363 resultados para Modèle d’évaluation d’actifs
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Aprs avoir propos une dfinition opratoire du mythe littraire, et suggr, sous l'tiquette de mytholectures, un mode d'approche de cet objet, le travail se subdivise en deux grandes parties.La premire, diachronique, cherche sonder le devenir historique du mythe de Perceval, de Chrtien de Troyes nos jours; il s'agit essentiellement d'observer comment la valeur et le sens du mythe se sont labors progressivement au fil de ses reprises - comment chaque priode, chaque auteur a rencontr le mythe sous un rapport singulier, susceptible de lui fournir un miroir qui reflte certaines de ses proccupations et lui permette, paralllement, de configurer son exprience du monde. Les principales tapes de ce parcours (qui touche environ quatre-vingts auteurs) sont Richard Wagner et Julien Gracq.La seconde partie propose deux approches thmatiques du mythe de Perceval: l'une d'elles est centre sur la problmatique familiale et les enjeux relationnels qui, de reprise en reprise, ne cessent d'tre rinterprts sous divers angles (dont Oedipe, cet anti-Perceval, n'est jamais trs loin). L'autre axe thmatique s'intresse la propension marque du mythe de Perceval fonctionner comme modèle des deux ples de l'activit littraire que sont la lecture (qute de sens) et l'criture (qute potique): divers arts potiques percevaliens (de Wagner Perec, en passant par Proust ou Handke) closent ainsi le parcours.
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Rsum Ce travail a pour objectif de concevoir une variable permettant d'apprhender la qualit du paysage, afin de l'utiliser dans un modèle de prix hdonistes pour en dfinir le prix implicite. La qualit des paysages naturel et construit des six stations constituant notre chantillon de 402 appartements lous par des touristes dans les stations valaisannes d'Anzre, Champry, Grimentz, Haute-Nendaz, Ovronnaz et Verbier, a t value par plusieurs groupes. Les rsultats de ces sances d'valuation ont t traits par l'algorithme MACBETH, permettant ainsi de bnficier d'une mesure cardinale de la qualit esthtique visuelle de ces paysages. Mises part un certain nombre de caractristiques conventionnelles exerant un influence sur la variation des loyers pays par les touristes, les rsultats de l'analyse conomtrique montrent que sur la seule base de la qualit du paysage naturel, le loyer peut varier entre 20 et 30% durant les ftes de fin d'anne selon le groupe d'valuation pris en considration. Le prix implicite de la qualit du paysage naturel varie galement entre les saisons touristiques analyses. En effet, la qualit esthtique visuelle du paysage naturel peut faire varier le loyer estim de 15% durant la saison d't plus de 50% durant le reste de la saison d'hiver. La variation du loyer estim peut aller de 13% plus de 40% durant le reste de la saison d'hiver sur la seule base de la qualit du paysage construit. Le prix implicite de la qualit esthtique visuelle du paysage construit varie galement entre les saisons touristiques analyses, puisque les coefficients associs cette variable peuvent passer du simple plus du double.
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Micro-RNAs (miRNAs) are key, post-transcriptional regulators of gene expression and have been implicated in almost every cellular process investigated thus far. However, their role in sleep, in particular the homeostatic aspect of sleep control, has received little attention. We here assessed the effects of sleep deprivation on the brain miRNA transcriptome in the mouse. Sleep deprivation affected miRNA expression in a brain-region specific manner. The forebrain expression of the miRNA miR-709 was affected the most and in situ analyses confirmed its robust increase throughout the brain, especially in the cerebral cortex and the hippocampus. The hippocampus was a major target of the sleep deprivation affecting 37 miRNAs compared to 52 in the whole forebrain. Moreover, independent from the sleep deprivation condition, miRNA expression was highly region-specific with 45% of all expressed miRNAs showing higher expression in hippocampus and 55% in cortex. Next we demonstrated that down-regulation of miRNAs in Com/c2o-expressing neurons of adult mice, through a conditional and inducible Dicer knockout mice model (cKO), results in an altered homeostatic response after sleep deprivation eight weeks following the tamoxifen-induced recombination. Dicer cKO mice showed a larger increase in the electro-encephalographic (EEG) marker of sleep pressure, EEG delta power, and a reduced Rapid Eye Movement sleep rebound, compared to controls, highlighting a functional role of miRNAs in sleep homeostasis. Beside a sleep phenotype, Dicer cKO mice developed an unexpected, severe obesity phenotype associated with hyperphagia and altered metabolism. Even more surprisingly, after reaching maximum body weight 5 weeks after tamoxifen injection, obese cKO mice spontaneously started losing weight as rapidly as it was gained. Brain transcriptome analyses in obese mice identified several obesity-related pathways (e.g. leptin, somatostatin, and nemo-like kinase signaling), as well as genes involved in feeding and appetite (e.g. Pmch, Neurotensin). A gene cluster with anti-correlated expression in the cerebral cortex of post-obese compared to obese mice was enriched for synaptic plasticity pathways. While other studies have identified a role for miRNAs in obesity, we here present a unique model that allows for the study of processes involved in reversing obesity. Moreover, our study identified the cortex as a brain area important for body weight homeostasis. Together, these observations strongly suggest a role for miRNAs in the maintenance of homeostatic processes in the mouse, and support the hypothesis of a tight relationship between sleep and metabolism at a molecular - Les micro-ARNS (miARNs) sont des rgulateurs post-transcriptionnels de l'expression des gnes, impliqus dans la quasi-totalit des processus cellulaires. Cependant, leur rle dans la rgulation du sommeil, et en particulier dans le maintien de l'homostasie du sommeil, n'a reu que trs peu d'attention jusqu' prsent. Dans cette tude, nous avons tudi les consquences d'une privation de sommeil sur l'expression crbrale des miARNs chez la souris, et observ des changements dans l'expression de nombreux miARNs. Dans le cerveau antrieur, miR-709 est le miARN le plus affect par la perte de sommeil, en particulier dans le cortex crbral et l'hippocampe. L'hippocampe est la rgion la plus touche avec 37 miARNs changs compars 52 dans le cerveau entier. Par ailleurs, indpendamment de la privation de sommeil, certains miARNs sont spcifiquement enrichis dans certaines aires crbrales, 45% des miARNs tant surexprims dans l'hippocampe contre 55% dans le cortex. Dans une seconde tude, nous avons observ que la dltion de DICER, enzyme essentielle la biosynthse des miARNs, et la perte subsquente des miARNs dans les neurones exprimant la protine CAMK2a altre la rponse homostatique une privation de sommeil, 8 semaines aprs l'induction de la recombinaison gntique par le tamoxifen. Les souris sans Dicer (cKO) ont une plus large augmentation de l'EEG delta power, le principal marqueur lectro-encphalographique du besoin de sommeil, compare aux contrles, ainsi qu'un rebond en sommeil paradoxal plus petit. De faon surprenante, les souris Dicer cKO dveloppent une obsit rapide, svre et transitoire, associe de l'hyperphagie et une altration de leur mtabolisme nergtique. Aprs avoir atteint un pic maximal d'obsit, les souris cKO entrent spontanment dans une priode de perte de poids rapide. L'analyse du transcriptome crbral des souris obses nous a permis d'identifier des voies associes l'obsit (leptine, somatostatine et nemo-like kinase), et la prise alimentaire (Pmch, Neurotensin), tandis que celui des souris post-obses a rvl un groupe de gnes lis la plasticit synaptique. Au-del des nombreux modèles d'obsit existant chez la souris, notre tude prsente un modèle unique permettant d'tudier les mcanismes sous-jacent la perte de poids. De plus, nous avons mis en vidence un rle important du cortex crbral dans le maintien de la balance nergtique. En conclusion, toutes ces observations soutiennent l'ide que les miARNs sont des rgulateurs cruciaux dans le maintien des processus homostatiques et confortent l'hypothse d'une troite relation molculaire entre le sommeil et le mtabolisme.
