Bacterial communities and biogeochemical transformations of iron and sulfur in a high saltmarsh soil profile

Microbial community structure in saltmarsh soils is stratified by depth and availability of electron acceptors for respiration. However, the majority of the microbial species that are involved in the biogeochemical transformations of iron (Fe) and sulfur (S) in such environments are not known. Here we examined the structure of bacterial communities in a high saltmarsh soil profile and discuss their potential relationship with the geochemistry of Fe and S. Our data showed that the soil horizons Ag (oxic-suboxic), Bg (suboxic), Cri (anoxic with low concentration of pyrite Fe) and Cr-2 (anoxic with high concentrations of pyrite Fe) have distinct geochemical and microbiological characteristics. In general, total S concentration increased with depth and was correlated with the presence of pyrite Fe. Soluble + exchangable-Fe, pyrite Fe and acid volatile sulfide Fe concentrations also increased with depth, whereas ascorbate extractable-Fe concentrations decreased. The occurrence of reduced forms of Fe in the horizon Ag and oxidized Fe in horizon Cr-2 suggests that the typical redox zonation, common to several marine sediments, does not occur in the saltmarsh soil profile studied. Overall, the bacterial community structure in the horizon Ag and Cr-2 shared low levels of similarity, as compared to their adjacent horizons, Bg and Cr-1, respectively. The phylogenetic analyses of bacterial 16S rRNA gene sequences from clone libraries showed that the predominant phylotypes in horizon Ag were related to Alphaproteobacteria and Bacteroidetes. In contrast, the most abundant phylotypes in horizon Cr-2 were related to Deltaproteo-bacteria, Chloroflexi, Deferribacteres and Nitrospira. The high frequency of sequences with low levels of similarity to known bacterial species in horizons Ag and Cr-2 indicates that the bacterial communities in both horizons are dominated by novel bacterial species. (c) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Effect of water renewal on dominance hierarchy of juvenile Nile tilapia

Nile tilapia social position (Oreochromis niloticus) can be mediated by multiple channels, including chemical communication. Absence of chemical cues in the environment prevents hierarchical settlement among pairs, and enhances time spent in confrontations. The aim of this study was to test the effect of continuously renewed water flow on the establishment of hierarchical dominance in Nile tilapia juveniles. In this condition, a high frequency of attacks and disruption on hierarchical stability were expected because chemical cues for hierarchy maintenance could be washed out. After 3 days in isolation, the fish were paired by standard size but not by sex, and submitted to two conditions: continuously renewed water flow (RENEWED, n = 7) and non-renewed water flow (NONRENEWED n = 8). The paired fish were placed in an aquarium (40 cm x 30 cm x 40 cm) for 3 h; four 10-min sessions were video-recorded: the first, immediately after the fish were paired and the others 1, 2, and 3 h after pairing. Hierarchy was identified by a dominance index (DI = given attacks/received + given attacks) For each fish. The hierarchical stability was achieved by analyzing the difference between dominant DI and subordinate DI (DI-D). Hierarchy was established in both groups after second session because the DI was significantly higher for one fish of the pair. The frequency of attacks of the dominant fish in RENEWED and NONRENEWED conditions was similar in all observation sessions. The attack frequency by subordinate fish was also similar during the first three sessions (2-h pairing). However, the frequency of attacks by subordinate fish in the RENEWED condition was higher than in the NONRENEWED situation at the fourth observation session (means +/- S.E.: RENEWED = 2.83 +/- 0.94 x 10 min(-1) and NONRENEWED = 0.25 +/- 0.16 x 10 min(-1); Mann-Whitney, p = 0.04). At this point, a significant reduction of the DI-D was observed (means +/- S.E.: RENEWED = 0.70 +/- 0.11 and NONRENEWED = 1,00 +/- 0.002; Mann-Whitney, p = 0.04). The changes in DI-D were related to more frequent attacks by the subordinated fish in renewed water flow. According to our results, the unsteady agonistic interaction under renewed water flow leads to social instability. Thus, continuous water renewing can wash out relevant chemical substances and therefore disturb the dominance recognition by subordinate fish. (C) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

Anomalias dentárias associadas: o ortodontista decodificando a genética que rege os distúrbios de desenvolvimento dentário

