Sleep deprivation effects on circadian clock gene expression in the cerebral cortex parallel electroencephalographic differences among mouse strains.

Sleep deprivation (SD) results in increased electroencephalographic (EEG) delta power during subsequent non-rapid eye movement sleep (NREMS) and is associated with changes in the expression of circadian clock-related genes in the cerebral cortex. The increase of NREMS delta power as a function of previous wake duration varies among inbred mouse strains. We sought to determine whether SD-dependent changes in circadian clock gene expression parallel this strain difference described previously at the EEG level. The effects of enforced wakefulness of incremental durations of up to 6 h on the expression of circadian clock genes (bmal1, clock, cry1, cry2, csnk1epsilon, npas2, per1, and per2) were assessed in AKR/J, C57BL/6J, and DBA/2J mice, three strains that exhibit distinct EEG responses to SD. Cortical expression of clock genes subsequent to SD was proportional to the increase in delta power that occurs in inbred strains: the strain that exhibits the most robust EEG response to SD (AKR/J) exhibited dramatic increases in expression of bmal1, clock, cry2, csnkIepsilon, and npas2, whereas the strain with the least robust response to SD (DBA/2) exhibited either no change or a decrease in expression of these genes and cry1. The effect of SD on circadian clock gene expression was maintained in mice in which both of the cryptochrome genes were genetically inactivated. cry1 and cry2 appear to be redundant in sleep regulation as elimination of either of these genes did not result in a significant deficit in sleep homeostasis. These data demonstrate transcriptional regulatory correlates to previously described strain differences at the EEG level and raise the possibility that genetic differences underlying circadian clock gene expression may drive the EEG differences among these strains.

Monitoring of illicit pill distribution networks using an image collection exploration framework

This paper proposes a novel approach for the analysis of illicit tablets based on their visual characteristics. In particular, the paper concentrates on the problem of ecstasy pill seizure profiling and monitoring. The presented method extracts the visual information from pill images and builds a representation of it, i.e. it builds a pill profile based on the pill visual appearance. Different visual features are used to build different image similarity measures, which are the basis for a pill monitoring strategy based on both discriminative and clustering models. The discriminative model permits to infer whether two pills come from the same seizure, while the clustering models groups of pills that share similar visual characteristics. The resulting clustering structure allows to perform a visual identification of the relationships between different seizures. The proposed approach was evaluated using a data set of 621 Ecstasy pill pictures. The results demonstrate that this is a feasible and cost effective method for performing pill profiling and monitoring.

Parallel imaging with phase scrambling.

PURPOSE: Most existing methods for accelerated parallel imaging in MRI require additional data, which are used to derive information about the sensitivity profile of each radiofrequency (RF) channel. In this work, a method is presented to avoid the acquisition of separate coil calibration data for accelerated Cartesian trajectories. METHODS: Quadratic phase is imparted to the image to spread the signals in k-space (aka phase scrambling). By rewriting the Fourier transform as a convolution operation, a window can be introduced to the convolved chirp function, allowing a low-resolution image to be reconstructed from phase-scrambled data without prominent aliasing. This image (for each RF channel) can be used to derive coil sensitivities to drive existing parallel imaging techniques. As a proof of concept, the quadratic phase was applied by introducing an offset to the x(2) - y(2) shim and the data were reconstructed using adapted versions of the image space-based sensitivity encoding and GeneRalized Autocalibrating Partially Parallel Acquisitions algorithms. RESULTS: The method is demonstrated in a phantom (1 × 2, 1 × 3, and 2 × 2 acceleration) and in vivo (2 × 2 acceleration) using a 3D gradient echo acquisition. CONCLUSION: Phase scrambling can be used to perform parallel imaging acceleration without acquisition of separate coil calibration data, demonstrated here for a 3D-Cartesian trajectory. Further research is required to prove the applicability to other 2D and 3D sampling schemes. Magn Reson Med, 2014. © 2014 Wiley Periodicals, Inc.

Inherently self-calibrating non-Cartesian parallel imaging.

The use of self-calibrating techniques in parallel magnetic resonance imaging eliminates the need for coil sensitivity calibration scans and avoids potential mismatches between calibration scans and subsequent accelerated acquisitions (e.g., as a result of patient motion). Most examples of self-calibrating Cartesian parallel imaging techniques have required the use of modified k-space trajectories that are densely sampled at the center and more sparsely sampled in the periphery. However, spiral and radial trajectories offer inherent self-calibrating characteristics because of their densely sampled center. At no additional cost in acquisition time and with no modification in scanning protocols, in vivo coil sensitivity maps may be extracted from the densely sampled central region of k-space. This work demonstrates the feasibility of self-calibrated spiral and radial parallel imaging using a previously described iterative non-Cartesian sensitivity encoding algorithm.

Patterns of calcium-binding proteins support parallel and hierarchical organization of human auditory areas.