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The capacity to learn to associate sensory perceptions with appropriate motor actions underlies the success of many animal species, from insects to humans. The evolutionary significance of learning has long been a subject of interest for evolutionary biologists who emphasize the benefit yielded by learning under changing environmental conditions, where it is required to flexibly switch from one behavior to another. However, two unsolved questions are particularly important for improving our knowledge of the evolutionary advantages provided by learning, and are addressed in the present work. First, because it is possible to learn the wrong behavior when a task is too complex, the learning rules and their underlying psychological characteristics that generate truly adaptive behavior must be identified with greater precision, and must be linked to the specific ecological problems faced by each species. A framework for predicting behavior from the definition of a learning rule is developed here. Learning rules capture cognitive features such as the tendency to explore, or the ability to infer rewards associated to unchosen actions. It is shown that these features interact in a non-intuitive way to generate adaptive behavior in social interactions where individuals affect each other's fitness. Such behavioral predictions are used in an evolutionary model to demonstrate that, surprisingly, simple trial-and-error learning is not always outcompeted by more computationally demanding inference-based learning, when population members interact in pairwise social interactions. A second question in the evolution of learning is its link with and relative advantage compared to other simpler forms of phenotypic plasticity. After providing a conceptual clarification on the distinction between genetically determined vs. learned responses to environmental stimuli, a new factor in the evolution of learning is proposed: environmental complexity. A simple mathematical model shows that a measure of environmental complexity, the number of possible stimuli in one's environment, is critical for the evolution of learning. In conclusion, this work opens roads for modeling interactions between evolving species and their environment in order to predict how natural selection shapes animals' cognitive abilities. - La capacit d'apprendre associer des sensations perceptives des actions motrices appropries est sous-jacente au succs volutif de nombreuses espces, depuis les insectes jusqu'aux tres humains. L'importance volutive de l'apprentissage est depuis longtemps un sujet d'intrt pour les biologistes de l'volution, et ces derniers mettent l'accent sur le bnfice de l'apprentissage lorsque les conditions environnementales sont changeantes, car dans ce cas il est ncessaire de passer de manire flexible d'un comportement l'autre. Cependant, deux questions non rsolues sont importantes afin d'amliorer notre savoir quant aux avantages volutifs procurs par l'apprentissage. Premirement, puisqu'il est possible d'apprendre un comportement incorrect quand une tche est trop complexe, les rgles d'apprentissage qui permettent d'atteindre un comportement rellement adaptatif doivent tre identifies avec une plus grande prcision, et doivent tre mises en relation avec les problmes cologiques spcifiques rencontrs par chaque espce. Un cadre thorique ayant pour but de prdire le comportement partir de la dfinition d'une rgle d'apprentissage est dvelopp ici. Il est dmontr que les caractristiques cognitives, telles que la tendance explorer ou la capacit d'infrer les rcompenses lies des actions non exprimentes, interagissent de manire non-intuitive dans les interactions sociales pour produire des comportements adaptatifs. Ces prdictions comportementales sont utilises dans un modèle volutif afin de dmontrer que, de manire surprenante, l'apprentissage simple par essai-et-erreur n'est pas toujours battu par l'apprentissage bas sur l'infrence qui est pourtant plus exigeant en puissance de calcul, lorsque les membres d'une population interagissent socialement par pair. Une deuxime question quant l'volution de l'apprentissage concerne son lien et son avantage relatif vis--vis d'autres formes plus simples de plasticit phnotypique. Aprs avoir clarifi la distinction entre rponses aux stimuli gntiquement dtermines ou apprises, un nouveau facteur favorisant l'volution de l'apprentissage est propos : la complexit environnementale. Un modèle mathmatique permet de montrer qu'une mesure de la complexit environnementale - le nombre de stimuli rencontrs dans l'environnement - a un rle fondamental pour l'volution de l'apprentissage. En conclusion, ce travail ouvre de nombreuses perspectives quant la modlisation des interactions entre les espces en volution et leur environnement, dans le but de comprendre comment la slection naturelle faonne les capacits cognitives des animaux.
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Summary: Amphibians are among the most vulnerable animals of the world. One third of all species are currently threatened with extinction. Habitat loss is the major menace to pond- and stream-breeding species in the old world. In highly urbanized landscape like the Swiss Plateau, most species suffer from habitat reduction and fragmentation. Among all indigenous species, the European tree frog (Hyla arborea L., 1758) is one of the most endangered. It experienced an alarming decline during the last century and its regional long-term persistence is not guaranteed. We developed a monitoring framework based on calling male counts which included multiple visits to each wetland during the reproduction period in order to precisely determine its distribution on the Lemanic coast. Our results indicate that visiting populations 3 limes under suitable climatic conditions (temperature >20C) provides reliable presence/absence data. Based on our monitoring data, we analyzed the species requirements regarding its breeding habitat. It appeared that anthropogenic activities had paradoxical effects on the species. On one hand, urbanization, traffic and intensive agriculture had a strong detrimental effect on tree frog distribution. On the other hand, large tree frog populations were frequently associated with gravel pits and military training grounds. Our results allowed us to create a habitat suitability map taking into account detrimental landscape elements around ponds (>1100m away from urban areas and >500m away from first class roads). In parallel, we developed a metapopulation model of the European tree frog in order to identify the critical threats to the long term persistence of the species. Our results indicated that suitable pond density is at the low end of the species requirements. Pond creation must therefore be considered an essential complementary approach to pond conservation and restoration. Our model also provided a mapping solution permitting the location of the must suitable area for pond creation from a metapopulation perspective. As many other amphibians, the European tree frog is not only exposed to an aquatic habitat (breeding and larval period), but also to a terrestrial stage (summer and overwintering habitats). Unfortunately, animals in their terrestrial phase are less conspicuous and, as a consequence, their terrestrial needs are relatively unknown. Using a recent tracking method (the Harmonic Direction Finder), we followed post-breeding frogs and identified favored terrestrial habitats, thus providing another practical conservation tool. We conclude that only the combination of multiple spatially explicit approaches (landscape-scale habitat suitability, metapopulation dynamics and terrestrial needs) is likely to provide wildlife managers with effective tools for the conservation of highly endangered amphibians. Rsum: Les amphibiens font partie des animaux les plus vulnrables du monde. Un tiers des espces est actuellement menac d'extinction. Dans l'ancien monde, la disparition des habitats constitue la principale menace pour les grenouilles, crapauds, tritons et salamandres. Dans les paysages fortement urbaniss comme le Plateau Suisse, la plupart des espces souffrent d'une rduction et d'une fragmentation de leurs habitats. Parmi toutes les espces indignes, la rainette verte (Hyla arborea L., 1758) est l'une des plus menace. Sa distribution a rgress de manire alarmante durant le sicle pass et sa survie rgionale long terme n'est pas assure. Nous avons dvelopp une mthode de suivi des populations se basant sur le comptage des mles chanteurs durant la priode de reproduction. Cette mthode requiert plusieurs visites chaque plan d'eau de manire dterminer prcisment la distribution de l'espce. Nos rsultats dmontrent que 3 visites par population dans des conditions climatiques favorable (temprature >20C) permettent