O presente trabalho versa sobre o diagnóstico e a abordagem ortodôntica das anomalias dentárias, enfatizando os aspectos etiológicos que definem tais irregularidades de desenvolvimento. Parece existir uma inter-relação genética na determinação de algumas dessas anomalias, considerando-se a alta frequência de associações. Um mesmo defeito genético pode originar diferentes manifestações fenotípicas, incluindo agenesias, microdontias, ectopias e atraso no desenvolvimento dentário. As implicações clínicas das anomalias dentárias associadas são muito relevantes, uma vez que o diagnóstico precoce de uma determinada anomalia dentária pode alertar o clínico sobre a possibilidade de desenvolvimento de outras anomalias associadas no mesmo paciente ou em outros membros da família, permitindo a intervenção ortodôntica em época oportuna.

Caracterização imunofenotípica e avaliação quantitativa do infiltrado linfocítário junto às áreas de displasia epitelial da próstata de cães adultos sexualmente intactos

O estudo da próstata canina tem se tornado comum em razão da grande incidência de doenças prostáticas nessa espécie e das similaridades com as alterações apresentadas pela glândula prostática humana. Frente à alta frequência de displasias epiteliais acompanhadas de infiltrado linfocitário intersticial e atrofia acinar na espécie canina, o presente estudo teve como objetivos a caracterização imunofenotípica e a avaliação quantitativa desse infiltrado, utilizando marcadores para identificação de linfócitos T (anti-CD3) e B (anti-CD79a). Foram catalogadas 42 lesões displásicas classificadas em discreta (48%), moderada (38%) e acentuada (14%). O infiltrado linfocitário intersticial periacinar junto às áreas de epitélio prostático displásico constituiu-se predominantemente por linfócitos T (66%) e houve interação entre o grau histológico da displasia e o marcador imunoistoquímico, com oscilação na quantidade de células T e B intersticiais em função do grau da displasia epitelial.

Oxigenoterapia domiciliar prolongada em crianças e adolescentes: uma análise do uso clínico e de custos de um programa assistencial

OBJETIVOS: Descrever as características clínicas e laboratoriais dos pacientes em oxigenoterapia domiciliar prolongada acompanhados pelo programa de atendimento domiciliar do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, durante um período de 8 anos, e comparar os grupos com e sem hipertensão pulmonar secundária. Estimar o custo do programa utilizando concentradores versus cilindros de oxigênio arcados pela instituição. MÉTODOS: Estudo descritivo retrospectivo e de coorte dos pacientes em oxigenoterapia domiciliar prolongada, em seguimento no período de 2002 a 2009, na Unidade de Pneumologia do Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. RESULTADOS: Foram estudados 165 pacientes, 53% do sexo masculino, com as medianas: idade de início da oxigenoterapia - 3,6 anos; tempo de oxigenoterapia - 7 anos; e tempo de sobrevida após início da oxigenoterapia - 3,4 anos. Os principais diagnósticos foram: fibrose cística (22%), displasia broncopulmonar (19%) e bronquiolite obliterante (15%). Dos 33 pacientes que realizaram espirometria, 70% apresentavam distúrbio ventilatório obstrutivo grave. O exame ecocardiográfico foi executado em 134 pacientes; 51% deles tinham hipertensão pulmonar secundária. Houve associação estatisticamente significante entre: presença de hipertensão pulmonar e necessidade de maiores fluxos de oxigênio (qui-quadrado, p = 0,011); e presença de hipertensão pulmonar e maior tempo de oxigenoterapia (Logrank, p = 0,0001). Não houve diferença estatisticamente significante entre tempo de sobrevida após início da oxigenoterapia e presença de hipertensão pulmonar. Os custos médios mensais do programa foram: US$ 7.392,93 para os concentradores e US$ 16.630,92 para cilindros. CONCLUSÕES: A oxigenoterapia domiciliar prolongada foi empregada em distintas doenças crônicas, predominantemente em lactentes e pré-escolares. Houve alta frequência de hipertensão pulmonar associada a maiores períodos de uso e fluxos de oxigênio, sem associação à sobrevida. A substituição dos cilindros por concentradores poderá reduzir custos significativamente.

