Identification of Propionibacterium avidum from a breast abscess: an overlooked etiology of clinically significant infections.

We report the case of a 37-year-old previously healthy woman diagnosed with a breast abscess due to Propionibacterium avidum after breast reduction surgery. This case emphasizes the potential pathogenicity and morbidity associated with this commensal skin organism.

Identification of imaging selection patterns in acute ischemic stroke patients and the influence on treatment and clinical trial enrollment decision making.

BACKGROUND AND PURPOSE: For the STroke Imaging Research (STIR) and VISTA-Imaging Investigators The purpose of this study was to collect precise information on the typical imaging decisions given specific clinical acute stroke scenarios. Stroke centers worldwide were surveyed regarding typical imaging used to work up representative acute stroke patients, make treatment decisions, and willingness to enroll in clinical trials. METHODS: STroke Imaging Research and Virtual International Stroke Trials Archive-Imaging circulated an online survey of clinical case vignettes through its website, the websites of national professional societies from multiple countries as well as through email distribution lists from STroke Imaging Research and participating societies. Survey responders were asked to select the typical imaging work-up for each clinical vignette presented. Actual images were not presented to the survey responders. Instead, the survey then displayed several types of imaging findings offered by the imaging strategy, and the responders selected the appropriate therapy and whether to enroll into a clinical trial considering time from onset, clinical presentation, and imaging findings. A follow-up survey focusing on 6 h from onset was conducted after the release of the positive endovascular trials. RESULTS: We received 548 responses from 35 countries including 282 individual centers; 78% of the centers originating from Australia, Brazil, France, Germany, Spain, United Kingdom, and United States. The specific onset windows presented influenced the type of imaging work-up selected more than the clinical scenario. Magnetic Resonance Imaging usage (27-28%) was substantial, in particular for wake-up stroke. Following the release of the positive trials, selection of perfusion imaging significantly increased for imaging strategy. CONCLUSIONS: Usage of vascular or perfusion imaging by Computed Tomography or Magnetic Resonance Imaging beyond just parenchymal imaging was the primary work-up (62-87%) across all clinical vignettes and time windows. Perfusion imaging with Computed Tomography or Magnetic Resonance Imaging was associated with increased probability of enrollment into clinical trials for 0-3 h. Following the release of the positive endovascular trials, selection of endovascular only treatment for 6 h increased across all clinical vignettes.

Identification of Low-Risk Patients with Acute Symptomatic Pulmonary Embolism for Outpatient Therapy.

RATIONALE: Patients with acute symptomatic pulmonary embolism (PE) deemed to be at low risk for early complications might be candidates for partial or complete outpatient treatment. OBJECTIVES: To develop and validate a clinical prediction rule that accurately identifies patients with PE and low risk of short-term complications and to compare its prognostic ability with two previously validated models (i.e., the Pulmonary Embolism Severity Index [PESI] and the Simplified PESI [sPESI]) METHODS: Multivariable logistic regression of a large international cohort of patients with PE prospectively enrolled in the RIETE (Registro Informatizado de la Enfermedad TromboEmbólica) registry. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: All-cause mortality, recurrent PE, and major bleeding up to 10 days after PE diagnosis were determined. Of 18,707 eligible patients with acute symptomatic PE, 46 (0.25%) developed recurrent PE, 203 (1.09%) bled, and 471 (2.51%) died. Predictors included in the final model were chronic heart failure, recent immobilization, recent major bleeding, cancer, hypotension, tachycardia, hypoxemia, renal insufficiency, and abnormal platelet count. The area under receiver-operating characteristic curve was 0.77 (95% confidence interval [CI], 0.75-0.78) for the RIETE score, 0.72 (95% CI, 0.70-0.73) for PESI (P < 0.05), and 0.71 (95% CI, 0.69-0.73) for sPESI (P < 0.05). Our RIETE score outperformed the prognostic value of PESI in terms of net reclassification improvement (P < 0.001), integrated discrimination improvement (P < 0.001), and sPESI (net reclassification improvement, P < 0.001; integrated discrimination improvement, P < 0.001). CONCLUSIONS: We built a new score, based on widely available variables, that can be used to identify patients with PE at low risk of short-term complications, assisting in triage and potentially shortening duration of hospital stay.