d'obtenir des donnes de prsence/ absence valables. Sur la base de nos comptages sur la Cte lmanique, nous avons analys les exigences de l'espce concernant ses sites de reproduction. Il est apparu que les activits humaines avaient un effet paradoxal sur l'espce. D'une part, l'urbanisation, le trafic routier et l'intensification de l'agriculture ont un effet fortement prjudiciable, tandis que d'autre part les plus grandes populations sont souvent associes des gravires et autres places d'armes. Nos rsultats ont permis de crer une carte de qualit d'habitat prenant en compte les lments paysagers prjudiciables la rainette (situ plus de 1100m de zones urbaines et plus de 500m de routes de premire classe). En parallle, nous avons dvelopp un modèle mtapopulationnel (incluant l'ensemble des populations) de manire identifier les menaces prpondrantes sur la survie long terme de l'espce. Nos rsultats ont permis de dterminer que la densit actuelle de plans d'eau adquats est la limite infrieure des exigences de l'espce. La cration d'tangs doit donc tre considre comme une approche indispensable et complmentaire la protection et la restauration des sites existants. Notre modèle a galement fourni des rsultats cartographiables permettant l'identification des sites les plus appropris dans une perspective mtapopulationnelle. Comme de nombreux autres amphibiens, la rainette verte est expose un habitat aquatique (reproduction et dveloppement larvaire) ainsi qu' un habitat terrestre (t et hiver). Les animaux tant particulirement cryptiques dans cette seconde phase, leurs besoins terrestres sont relativement mal connus. Nous avons donc dvelopp une nouvelle mthode de tlmtrie base sur le goniomtre harmonique. Cette mthode nous a permis de suivre des rainettes dans leurs migrations jusqu' leurs habitats d't et d'tablir ainsi des recommandations pratiques pour la conservation de la rainette. Nous concluons que la combinaison de multiples approches spatialement explicites (qualit d'habitat, dynamique de mtapopulation et habitats terrestres) est seule mme de produire des outils efficaces pour la conservation des espces menaces d'amphibiens.
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RESUME Dal et le dynamisme des formes. L'laboration de l'activit paranoaque-critique dans le contexte socioculturel des annes 1920-1930 Rendre nouveau lisibles des textes dont on ne sait plus reconnatre les enjeux historiques et cognitifs, tel est le principal dfi que cet ouvrage consacr aux crits surralistes de Dal se propose de relever. La thse fait ressortir l'image sans doute un peu droutante d'un crateur stratge qui, assimilant de manire originale les savoirs les plus varis et dialoguant avec les intellectuels de son temps, propose au tournant des annes 1930 une thorie du surralisme novatrice, capable de redynamiser un groupe en pleine crise. L'tude, combinant des perspectives sociologiques et linguistiques, explore tout d'abord les crits caractre manifestaire et dessine les traits conceptuels et stylistiques qui font la singularit du projet de Dal dans le cadre du mouvement surraliste. S'inspirant des images-devinettes, de la production des fous, de l'interprtation des figures aux formes indtermines, le Catalan conoit une mthode crative et cognitive qui se fonde sur une pense subconsciente active, schmatisant et fertilisant automatiquement toute donne perue. Dans le domaine de la peinture, ce sont les formes des objets qui sont surdtermines par les dsirs subconscients du crateur et du spectateur et qui acquirent ainsi des significations inattendues. Dans le domaine de l'criture, ce sont les formes sonores et graphiques des mots ou encore l'ossature discursive qui, investies par les fantasmes de l'crivain et du lecteur, gnrent une multitude d'images. A l'aune des modes de connaissance propres l'poque, l'tude porte ensuite sur deux modèles de pense - le paradigme photographique et l'imaginaire li la notion d'espace-temps dveloppe par Einstein dans le cadre de la thorie de la relativit gnrale - qui sont en vogue pendant les annes 1930 et que le peintre se rapproprie pour signifier la dimension rvlatrice et objective de ses oeuvres. Premirement, pour penser la mthode paranoaque-critique , le Catalan reprend et dtourne les phases de production du clich : loin de reproduire fidlement le visible, le dispositif photographique dalinien permet de rvler les penses subconscientes. Deuximement, ds 1933-1934, Dal reformule le modèle de l'espace-temps de la relativit gnrale d'Einstein pour penser la faon dont une entit invisible (le fantasme) s'objective et se matrialise dans la ralit extrieure. L'tude du dynamisme psychique confr par Dal aux formes des objets, aux formes verbales et picturales permet finalement de mettre en lumire le foisonnement mais aussi l'extrme cohrence de l'univers surraliste du Catalan, et de souligner la valeur de l'approche paranoaque-critique de la ralit tant sur le plan de l'histoire culturelle que sur le plan de la connaissance.
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Introduction : Le syndrome de Brugada, dcrit en 1992 par Pedro et Josep Brugada, est un syndrome cardiaque caractris par un sus-dcalage particulier du segment ST associ un bloc de branche droit atypique au niveau des drivations ECG V1 V3. Les altrations ECG du syndrome de Brugada sont classifies en 3 types dont seul le type 1 est diagnostique. Les mcanismes physiopathologiques exacts de ce syndrome sont pour le moment encore controverss. Plusieurs hypothses sont proposes dans la littrature dont deux principales retiennent l'attention : 1) le modèle du trouble de repolarisation stipule des potentiels d'action rduits en dure et en amplitude lis un changement de rpartition de canaux potassiques 2) le modèle du trouble de dpolarisation spcifie un retard de conduction se traduisant par une dpolarisation retarde. Dans le STEMI, un sus-dcalage ST ressemblant celui du syndrome de Brugada est expliqu par deux thories : 1) le courant de lsion diastolique suggre une lvation du potentiel diastolique transform artificiellement en sus-dcalage ST par les filtres utiliss dans tous les appareils ECG.Objectif : Recrer les manifestations ECG du syndrome de Brugada en appliquant les modifications du potentiel d'action des cardiomyocytes rapportes dans la littrature.Mthode : Pour ce travail, nous avons utilis "ECGsim", un simulateur informatique raliste d'ECG disponible gratuitement sur www.ecgsim.org. Ce programme est bas sur une reconstruction de l'ECG de surface l'aide de 1500 noeuds reprsentant chacun les potentiels d'action des ventricules droit et gauche, picardiques et endocardiques. L'ECG simul peut tre donc vu comme l'intgration de l'ensemble de ces potentiels d'action en tenant compte des proprits de conductivit des tissus s'interposant entre les lectrodes de surface et le coeur. Dans ce programme, nous avons dfinit trois zones, de taille diffrente, comprenant la chambre de chasse du ventricule droit. Pour chaque zone, nous avons reproduit les modifications des potentiels d'action cites dans les modèles du trouble de repolarisation et de dpolarisation et des thories de courant de lsion systolique et diastolique. Nous avons utilis, en plus des douze drivations habituelles, une lectrode positionne en V2IC3 (i.e. 3me espace intercostal) sur le thorax virtuel du programme ECGsim.Rsultats : Pour des raisons techniques, le modèle du trouble de repolarisation n'a pas pu tre entirement ralise dans ce travail. Le modèle du trouble de dpolarisation ne reproduit pas d'altration de type Brugada mais un bloc de branche droit plus ou moins complet. Le courant de lsion diastolique permet d'obtenir un sus-dcalage ST en augmentant le potentiel diastolique picardique des cardiomyocytes de la chambre de chasse du ventricule droit. Une inversion de l'onde T apparat lorsque la dure du potentiel d'action est prolonge. L'amplitude du sus-dcalage ST dpend de la valeur du potentiel diastolique, de la taille de la lsion et de sa localisation picardique ou transmurale. Le courant de lsion systolique n'entrane pas de sus-dcalage ST mais accentue l'amplitude de l'onde T.Discussion et conclusion : Dans ce travail, l'lvation du potentiel diastolique avec un prolongement de la dure du potentiel d'action est la combinaison qui reproduit le mieux les altrations ECG du Brugada. Une persistance de cellules de type nodal au niveau de la chambre de chasse du ventricule droit pourrait tre une explication ces modifications particulires du potentiel d'action. Le risque d'arythmie dans la Brugada pourrait galement tre expliqu par une automaticit anormale des cellules de type nodal. Ainsi, des altrations des mcanismes cellulaires impliqus dans le maintien du potentiel diastolique pourraient tre prsentes dans le syndrome de Brugada, ce qui, notre connaissance, n'a jamais t rapport dans la littrature.
