRs répondent à certains critères des cellules souches. Nous avons identifié et caractérisé les cellules souches rétiniennes résidant dans l'oeil adulte humain. Nous avons prouvé qu'elles partagent les mêmes propriétés que leurs homologues chez les rongeurs c.-à-d. auto-renouvellement, amplification, et différenciation en neurones rétiniens in vitro et in vivo (démontré par immunocoloration et microarray). D'autre part, ces cellules peuvent être considérablement amplifiées, tout en conservant leur potentiel de cellules souches, comme indiqué par l'analyse de leur profil d'expression génique (microarray). Elles expriment également des gènes communs à diverses cellules souches: nucleostemin, nestin, Brni1, Notch2, ABCG2, c-kit et son ligand, aussi bien que cyclin D3 qui agit en aval de c-kit. Nous avons pu montré que Bmi1et Oct4 sont nécessaires pour la prolifération des CSRs confortant leur propriété de cellules souches. Nos données indiquent que la neurorétine postnatale chez la souris et l'épithélium pigmenté de la marge ciliaire chez l'humain adulte contiennent les cellules souches rétiniennes. En outre, nous avons développé un système qui permet d'amplifier et de cultiver facilement les CSRs. Ce modèle permet de disséquer les mécanismes impliqués lors de la retinogenèse. Par exemple, ce système peut être employé pour l'étude des substances ou des facteurs impliqués, par exemple, dans la survie ou dans la génération des cellules rétiniennes. Il peut également aider à disséquer la fonction de gènes ou les facteurs impliqués dans la restriction ou la spécification du destin cellulaire. En outre, dans les pays occidentaux, la rétinite pigmentaire (RP) touche 1 individu sur 3500 et la dégénérescence maculaire liée à l'âge (DMLA) affecte 1 % à 3% de la population âgée de plus de 60 ans. La génération in vitro de cellules rétiniennes est aussi un outil prometteur pour fournir une source illimitée de cellules pour l'étude de transplantation cellulaire pour la rétine. SUMMARY IN ENGLISH Stem cells are defined as undifferentiated cells capable of a) proliferation, b) self maintenance (self-renewability), c) production of many differentiated functional postmitotic cells (multipotency), and d) regenerating tissue after injury. For instance, hematopoietic stem cells, located in bone marrow, can expand, divide and generate differentiated cells into the diverse lineages throughout life, the stem cells conserving their status. In the villi crypt, the intestinal stem cells are also able to regenerate the intestine during their life time. The retina is composed of six classes of neurons and one glial cell. All these cell types are produced by the retinal progenitor cell. The peak of photoreceptor production is reached around the first postnatal days in rodents. Thus, at this stage the retina contains highly proliferative cells. In our research, we analyzed the phenotype of these cells and their potential as possible progenitor or stem cells. We also focused on the effect of epigenic factor(s) and cell fate determination. All the proliferating cells isolated from mice postnatal neuroretina harbored the radial glia marker RC2, expressed transcription factors usually found in radial glia (Mash 1, Pax6), and met the criteria of stem cells: high capacity of expansion, maintenance of an undifferentiated state, and