Galerkin finite element method for incompressible thermofluid flows framed within the bond graph theory

In this paper a bond graph methodology is used to model incompressible fluid flows with viscous and thermal effects. The distinctive characteristic of these flows is the role of pressure, which does not behave as a state variable but as a function that must act in such a way that the resulting velocity field has divergence zero. Velocity and entropy per unit volume are used as independent variables for a single-phase, single-component flow. Time-dependent nodal values and interpolation functions are introduced to represent the flow field, from which nodal vectors of velocity and entropy are defined as state variables. The system for momentum and continuity equations is coincident with the one obtained by using the Galerkin method for the weak formulation of the problem in finite elements. The integral incompressibility constraint is derived based on the integral conservation of mechanical energy. The weak formulation for thermal energy equation is modeled with true bond graph elements in terms of nodal vectors of temperature and entropy rates, resulting a Petrov-Galerkin method. The resulting bond graph shows the coupling between mechanical and thermal energy domains through the viscous dissipation term. All kind of boundary conditions are handled consistently and can be represented as generalized effort or flow sources. A procedure for causality assignment is derived for the resulting graph, satisfying the Second principle of Thermodynamics. (C) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

Optimization and Complexity Reduction of Switch-Reconfigured Antennas Using Graph Models

This letter addresses the optimization and complexity reduction of switch-reconfigured antennas. A new optimization technique based on graph models is investigated. This technique is used to minimize the redundancy in a reconfigurable antenna structure and reduce its complexity. A graph modeling rule for switch-reconfigured antennas is proposed, and examples are presented.

OCCURRENCE AND ANTIBIOTIC SENSIBILITY PROFILE OF Salmonella spp. ISOLATED FROM PORK MEAT CUTS COMMERCIALIZED IN THE OPEN MARKETS IN PELOTAS, RS (BRAZIL)

The objective of the present study was to evaluate the occurrence of Salmonella spp. in 15 samples of pork meat cuts (T-bone, shank, sausage and ribs) commercialized in open markets of Pelotas (RS, Brazil) and verify the prevalent serovars, and test the isolates profile of sensitivity to several antibiotics of importance in medicine (nalidixic acid, ampicillin, aztreonam, kanamycin, carbenicillin, cephalothin, cefoxitin, ceftriaxone, ciprofloxacin, chloramphenicol, gentamicin, sulfonamide, tetracycline and trimetoprina). Twelve samples (80%) were contaminated by Salmonella enterica, serovars Infantis, Derby, Panama and Typhimurium. All isolates were susceptible to trimetoprin, aztreonam, ciprofloxacin, ceftriaxone and cefoxitin. For the other antibiotics, the pattern of sensitivity varied as serovar. In addition, 39.1% of isolates showed up to be multiresistant.

Characterization of rat behavior in the elevated plus-maze using a directed graph

The elevated plus-maze is a device widely used to assess rodent anxiety under the effect of several treatments, including pharmacological agents. The animal is placed at the center of the apparatus, which consists of two open arms and two arms enclosed by walls, and the number of entries and duration of stay in each arm are measured for a 5-min exposure period. The effect of an anxiolytic drug is to increase the percentage of time spent and number of entries into the open arms. In this work, we propose a new measure of anxiety levels in the rat submitted to the elevated plus-maze. We represented the spatial structure of the elevated plus-maze in terms of a directed graph and studied the statistics of the rat`s transitions between the nodes of the graph. By counting the number of times each transition is made and ordering them in descending frequency we represented the rat`s behavior in a rank-frequency plot. Our results suggest that the curves obtained under different pharmacological conditions can be well fitted by a power law with an exponent sensitive to both the drug type and the dose used. (C) 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.

Quality control of Toxoplasma gondii in meat packages: Standardization of an ELISA test and its use for detection in rabbit meat cuts

Toxoplasma gondii causes severe disease both to man and livestock and its detection in meat after slaughtering requires PCR or biological tests. Meat packages contain retained exudate that could be used for serology due to its blood content. Similar studies reported false negative assays in those tests. We standardized an anti-T. gondii IgG ELISA in muscle juices from experimentally infected rabbits, with blood content determination by cyanhemoglobin spectrophotometry. IgG titers and immunoblotting profiles were similar in blood, serum or meat juice, after blood content correction. These assays were adequate regardless of the storage time up to 120 days or freeze-thaw cycles, without false negative results. We also found 1.35% (1/74) positive sample in commercial Brazilian rabbit meat cuts, by this assay. The blood content determination shows ELISA of meat juice may be useful for quality control for toxoplasmosis monitoring. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Designing Novel Antitrypanosomal Agents from a Mixed Graph-Theoretical Substructural Approach