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Recently, the introduction of second generation sequencing and further advance-ments in confocal microscopy have enabled system-level studies for the functional characterization of genes. The degree of complexity intrinsic to these approaches needs the development of bioinformatics methodologies and computational models for extracting meaningful biological knowledge from the enormous amount of experimental data which is continuously generated. This PhD thesis presents several novel bioinformatics methods and computational models to address specific biological questions in Plant Biology by using the plant Arabidopsis thaliana as a model system. First, a spatio-temporal qualitative analysis of quantitative transcript and protein profiles is applied to show the role of the BREVIS RADIX (BRX) protein in the auxin- cytokinin crosstalk for root meristem growth. Core of this PhD work is the functional characterization of the interplay between the BRX protein and the plant hormone auxin in the root meristem by using a computational model based on experimental evidence. Hyphotesis generated by the modelled to the discovery of a differential endocytosis pattern in the root meristem that splits the auxin transcriptional response via the plasma membrane to nucleus partitioning of BRX. This positional information system creates an auxin transcriptional pattern that deviates from the canonical auxin response and is necessary to sustain the expression of a subset of BRX-dependent auxin-responsive genes to drive root meristem growth. In the second part of this PhD thesis, we characterized the genome-wide impact of large scale deletions on four divergent Arabidopsis natural strains, through the integration of Ultra-High Throughput Sequencing data with data from genomic hybridizations on tiling arrays. Analysis of the identified deletions revealed a considerable portion of protein coding genes affected and supported a history of genomic rearrangements shaped by evolution. In the last part of the thesis, we showed that VIP3 gene in Arabidopsis has an evo-lutionary conserved role in the 3' to 5' mRNA degradation machinery, by applying a novel approach for the analysis of mRNA-Seq data from random-primed mRNA. Altogether, this PhD research contains major advancements in the study of natural genomic variation in plants and in the application of computational morphodynamics models for the functional characterization of biological pathways essential for the plant. - Rcemment, l'introduction du squenage de seconde gnration et les avances dans la microscopie confocale ont permis des tudes l'chelle des diffrents systmes cellulaires pour la caractrisation fonctionnelle de gnes. Le degrs de complexit intrinsque ces approches ont requis le dveloppement de mthodologies bioinformatiques et de modèles mathmatiques afin d'extraire de la masse de donnes exprimentale gnre, des information biologiques significatives. Ce doctorat prsente la fois des mthodes bioinformatiques originales et des modèles mathmatiques pour rpondre certaines questions spcifiques de Biologie Vgtale en utilisant la plante Arabidopsis thaliana comme modèle. Premirement, une analyse qualitative spatio-temporelle de profiles quantitatifs de transcripts et de protines est utilise pour montrer le rle de la protine BREVIS RADIX (BRX) dans le dialogue entre l'auxine et les cytokinines, des phytohormones, dans la croissance du mristme racinaire. Le noyau de ce travail de thse est la caractrisation fonctionnelle de l'interaction entre la protine BRX et la phytohormone auxine dans le mristme de la racine en utilisant des modèles informatiques bass sur des preuves exprimentales. Les hypothses produites par le modèle ont men la dcouverte d'un schma diffrentiel d'endocytose dans le mristme racinaire qui divise la rponse transcriptionnelle l'auxine par le partitionnement de BRX de la membrane plasmique au noyau de la cellule. Cette information positionnelle cre une rponse transcriptionnelle l'auxine qui dvie de la rponse canonique l'auxine et est ncessaire pour soutenir l'expression d'un sous ensemble de gnes rpondant l'auxine et dpendant de BRX pour conduire la croissance du mristme. Dans la seconde partie de cette thse de doctorat, nous avons caractris l'impact sur l'ensemble du gnome des dltions grande chelle sur quatre souches divergentes naturelles d'Arabidopsis, travers l'intgration du squenage ultra-haut-dbit avec l'hybridation gnomique sur puces ADN. L'analyse des dltions identifies a rvl qu'une proportion considrable de gnes codant tait affecte, supportant l'ide d'un historique de rarrangement gnomique model durant l'volution. Dans la dernire partie de cette thse, nous avons montr que le gne VP3 dans Arabidopsis a conserv un rle volutif dans la machinerie de dgradation des ARNm dans le sens 3' 5', en appliquant une nouvelle approche pour l'analyse des donnes de squenage d'ARNm issue de transcripts amplifis alatoirement. Dans son ensemble, cette recherche de doctorat contient des avances majeures dans l'tude des variations gnomiques naturelles des plantes et dans l'application de modèles morphodynamiques informatiques pour la caractrisation de rseaux biologiques essentiels la plante. - Le dveloppement des plantes est crit dans leurs codes gntiques. Pour comprendre comment les plantes sont capables de s'adapter aux changements environnementaux, il est essentiel d'tudier comment leurs gnes gouvernent leur formation. Plus nous essayons de comprendre le fonctionnement d'une plante, plus nous ralisons la complexit des mcanismes biologiques, tel point que l'utilisation d'outils et de modèles mathmatiques devient indispensable. Dans ce travail, avec l'utilisation de la plante modèle Arabidopsis thalicinci nous avons rsolu des problmes biologiques spcifiques travers le dveloppement et l'application de mthodes informatiques concrtes. Dans un premier temps, nous avons investigu comment le gne BREVIS RADIX (BRX) rgule le dveloppement de la racine en contrlant la rponse deux hormones : l'auxine et la cytokinine. Nous avons employ une analyse statistique sur des mesures quantitatives de transcripts et de produits de gnes afin de dmontrer que BRX joue un rle antagonisant dans le dialogue entre ces deux hormones. Lorsque ce-dialogue molculaire est perturb, la racine primaire voit sa longueur dramatiquement rduite. Pour comprendre comment BRX rpond l'auxine, nous avons dvelopp un modèle informatique bas sur des rsultats exprimentaux. Les simulations successives ont men la dcouverte d'un signal positionnel qui contrle la rponse de la racine l'auxine par la rgulation du mouvement intracellulaire de BRX. Dans la seconde partie de cette thse, nous avons analys le gnome entier de quatre souches naturelles d'Arabidopsis et nous avons trouv qu'une grande partie de leurs gnes taient manquant par rapport la souche de rfrence. Ce rsultat indique que l'historique des modifications gnomiques conduites par l'volution dtermine une disponibilit diffrentielle des gnes fonctionnels dans ces plantes. Dans la dernire partie de ce travail, nous avons analys les donnes du transcriptome de la plante o le gne VIP3 tait non fonctionnel. Ceci nous a permis de dcouvrir le rle double de VIP3 dans la rgulation de l'initiation de la transcription et dans la dgradation des transcripts. Ce rle double n'avait jusqu'alors t dmontre que chez l'homme. Ce travail de doctorat supporte le dveloppement et l'application de mthodologies informatiques comme outils inestimables pour rsoudre la complexit des problmes biologiques dans la recherche vgtale. L'intgration de la biologie vgtale et l'informatique est devenue de plus en plus importante pour l'avance de nos connaissances sur le fonctionnement et le dveloppement des plantes.