multipotency demonstrated by clonal analysis. We analyzed the differentiation seven days after the transfer of the cells in different culture media. In the absence of serum, EGF led to the expression of the neuronal marker β-tubulin-III, and the acquisition of neuronal morphology in 15% of the cells. Analysis of cell proliferation by bromodeoxyuridine incorporation revealed that EGF mainly induced the formation of neurons without stimulating massively cell cycle progression. Moreover, a pulse of 2h EGF stimulation was sufficient to induce neuronal differentiation. Some neurons were committed to the retinal ganglion cell (RGC) phenotype, as revealed by the expression of retinal ganglion markers (Ath5, Brn3b and melanopsin), and in few cases to other retinal phenotypes (photoreceptors (PRs) and bipolar cells). We confirmed that the late RSCs were not restricted over-time and conserved multipotentcy characteristics by generating retinal phenotypes that usually appear at early (RGC) or late (PRs) developmental stages. Our results show that EGF is not only a factor controlling glial development, as previously shown, but also a potent differentiation factor for retinal neurons, at least in vitro. On the other hand, we wanted to find out if the adult human eye contains retina stem cells. The eye of some fishes and amphibians continues to grow during adulthood due to the persistent activity of retinal stem cells (RSCs). In fish, the RSCs are located in the ciliary margin zone (CMZ) at the periphery of the retina. Although, the adult mammalian eye does not grow during adult life, several groups have shown that the adult mouse eye contains retinal stem cells in the homologous zone (i.e. the ciliary margin), in the pigmented epithelium and not in the neuroretina. These RSCs meet some criteria of stem cells. We identified and characterized the human retinal stem cells. We showed that they posses the same features as their rodent counterpart i.e. they self-renew, expand and differentiate into retinal neurons in vitro and in vivo (indicated by immunostaining and microarray analysis). Moreover, they can be greatly expanded while conserving their sternness potential as revealed by the gene expression profile analysis (microarray approach). They also expressed genes common to various stem cells: nucleostemin, nestin, Bmil , Notch2, ABCG2, c-kit and its ligand, as well as cyclin D3 which acts downstream of c-kit. Furthermore, Bmil and Oct-4 were required for RSC proliferation reinforcing their stem cell identity. Our data indicate that the mice postnatal neuroretina and the adult pigmented epithelium of adult human ciliary margin contain retinal stem cells. We developed a system to easily expand and culture RSCs that can be used to investigate the retinogenesis. For example, it can help to screen drugs or factors involved, for instance, in the survival or generation of retinal cells. This could help to dissect genes or factors involved in the restriction or specification of retinal cell fate. In Western countries, retinitis pigmentosa (RP) affects 1 out of 3'500 individuals and age-related macula degeneration (AMD) strikes 1 % to 3% of the population over 60. In vitro generation of retinal cells is thus a promising tool to provide an unlimited cell source for cellular transplantation studies in the retina.