Ressecções eletiva e de urgência para tratamento de neoplasia maligna do cólon em hospital universitário: estudo de 66 casos

O câncer de cólon é uma doença de alta prevalência e mortalidade, cujo tratamento baseia-se na ressecção cirúrgica. A possibilidade de cura aumenta com o diagnóstico precoce, daí a importância dos programas de rastreamento populacional do câncer colorretal. O presente estudo analisou, retrospectivamente, 66 pacientes submetidos a ressecções do cólon por neoplasia em um período de 58 meses no Hospital Universitário da Universidade de São Paulo. Os pacientes foram divididos em dois grupos: grupo 1, submetidos a cirurgia eletiva (28 pacientes), e grupo 2, submetidos a cirurgia de urgência (38 pacientes). Os grupos foram comparados com relação às variáveis sexo, idade, apresentação clínica, aspectos da técnica cirúrgica, sítio anatômico da lesão, estádio patológico, taxas de complicações, permanência hospitalar pós-operatória e óbitos na internação. Verificou-se no presente estudo que a idade entre os grupos foi semelhante. Houve uma predominância do sexo masculino entre os pacientes operados de urgência. No grupo de cirurgia eletiva, o principal sintoma foi a hematoquezia, enquanto os operados na urgência, tinham como principal queixa dor abdominal. A grande maioria dos pacientes, no momento da cirurgia, apresentava-se sintomática há meses. Os pacientes operados na urgência apresentaram mais tumores pT4 e os operados eletivamente apresentaram mais neoplasias em estádio I. Em ambos os grupos, o caráter oncológico dos procedimentos foi preservado, bem como foi alto o índice de anastomoses primárias (81,8%). As taxas de complicações pós-operatórias, o tempo de permanência hospitalar pós-operatório e a mortalidade foram semelhantes.

The role of γ -aminobutyric acid (Gaba) in somatic embryogenesis of Acca sellowiana Berg. (Myrtaceae)

The γ-aminobutyric acid (Gaba) is a non-protein amino acid found in prokaryotes and eukaryotes. Its role in plant development has not been fully established. This study reports a quantification of the levels of endogenous Gaba, as well as investigation of its role in different stages of somatic embryogenesis in Acca sellowiana Berg. (Myrtaceae). Zygotic embryos were used as explants and they were inoculated into the culture medium contained different concentrations of Gaba (0,2, 4, 6, 8 and 10 µM). The highest concentrations of endogenous Gaba were detected between the third and nine days after inoculation, reaching the value of 12.77 µmol.g-1FW. High frequency of somatic embryogenesis was observed in response to 10 µM Gaba. This treatment also resulted in a large number of normal embryos, and the lowest percentage of formation of fused somatic embryos, phenotypic characteristic of most deformed embryos in all treatments. Also, all treatments promoted the formation of the somatic embryos with positive characteristics of development resumption, which however did not originate the seedlings.

Impacto da adequação da oferta energética sobre a mortalidade em pacientes de UTI recebendo nutrição enteral

OBJETIVO: Investigar a relação entre adequação da oferta energética e mortalidade na unidade de terapia intensiva em pacientes sob terapia nutricional enteral exclusiva. MÉTODOS: Estudo observacional prospectivo conduzido em uma unidade de terapia intensiva em 2008 e 2009. Foram incluídos pacientes >18 anos que receberam terapia nutricional enteral por >72h. A adequação da oferta de energia foi estimada pela razão administrado/prescrito. Para a investigação da relação entre variáveis preditoras (adequação da oferta energética, escore APACHE II, sexo, idade e tempo de permanência na unidade de terapia intensiva e o desfecho mortalidade na unidade de terapia intensiva, utilizou-se o modelo de regressão logística não condicional. RESULTADOS: Foram incluídos 63 pacientes (média 58 anos, mortalidade 27%), 47,6% dos quais receberam mais de 90% da energia prescrita (adequação média 88,2%). O balanço energético médio foi de -190 kcal/dia. Observou-se associação significativa entre ocorrência de óbito e as variáveis idade e tempo de permanência na unidade de terapia intensiva, após a retirada das variáveis adequação da oferta energética, APACHE II e sexo durante o processo de modelagem. CONCLUSÃO: A adequação da oferta energética não influenciou a taxa de mortalidade na unidade de terapia intensiva. Protocolos de infusão de nutrição enteral seguidos criteriosamente, com adequação administrado/prescrito acima de 70%, parecem ser suficientes para não interferirem na mortalidade. Dessa forma, pode-se questionar a obrigatoriedade de atingir índices próximos a 100%, considerando a elevada frequência com que ocorrem interrupções no fornecimento de dieta enteral devido a intolerância gastrointestinal e jejuns para exames e procedimentos. Pesquisas futuras poderão identificar a meta ideal de adequação da oferta energética que resulte em redução significativa de complicações, mortalidade e custos.