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Learning and immunity are two adaptive traits with roles in central aspects of an organism's life: learning allows adjusting behaviours in changing environments, while immunity protects the body integrity against parasites and pathogens. While we know a lot about how these two traits interact in vertebrates, the interactions between learning and immunity remain poorly explored in insects. During my PhD, I studied three possible ways in which these two traits interact in the model system Drosophila melanogaster, a model organism in the study of learning and in the study of immunity. Learning can affect the behavioural defences against parasites and pathogens through the acquisition of new aversions for contaminated food for instance. This type of learning relies on the ability to associate a food-related cue with the visceral sickness following ingestion of contaminated food. Despite its potential implication in infection prevention, the existence of pathogen avoidance learning has been rarely explored in invertebrates. In a first part of my PhD, I tested whether D. melanogaster, which feed on food enriched in microorganisms, innately avoid the orally-acquired 'novel' virulent pathogen Pseudomonas entomophila, and whether it can learn to avoid it. Although flies did not innately avoid this pathogen, they decreased their preference for contaminated food over time, suggesting the existence of a form of learning based likely on infection-induced sickness. I further found that flies may be able to learn to avoid an odorant which was previously associated with the pathogen, but this requires confirmation with additional data. If this is confirmed, this would be the first time, to my knowledge, that pathogen avoidance learning is reported in an insect. The detrimental effect of infection on cognition and more specifically on learning ability is well documented in vertebrates and in social insects. While the underlying mechanisms are described in detail in vertebrates, experimental investigations are lacking in invertebrates. In a second part of my PhD, I tested the effect of an oral infection with natural pathogens on associative learning of D. melanogaster. By contrast with previous studies in insects, I found that flies orally infected with the virulent P. entomophila learned better the association of an odorant with mechanical shock than uninfected flies. The effect seems to be specific to a gut infection, and so far I have not been able to draw conclusions on the respective contributions of the pathogen's virulence and of the flies' immune activity in this effect. Interestingly, infected flies may display an increased sensitivity to physical pain. If the learning improvement observed in infected flies was due partially to the activity of the immune system, my results would suggest the existence of physiological connections between the immune system and the nervous system. The basis of these connections would then need to be addressed. Learning and immunity are linked at the physiological level in social insects. Physiological links between traits often result from the expression of genetic links between these traits. However, in social insects, there is no evidence that learning and immunity may be involved in an evolutionary trade-off. I previously reported a positive effect of infection on learning in D. melanogaster. This might suggest that a positive genetic link could exist between learning and immunity. We tested this hypothesis with two approaches: the diallel cross design with inbred lines, and the isofemale lines design. The two approaches provided consistent results: we found no additive genetic correlation between learning and resistance to infection with the diallel cross, and no genetic correlation in flies which are not yet adapted to laboratory conditions in isofemale lines. Consistently with the literature, the two studies suggested that the positive effect of infection on learning I observed might not be reflected by a positive evolutionary link between learning and immunity. Nevertheless, the existence of complex genetic relationships between the two traits cannot be excluded. - L'apprentissage et l'immunit sont deux caractres valeur adaptative impliqus dans des aspects centraux de la vie d'un organisme : l'apprentissage permet d'ajuster les comportements pour faire face aux changements de l'environnement, tandis que l'immunit protge l'intgrit corporelle contre les attaques des parasites et des pathognes. Alors que les interactions entre l'apprentissage et l'immunit sont bien documentes chez les vertbrs, ces interactions ont t trs peu tudies chez les insectes. Pendant ma thse, je me suis intresse trois aspects des interactions possibles entre l'apprentissage et l'immunit chez la mouche du vinaigre Drosophila melanogaster, qui est un organisme modèle dans l'tude la fois de l'apprentissage et de l'immunit. L'apprentissage peut affecter les dfenses comportementales contre les parasites et les pathognes par l'acquisition de nouvelles aversions pour la nourriture contamine par exemple. Ce type d'apprentissage repose sur la capacit associer une caractristique de la nourriture avec la maladie qui suit l'ingestion de cette nourriture. Malgr les implications potentielles pour la prvention des infections, l'vitement appris des pathognes a t rarement tudi chez les invertbrs. Dans une premire partie de ma thse, j'ai test si les mouches, qui se nourrissent sur des milieux enrichis en micro-organismes, vitent de faon inne un 'nouveau' pathogne virulent Pseudomonas entomophila, et si elles ont la capacit d'apprendre l'viter. Bien que les mouches ne montrent pas d'vitement inn pour ce pathogne, elles diminuent leur prfrence pour de la nourriture contamine dans le temps, suggrant l'existence d'une forme d'apprentissage base vraisemblablement sur la maladie gnre par l'infection. J'ai ensuite observ que les mouches semblent tre capables d'apprendre viter une odeur qui tait au pralable associe avec ce pathogne, mais cela reste confirmer par la collecte de donnes supplmentaires. Si cette observation est confirme, cela sera la premire fois, ma connaissance, que l'vitement appris des pathognes est dcrit chez un insecte. L'effet dtrimental des infections sur la cognition et plus particulirement sur les capacits d'apprentissage est bien document chez les vertbrs et les insectes sociaux. Alors que les mcanismes sous-jacents sont dtaills chez les vertbrs, des tudes exprimentales font dfaut chez les insectes. Dans une seconde partie de ma thse, j'ai mesur les effets d'une infection orale par des pathognes naturels sur les capacits d'apprentissage associatif de la drosophile. Contrairement aux tudes prcdentes chez les insectes, j'ai trouv que les mouches infectes par le pathogne virulent P. entomophila apprennent mieux associer une odeur avec des chocs mcaniques que des mouches non infectes. Cet effet semble spcifique l'infection orale, et jusqu' prsent je n'ai pas pu conclure sur les contributions respectives de la virulence du pathogne et de l'activit immunitaire des mouches dans cet effet. De faon intressante, les mouches infectes pourraient montrer une plus grande ractivit la douleur physique. Si l'amlioration de l'apprentissage observe chez les mouches infectes tait due en partie l'activit du systme immunitaire, mes rsultats suggreraient l'existence de connections physiologiques entre le systme immunitaire et le systme nerveux. Les mcanismes de ces connections seraient explorer. L'apprentissage et l'immunit sont lis sur un plan physiologique chez les insectes sociaux. Les liens physiologiques entre les caractres rsultent souvent de l'expression de liens entre ces caractres au niveau gntique. Cependant, chez les insectes sociaux, il n'y a pas de preuve que l'apprentissage et l'immunit soient lis par un compromis volutif. J'ai prcdemment rapport un effet positif de l'infection sur l'apprentissage chez la drosophile. Cela pourrait suggrer qu'une relation gntique positive existerait entre l'apprentissage et l'immunit. Nous avons test cette hypothse par deux approches : le croisement diallle avec des lignes consanguines, et les lignes isofemelles. Les deux approches ont fournies des rsultats similaires : nous n'avons pas dtect de corrlation gntique additive entre l'apprentissage et la rsistance l'infection avec le croisement diallle, et pas de corrlation gntique chez des mouches non adaptes aux conditions de laboratoire avec les lignes isofemelles. En ligne avec la littrature, ces deux tudes suggrent que l'effet positif de l'infection sur l'apprentissage que j'ai prcdemment observ ne reflterait pas un lien volutif positif entre l'apprentissage et l'immunit. Nanmoins, l'existence de relations gntiques complexes n'est pas exclue.