Incidence and types of illness when traveling to the tropics: a prospective controlled study of children and their parents.

Increasingly, families travel to tropical destinations exposing them to infectious agents and tropical diseases not encountered at home. We studied 157 children (0-16 years) and their adult relatives traveling to the tropics, who attended a pretravel clinic and were generally adherent to prescribed advice. Incidence rates of common illness in children and adults were respectively 16.9 (14.3-19.7) and 15.1 (12.7-17.8) episodes/100 person-weeks. Diarrhea, abdominal pain, and fever were the most frequent complaints. There was no significant difference in the incidence of morbid episodes between children and adults, except for fever (more frequent in children). Most episodes occurred in the first 10 days of travel. The similar incidence of morbidity in children and adults and the episodes' mildness challenge the view that it is unwise to travel with small children.

Das römische Theater von Avenches/Aventicum : Architektur, Baugeschichte, kulturhistorische Aspekte

Résumée Le théâtre romain d'Aventicum s'inscrit entre la petite ville moderne d'Avenches et le village de Donatyre, au pied d'une colline en pente douce délimitant au sud-est la plaine de la Broye. Il se situe à l'ouest des quartiers urbains antiques, construits selon un plan orthogonal, et s'intègre à une zone comptant divers temples et édifices publics. Dès l'hiver 1889/1890, l'Association Pro Aventico nouvellement fondée lança les premières fouilles archéologiques. Jusqu'en 1914, on dégagea les parties originales de la maçonnerie tout en assurant la restauration de l'édifice. En 1926/1927 et de 1939 à 1942 auront lieu d'autres fouilles de grande envergure, accompagnées de mesures de conservation. En 2001, la Fondation Pro Aventico lança un projet visant à étudier l'histoire de la construction ainsi que l'architecture du monument, alors connues en partie seulement. Sur la base de vestiges attestant la présence d'édifices antérieurs au théâtre, on définira pour la construction de ce dernier un terminus post quem entre 100 et 120 ap. J.-C. Comme l'indique l'étude du plan au sol, ce projet nécessita une importante planification. L'édifice lui-même se constitue d'une zone en demi-cercle réservée au public, dont les substructions indiquent qu'elle était partiellement isolée des autres. La cavea, subdivisée en trois secteurs concentriques, se termine par le bâtiment des halles et par les aditus; on relèvera que les rangées supérieures réservées aux spectateurs s'étendaient sans doute au-delà des halles et jusqu'à la façade. Les aditus permettaient d'accéder à la zone de l'orchestra et de la scène, dominée par une plate-forme de plan rectangulaire et bordée d'une proédrie. On disposait de deux voies d'accès différentes: l'une à l'avant, par les arcades des halles, et l'une à l'arrière, pratiquée dans le mur en demi-cercle; apparemment, on ne pouvait pénétrer que dans la partie centrale de ce dernier. On ne parvient à restituer que partiellement les voies de circulation dans les substructions de la cavea, en raison de leur piètre état de conservation. On a par contre pu repérer le deambulatorium, à la périphérie, ainsi que cinq vomitoria sur la première praecinctio et six vomitoria sur la seconde praecinctio. On peut admettre, sans toutefois disposer d'arguments à toute épreuve, que la troisième rangée, en haut, était accessible par des cages d'escaliers conduisant à la summa cavea. Ces hypothèses, fondées essentiellement sur le plan au sol de l'édifice et touchant aux voies de circulation, sont corroborées par une restitution des gradins des parties en élévation, aujourd'hui disparus. Quelques éléments architecturaux fournissent des arguments décisifs pour cette restitution, comme par exemple un bloc de gradin qui permet de conclure à un pendage de la cavea de 26.5°. On peut par ailleurs démontrer que le module architectural défini sur la base du plan au sol fut également appliqué lors de la planification de l'élévation. Grâce à des fragments de corniche, à deux chapiteaux de pilastre ornés de feuilles d'acanthe, à une base de pilastre engagée in situ dans la maçonnerie restaurée, et en tenant compte du module architectural, on peut proposer une reconstitution approximative de la composition de la façade de l'enceinte en demi-cercle. Si les structures architecturales révèlent que le théâtre fut planifié et édifié selon un seul et unique concept, on observe cependant quelques transformations et modifications au cours du temps. D'une part, on décèle en divers endroits des traces de réparation et de consolidation, visant sans doute à stabiliser un bâtiment ayant visiblement subi des dégâts. Par ailleurs, on a également entrepris des modifications structurelles ou fonctionnelles, comme l'édification ultérieure du postscaenium le long du mur de scène extérieur. Dans un contexte identique, on relèvera également deux murs flanquant les basiliques, qu'on suppose être en relation avec l'agrandissement du complexe architectural du temple du Cigognier et du théâtre, augmenté des deux temples édifiés au milieu du 2e s. ap. J.-C. au lieu-dit Au Lavoëx. L'excavation, au cours du dernier tiers du IIIe siècle ap. J.-C., d'un fossé de près de 6 m de large pour 1.5 m de profondeur tout autour de l'édifice fit du théâtre un véritable lieu fortifié. Au-dessus du fossé, on a pu relever une séquence stratigraphique témoignant d'une activité d'habitation à proximité du théâtre pour la période allant du IVe au VIIe siècle ap. J.-C. Il s'agit de l'un des rares cas où l'on peut, à Avenches, évoquer la présence d'un habitat de la période du Haut Moyen Age.

Salt-sensitive hypertension and cardiac hypertrophy in mice deficient in the ubiquitin ligase Nedd4-2.