Identification of novel factors during the establishment of the Casparian strip in the endodermis

Multicellular organisms rely on specialized tissues that allow for the controlled exchange of matter with their surrounding. In order to function properly, these tissues need to establish a tight connection between the individual cells to prevent uncontrolled passive diffusion across the extracellular space. In animals, these connections are called tight and adherens junctions and are a critical feature of epithelia. These connections, however, rely on direct protein-protein interaction of plasma membrane proteins of adjacent cells. Such a mechanism is not possible in plants due to the cell wall, which encases the individual cells. In order to absorb nutrients, while simultaneously preventing uncontrolled diffusion between cells, land plants have evolved the root endodermis, which is functionally equivalent to animal epithelia. Its cells are surrounded by a precisely localized and aligned, ring-like lignin deposition, called the Casparian strip, and therefore tightly connected between each other. Very little was known about the development of the endodermis and the Casparian strip until recently. In the meantime, however, we have identified a family of endodermis- specific proteins, the CASPs, which recruits extracellular proteins the specific Casparian strip membrane domain (CSD) to locally synthesize lignin in the cell wall. Yet, we hardly knew any specifics on how the CSD is initially defined and how the critically important CASPs are being recruited to it. We therefore conducted a forward genetic screen on the localization of CASPI-GFP in order to identify novel mutants, which lack a defined CSD. We identified 48 mutants, which fell into 15 different complementation groups. While some of the isolated genes had previously been identified through different approaches, nine novel genes, which had never been implicated in CSD development and maintenance, were identified. One of them, LORD OF THE RINGS 2 (.LOTR2) is described to greater detail in this work. LOTR2 encodes for EX070A1, a protein of the evolutionary conserved exocyst complex. This complex has frequently been implicated in various secretory processes across kingdoms. In Arabidopsis, it transiently defines the positioning of CASPI-GFP. We have performed a detailed analysis of the dynamics of EX070A1 and CASPI-GFP, including studies with other markers and propose a mechanism, by which the cytosolic EX070A1 transiently defines a plasma membrane domain to recruit transmembrane proteins, which then recruit extracellular enzymes for localized cell wall modification. Considering the ubiquitous expression of EX070A1, we think that this mechanism is potentially of importance not only for the endodermis and the Casparian strip but also for many other tissues, in which the cell wall becomes locally modified. In fact, many other tissues with secondary cell wall modifications contain proteins very similar to the CASPs. It will be interesting to see to which degree this mechanism is employed in other tissues. As for the endodermis, we have now identified the first gene, which is not specific to the endodermis but shows endodermis-specific dynamics. This might give us a better insight on how the plant modulates this ubiquitously present factor in a cell- or tissue-type specific manner. Considering the knowledge, mutants and tools, which are available to us for investigating the endodermis, the Casparian strip, the exocyst complex and EX070A1 might be just the right experimental system to address these questions. -- Les organismes multicellulaires dépendent des tissues spécialisé pour l'échange contrôlé entre eux et leur environnement. Pour leur bon fonctionnement, les cellules de ces tissus ont besoin d'être très étroitement assemblés afin de prévenir la diffusion non-contrôlée à travers l'espace extracellulaire. Chez les animaux, ces connexions sont appelées jonctions serrées et jonctions adhérentes. Ces jonctions dépendent des interactions directes entre les protéines des cellules voisines. Ceci n'est pas possible chez les plantes à cause de la paroi cellulaire qui recouvre chaque cellule individuellement. Pour absorber les nutriments et en même temps empêcher la diffusion non-contrôlé entre cellules, les plantes ont évolué 1'endoderme dans la racine, qui est fonctionnellement équivalent aux épithéliums des animaux. Les cellules de l'endoderme sont ceinturées par une déposition de lignine très précisément localisées comme un anneau et alignées entre les cellules, et qui, donc, connecte étroitement les cellules avoisinante: Le cadre de Caspary. Peu était connu sur le développement de l'endoderme et le cadre de Caspaiy jusqu'à il y a quelques années. Récemment, pourtant, nous avons