Chagas disease is nowadays the most serious parasitic health problem. This disease is caused by Trypanosoma cruzi. The great number of deaths and the insufficient effectiveness of drugs against this parasite have alarmed the scientific community worldwide. In an attempt to overcome this problem, a model for the design and prediction of new antitrypanosomal agents was obtained. This used a mixed approach, containing simple descriptors based on fragments and topological substructural molecular design descriptors. A data set was made up of 188 compounds, 99 of them characterized an antitrypanosomal activity and 88 compounds that belong to other pharmaceutical categories. The model showed sensitivity, specificity and accuracy values above 85%. Quantitative fragmental contributions were also calculated. Then, and to confirm the quality of the model, 15 structures of molecules tested as antitrypanosomal compounds (that we did not include in this study) were predicted, taking into account the information on the abovementioned calculated fragmental contributions. The model showed an accuracy of 100% which means that the ""in silico"" methodology developed by our team is promising for the rational design of new antitrypanosomal drugs. (C) 2009 Wiley Periodicals, Inc. J Comput Chem 31: 882-894. 2010

Design of novel antituberculosis compounds using graph-theoretical and substructural approaches

The increasing resistance of Mycobacterium tuberculosis to the existing drugs has alarmed the worldwide scientific community. In an attempt to overcome this problem, two models for the design and prediction of new antituberculosis agents were obtained. The first used a mixed approach, containing descriptors based on fragments and the topological substructural molecular design approach (TOPS-MODE) descriptors. The other model used a combination of two-dimensional (2D) and three-dimensional (3D) descriptors. A data set of 167 compounds with great structural variability, 72 of them antituberculosis agents and 95 compounds belonging to other pharmaceutical categories, was analyzed. The first model showed sensitivity, specificity, and accuracy values above 80% and the second one showed values higher than 75% for these statistical indices. Subsequently, 12 structures of imidazoles not included in this study were designed, taking into account the two models. In both cases accuracy was 100%, showing that the methodology in silico developed by us is promising for the rational design of antituberculosis drugs.

Acessibilidade em ambiente universitário: identificação de barreiras arquitetônicas no campus da USP de Bauru

A acessibilidade é um direito do cidadão assegurado por lei para que portadores de deficiência tenham a possibilidade de usufruir de recursos e ações no âmbito social. Barreiras arquitetônicas interferem na vida destes podendo deixá-los a parte da convivência e vida social. Os objetivos deste estudo foram: identificar, descrever e mapear barreiras físicas no Campus da Universidade de São Paulo de Bauru e apresentar as intervenções realizadas, durante o período de outubro de 2001 a dezembro de 2005. O estudo foi descritivo-quantitativo, no qual a coleta de dados centrou-se na análise das condições arquitetônicas das três unidades que compõe este campus, observada as normativas da Associação Brasileira de Normas técnicas e realizada intervenções. Foram identificados: 72 pontos de guias não rebaixadas, 21 pontos de acessos com diferenças de níveis sem rampas; 220m² de escadas/rampas sem corrimãos; 658m² de escadas/rampas com corrimãos em discordância com as normas vigentes; 03 rampas com inclinações superiores às determinadas nas normas técnicas; 10 banheiros parcialmente adaptados para deficientes; 02 vagas de estacionamento parcialmente adaptadas e 02 elevadores existentes. Foram executados, em 19 pontos, rebaixamentos de guias, somando 115 m², com linhas de piso tátil, pintados; 8 rampas; 14 pontos de escadas e rampas externas instaladas com corrimãos e guarda-corpos, 5 vagas exclusivas no estacionamento; instalado 2 centrais de atendimento telefônico para surdo e adquiridas 3 cadeira de rodas. As intervenções realizadas contribuíram para melhorar a acessibilidade de portadores de deficiência no campus favorecendo a utilização dos recursos existentes neste espaço público.

ScriptLattes: an open-source knowledge extraction system from the Lattes platform

The Lattes platform is the major scientific information system maintained by the National Council for Scientific and Technological Development (CNPq). This platform allows to manage the curricular information of researchers and institutions working in Brazil based on the so called Lattes Curriculum. However, the public information is individually available for each researcher, not providing the automatic creation of reports of several scientific productions for research groups. It is thus difficult to extract and to summarize useful knowledge for medium to large size groups of researchers. This paper describes the design, implementation and experiences with scriptLattes: an open-source system to create academic reports of groups based on curricula of the Lattes Database. The scriptLattes system is composed by the following modules: (a) data selection, (b) data preprocessing, (c) redundancy treatment, (d) collaboration graph generation among group members, (e) research map generation based on geographical information, and (f) automatic report creation of bibliographical, technical and artistic production, and academic supervisions. The system has been extensively tested for a large variety of research groups of Brazilian institutions, and the generated reports have shown an alternative to easily extract knowledge from data in the context of Lattes platform. The source code, usage instructions and examples are available at http://scriptlattes.sourceforge.net/.

