Biana: a software framework for compiling biological interactions and analyzing networks

Background: The analysis and usage of biological data is hindered by the spread of information across multiple repositories and the difficulties posed by different nomenclature systems and storage formats. In particular, there is an important need for data unification in the study and use of protein-protein interactions. Without good integration strategies, it is difficult to analyze the whole set of available data and its properties.Results: We introduce BIANA (Biologic Interactions and Network Analysis), a tool for biological information integration and network management. BIANA is a Python framework designed to achieve two major goals: i) the integration of multiple sources of biological information, including biological entities and their relationships, and ii) the management of biological information as a network where entities are nodes and relationships are edges. Moreover, BIANA uses properties of proteins and genes to infer latent biomolecular relationships by transferring edges to entities sharing similar properties. BIANA is also provided as a plugin for Cytoscape, which allows users to visualize and interactively manage the data. A web interface to BIANA providing basic functionalities is also available. The software can be downloaded under GNU GPL license from http://sbi.imim.es/web/BIANA.php.Conclusions: BIANA's approach to data unification solves many of the nomenclature issues common to systems dealing with biological data. BIANA can easily be extended to handle new specific data repositories and new specific data types. The unification protocol allows BIANA to be a flexible tool suitable for different user requirements: non-expert users can use a suggested unification protocol while expert users can define their own specific unification rules.

Disseny i implementació d'un marc de treball (framework) de presentació per aplicacions J2EE : Jewel Framework

El present projecte tracta sobre el desenvolupament d'un marc de treball o framework per la capa de presentació d'aplicacions J2EE.En un primer bloc, s'analitzen els frameworks més utilitzats al món empresarial a dia d'avui: Struts 2, Spring MVC i JavaServer Faces. S'estudia com funcionen i les característiques principals de cada un, comparant-les per veure quines són comuns a tots i es consideren imprescindibles per un framework d'aquest tipus. A més, es fa un anàlisi exhaustiu dels patrons J2EE i les bones pràctiques que poden aportar al projecte.El segon bloc del projecte és el desenvolupament de Jewel Framework, el marc de treball que s'ha creat. Primer, s'analitza quines són les funcionalitats que ha de complir el framework i es fa un disseny de l'arquitectura i estructura que segueix. Després, s'implementa seguint el disseny i tenint cura que es compleixin tots els requisits, tant funcionals com de qualitat del producte. Finalment, es dissenya i desenvolupa una aplicació d'exemple que demostra la usabilitat i bon funcionament de Jewel.

Virtual Camarero : desarrollo de aplicaciones departamentales con .NET Framework 4.0

El Virtual Camarero es un proyecto de final de carrera realizado con .NET. Consiste en una aplicación para terminal táctil para poder realizar pedidos en un bar o restaurante desde la mesa de un local. Sin la necesidad de que el camarero venga a pedir lo que se quiere tomar.

Disseny i implementació d'un marc de treball de presentació amb XML per a aplicacions J2EE a partir del Framework Struts

L'objectiu principal d'aquest projecte és la separació total dels rols de programador i de dissenyador de vistes en el disseny d'aplicacions distribuïdes fetes mitjançant tecnologia J2EE, i també el suport d'una sola aplicació a diferents tipus de client i idiomes alhora, sense la necessitat de codi extra o específic per a aconseguir-ho.

Generació automàtica d'una solució JEE (JPA + EJB + JSF) basada en el framework AndroMDA

En aquest projecte s'utilitzarà el framework AndroMDA per construir un programari que permeti generar automàticament a partir d'un model UML simple una aplicació JEE.

Framework para la capa de presentación de aplicaciones web

El framework dissenyat, denominat magis, ajuda als desenvolupadors organitzant la presentació de continguts, l'accés a les funcions i serveis de negoci, el flux de pàgines, el processament de formularis, el maneig d'errors i la gestió d'estat.