identifié une famille de protéines spécifiques à l'endoderme, les CASPs, qui définissent le domaine membranaire du cadre de Caspaiy (CSD). Les CASPs recrutent les protéines extracellulaires nécessaire à la synthèse du cadre de Caspary vers une région limité dans la paroi cellulaire. Pourtant, on connaît très peu les processus spécifiques concernant la définition initiale du CSD et comment les CASPs, qui ont une importance cruciale, sont recrutées vers ce domaine. Par conséquent nous avons mené un crible génétique sur la localisation du CASPI- GFP, qui sert comme marqueur pour le CSD. Notre but étant d'isoler de nouveaux mutants affectés dans l'établissement du CSD. Nous avons identifié 48 mutants, en 15 groupes de complémentation. Bien que certains des gènes isolés étaient déjà impliqué dans la formation du cadre de Caspary, neuf nouveaux gènes n'ayant jamais été impliqués dans le développement ou la maintenance du CSD ont pu être identifiés. Un de ces gènes, LORD OF THE RINGS2 (LOTR2) sera décrit plus en détail dans cette étude. LOTR2 code pour EX070A1, qui est une protéine, du complexe exocyste. Ce complexe de protéines a très bien été conservé au cours de l'évolution. Il était souvent impliqué dans plusieurs processus de sécrétion dans toutes les branches de la vie. Chez Arabidopsis, EX070A1 définit la position du CSD d'une façon transitoire et recrute CASP1- GFP. Nous avons mené une analyse détaillée des dynamiques d'EX070Al et CASPI-GFP ainsi que, des études avec des autres mutants. Nous proposons un mécanisme, d'après lequel EX070A1, recruté du cytosol, définit un domaine dans la membrane plasmique pour localiser des protéines transmembranaires, ces dernières ensuite recruteront des enzymes extracellulaires pour la modification locale de la paroi cellulaire. Vu qu'EX070A1 est exprimé dans toute dans la plante, nous pensons que ce mécanisme est potentiellement important non seulement pour l'endoderme et le cadre de Caspary, mais aussi pour les autres tissus où la paroi cellulaire doit être localement modifiée. En effet, plusieurs autres tissus contiennent des protéines très similaires aux CASPs. Il serait intéressant de voir à quelle dégrée ce mécanisme est également utilisé dans ces tissues. En ce qui concerne l'endoderme, nous avons maintenant identifié le premier gène qui n'est pas exprimé spécifiquement dans l'endoderme, mais qui montre tout de même une dynamique caractéristique dans ce tissu. Il serait intéressant de voir comment la plante peut moduler ce facteur omniprésent d'une façon spécifique. Vu les connaissances, les mutants et les outils qu'on a maintenant à notre disposition, l'endoderme et son cadre de Caspary, le complexe exocyste et EX070A1 sont probablement des bons systèmes expérimentaux pour étudier ces questions. -- Identification des nouveaux facteurs pendant l'établissement du cadre de Caspary dans l'endoderme. Lothar Kalmbach, Département de Biologie Moléculaire Végétale (DBMV), Université de Lausanne. Comme tous les autres organismes multicellulaires, les plantes terrestres dépendent de tissus spécialisés pour l'échange contrôlé avec leur environnement. Ces tissus sont importants pour l'absorption des nutriments mais également pour éviter l'influx de composés toxiques. Chez les plantes, ce tissu se trouve dans la racine. C'est l'endoderme. Grâce au cadre de Caspary, qui permet une forte connexion entre les cellules au niveau de leur paroi, l'endoderme empêche les éléments toxiques d'entrer dans le système vasculaire. Depuis quelques années, nous comprenons de plus en plus la nature et la biosynthèse, ainsi que les protéines impliquées dans l'ancrage des enzymes à la membrane plasmique. Nous n'avons eu, par contre, aucune idée sur le mécanisme qui d'abord définit cet endroit dans la membrane plasmique. Nous avons mené un crible génétique sur la localisation de CASPI-GFP, une protéine, qui recrute les enzymes extracellulaires pour la synthèse du cadre de Caspary. Nous avons identifié plusieurs nouveaux gènes qui sont impliqués dans l'intégrité du cadre de Caspary. L'un de ces gènes est EX070A1, qui est un facteur ayant un rôle important lors de la sécrétion des protéines dans tous les organismes eukaryotes. Ces mutants sont gravement affectés au niveau du cadre de Caspary, mais surtout ils ne sont plus capables de localiser CASPI-GFP. Nous avons suivi la dynamique d'EX070Al et de CASP1-GFP en combinaison avec d'autres marqueurs. Nous avons pu montrer que l'accumulation d'EX070Al est spécifique pour l'endoderme et essentielle pour bien localiser CASPI-GFP et donc, le cadre de Caspary. Ces résultats nous aident à mieux comprendre le développement de l'endoderme mais peuvent potentiellement aussi être utilisés pour étudier les modifications de la paroi cellulaire dans d'autres cellules de la plante.