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Le gopatrimoine regroupe des objets gologiques lato sensu auxquels certaines valeurs sont attribues, en fonction de leur intrt pour la science, de leur raret, de leurs particularits culturelles ou cologiques, etc. Valoriser le gopatrimoine signifie avant tout faire partager cette approche aux non-spcialistes, en expliquant ce qui fait la valeur de ces objets. Cette valorisation peut s'effectuer, entre autres, sous la forme d'une activit touristique et contribuer ainsi au dveloppement rgional. Faire comprendre l'origine, la singularit et la valeur des formes du relief implique le recours une communication ducative, dsigne par le terme de mdiation. Les implications de la dimension ducative du processus, comme la prise en compte des connaissances et attentes du public, la cration d'un environnement favorable l'apprentissage ou l'attractivit du contenu, sont souvent ngliges. Du point de vue conceptuel, un modèle de la mdiation indirecte (c'est--dire au moyen de supports mdiatiques) a t propos et appliqu au dveloppement empirique de produits de mdiation et leur valuation. Ce modèle ne garantit pas la russite de la communication ducative, mais contribue crer un cadre favorable au processus. De plus, plusieurs lignes directrices pour le choix du type de mdia et sa mise en forme ont t dfinies sur la base d'une compilation de rsultats de la psychologie cognitive sur l'usage des mdias pour l'apprentissage. Des mthodes qualitatives et quantitatives varies ont t mobilises: enqutes par questionnaire ex situ et in situ, auprs des visiteurs de gomorphosites de montagne, ralisation de mdias interactifs tests ensuite auprs de divers publics (parcours enregistr, pr- et post-questionnaires) et entretiens collectifs. Les rsultats obtenus clairent divers aspects de la problmatique. L'tude du public a montr, par exemple, que le gotourisme possde un rel public parmi les visiteurs des sites de montagnes: trois-quarts d'entre eux expriment de l'intrt pour des explications sur la gologie et l'volution du paysage. Cette thse a explor ces aspects lis au processus d'apprentissage en se focalisant sur les mdias visuels, surtout interactifs. La plupart des mdias visuels couramment utiliss en gomorphologie ont t considrs. Le dveloppement de versions interactives de ces mdias sous forme d'applications web a fourni un aperu concret des possibilits des nouvelles technologies. Les utilisateurs apprcient en particulier a richesse du contenu, le haut degr d'interactivit et la varit de ces applications. De tels mdias incitent visiter le site naturel et semblent aussi rpondre aux intrts de publics varis.
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RESUME : La douleur neuropathique est le rsultat d'une lsion ou d'un dysfonctionnement du systme nerveux. Les symptmes qui suivent la douleur neuropathique sont svres et leur traitement inefficace. Une meilleure approche thrapeutique peut tre propose en se basant sur les mcanismes pathologiques de la douleur neuropathique. Lors d'une lsion priphrique une douleur neuropathique peut se dvelopper et affecter le territoire des nerfs lss mais aussi les territoires adjacents des nerfs non-lss. Une hyperexcitabilit des neurones apparat au niveau des ganglions spinaux (DRG) et de la corne dorsale (DH) de la moelle pinire. Le but de ce travail consiste mettre en vidence les modifications molculaires associes aux nocicepteurs lss et non-lss au niveau des DRG et des laminae I et II de la corne dorsale, l o l'information nociceptive est intgre. Pour tudier les changements molculaires lis la douleur neuropathique nous utilisons le modèle animal d'pargne du nerf sural (spared nerve injury model, SNI) une semaine aprs la lsion. Pour la slection du tissu d'intrt nous avons employ la technique de la microdissection au laser, afin de slectionner une sous-population spcifique de cellules (notamment les nocicepteurs lss ou non-lss) mais galement de prlever le tissu correspondant dans les laminae superficielles. Ce travail est coupl l'analyse large spectre du transcriptome par puce ADN (microarray). Par ailleurs, nous avons tudi les courants lectriques et les proprits biophysiques des canaux sodiques (Na,,ls) dans les neurones lss et non-lss des DRG. Aussi bien dans le systme nerveux priphrique, entre les neurones lss et non-lss, qu'au niveau central avec les aires recevant les projections des nocicepteurs lss ou non-lss, l'analyse du transcriptome montre des diffrences de profil d'expression. En effet, nous avons constat des changements transcriptionnels importants dans les nocicepteurs lss (1561 gnes, > 1.5x et pairwise comparaison > 77%) ainsi que dans les laminae correspondantes (618 gnes), alors que ces modifications transcriptionelles sont mineures au niveau des nocicepteurs non-lss (60 gnes), mais important dans leurs laminae de projection (459 gnes). Au niveau des nocicepteurs, en utilisant la classification par groupes fonctionnels (Gene Ontology), nous avons observ que plusieurs processus biologiques sont modifis. Ainsi des fonctions telles que la traduction des signaux cellulaires, l'organisation du cytosquelette ainsi que les mcanismes de rponse au stress sont affects. Par contre dans les neurones non-lss seuls les processus biologiques lis au mtabolisme et au dveloppement sont modifis. Au niveau de la corne dorsale de la moelle, nous avons observ des modifications importantes des processus immuno-inflammatoires dans l'aire affecte par les nerfs lss et des changements associs l'organisation et la transmission synaptique au niveau de l'aire des nerfs non-lss. L'analyse approfondie des canaux sodiques a dmontr plusieurs changements d'expression, principalement dans les neurones lss. Les analyses fonctionnelles n'indiquent aucune diffrence entre les densits de courant ttrodotoxine-sensible (TTX-S) dans les neurones lss et non-lss mme si les niveaux d'expression des ARNm des sous-units TTX-S sont modifis dans les neurones lss. L'inactivation basale dpendante du voltage des canaux ttrodotoxine-insensible (TTX-R) est dplace vers des potentiels positifs dans les cellules lses et non-lses. En revanche la vitesse de rcupration des courants TTX-S et TTX-R aprs inactivation est acclre dans les neurones lss. Ces changements pourraient tre l'origine de l'altration de l'activit lectrique des neurones sensoriels dans le contexte des douleurs neuropathiques. En rsum, ces rsultats suggrent l'existence de mcanismes diffrencis affectant les neurones lss et les neurones adjacents non-lss lors de la mise en place la douleur neuropathique. De plus, les changements centraux au niveau de la moelle pinire qui surviennent aprs lsion sont probablement intgrs diffremment selon la perception de signaux des neurones priphriques lss ou non-lss. En conclusion, ces modulations complexes et distinctes sont probablement des acteurs essentiels impliqus dans la gense et la persistance des douleurs neuropathiques. ABSTRACT : Neuropathic pain (NP) results from damage or dysfunction of the peripheral or central nervous system. Symptoms associated with NP are severe and difficult to treat. Targeting NP mechanisms and their translation into symptoms may offer a better therapeutic approach.Hyperexcitability of the peripheral and central nervous system occurs in the dorsal root ganglia (DRG) and the dorsal horn (DH) of the spinal cord. We aimed to identify transcriptional variations in injured and in adjacent non-injured nociceptors as well as in corresponding laminae I and II of DH