Design and implementation of a behaviorally typed programming system for web services

Dissertação apresentada na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para a obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Informática.

Territórios Globais - Explosão Demográfica e Internet

De acordo com os últimos dados da ONU, a população da terra está a crescer a um ritmo demasiado elevado. Dos cinco mil milhões em 1987, para mais de seis mil milhões em 2007 e, em 2050, mais de 9 mil milhões. Ainda segundo a Agência das Nações Unidas para a População (UNFPA), em 2007 a população urbana já atingia os 50% da população mundial. O acentuado crescimento demográfico far-se-á sentir sobretudo nos continentes Africano e Asiático onde, apenas numa geração, o seu crescimento acumulado duplicará. Isso significa que, daqui a 23 anos nas maiores cidades do mundo, viverão 80% dos habitantes do planeta. O mundo vira-se assim para as cidades, asfixiando-as num insuportável ritmo de crescimento urbano onde, por vezes, várias cidades se juntam numa, tornando-se aglomerações de escala regional. As razões que levam as cidades a um tão elevado crescimento são múltiplas. A sociedade da informação poderá ser um dos factores responsáveis. Se há uns anos se pensava que esta traria uma diminuição da densidade populacional das cidades, devido a factores resultantes de mudanças como o téle-trabalho ou a diminuição do número de deslocações entre o local de trabalho e as periferias, tais pressupostos não se vieram a verificar. A globalização poderia ser outro dos factores explicativos, uma vez que as cidades e as regiões estão a competir por recursos humanos, pela captação de investimento e pela imagem através do marketing territorial. A globalização e a regionalização representam ambos os lados da mesma medalha, reflectindo-se na economia, na cultura e no contexto sócio-político das grandes potências mundiais. Ambas as tendências devem ter, logicamente, expressão na Internet. De facto, além dos domínios de topo associados ao código de cada país (.pt para Portugal, .fr para França. etc.) começa a ser sentida uma enorme necessidade de criar um novo tipo de domínios, quer regionais quer, inclusivamente ao nível das cidades. Estes representariam um conjunto de sub-domínios associados quer a nomes completos, quer a abreviaturas de cidades. Este paper tem assim como objectivos: (i) Observar, para alguns países, o cenário de crescimento demográfico; (ii) Quantificar com base em metodologias de análise da Geografia da Internet, a espacialização territorial do endereçamento IP (Internet Protocol) através do número de hosts por domínios de topo (número de dispositivos on-line); (iii) Questionar a correlação entre deste indicador com a dinâmica demográfica de alguns territórios; (iv) Reflectir sobre as propostas para novas designações de domínios de topo (.eu, .asia, .nyc, .sg, .berlim, etc. ) que representariam comunidades políticas, económicas e/ou culturais de inquestionável relevância.

Simple and stable dynamic traffic engineering for provider scale ethernet

Trabalho apresentado no âmbito do Mestrado em Engenharia Informática, como requisito parcial para obtenção do grau de Mestre em Engenharia Informática

Immune response and tissue cytoprotection: two sides of the same coin in immunopathology

Dissertation presented to obtain the Ph.D degree in Biochemistry

Expressão em Escherichia coli de antigénios do Cell fusing agent virus (Flaviviridae: Flavivirus) como proteína de fusão