Nedd4-2 has been proposed to play a critical role in regulating epithelial Na+ channel (ENaC) activity. Biochemical and overexpression experiments suggest that Nedd4-2 binds to the PY motifs of ENaC subunits via its WW domains, ubiquitinates them, and decreases their expression on the apical membrane. Phosphorylation of Nedd4-2 (for example by Sgk1) may regulate its binding to ENaC, and thus ENaC ubiquitination. These results suggest that the interaction between Nedd4-2 and ENaC may play a crucial role in Na+ homeostasis and blood pressure (BP) regulation. To test these predictions in vivo, we generated Nedd4-2 null mice. The knockout mice had higher BP on a normal diet and a further increase in BP when on a high-salt diet. The hypertension was probably mediated by ENaC overactivity because 1) Nedd4-2 null mice had higher expression levels of all three ENaC subunits in kidney, but not of other Na+ transporters; 2) the downregulation of ENaC function in colon was impaired; and 3) NaCl-sensitive hypertension was substantially reduced in the presence of amiloride, a specific inhibitor of ENaC. Nedd4-2 null mice on a chronic high-salt diet showed cardiac hypertrophy and markedly depressed cardiac function. Overall, our results demonstrate that in vivo Nedd4-2 is a critical regulator of ENaC activity and BP. The absence of this gene is sufficient to produce salt-sensitive hypertension. This model provides an opportunity to further investigate mechanisms and consequences of this common disorder.

T cell homeostasis.

The pool of mature T cells comprises a heterogeneous mixture of naive and memory CD4(+) and CD8(+) cells. These cells are long lived at a population level but differ markedly in their relative rates of turnover and survival. Here, we review how contact with exogenous stimuli, notably self MHC ligands and various gamma(c) cytokines, plays a decisive role in controlling normal T cell homeostasis.

Loss-of-function mutations of an inhibitory upstream ORF in the human hairless transcript cause Marie Unna hereditary hypotrichosis.

Marie Unna hereditary hypotrichosis (MUHH) is an autosomal dominant form of genetic hair loss. In a large Chinese family carrying MUHH, we identified a pathogenic initiation codon mutation in U2HR, an inhibitory upstream ORF in the 5' UTR of the gene encoding the human hairless homolog (HR). U2HR is predicted to encode a 34-amino acid peptide that is highly conserved among mammals. In 18 more families from different ancestral groups, we identified a range of defects in U2HR, including loss of initiation, delayed termination codon and nonsense and missense mutations. Functional analysis showed that these classes of mutations all resulted in increased translation of the main HR physiological ORF. Our results establish the link between MUHH and U2HR, show that fine-tuning of HR protein levels is important in control of hair growth, and identify a potential mechanism for preventing hair loss or promoting hair removal.

Genomics and the origin of species.

Speciation is a fundamental evolutionary process, the knowledge of which is crucial for understanding the origins of biodiversity. Genomic approaches are an increasingly important aspect of this research field. We review current understanding of genome-wide effects of accumulating reproductive isolation and of genomic properties that influence the process of speciation. Building on this work, we identify emergent trends and gaps in our understanding, propose new approaches to more fully integrate genomics into speciation research, translate speciation theory into hypotheses that are testable using genomic tools and provide an integrative definition of the field of speciation genomics.

Routine therapeutic drug monitoring in patients treated with 10-360 mg/day citalopram