Identification and ethnic diversity underlie support for multicultural rights : a multilevel analysis in Bulgaria

Bulgaria is historically a multicultural society, composed of the Bulgarian (ethnic) majority and a number of ethnic minorities among which Bulgarian Turks and Roma are the largest. Both minority communities are stigmatized in contemporary Bulgaria, though to different degrees and for different reasons. Ethnic minorities' rights to preserve their culture, customs, and language are a topic of contentious debate. The purpose of this study was to examine individual- and context-level antecedents of the ethnic Bulgarian majority's support for multicultural rights of ethnic minorities. Multilevel regression analyses were conducted with International Social Survey Programme ISSP 2003 data (N = 920 in 28 Bulgarian districts). At the individual-level, an ethnic conception of the nation and anti-Roma symbolic prejudice were negatively related to support for multicultural rights, whereas national identification was positively related to the support of these rights. Over and above individual-level effects, and in line with recent extensions of intergroup contact theory, thepercentage ofBulgarianTurks withindistricts was positively related to support for multicultural rights. Importantly, support for multicultural rights was particularly high in districts characterized by ethnic diversity, that is, in districts with high proportions of both Bulgarian Turks and Roma. The beneficial effects of ethnic diversity and theoretical implications of findings are discussed.

A web-based tool to aid the identification of chemicals potentially posing a health risk through percutaneous exposure

Occupational hygiene practitioners typically assess the risk posed by occupational exposure by comparing exposure measurements to regulatory occupational exposure limits (OELs). In most jurisdictions, OELs are only available for exposure by the inhalation pathway. Skin notations are used to indicate substances for which dermal exposure may lead to health effects. However, these notations are either present or absent and provide no indication of acceptable levels of exposure. Furthermore, the methodology and framework for assigning skin notation differ widely across jurisdictions resulting in inconsistencies in the substances that carry notations. The UPERCUT tool was developed in response to these limitations. It helps occupational health stakeholders to assess the hazard associated with dermal exposure to chemicals. UPERCUT integrates dermal quantitative structure-activity relationships (QSARs) and toxicological data to provide users with a skin hazard index called the dermal hazard ratio (DHR) for the substance and scenario of interest. The DHR is the ratio between the estimated 'received' dose and the 'acceptable' dose. The 'received' dose is estimated using physico-chemical data and information on the exposure scenario provided by the user (body parts exposure and exposure duration), and the 'acceptable' dose is estimated using inhalation OELs and toxicological data. The uncertainty surrounding the DHR is estimated with Monte Carlo simulation. Additional information on the selected substances includes intrinsic skin permeation potential of the substance and the existence of skin notations. UPERCUT is the only available tool that estimates the absorbed dose and compares this to an acceptable dose. In the absence of dermal OELs it provides a systematic and simple approach for screening dermal exposure scenarios for 1686 substances.