The human primary auditory cortex (AI) is surrounded by several other auditory areas, which can be identified by cyto-, myelo- and chemoarchitectonic criteria. We report here on the pattern of calcium-binding protein immunoreactivity within these areas. The supratemporal regions of four normal human brains (eight hemispheres) were processed histologically, and serial sections were stained for parvalbumin, calretinin or calbindin. Each calcium-binding protein yielded a specific pattern of labelling, which differed between auditory areas. In AI, defined as area TC [see C. von Economo and L. Horn (1930) Z. Ges. Neurol. Psychiatr.,130, 678-757], parvalbumin labelling was dark in layer IV; several parvalbumin-positive multipolar neurons were distributed in layers III and IV. Calbindin yielded dark labelling in layers I-III and V; it revealed numerous multipolar and pyramidal neurons in layers II and III. Calretinin labelling was lighter than that of parvalbumin or calbindin in AI; calretinin-positive bipolar and bitufted neurons were present in supragranular layers. In non-primary auditory areas, the intensity of labelling tended to become progressively lighter while moving away from AI, with qualitative differences between the cytoarchitectonically defined areas. In analogy to non-human primates, our results suggest differences in intrinsic organization between auditory areas that are compatible with parallel and hierarchical processing of auditory information.

Characterization of a new clinical yeast species, Candida tunisiensis sp. nov., isolated from a strain collection from Tunisian hospitals.

From a collection of yeast isolates isolated from patients in Tunisian hospitals between September 2006 and July 2010, the yeast strain JEY63 (CBS 12513), isolated from a 50-year-old male that suffered from oral thrush, could not be identified to the species level using conventional methods used in clinical laboratories. These methods include matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), germ tube formation, and the use of CHROMagar Candida and metabolic galleries. Sequence analysis of the nuclear rRNA (18S rRNA, 5.8S rRNA, and 26S rRNA) and internal transcribed spacer regions (ITS1 and ITS2) indicated that the ribosomal DNA sequences of this species were not yet reported. Multiple gene phylogenic analyses suggested that this isolate clustered at the base of the Dipodascaceae (Saccharomycetales, Saccharomycetes, and Ascomycota). JEY63 was named Candida tunisiensis sp. nov. according to several phenotypic criteria and its geographical origin. C. tunisiensis was able to grow at 42°C and does not form chlamydospores and hyphae but could grow as yeast and pseudohyphal forms. C. tunisiensis exhibited most probably a haploid genome with an estimated size of 10 Mb on at least three chromosomes. Using European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) and Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) Candida albicans susceptibility breakpoints as a reference, C. tunisiensis was resistant to fluconazole (MIC = 8 μg/ml), voriconazole (MIC = 0.5 μg/ml), itraconazole (MIC = 16 μg/ml), and amphotericin B (MIC = 4 μg/ml) but still susceptible to posaconazole (MIC = 0.008 μg/ml) and caspofungin (MIC = 0.5 μg/ml). In conclusion, MALDI-TOF MS permitted the early selection of an unusual isolate, which was still unreported in molecular databases but could not be unambiguously classified based on phylogenetic approaches.

The acquisition of pronouns by French children: A parallel study of production and comprehension

This study examines syntactic and morphological aspects of the production and comprehension of pronouns by 99 typically developing French-speaking children aged 3 years, 5 months to 6 years, 5 months. A fine structural analysis of subject, object, and reflexive clitics suggests that whereas the object clitic chain crosses the subject chain, the reflexive clitic chain is nested within it. We argue that this structural difference introduces differences in processing complexity, chain crossing being more complex than nesting. In support of this analysis, both production and comprehension experiments show that children have more difficulty with object than with reflexive clitics (with more omissions in production and more erroneous judgments in sentences involving Principle B in comprehension). Concerning the morphological aspect, French subject and object pronouns agree in gender with their referent. We report serious difficulties with pronoun gender both in production and comprehension in children around the age of 4 (with nearly 30% errors in production and chance level judgments in comprehension), which tend to disappear by age 6. The distribution of errors further suggests that the masculine gender is processed as the default value. These findings provide further insights into the relationship between comprehension and production in the acquisition process.

La Manie épistolaire : d'une analyse textuelle à une poétique des lettres asilaires conservées à la Collection de l'Art Brut