receiving their inputs.We investigated changes one week after the injury induced by the spared nerve injury model of NP. We employed the laser capture microdissection (LCM) for the procurement of specific cell-types (enrichment in nociceptors of injured/non-injured neurons) and laminae in combination with transcriptional analysis by microarray. In addition, we studied functionl properties and currents of sodium channels (Nav1s) in injured and neighboring non-injured DRG neurons.Microarray analysis at the periphery between injured and non-injured DRG neurons and centrally between the area of central projections from injured and non-injured neurons show significant and differential expression patterns. We reported changes in injured nociceptors (1561 genes, > 1.5 fold, >77% pairwise comparison) and in corresponding DH laminae (618 genes), while less modifications occurred in non-injured nociceptors (60 genes) and in corresponding DH laminae (459 genes). At the periphery, we observed by Gene Ontology the involvement of multiple biological processes in injured neurons such as signal transduction, cytoskeleton organization or stress responses. On contrast, functional overrepresentations in non-injured neurons were noted only in metabolic or developmentally related mechanisms. At the level of superficial laminae of the dorsal horn, we reported changes of immune and inflammatory processes in injured-related DH and changes associated with synaptic organization and transmission in DH corresponding to non-injured neurons. Further transcriptional analysis of Nav1s indicated several changes in injured neurons. Functional analyses of Nav1s have established no difference in tetrodotoxin-sensitive (TTX-S) current densities in both injured and non-injured neurons, despite changes in TTX-S Nav1s subunit mRNA levels. The tetrodotoxin-resistant (TTX-R) voltage dependence of steady state inactivation was shifted to more positive potentials in both injured and non-injured neurons, and the rate of recovery from inactivation of TTX-S and TTX-R currents was accelerated in injured neurons. These changes may lead to alterations in neuronal electrogenesis. Taken together, these findings suggest different mechanisms occurring in the injured neurons and the adjacent non-injured ones. Moreover, central changes after injury are probably driven in a different manner if they receive inputs from injured or non-injured neurons. Together, these distinct and complex modulations may contribute to NP.
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Objectif : En Suisse, la radaptation est finance enpartie par l'assureur qui fixe pralablement l'admissionun nombre de jours (dure garantie) qu'il s'engage rembourser. Lorsqu'une dure garantie est trop courte,une demande de prolongation est ncessaire, induisantdes dmarches administratives. Les objectifs de cettetude taient a) d'tudier le lien entre dures garantieset caractristiques du patient ; b) d'estimer les cotslis aux demandes de prolongation ; c) d'valuerl'impact de l'introduction d'un modèle d'attribution dedure garantie bas sur l'tat fonctionnel du patient.Mthodes : Les corrlations entre tat fonctionnel,dure effective et dure garantie ont t testes sur208 sjours reprsentatifs. Des dures garanties fictivesont t calcules partir de la mdiane de dure desjour de 2 335 patients, groups selon leur niveaufonctionnel (score des activits de base de la vie quotidienne(BAVQ) 0-1 vs 2-4 vs 5-6), puis compares auxdures de sjour effectives et garanties.Rsultats : L'tat fonctionnel du patient n'est pascorrl la dure garantie, et 69 % des sjours ncessitentau moins une demande de prolongation, reprsentant2,6 quivalents temps plein en temps administratifprojet sur le canton. L'application du modèle proposrduirait de 28 % les demandes de prolongation, etn'augmenterait que marginalement la proportion dejours garantis en surplus (11,2 % contre 6,5 % actuellement).Conclusion : L'utilisation systmatique d'un modèled'attribution de dures garanties bases sur l'tatfonctionnel du patient permettrait de rduire sensiblementles cots administratifs lis aux demandes deprolongation, sans entraner de risque accru d'une augmentationde la dure de sjour.
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In my first project, I analyzed the role of the amiloride-sensitive epithelial sodium channel ENaC) in the skin during wound healing. ENaC is present in the skin and a function in keratinocyte differentiation and barrier formation has been demonstrated. Previous findings suggested, that ENaC might be implicated in keratinocyte migration, although its role in wound healing was not analyzed yet. Using skin-specific (K14-Cre) conditional ENaC knockout and overexpressing mice, I determined the wound closure kinetic and performed morphometric measurements. The time course of wound repair was not significantly different in knockouts or transgenics when compared to control mice and the morphology of the closing wound was not altered. In my second project, I studied the glucocorticoid-induced leucine zipper (GILZ, Tsc22d3). GILZ is widely expressed and an important role has been predicted in immunity, adipogenesis and renal sodium handling. Mice were generated that constitutively lack all the functional domains of the Gilz gene. In these mice, the expression of GILZ mRNA transcripts and protein were completely abolished in all tissues tested. Surprisingly, knockout mice survived. To test whether GILZ mimicks glucocorticoid action, we studied its implication in T- and B- cell development and in a model of sepsis. We measured cytokine secretion in different inflammatory models, like in peritoneal and bone marrow-derived macrophages, in splenocytes and a model of sepsis. In all our experiments, cytokine secretion from GILZ- deficient cells was not different from controls. From 6 months onwards, knockout mice contained significantly less body fat and were lighter. Following sodium and water deprivation experiments, water and salt homeostasis was preserved. Sterility of knockout males was associated with a severe testis dysplasia, smaller seminiferous tubules, the number of Sertoli and germ cell was reduced while increased apoptosis, but not cell proliferation, was evidenced. The interstitial Leydig cell population was augmented, and higher plasma FSH and testosterone levels were found. Interestingly, the expression of the target gene Ppar2 was diminished in the testis and in the liver, but not in the skin, kidney or fat. Tsc22d1 mRNA transcript level was found to be upregulated in testis, but not in the kidney or fat tissue. In most tissue, excepted the testis, GILZ-deficient mice reveal functional redundancy amongst members of the Tsc22d family or genes involved in the same regulatory pathways. In summary, contrarily to the published in vitro data, GILZ does not play a crucial role attributed in immunology or inflammation, but we identified a novel function in spermatogenesis. -- Dans mon premier projet, j'ai analys le rle du canal pithlial sodique sensible l'amiloride (ENaC) dans la cicatrisation de la peau. ENaC est prsent dans la peau et il a une fonction dans la diffrenciation des kratinocytes et dans la formation de la barrire. Des tudes suggrent qu'ENaC pourrait tre impliqu dans la migration des kratinocytes, cependant, son rle dans la cicatrisation n'a pas encore t tudi. A l'aide de souris qui surexpriment ou qui sont knockout pour ENaC, spcifiquement dans la peau (K14-Cre), j'ai analys le temps de clture de la cicatrice et