Crystallization, data collection and data processing of maltose-binding protein (MalE) from the phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri

Maltose-binding protein is the periplasmic component of the ABC transporter responsible for the uptake of maltose/maltodextrins. The Xanthomonas axonopodis pv. citri maltose-binding protein MalE has been crystallized at 293 Kusing the hanging-drop vapour-diffusion method. The crystal belonged to the primitive hexagonal space group P6(1)22, with unit-cell parameters a = 123.59, b = 123.59, c = 304.20 angstrom, and contained two molecules in the asymetric unit. It diffracted to 2.24 angstrom resolution.

Methods of Fourier optics in digital holographic microscopy

In this paper, processing methods of Fourier optics implemented in a digital holographic microscopy system are presented. The proposed methodology is based on the possibility of the digital holography in carrying out the whole reconstruction of the recorded wave front and consequently, the determination of the phase and intensity distribution in any arbitrary plane located between the object and the recording plane. In this way, in digital holographic microscopy the field produced by the objective lens can be reconstructed along its propagation, allowing the reconstruction of the back focal plane of the lens, so that the complex amplitudes of the Fraunhofer diffraction, or equivalently the Fourier transform, of the light distribution across the object can be known. The manipulation of Fourier transform plane makes possible the design of digital methods of optical processing and image analysis. The proposed method has a great practical utility and represents a powerful tool in image analysis and data processing. The theoretical aspects of the method are presented, and its validity has been demonstrated using computer generated holograms and images simulations of microscopic objects. (c) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

Parametric analysis of discrepant sets of data

In this paper a new parametric method to deal with discrepant experimental results is developed. The method is based on the fit of a probability density function to the data. This paper also compares the characteristics of different methods used to deduce recommended values and uncertainties from a discrepant set of experimental data. The methods are applied to the (137)Cs and (90)Sr published half-lives and special emphasis is given to the deduced confidence intervals. The obtained results are analyzed considering two fundamental properties expected from an experimental result: the probability content of confidence intervals and the statistical consistency between different recommended values. The recommended values and uncertainties for the (137)Cs and (90)Sr half-lives are 10,984 (24) days and 10,523 (70) days, respectively. (C) 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.

Prontuários, para que servem?: representação dos coordenadores de equipe dos capsi a respeito do valor e da utilidade dos prontuários

INTRODUÇÃO: o artigo procura compreender como os Coordenadores dos Centros de Atenção Psicossocial Infantojuvenil (CAPSi) do Estado de São Paulo percebem o valor e a utilidade dos prontuários do usuários do serviço. Atualmente, os prontuários obedecem a claros princípios éticos. São muitas as pesquisas que se utilizam de prontuários e vários os estudos que se propõem a aperfeiçoá-los uma vez que são considerados ferramenta de primeira importância no âmbito da saúde. Cabe, entretanto, indagar se esses instrumentos são valorizados e se suas utilidades percebidas pelas equipes de saúde mental no exercício real de suas práticas. O trabalho descreve e analisa as percepções dos Coordenadores dos CAPSi-SP a respeito da utilidade dos prontuários para a equipe de saúde e para os usuários. MÉTODO: foi entrevistado um Coordenador de cada um dos 19 dos CAPSi do Estado de São Paulo. As respostas foram analisadas de acordo com os procedimentos clássicos da Análise de Conteúdo. RESULTADOS: os prontuários são percebidos como valiosos instrumentos de trabalho e sua importância destacada como instrumento de intervenção e de acompanhamento clínicos. Sua relevância é assinalada como dispositivo que possibilita a articulação e a comunicação dos membros das equipes técnicas dos CAPSi. Por outro lado, não é percebida qual a utilidade que eles teriam para o usuário. A contradição nos níveis de importância alocada à utilidade dos prontuários quando se trata da equipe técnica ou dos usuários enseja uma discussão aprofundada sobre a natureza da clínica em saúde mental praticada nos CAPSi

NGC 7097: THE ACTIVE GALACTIC NUCLEUS AND ITS MIRROR, REVEALED BY PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS TOMOGRAPHY