RESUMO: O Cell Fusing Agent Vírus (CFAV), considerado como o primeiro “flavivírus específicos de insectos” (ISF), parece estar exclusivamente adaptado aos seus hospedeiros, não replicando em células de vertebrados. Apesar de ter sido identificado há mais de três décadas (1975), a verdade é que muito pouco se conhece sobre a sua biologia. Dado o seu parentesco filogenético com alguns outros flavivírus encontrados naturalmente em mosquitos de diferentes géneros colhidos em diferentes regiões do globo, este vírus poderá ser usado como modelo para o estudo de ISF. No entanto, necessitam do desenvolvimento de ferramentas básicas, tais como clones moleculares ou baterias de soros contendo anticorpos que reconheçam uma ou mais proteínas codificadas pelo genoma viral, produzidas, por exemplo, a partir de antigénios virais produzidos de forma recombinante. Com este trabalho pretendeu-se a optimização de protocolos que permitiram a expressão e purificação parcial de quatro proteínas [duas proteínas estruturais (C e E) e duas não estruturais (NS3hel e NS5B)] do CFAV em E. coli, todas elas produzidas como proteínas de fusão com “caudas” (tags) de hexahistidina nos seus extremos carboxilo. Para a expansão do CFAV foram utilizadas células Aedes albopictus (C6/36). Após a realização da extracção do RNA viral e a obtenção de cDNA, procedeu-se amplificação, por RT-PCR, das regiões codificantes das proteínas C, E, NS3hel e NS5B, utilizando primers específicos. Os quatro fragmentos de DNA foram independentemente inseridos no vector pJTE1.2/blunt usando E. coli NovaBlue como hospedeira de clonagem e, posteriormente, inseridos em vectores de expressão pET-28b e pET-29b usando E. coli BL21(DE3)pLysS e Rosetta(DE3)pLysS como hospedeiras de expressão. Após da indução, expressão e purificação das proteínas recombinantes C, E, NS3hel e NS5B, foi confirmada a autenticidade destas proteínas produzidas através do método Western Blot com um anticorpo anti-histidina. --------- ABSTRACT: The Cell Fusing Agent virus (CFAV) considered as the first "insect- specific flavivirus" (ISF) and seems to be uniquely adapted to their hosts, not replicating in vertebrate cells. Although it has been known for more than three decades (1975), the truth is very little is known about its biology. Given its close phylogenetic relationship with other flavivirus naturally circulating in various genera of mosquitoes collected from different regions of the globe, this virus could be used as a model for the study of ISF. However, such studies require the development of experimental basic tools, such as molecular clones or serum batteries containing antibodies that recognize one or more proteins encoded by the viral genome, produced, for example, from viral antigens recombinant produced. In this work, we carried out the optimization of protocols that allowed the expression and partial purification of four proteins [two structural proteins (C and E) and two nonstructural proteins (NS3hel and NS5B)] CFAV in E. coli as fusion protein for c-terminal hexahistidine tags. For the expansion of the CFAV we used Aedes albopictus (C6/36) cells. After completion of the viral RNA extraction and cDNA obtained, amplification of the coding regions of the C, E, NS5B and NS3hel proteins was carried out by RT-PCR using specific primers. The four DNA fragments were independently inserted into the vector pJTE1.2/blunt using E. coli NovaBlue as cloning host and then inserted into expression vectors pET-28b and pET-29b using E. coli BL21(DE3)pLysS and Rosetta(DE3)pLysS as expression host. After induction, expression and purification of recombinant C, E, NS3hel and NS5B proteins Western Blot analyses with an anti-histidine antibody confirmed the authenticity of these proteins produced.

Epidemiological studies of Streptococcus pneumoniae carriage in the post-vaccination era among two risk groups: children and the elderly

Dissertation presented to obtain the Ph.D. degree in Biology/ Molecular Biology

Genetic characterization of Portuguese Fasciola hepatica isolates

Dissertation presented to obtain the Master Degree in Molecular, Genetics and Biomedicine

A layer 2 multipath fabric using a centralized controller

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Electrotécnica e de Computadores

Studies of the assembly of the Streptococcus pneumoniae capsular polysaccharide

Dissertation presented to obtain the Ph.D degree in Biology.

A distributed platform for the volunteer execution of workflows on a local area network

Thesis submitted in fulfilment of the requirements for the Degree of Master of Science in Computer Science

Genomic and environmental factors influence Wolbachia-Drosophila symbiosis

Intracellular, vertically transmitted bacteria form complex and intimate relationships with their hosts. Wolbachia, maternally transmitted α- proteobacteria, live within the cells of numerous arthropod species. Wolbachia are famous master manipulators of insect reproduction: to favour their own spread they can induce male killing, parthenogenesis or cytoplasmic incompatibility. Wolbachia can also protect various insects from pathogens, which makes them a promising tool for the control of vector-borne diseases. Mosquitoes with Wolbachia have already been released in the wild to eliminate dengue. Yet, how Wolbachia manipulate their hosts remains largely unknown.(...)