From data collected during routine TDM, plasma concentrations of citalopram (CIT) and its metabolites demethylcitalopram (DCIT) and didemethylcitalopram (DDCIT) were measured in 345 plasma samples collected in steady-state conditions. They were from 258 patients treated with usual doses (20-60 mg/d) and from patients medicated with 80-360 mg/d CIT. Most patients had one or several comedications, including other antidepressants, antipsychotics, lithium, anticonvulsants, psychostimulants and somatic medications. Dose-corrected CIT plasma concentrations (C/D ratio) were 2.51 +/- 2.25 ng mL-1 mg-1 (n = 258; mean +/- SD). Patients >65 years had significantly higher dose-corrected CIT plasma concentrations (n = 56; 3.08 +/- 1.35 ng mL-1 mg-1) than younger patients (n = 195; 2.35 +/- 2.46 ng mL-1 mg-1) (P = 0.03). CIT plasma concentrations in the generally recommended dose range were [mean +/- SD, (median)]: 57 +/- 64 (45) ng/mL (10-20 mg/d; n = 64), 117 +/- 95 (91) ng/mL (21-60 mg/d; n = 96). At higher than usual doses, the following concentrations of CIT were measured: 61-120 mg/d CIT, 211 +/- 103 (190) ng/mL (n = 93); 121-200 mg/d: 339 +/- 143 (322) ng/mL (n = 70); 201-280 mg/d: 700 +/- 408 (565) ng/mL (n = 18); 281-360 mg/d: 888 +/- 620 (616) ng/mL (n = 4). When only one sample per patient (at the highest daily dose if repeated dosages) is considered, there is a linear and significant correlation (n = 48, r = 0.730; P < 0.001) between daily dose (10-200 mg/d) and CIT plasma concentrations. In experiments with dogs, DDCIT was reported to affect the QT interval when present at concentrations >300 ng/mL. In this study, DDCIT concentration reached 100 ng/mL in a patient treated with 280 mg/d CIT. Twelve other patients treated with 140-320 mg/d CIT had plasma concentrations of DDCIT within the range 52-73 ng/mL. In a subgroup comprised of patients treated with > or =160 mg/d CIT and with CIT plasma concentrations < or =300 ng/mL, and patients treated with < or =200 mg/d CIT and CIT plasma concentrations > or = 600 ng/mL, the enantiomers of CIT and DCIT were also analyzed. The highest S-CIT concentration measured in this subgroup was 327 ng/mL in a patient treated with 140 mg/d CIT, but the highest S-CIT concentration (632 ng/mL) was measured in patient treated with 360 mg/d CIT. In conclusion, there is a highly linear correlation between CIT plasma concentrations and CIT doses, well above the usual dose range.

A Picture of Performance Goals in the Social Plenum: The Interpersonal Antecedents and Consequences of Performance Goals