Preparation of a blood culture pellet for rapid bacterial identification and antibiotic susceptibility testing.

Bloodstream infections and sepsis are a major cause of morbidity and mortality. The successful outcome of patients suffering from bacteremia depends on a rapid identification of the infectious agent to guide optimal antibiotic treatment. The analysis of Gram stains from positive blood culture can be rapidly conducted and already significantly impact the antibiotic regimen. However, the accurate identification of the infectious agent is still required to establish the optimal targeted treatment. We present here a simple and fast bacterial pellet preparation from a positive blood culture that can be used as a sample for several essential downstream applications such as identification by MALDI-TOF MS, antibiotic susceptibility testing (AST) by disc diffusion assay or automated AST systems and by automated PCR-based diagnostic testing. The performance of these different identification and AST systems applied directly on the blood culture bacterial pellets is very similar to the performance normally obtained from isolated colonies grown on agar plates. Compared to conventional approaches, the rapid acquisition of a bacterial pellet significantly reduces the time to report both identification and AST. Thus, following blood culture positivity, identification by MALDI-TOF can be reported within less than 1 hr whereas results of AST by automated AST systems or disc diffusion assays within 8 to 18 hr, respectively. Similarly, the results of a rapid PCR-based assay can be communicated to the clinicians less than 2 hr following the report of a bacteremia. Together, these results demonstrate that the rapid preparation of a blood culture bacterial pellet has a significant impact on the identification and AST turnaround time and thus on the successful outcome of patients suffering from bloodstream infections.

Identification des dermatophytes en cultures sur la base de leurs critères macroscopiques et microscopiques

Contexte : Les dermatophytes sont des champignons filamenteux parasites spécialisés qui dégradent les tissus kératinisés. Ils sont responsables de la plupart des mycoses de la peau, du cuir chevelu et des cheveux, et des ongles. Le choix du traitement des dermatophytoses dépend des symptômes et du dermatophyte incriminé parmi une quinzaine d'espèces possibles. L'identification des dermatophytes se fait en général sur la base des caractères macroscopiques et microscopiques des cultures. L'identification est parfois difficile ou reste incertaine car il peut y avoir des variations d'un isolat à l'autre au sein d'une même espèce. Cependant, les espèces sont facilement identifiées sur la base de séquences d'ADN. En pratique, des séquences d'ADN ribosomique suffisamment polymorphes sont le plus souvent utilisées pour discriminer les espèces de dermatophytes. Des méthodes spécialisées et sophistiquées telles que les séquences d'ADN et la spectrométrie de masse sont de plus en plus proposées dans la littérature pour identifier les dermatophytes. Toutefois, ces méthodes ne peuvent pas être utilisées directement par un médecin dans un cabinet médical. C'est pourquoi des méthodes plus simples basées sur l'observation de caractères phénotypiques des champignons en culture ne devraient pas être abandonnées. Objectif : Etablir une clé d'identification dichotomique se basant sur des caractères macroscopiques et microscopiques permettant une identification fiable du dermatophyte par la culture. Des clés d'identification des espèces seront élaborées et testées pour leur validation en parallèle avec leur identification par des méthodes de Biologie Moléculaire. Créer un outil simple qui pourra être utilisé au laboratoire par des médecins ou des biologistes non spécialisés en mycologie pour identifier les dermatophytes sans avoir recours à une technologie sophistiquée. Méthodes : Inventaire des espèces isolées de 2001 à 2012 au laboratoire de dermatologie du CHUV. Inventaire des caractères phénotypiques permettant de caractériser chaque espèce. Création d'un système dichotomique sur la base des caractères phénotypiques pour séparer et identifier les espèces (clé d'identification des espèces). Résultats attendus : Les résultats attendus sont définis au niveau des objectifs. L'outil doit être accessible pour des personnes inexpérimentées qui pourront alors identifier les dermatophytes. Plus-value : Les dermatophytoses sont fréquemment diagnostiquées. Cet outil est destiné à tous les dermatologues installés et au personnel de laboratoire qui ne sont pas nécessairement spécialisés en la matière.