UK Mental health professionals volunteering in LMIC-benefits to UK and host countries

RESUMO: O Royal College of Psychiatrists tem um programa de voluntariado internacional desde 2005. O interesse no Reino Unido tem crescido nos últimos 15 anos com muitos projetos novos. Os benefícios para vários países têm sido reconhecidos. O que está menos claro são os benefícios da experiência para o Reino Unido e do programa de voluntariado do Royal College of Psychiatrists. O objectivo desta dissertação é explorar os benefícios do voluntariado para o Sistema Nacional de Saúde focando principalmente, mas não exclusivamente, o programa de voluntariado do Royal College of Psychiatrists. Nesta dissertação abordamos primeiro o contexto antes de discutirmos dois grandes estudos de psiquiatras e hospitais do Sistema Nacional de Saúde no Reino Unido. Incluimos no estudo todos os psiquiatras registados como Voluntários no Royal College of Psychiatrists e o Grupo de Interesse Especial associado. Foi ainda possível incluir os Diretores Médicos de todos os hospitais do Reino Unido. Os estudos foram desenhados para analisar as opiniões dos Voluntários do Reino Unido sobre os benefícios para os países recetores de baixo e médio rendimento e para o Reino Unido. Todos os 60 hospitais do Sistema Nacional de Saúde foram incluí dos para analisar a opinião sobre Voluntariado. As limitações dos estudos foram a baixa taxa de resposta, mas esta foi comparável a outros estudos do College. É provável haver um enviezamento de resposta e favorecimento dos que estão envolvidos no Voluntariado. Os resultados mostraram um interesse forte no voluntariado e benefícios no Sistema Nacional de Saúde, nas. áreas de liderança, transculturalismo, gestão e recursos e capacidades pessoais. Os hospitais do Sistema Nacional de Saúde valorizaram o voluntariado e, em contrapartida, o valor acrescido para competências profissionais. Os obstáculos contra o Voluntariado a nível individual e dos hospitais foram maioritariamente de natureza prática, tais como obter dispensa do trabalho, substituição no trabalho e custos. As implicações destes estudos são que o programa de voluntariado do College precisa de ser fortalecido. Para assegurar que este trabalho continua é necessário existir uma sensibilização nacional e maior responsabilização sobre os benefícios para o Reino Unido e a nível global. -------------------------- ABSTRACT: The Royal College of Psychiatrists has had an international volunteering programme since 2005. The interest in UK has grown over the past 15 years with many new projects. The benefits in various countries has been acknowledged. What has been less clear are the benefits of the experience back in the UK and of the Royal College of Psychiatrists Volunteer Scheme. The aim of this dissertation is to explore the benefit of volunteering to the NHS focusing mainly, but not exclusively on the Royal College of Psychiatrists Volunteering scheme. In this dissertation we first look at background information before discussing two large surveys of Psychiatrists and NHS Trusts in UK. We surveyed all those registered as Volunteers at the Royal College of Psychiatrists and the associated Special Interest Group. We also were able to survey the Medical Directors of all UK Trusts. The Surveys were designed to assess views of UK Volunteers of benefits to hosts in LMIC and back in UK. All 60 NHS Trusts were surveyed to assess the view of Volunteering. Limitation of the surveys were the low response rate but this was comparable to other College surveys. There is likely to be a bias in response and favour those who are engaged in the Volunteering agenda. Results showed a strong interest in volunteering and perceived benefits in NHS. These areas included leadership, transcultural, resource management and personal skills. NHS trusts valued volunteering and added value to professional competencies on return. Obstacles to Volunteering at individual and Trust level were mainly practical issues such as getting time off, cover and costs. Implications of these surveys are that the College volunteering scheme needs strengthening. There needs to be a National advocacy to ensure that this work continues and greater accountability as to benefits in UK and globally.