Desenvolvimento morfológico dos ovários em fetos eqüinos sem raça definida

O objetivo deste trabalho foi caracterizar histologicamente o desenvolvimento ovariano pré-natal em fetos eqüinos sem raça definida (SRD) nos trópicos, ressaltando surgimento e quantificação de ovogônias e folículos. Foram obtidos 131 fetos em frigorífico, os quais foram mensurados quanto ao comprimento (cm) equivalente à distância cefalococcígea (CR), seguido de corte das gônadas e fixação das amostras em Bouin por 24 horas. As idades foram estimadas por regressão. Foram preparados cortes histológicos ovarianos de 7µm de espessura, os quais foram corados com hematoxilina-eosina. O surgimento de ovogônias, folículos primordiais, em crescimento e antrais foi verificado, respectivamente, em fetos com CR entre 4,1 e 6,5cm (40 a 49 dias de gestação (DG)); 9,1 e 12,0cm (60 a 69 DG); 23,1 e 29,0cm (116 a 135 DG) e 50,1 e 65,0cm (201 a 245 DG). A quantidade máxima de ovogônias, folículos primordiais, em crescimento e antrais foi observada em fetos com CR entre, 4,1 e 6,0cm (40 a 49 DG); 16,1 e 23,0cm (90 a 115 DG); 29,1 e 36,0cm (136 a 155 DG) e 50,1 e 97,0cm (201 a 320 DG), respectivamente. Os resultados sugerem que o desenvolvimento morfológico dos ovários fetais de eqüinos SRD nos trópicos é mais precoce que o observado nos relatos de literatura referentes a estudos de eqüinos de diversas raças em regiões temperadas.

Ácidos orgânicos em aguardentes produzidas em alambique e em coluna

The concentration of 14 organic acids of 50 sugarcane spirits samples was determined by gas chromatography using flame ionization detection. The organic acids analytical quantitative profile in stills and column distilled spirits from wines obtained from the same must were compared. The comparison was also carried in "head", "heart" and "tail fractions of stills distilled spirits. The experimental data were analyzed by Principal Components Analysis (PCA) and pointed out that the distillation process (stills and column) strongly influences the lead spirits' organic acid composition and that producers' operational "cuts off" to produce "tail", "heart" and "head", fractions should be optimized.

Análise TG-ROC de testes de imunofluorescência no diagnóstico de leishmaniose visceral canina

OBJETIVO: Analisar a acurácia do diagnóstico de dois protocolos de imunofluorescência indireta para leishmaniose visceral canina. MÉTODOS: Cães provenientes de inquérito soroepidemiológico realizado em área endêmica nos municípios de Araçatuba e de Andradina, na região noroeste do estado de São Paulo, em 2003, e área não endêmica da região metropolitana de São Paulo, foram utilizados para avaliar comparativamente dois protocolos da reação de imunofluorescência indireta (RIFI) para leishmaniose: um utilizando antígeno heterólogo Leishmania major (RIFI-BM) e outro utilizando antígeno homólogo Leishmania chagasi (RIFI-CH). Para estimar acurácia utilizou-se a análise two-graph receiver operating characteristic (TG-ROC). A análise TG-ROC comparou as leituras da diluição 1:20 do antígeno homólogo (RIFI-CH), consideradas como teste referência, com as diluições da RIFI-BM (antígeno heterólogo). RESULTADOS: A diluição 1:20 do teste RIFI-CH apresentou o melhor coeficiente de contingência (0,755) e a maior força de associação entre as duas variáveis estudadas (qui-quadrado=124,3), sendo considerada a diluição-referência do teste nas comparações com as diferentes diluições do teste RIFI-BM. Os melhores resultados do RIFI-BM foram obtidos na diluição 1:40, com melhor coeficiente de contingência (0,680) e maior força de associação (qui-quadrado=80,8). Com a mudança do ponto de corte sugerido nesta análise para a diluição 1:40 da RIFI-BM, o valor do parâmetro especificidade aumentou de 57,5% para 97,7%, embora a diluição 1:80 tivesse apresentado a melhor estimativa para sensibilidade (80,2%) com o novo ponto de corte. CONCLUSÕES: A análise TG-ROC pode fornecer importantes informações sobre os testes de diagnósticos, além de apresentar sugestões sobre pontos de cortes que podem melhorar as estimativas de sensibilidade e especificidade do teste, e avaliá-los a luz do melhor custo-benefício.