j'ai aussi tudi la morphologie de la plaie gurissant. Chez les souris qui surexpriment ou chez les knockouts, la vitesse de fermeture et la morphologie de la cicatrice taient identiques aux souris contrles. Dans mon second projet, j'ai tudi le glucocorticoid-induced leucine zipper (GILZ, Tsc22d3). GILZ est largement exprim et un rle important a t prdit dans l'immunit, l'adipognse et le transport sodique rnal. Des souris ont t gnres dont les domaines fonctionnels du gne Gilz sont limins. L'expression de GILZ en ARNm et protine a t compltement abolie dans tous les tissus tests. tonnamment, ces souris knockout survivent. Afin de tester si GILZ imite les effets des glucocorticodes, nous avons tudi son implication dans le dveloppement des cellules T et B ainsi qu'un modèle de septicmie. Nous avons mesur la scrtion de cytokines partir de diffrents modèles d'inflammation tels que des macrophages pritonaux ou de moelle, de splnocytes ou encore d'un modèle de septicmie. Dans toutes nos expriences, la scrtion de cytokines de cellules GILZ-dficientes tait semblable. Ds 6 mois, les knockouts contenaient significativement moins de graisses et taient plus lgres. Suite une privation sodique et aqueuse, l'homostasie du sel et de l'eau tait prserve. Les mles knockouts prsentaient une strilit accompagne d'une dysplasie testiculaire svre, de tubules sminifres taient plus petits et contenaient un nombre rduit de cellules de Sertoli et de cellules germinales. L'apoptose tait augmente dans ces cellules mais pas la prolifration cellulaire. Le nombre de cellules de Leydig tait aussi plus lev, ainsi que la FSH et la testostrone. L'expression du gne cible Pparγ2 tait diminue dans le testicule et le foie, mais pas dans la peau, le rein ou le tissu adipeux. L'ARNm de Tsc22d1 tait plus exprim dans le testicule, mais pas dans le rein ou le tissu adipeux. Dans la plupart des tissus, sauf le testicule, les souris knockouts rvlaient une redondance fonctionnelle des autres membres de la famille Tsc22d ou de gnes impliqus dans les mmes voies de rgulation. En rsum, contrairement aux donnes in vitro, GILZ ne joue pas un rle essentiel en immunologie, mais nous avons identifi une nouvelle fonction dans la spermatognse.
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En clinique infantile, la singularit des ractions motionnelles d'un enfant passe parfois inaperue. Reconnatre le temprament d'un enfant est pourtant une tape souvent utile la construction d'une alliance thrapeutique avec la famille. Le modèle en neuf traits de Thomas et Chess et l'pigense probabiliste de Gottlieb nous semblent offrir des repres utiles au clinicien. Il est alors possible, dans un second temps, d'aborder les problmatiques personnelles des parents qui desservent leur ajustement aux besoins spcifiques de l'enfant.
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Rsum : Les vertbrs ont recours au systme immunitaire inn et adaptatif pour combattre les pathognes. La dcouverte des rcepteurs Toll, il y a dix ans, a fortement augment l'intrt port l'immunit inne. Depuis lors, des rcepteurs intracellulaires tels que les membres de la famille RIG-like helicase (RLHs) et NOD-like receptor (NLRs) ont t dcrits pour leur rle dans la dtection des pathognes. L'interleukine-1 beta (IL-1β) est une cytokine pro-inflammatoire qui est synthtise sous forme de prcurseur, la proIL-1β. La proIL-1β requiert d'tre clive par la caspase-1 pour devenir active. La caspase-1 est elle-mme active par un complexe appel inflammasome qui peut tre form par divers membres de la famille NLR. Plusieurs inflammasomes ont t dcrits tels que le NALP3 inflammasome ou l'IPAF inflammasome. Dans cette tude nous avons identifi la co-chaperone SGT1 et la chaperone HSP90 comme partenaires d'interaction de NALP3. Ces deux protines sont bien connues chez les plantes pour leurs rles dans la rgulation des gnes de rsistance (gne R) qui sont structurellement apparents la famille NLR. Nous avons pu montrer que SGT1 et HSP90 jouent un rle similaire dans la rgulation de NALP3 et des protines R. En effet, nous avons dmontr que les deux protines sont ncessaires pour l'activit du NALP3 inflammasome. De plus, la HSP90 est galement requise pour la stabilit de NALP3. En se basant sur ces observations, nous avons propos un modèle dans lequel SGT1 et HSP90 maintiennent NALP3 inactif mais prt percevoir un ligand activateur qui initierait la cascade inflammatoire. Nous avons galement montr une interaction entre SGT1 et HSP90 avec plusieurs NLRs. Cette observation suggre qu'un mcanisme similaire pourrait tre impliqu dans la rgulation des membres de la famille des NLRs. Ces dernires annes, plusieurs PAMPs mais galement des DAMPs ont t identifis comme activateurs du NALP3 inflammasome. Dans la seconde partie de cette tude, nous avons identifi la rponse au stress du rticulum endoplasmique (RE) comme nouvel activateur du NALP3 inflammasome. Cette rponse est initie lors de l'accumulation dans le rticulum endoplasmique de protines ayant une mauvaise conformation ce qui conduit, en autre, l'arrt de la synthse de nouvelles protines ainsi qu'une augmentation de la dgradation des protines. Les mcanismes par lesquels la rponse du rticulum endoplasmique induit l'activation du NALP3 inflammasome doivent encore tre dtermins. Summary : Vertebrates rely on the adaptive and the innate immune systems to fight pathogens. Awarness of the importance of the innate system increased with the identification of Toll-like receptors a decade ago. Since then, intracellular receptors such as the RIG-like helicase (RLH) and the NOD-like receptor (NLR) families have been described for their role in the recognition of microbes. Interleukin- 1 (IL-1) is a key mediator of inflammation. This proinflammatory cytokine is synthesised as an inactive precursor that requires processing by caspase-1 to become active. Caspase-1 is, itself, activated in a complex termed the inflammasome that can be formed by members of the NLR family. Various inflammasome complexes have been described such as the IPAF and the NALP3 inflammasome. In this study, we have identified the co-chaperone SGT1 and the chaperone HSP90 as interacting partners of NALP3. SGT1 and HSP90 are both known for their role in the activity of plant resistance proteins (R proteins) which are structurally related to the NLR family. We have shown that HSP90 and SGT1 play a similar role in the regulation of NALP3 and in the regulation of plant R proteins. Indeed, we demonstrated that both HSP90 and SGT1 are essential for the activity of the NALP3 inflammasome complex. In addition, HSP90 is required for the stability of NALP3. Based on these observations, we have proposed a model in which SGT1 and HSP90 maintain NALP3 in an inactive but signaling-competent state, ready to receive an activating ligand that induces the inflammatory cascade. An interaction between several NLR members, SGTI and HSP90 was also shown, suggesting that similar mechanisms could be involved in the regulation of other NLRs. Several pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) but also danger associated molecular patterns (DAMPs) have been identified as NALP3 activators. In the second part of this study, we have identified the ER stress response as a new NALP3 activator. The ER stress response is activated upon the accumulation of unfolded protein in the endoplasmic reticulum and results in a block in protein synthesis and increased protein degradation. The mechanisms of ER stress-mediated NALP3 activation remain to be determined.