Three-dimensional spectroscopy techniques are becoming more and more popular, producing an increasing number of large data cubes. The challenge of extracting information from these cubes requires the development of new techniques for data processing and analysis. We apply the recently developed technique of principal component analysis (PCA) tomography to a data cube from the center of the elliptical galaxy NGC 7097 and show that this technique is effective in decomposing the data into physically interpretable information. We find that the first five principal components of our data are associated with distinct physical characteristics. In particular, we detect a low-ionization nuclear-emitting region (LINER) with a weak broad component in the Balmer lines. Two images of the LINER are present in our data, one seen through a disk of gas and dust, and the other after scattering by free electrons and/or dust particles in the ionization cone. Furthermore, we extract the spectrum of the LINER, decontaminated from stellar and extended nebular emission, using only the technique of PCA tomography. We anticipate that the scattered image has polarized light due to its scattered nature.

Analysis of coaches objectives in artistic gymnastics

The present study is a piece of the main project entitled ""Diagnosis of the Artistic Gymnastics Developing Program in Brazil"". Among many issues included in the main study, we analyzed and discussed the coach`s objectives who are coaching incoming gymnasts who are potential to be representative at the national teams. We interviewed 46 coaches from 29 sports institutions in Brazil. As data collection we used a semi-structured interview, and as data treatment we used the content analysis proposed by Bardin ( 2004). We could evidence that many coaches` objectives is focused on the competition and the highest level, and that the institutions` emphasis on the results in all levels of categories.

Regression models for grouped survival data: Estimation and sensitivity analysis

In this study, regression models are evaluated for grouped survival data when the effect of censoring time is considered in the model and the regression structure is modeled through four link functions. The methodology for grouped survival data is based on life tables, and the times are grouped in k intervals so that ties are eliminated. Thus, the data modeling is performed by considering the discrete models of lifetime regression. The model parameters are estimated by using the maximum likelihood and jackknife methods. To detect influential observations in the proposed models, diagnostic measures based on case deletion, which are denominated global influence, and influence measures based on small perturbations in the data or in the model, referred to as local influence, are used. In addition to those measures, the local influence and the total influential estimate are also employed. Various simulation studies are performed and compared to the performance of the four link functions of the regression models for grouped survival data for different parameter settings, sample sizes and numbers of intervals. Finally, a data set is analyzed by using the proposed regression models. (C) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

PCA Tomography: how to extract information from data cubes

Astronomy has evolved almost exclusively by the use of spectroscopic and imaging techniques, operated separately. With the development of modern technologies, it is possible to obtain data cubes in which one combines both techniques simultaneously, producing images with spectral resolution. To extract information from them can be quite complex, and hence the development of new methods of data analysis is desirable. We present a method of analysis of data cube (data from single field observations, containing two spatial and one spectral dimension) that uses Principal Component Analysis (PCA) to express the data in the form of reduced dimensionality, facilitating efficient information extraction from very large data sets. PCA transforms the system of correlated coordinates into a system of uncorrelated coordinates ordered by principal components of decreasing variance. The new coordinates are referred to as eigenvectors, and the projections of the data on to these coordinates produce images we will call tomograms. The association of the tomograms (images) to eigenvectors (spectra) is important for the interpretation of both. The eigenvectors are mutually orthogonal, and this information is fundamental for their handling and interpretation. When the data cube shows objects that present uncorrelated physical phenomena, the eigenvector`s orthogonality may be instrumental in separating and identifying them. By handling eigenvectors and tomograms, one can enhance features, extract noise, compress data, extract spectra, etc. We applied the method, for illustration purpose only, to the central region of the low ionization nuclear emission region (LINER) galaxy NGC 4736, and demonstrate that it has a type 1 active nucleus, not known before. Furthermore, we show that it is displaced from the centre of its stellar bulge.

A bivariate regression model for matched paired survival data: local influence and residual analysis

The use of bivariate distributions plays a fundamental role in survival and reliability studies. In this paper, we consider a location scale model for bivariate survival times based on the proposal of a copula to model the dependence of bivariate survival data. For the proposed model, we consider inferential procedures based on maximum likelihood. Gains in efficiency from bivariate models are also examined in the censored data setting. For different parameter settings, sample sizes and censoring percentages, various simulation studies are performed and compared to the performance of the bivariate regression model for matched paired survival data. Sensitivity analysis methods such as local and total influence are presented and derived under three perturbation schemes. The martingale marginal and the deviance marginal residual measures are used to check the adequacy of the model. Furthermore, we propose a new measure which we call modified deviance component residual. The methodology in the paper is illustrated on a lifetime data set for kidney patients.