Crescimento alométrico dos componentes da carcaça de cordeiros Texel × Ile de France confinados do desmame aos 35kg de peso vivo

Foi avaliado o crescimento alométrico de ossos, músculos e gordura, e das regiões da carcaça de cordeiros Texel × Ile de France, terminados em confinamento. Vinte cordeiros, machos não-castrados, foram desmamados aos 42 dias de idade (15,9 ± 2,1kg de peso vivo) e confinados em baias individuais recebendo alimentação ad libitum. Destes, cinco foram abatidos 10 dias após o desmame e, os remanescentes, aos 25, 30 ou 35kg de peso vivo. Para determinação do crescimento alométrico dos cortes e tecidos foi utilizada a equação exponencial Y = aXb, transformada logaritmicamente em um modelo linear. Observou-se crescimento precoce (b = 0,89) da paleta, ao passo que a perna, a costela e o pescoço apresentaram crescimento isogônico (b = 1,00, 1,03 e 1,11, respectivamente), ou seja, equivalente ao da carcaça. O aumento do peso da carcaça implicou em redução da taxa de crescimento de ossos e músculos (b = 0,60 e 0,92, respectivamente) e aumento da taxa de crescimento da gordura (b = 1,78). O crescimento muscular foi diferenciado nas distintas regiões da carcaça, sendo isogônico na paleta (b = 0,98) e na perna (b = 0,99) e precoce na costela (b = 0,90) e no pescoço (b = 0,79). Recomenda-se que o abate de cordeiros Texel × Ile de France seja realizado com, no máximo, 30kg de peso vivo.

Características de produção e qualidade nutricional de genótipos de capim- colonião colhidos em três estádios de maturidade

Objetivou- se verificar a existência de variação genética entre cultivares de capim- colonião quanto ao efeito da maturidade sobre a composição química e a digestibilidade, e classificar os genótipos de acordo com características produtivas e de qualidade nutricional. Utilizou- se o delineamento de blocos ao acaso, com parcelas subdivididas e três repetições, considerando parcelas as datas de corte e subparcelas, os genótipos. A produção de MS diferiu entre os genótipos somente aos 90 dias de crescimento, mas a porcentagem de folhas, colmos e material morto variou tanto aos 60 como aos 90 dias de crescimento. Ao contrário do observado para as folhas, a composição química e a digestibilidade do colmo apresentou grande variabilidade entre os genótipos. O colmo apresentou concentrações mais elevadas de FDN, FDA e lignina e menores valores de PB em comparação às folhas. Apresentou ainda maior digestibilidade da MS aos 60 dias de crescimento e maior digestibilidade da FDN aos 30 e 60 dias de crescimento. No agrupamento dos cultivares, os genótipos PM39 e PM47 foram apontados como os mais promissores no programa de melhoramento, por apresentarem alta produtividade e alta qualidade nutricional. A maturidade pouco afeta a digestibilidade de folhas em comparação ao colmo. Quando a participação de colmo no total de massa seca aumenta, esse componente passa a ser o limitador da qualidade de plantas forrageiras. Portanto, programas de melhoramento devem considerar, além da relação folha:colmo, também a digestibilidade in vitro da FDN do colmo na seleção de genótipos.

Níveis de lisina digestível para frangos de corte machos no período de 37 a 49 dias de idade

Foram utilizados 1.015 frangos de corte machos, linhagem Ross, dos 37 aos 49 dias de idade, para avaliar os efeitos de diferentes níveis de lisina digestível nas dietas experimentais. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com 5 níveis de lisina digestível (0,90; 0,95; 1,00; 1,05; 1,10%), cada um com 7 repetições e 29 aves por unidade experimental. Utilizaram-se dietas isoenergéticas com 3.250 de kcal de EM/kg e isoprotéicas, com 18% de PB, à base de milho e farelo de soja. Foram avaliados o ganho de peso, o consumo de ração, a conversão alimentar, as características de carcaça, o rendimento de cortes, a composição e a deposição de nutrientes corporais. Os níveis de lisina digestível influenciaram, entre as características de desempenho, apenas a conversão alimentar, que melhorou de forma linear de acordo com níveis de lisina da ração. Das características de carcaça e rendimento de cortes, apenas gordura abdominal aumentou de forma quadrática conforme os níveis de lisina. Os níveis de lisina digestível tiveram efeito quadrático no teor da matéria mineral da carcaça, mas não influenciaram a composição química das vísceras e do sangue. Observou-se, contudo, tendência a aumento linear na deposição de proteína da carcaça e do corpo vazio com o aumento no nível de lisina digestível. Os resultados de desempenho indicam que o nível de lisina digestível da ração de frangos de corte machos no período de 37 a 49 dias de idade deve ser igual ou superior a 1,10%.