Bien que les activités où la compétence est un enjeu (p. ex. : problème académique) prennent souvent place dans des contextes interpersonnels (p. ex. : classe), hiérarchiques (p. ex. : enseignant-e/élèves), et spécifiques en termes de normes et de valeurs (p. ex. : culture), l'étude des buts de performance-le désir de se montrer compétent-e relativement à autrui-a le plus souvent été conduite au seul niveau intrapersonnel. S'appuyant sur le modèle transactionnel du stress et du coping, le modèle circumplexe des comportements interpersonnels, ainsi que sur la théorie de l'élaboration du conflit, la première partie de cette thèse révèle les conséquences interpersonnelles des buts de performance sur la régulation d'un comportement spécifique, à savoir le conflit sociocognitif (c.-à-d., une situation de confrontation avec un intéractant en désaccord) : les buts de performance-approche-le désir d'être meilleur-e qu'autrui-prédisent une régulation du conflit fortement agentique (dominante), soit la validation de son point de vue au détriment de celui de l'intéractant (que nous désignons régulation compétitive) ; alors que les buts de performance-évitement-le désir de ne pas être moins bon-ne qu'autrui-prédisent une régulation du conflit faiblement agentique (soumise), soit l'invalidation de son point de vue au bénéfice de celui de l'intéractant (que nous désignons régulation protective). De plus, les effets susmentionnés augmentent à mesure que l'intéractant est présenté comme supérieurement (vs. similairement) compétent. S'appuyant sur la littérature sur les structures de buts de groupe, et celle sur la socialisation des valeurs, la seconde partie de cette thèse révèle les antécédents interpersonnels des buts de performance, et plus spécifiquement le rôle du superviseur dans la socialisation des buts de performance : les buts de performance-approche d'un superviseur sont positivement associés avec l'émergence au cours du temps des buts de performance-approche de ses subordonnés (particulièrement lorsqu'ils se perçoivent comme compétents) et celle de leurs buts de performance-évitement (particulièrement lorsqu'ils se perçoivent comme incompétents). En outre, ce phénomène consistant en un processus de socialisation, les effets susmentionnés augmentent lorsque l'identification à l'endogroupe des subordonnées augmente, et lorsque l'adhésion aux valeurs culturelles occidentales dominantes (c.-à-d., rehaussement de soi) du superviseur augmente. Dans leur ensemble, ces résultats soulignent la nécessité d'étudier les buts dans leur plenum social, autrement dit, en adoptant une perspective interpersonnelle (c.-à-d., étudier les effets des buts entre les individus), positionnelle (c.-à-d., entre des individus de différentes positions sociales), et idéologique (c.- à-d., entre des individus se conformant à des normes spécifiques et adhérant à des valeurs spécifiques). -- Although competence-relevant activities (e.g., solving an academic problem) are often embedded in interpersonal (e.g., classroom), hierarchical (e.g., teacher/pupils), and norm-/value-specific (e.g., culture) settings, the study of performance goals-the desire to demonstrate competence relative to others-has mostly been conducted at the intrapersonal level alone. Drawing on the transactional model of stress and coping, the circumplex model of interpersonal behaviors, as well as on the conflict elaboration theory, the first part of this thesis reveals the interpersonal consequences of performance goals on the regulation of a specific behavior, namely socio-cognitive conflict (i.e., a situation of confrontation with a disagreeing interactant): Performance-approach goals-the desire to outperform others- predicted a highly agentic (dominant) conflict regulation, that is, the validation of one's point of view at the expense of that of the interactant (which we labeled competitive regulation); whereas performance-avoidance goals-the desire not to be outperformed by others- predicted a poorly agentic (submissive) conflict regulation, that is, the invalidation of one's point of view to the benefit of that of the interactant (which we labeled protective regulation). Furthermore, both the aforementioned effects were found to increase when the interactant was presented as being superiorly (vs. equally) in competence. Drawing on the literature on group goal structure, as well as on research on socialization of supervisors-based values, the second part of this thesis reveals the interpersonal antecedents of performance-based goals endorsement, focusing-more specifically-on the role of group-supervisors in performance goals socialization: Supervisor's performance-approach goals were positively associated with the emergence over time of subordinates' performance-approach (especially when perceiving themselves as competent) and -avoidance goals (especially when perceiving themselves as incompetent). Furthermore, providing evidence that this phenomenon essentially reflects a socialization process, both the aforementioned effects were found to increase as subordinates' in-group identification increased, and as supervisors' adherence to dominant Western values (i.e., self-enhancement values) increased. Taken together, these results advocate the need to study performance goals in their social plenum, that is, adopting an interpersonal (i.e., studying the effects of goals between individuals), positional (i.e., between individuals from different social positions), and ideological (i.e., between individuals following specific norms and endorsing specific values) perspective.

MADAP, a flexible clustering tool for the interpretation of one-dimensional genome annotation data.

A recurring task in the analysis of mass genome annotation data from high-throughput technologies is the identification of peaks or clusters in a noisy signal profile. Examples of such applications are the definition of promoters on the basis of transcription start site profiles, the mapping of transcription factor binding sites based on ChIP-chip data and the identification of quantitative trait loci (QTL) from whole genome SNP profiles. Input to such an analysis is a set of genome coordinates associated with counts or intensities. The output consists of a discrete number of peaks with respective volumes, extensions and center positions. We have developed for this purpose a flexible one-dimensional clustering tool, called MADAP, which we make available as a web server and as standalone program. A set of parameters enables the user to customize the procedure to a specific problem. The web server, which returns results in textual and graphical form, is useful for small to medium-scale applications, as well as for evaluation and parameter tuning in view of large-scale applications, requiring a local installation. The program written in C++ can be freely downloaded from ftp://ftp.epd.unil.ch/pub/software/unix/madap. The MADAP web server can be accessed at http://www.isrec.isb-sib.ch/madap/.