Representações sociais do trabalho: uma análise comparativa entre jovens trabalhadores e não trabalhadores

O trabalho na adolescência é justificado, dentre outros aspectos, pela necessidade econômica das famílias. Os objetivos deste estudo foram analisar o conteúdo e a estrutura da representação social do trabalho na adolescência, entre estudantes trabalhadores e não trabalhadores, entre catorze e dezoito anos; comparar as representações nos dois grupos estudados; verificar se as cognições participantes do núcleo central das representações caracterizadas se confirmam em uma segunda técnica de estudo das representações. A amostra foi composta por 724 alunos do ensino médio da rede pública de ensino da cidade de São Paulo. A coleta de dados foi realizada através da técnica de evocações livres de palavras, utilizando o termo indutor "trabalho", e da realização de 21 grupos focais. Os resultados revelam que a representação do trabalho, em ambos os grupos, foi associada a significados morais e psicossociais positivos. Do ponto de vista metodológico, a maioria dos elementos classificados como participantes do núcleo central da representação foram confirmados nos diferentes eixos temáticos da análise de conteúdo dos grupos focais.

Acupuntura: motivações de médicos para a procura de especialização

Este estudo quanti-qualitativo objetivou identificar concepções sobre Medicina Convencional e Acu puntura que contribuem para entender os motivos que levam médicos a procurarem conhecer ou se especializar em Acupuntura. Foram pesquisados 175 médicos do Curso de Desenvolvimento em Me dicina Chinesa − Acupuntura, do Center-AO − Centro de Pesquisa e Estudo da Medicina Chinesa e Universidade Federal de São Paulo − Escola Paulista de Medicina (Unifesp - EPM), com questio nário composto por perguntas abertas e fechadas. Os dados obtidos foram analisados estatisticamente, e as respostas foram analisadas com a técnica de análise de conteúdo, buscando desvelar unidades de significado. A partir disso, foram estabelecidas categorias gerais e específicas, que passaram a dar significado aos discursos. Dessa forma, foram obtidos três grupos categoriais: "aprimoramento profis sional", "ampliar seu próprio horizonte de vida" e "compreender o paciente em uma dimensão mais abrangente". Nossos dados revelaram que os médicos desejam exercer a Acupuntura de forma inte grada à Medicina Convencional, no bojo da qual a Acupuntura vem se firmando como especialidade médica.

Tendência da mortalidade relacionada à doença de Chagas, Estado de São Paulo, Brasil, 1985 a 2006: estudo usando causas múltiplas de morte

OBJETIVO: Estudar a tendência da mortalidade relacionada à doença de Chagas informada em qualquer linha ou parte do atestado médico da declaração de óbito.MÉTODOS: Os dados provieram dos bancos de causas múltiplas de morte da Fundação Sistema Estadual de Análise de Dados de São Paulo (SEADE) entre 1985 e 2006. As causas de morte foram caracterizadas como básicas, associadas (não-básicas) e total de suas menções.RESULTADOS: No período de 22 anos, ocorreram 40 002 óbitos relacionados à doença de Chagas, dos quais 34 917 (87,29%) como causa básica e 5 085 (12,71%) como causa associada. Foi observado um declínio de 56,07% do coeficiente de mortalidade pela causa básica e estabilidade pela causa associada. O número de óbitos foi 44,5% maior entre os homens em relação às mulheres. O fato de 83,5% dos óbitos terem ocorrido a partir dos 45 anos de idade revela um efeito de coorte. As principais causas associadas da doença de Chagas como causa básica foram as complicações diretas do comprometimento cardíaco, como transtornos da condução, arritmias e insuficiência cardíaca. Para a doença de Chagas como causa associada, foram identificadas como causas básicas as doenças isquêmicas do coração, as doenças cerebrovasculares e as neoplasias.CONCLUSÕES: Para o total de suas menções, verificou-se uma queda do coeficiente de mortalidade de 51,34%, ao passo que a queda no número de óbitos foi de apenas 5,91%, tendo sido menor entre as mulheres, com um deslocamento das mortes para as idades mais avançadas. A metodologia das causas múltiplas de morte contribuiu para ampliar o conhecimento da história natural da doença de Chagas