J2EE Framework capa de presentación

El present projecte se centra en la creació d'un framework1 per a la capa de presentació de java J2EE2, així com un generador de codi de suport a aquest.

Diseño e implementación de un marco de trabajo(framework) de presentación para aplicaciones J2EE

El projecte de fi de carrera proposat consisteix en l'anàlisi, disseny i implementació d'un conjunt de components que simplifiquen la construcció de la capa de presentació per a aplicacions web, servint de base per al desenvolupament d'altres productes.

GWT RAD Base : desenvolupament d'un framework JEE.Aplicació pràctica : Registre E/S de la policia local

Aquest treball consta de 2 parts, la primera consisteix en desenvolupar el framework JEE amb arquitectura MVC que he denominat GWT RAD Base (qualsevol altre nom haguésvalgut també), i la segona és una aplicació pràctica de registre de entrada i sortida de la policialocal implementada mitjançant aquest framework.

Disseny i implementació d'un marc de treball (framework) de presentació per aplicacions J2EE

En aquest projecte he dissenyat i implementat un marc de treball (framework) de presentació per aplicacions J2EE. Avui en dia, per desenvolupar aplicacions web, estem obligats a que segueixin una sèrie de qualitats per tal de fer-les útils. Aquestes són eficiència, extensibilitat, reutilització i portabilitat. De no ser així, el nostre programari no tindrà lloc al mercat. Per tal d' aconseguir aquestes qualitats, cal seguir les regles establertes i utilitzar frameworks.

Diseño e implementación de un framework de presentación para J2EE

Diseño de d'jNeko, un framework basado en acciones para la capa de presentación de aplicaciones J2EE.

Diseño e implementación de un framework de persistencia

Los Frameworks constituyen el nuevo paradigma en cuanto al desarrollo de software se refiere. Entre sus principales características se encuentran la facilidad para la reutilización de código. En este marco específico proporcionados por la tecnología usaremos la tecnología JAVA y su extensión en cuanto a la persistencia de datos. El Framework de persistencia es el responsable de gestionar la lógica de acceso a los datos en un SGBD (Sistema de Gestión de Bases de Datos), ya sea de entrada o salida, y ocultando los detalles más pesados relativos a la estructura propia de la Base de Datos utilizada, de manera completa y transparentemente. En conclusión, este proyecto se basa en un análisis del los Frameworks existentes, analizando sus características y profundizando en los detalles concretos de su actividad y manejo en cuanto a la persistencia.

Framework de persistència J2EE

Disseny i implementació d'un framework de persistència per a aplicacions J2EE. S'inclou un estudi de mercat i una aplicació desenvolupada que utilitza el framework implementat.

Diseño de un framework de persistencia

Este proyecto de final de carrera va encaminado al análisis, diseño e implementación de componentes de software, usualmente llamado framework, con la idea de servir de base para desarrollos sencillos directos así como para rediseños escalares posteriores. El objetivo es triple: estudiar y evaluar las diferentes alternativas existentes para implementar la capa de persistencia para aplicaciones JEE de cliente delgado, hacer el diseño y la implementación de un framework de mapeo entidad-relación y, por último, construir una aplicación de ejemplo que muestre el uso del framework que ha implementado.

Sistema de Administración de Propiedades Proyecto de Software Libre Wakodi

El trabajo se centra en proporcionar una solución informática para la Administración de Propiedades haciendo uso de nuevas tecnologías y a su vez dotar de las herramientas necesarias para la construcción de una comunidad. El desarrollo de la solución pasa por la descripción de las herramientas empleadas y las etapas para su construcción, que incluyen el análisis, diseño, implementación y posterior implantación. Se hace énfasis en el Framework elegido para demostrar las ventajas de su aplicación. En la construcción de la comunidad se describen las herramientas utilizadas para la difusión del proyecto que incluyen la publicación de una página del proyecto, el uso de redes sociales y páginas publicitarias y la puesta en marcha de un software de colaboración para la administración del desarrollo del proyecto.