Relevant globalement de l'analyse de discours, cette thèse se propose en deux temps (questions de méthode, puis analyses) d'étudier dans le détail et d'interpréter des lettres asilaires initialement gardées au sein d'archives médicales de différents hôpitaux psychiatriques de Suisse romande et désormais conservées à la Collection de l'Art Brut, à Lausanne. Ce transfert institutionnel noue le problème central posé par le corpus recueilli : quelle lecture accorder à ces productions qui, dans ces conditions, semblent échapper à toute catégorisation générique a priori ou, en reformulant l'interrogation, en quoi est-ce que les oeuvres d'art brut dépassent-elles leur statut de documents cliniques? Pour répondre à cette ample question, il faut une théorie du langage qui conceptualise des modalités de réception. En l'occurrence, les textes retenus sont abordés à partir de la théorie de Yénonciation, élaborée au moins depuis Emile Benveniste, qui implique de saisir le langage non à partir de la perspective de l'interprété mais depuis celle de l'interprétant.¦Une fois ce fondement énonciatif posé, de nombreux problèmes peuvent être posés et permettent d'architecturer le travail. L'énonciation installe en premier lieu l'univers du discours, qui implique de tenir globalement compte du primat de l'interdiscursivité, autant dans le geste raisonné de constitution du corpus que dans la conduite de son interprétation. En l'occurrence, la thématique de la folie est ici centrale : les production retenues ont en effet d'abord fait l'objet du diagnostic psychiatrique et y ont eu valeur de symptômes ; elles ont ensuite intégré les rangs de la Collection de l'Art Brut, dont les principaux artisans (Jean Dubuffet et Michel Thévoz en tête) ont beaucoup insisté sur le renouvellement du regard à apporter sur la folie, celle-ci y étant considérée pour ses vertus créatrices et contestatrices.¦Le cadrage (doublement) dialogique du corpus implique à grands traits de lier la folie et le langage ou, plus spécifiquement, de faire de la folie non plus une pathologie mais un problème de (théorie du) langage. Pour conceptualiser ce passage, les notions de manie et de manière (Dessons) sont primordiales. La première est dotée d'une mémoire psychiatrique et fait de la folie une maladie mentale dont souffre un individu doté de son empirie et d'une psycho-biologie. La seconde, en revanche, est énonciative et concerne la subjectivation d'un langage, si spécifique qu'il implique de sortir des catégories linguistiques conventionnelles pour le désigner et le décrire, inaptes à le rationaliser. La manière rejoint donc la folie parce qu'elle rend, littéralement, fou (elle déstabilise nos grilles préformatées de lecture). En ce sens, elle implique, dans le discours, de passer d'une énonciation qui n'est pas une simple interlocution (où le langage permet à un sujet de communiquer à propos de quelque chose à un autre sujet) à une énonciation dont la réception fait problème.¦Pour saisir cette énonciation dans le discours, il importe de se débarrasser d'une rhétorique des genres pour passer, radicalement, à une poétique de Γénonciation. La rhétorique ne peut appréhender la spécificité des textes retenus ou, autrement dit, leur mode propre de signifier, pour plusieurs raisons : elle se centre sur les effets provoqués par le discours sur un « auditoire » en vue de certaines visées préalables, elle instrumentalise le langage à des fins uniquement communicatives, elle repose sur un réalisme linguistique (le rapport presque naturel entre le signifiant et le concept qu'il est censé transcrire de façon transparente), elle n'a pas de théorie du sujet (sinon un bien trop flou « locuteur »).¦Une poétique de l'énonciation offre « au contraire » (l'opposition est caricaturale ici) l'avantage de traiter dans le discours d'une énonciation qui n'est pas pensée à partir de modèles collectifs (genres, signe linguistique, ...). Dans ce dernier cas, l'appréhension du discours ne peut considérer que des variations (quand ce n'est pas des « déviances » ou des symptômes) internes à tel ou tel modèle générique, pas remis en cause comme tel. En somme, une poétique renverse la pensée du langage : elle ne l'appréhende plus à partir de catégories qui lui sont externes, mais s'intéresse à des « procédés » indésignables a priori, ou, plus globalement, à un mode spécifique de signifier, c'est-à-dire qu'il ne « fait sens » que pour un seul langage - et pas un autre.¦Le langage est alors si subjectivé qu'il confond son statut d'objet avec celui de sujet. Pour preuve, on ne le désigne plus dans le discours à partir d'une catégorie sociale générique (« c'est une lettre »), mais à partir d'un « nom d'auteur » ou, plus spécifiquement, une manière (« c'est un Aloïse », par exemple pour le cas d'une oeuvre apparentée à l'art brut), sujet théorique de l'énonciation artistique. Cette forme-sujet, comme la nommait Henri Meschonnic dans sa théorie dite du poème, se reconnaît dans l'unité (sémantique) du texte et ouvre dans le discours à un système-sujet d'organisation identifiable à l'échelle élargie d'une oeuvre. Elle permet d'inscrire pleinement la démarche dans le cadre englobant non seulement de l'analyse du discours mais aussi d'une anthropologie linguistique.¦En somme, l'objet au centre de nos préoccupations fait de ce passage (d'une rhétorique à une poétique) un problème épistémologique. Les oeuvres d'art brut impliquent de passer d'une discursivité à une autre, d'une folie psychiatrique à une folie artistique, déplaçant la folie dans le champ social. Le langage dessine bel et bien la société. Ce travail permet finalement de comprendre la contribution du langage à la construction des réalités sociales, dans l'élaboration du sens qui s'y fabrique. Son orientation herméneutique aboutit à identifier une nouvelle figure de l'altérité, inscrite au sein même de la pensée linguistique.