Contraceptive methods with male participation: a perspective of brazilian couples

OBJECTIVE: To assess the perspectives of couples who requested vasectomy in a public health service on the use of male participation contraceptive methods available in Brazil: male condoms, natural family planning/calendar, coitus interruptus and vasectomy. METHODS: A qualitative study with semi-structured interviews was held with 20 couples who had requested vasectomy at the Human Reproduction Unit of the Universidade Estadual de Campinas, Brazil. Data analysis was carried out through thematic content analysis. FINDINGS: The couples did not, in general, know any effective contraceptive options for use by men and/or participating in their use, except for vasectomy. The few methods with male participation that they knew of were perceived to interfere in spontaneity and in pleasure of intercourse. Men accepted that condom use in extra-conjugal relations offered them protection from sexually transmitted diseases; that their wives might also participate in extra-marital relationships was not considered. DISCUSSION: The few contraceptive options with male participation lead to difficulty in sharing responsibilities between men and women. On the basis of perceived gender roles, women took the responsibility for contraception until the moment when the situation became untenable, and they faced the unavoidable necessity of sterilization. CONCLUSIONS: Specific actions are necessary for men to achieve integral participation in relation to reproductive sexual health. These include education and discussions on gender roles, leading to greater awareness in men of the realities of sexual and reproductive health

Saúde bucal e cuidado odontológico: representações sociais de mães usuárias de um serviço público de saúde

Objetivo: identificar as representações sociais de mães de crianças da faixa etária de zero a cinco anos de idade do Núcleo de Saúde da Família IV, em Ribeirão Preto-SP, procurando saber o que pensam sobre saúde bucal e tratamento odontológico. Método: trata-se de pesquisa qualitativa, sendo utilizada a entrevista semi-estruturada para a coleta dos dados e a análise de conteúdo. Resultados: constatou-se grande dificuldade das mães em se expressar a respeito do que é, para elas, saúde. Para essas mães a saúde bucal está relacionada com normas de higiene e dietéticas e também com a ida ao dentista, restringindo-se na preocupação com a estética e pouco com a função. Já em relação ao tratamento odontológico, a grande maioria demonstrou apresentar medo, causado pela sua experiência anterior com o tratamento. A assistência particular está associada à pontualidade e ao atendimento da maneira desejada enquanto o tratamento oferecido pelo setor público à demora e à falta de equipamentos e materiais. A humanização no atendimento e competência do profissional emergiram como dois aspectos importantes, e podem estar determinando a decisão de ir ou não ao dentista. Conclusões: A expressão saúde bucal foi associada à assistência odontológica. O atendimento pelo setor privado foi referido como o que mais se aproxima do tipo ideal de assistência odontológica

FILTERING TECHNIQUES APPLIED ON RAW CARRIER PHASE FOR GPS DETECTING SMALL DYNAMIC DISPLACEMENTS

This work is part of a research under construction since 2000, in which the main objective is to measure small dynamic displacements by using L1 GPS receivers. A very sensible way to detect millimetric periodic displacements is based on the Phase Residual Method (PRM). This method is based on the frequency domain analysis of the phase residuals resulted from the L1 double difference static data processing of two satellites in almost orthogonal elevation angle. In this article, it is proposed to obtain the phase residuals directly from the raw phase observable collected in a short baseline during a limited time span, in lieu of obtaining the residual data file from regular GPS processing programs which not always allow the choice of the aimed satellites. In order to improve the ability to detect millimetric oscillations, two filtering techniques are introduced. One is auto-correlation which reduces the phase noise with random time behavior. The other is the running mean to separate low frequency from the high frequency phase sources. Two trials have been carried out to verify the proposed method and filtering techniques. One simulates a 2.5 millimeter vertical antenna displacement and the second uses the GPS data collected during a bridge load test. The results have shown a good consistency to detect millimetric oscillations.