Comportamento de risco para transtorno alimentar em universitárias brasileiras

CONTEXTO: Comportamentos de risco para transtornos alimentares envolvem atitudes e práticas inadequadas para com o alimento e o peso e podem ser avaliados com base em instrumentos validados. OBJETIVOS: Avaliar comportamento de risco para transtornos alimentares em universitárias brasileiras das cinco regiões do país. MÉTODOS: 2.483 universitárias responderam ao Teste de Atitudes Alimentares (EAT-26) nas cinco regiões. A pontuação no teste foi comparada entre as regiões por meio do teste qui-quadrado. Possíveis associações ou correlações com curso de graduação, idade, estado nutricional, renda individual e escolaridade do chefe da família foram avaliadas pelos coeficientes de Pearson e Spearman. Uma análise de covariância comparou o escore do EAT entre as regiões. RESULTADOS: A frequência de comportamento de risco para transtornos alimentares variou de 23,7% a 30,1% nas cinco regiões e não houve diferença na pontuação média do EAT e na proporção de escores positivos para comportamento de risco entre as regiões. Não houve forte correlação do escore do EAT com nenhuma das variáveis. CONCLUSÃO: Universitárias brasileiras apresentam alta frequência de comportamentos de risco para TA em todas as regiões do país. Medidas de prevenção devem ser planejadas para a população jovem feminina do Brasil.

Microbiological and histopathological aspects of canine pyometra

As pyometra is recognized as one of the main causes of disease and death in the bitch the purposes of this study were to evaluate microbiological and histopathological aspects of canine pyometra and to research the virulence factors of the E. coli isolates identifying possible risks to human health. The microbiological isolation from the intrauterine contents of 100 dogs with pyometra was carried out and the virulence factors in the E. coli strains were identified using PCR method. This study also consisted of the counting of microorganisms colonies forming units in samples of intrauterine content, tests of antimicrobial susceptibility of the E. coli isolates and the histological examination of the uterus. E. coli was the most prevalent microorganism isolated (76.6%) and 120 strains (79.5%) were positive for sfa, 86 (56.9%) were positive for cnf, 87 (57.6%) were positive for pap, 52 (34.4%) were positive for hly, 51 (33.8%) were positive for iuc and 5 (3.3%) were positive for afa genes. One observed more sensitivity of E. coli to norfloxacin, polimixin B, sulphazotrin, chloranfenicol and enrofloxacin. In 42% of the samples of uterine walls where microorganisms were isolated, the sizes of the areas of the inflammatory responses corresponded to 39-56%. Virulence factors were identified in 98.0% of the strains evaluated, demonstrating a high frequency of potentially pathogenic E. coli. It must be considered that dogs are animals that are living in close proximity to man for thousands of years and have an important role in the transmission of E. coli to other animals and to man.

Ventilação oscilatória de alta freqüência em pediatria e neonatologia

Este trabalho teve por objetivo rever a literatura e descrever a utilização da ventilação oscilatória de alta freqüência em crianças e recém-nascidos. Revisão bibliográfica e seleção de publicações mais relevantes sobre ventilação de alta freqüência utilizando as bases de dados MedLine e SciElo publicadas nos últimos 15 anos. As seguintes palavras-chave foram utilizadas: ventilação oscilatória de alta freqüência, ventilação mecânica, síndrome do desconforto respiratório agudo, crianças e recém-nascidos. Descreveu-se o emprego da ventilação oscilatória de alta freqüência em crianças com síndrome do desconforto respiratório agudo, síndrome de escape de ar e doença pulmonar obstrutiva. Avaliou em recém-nascidos, síndrome do desconforto respiratório, displasia broncopulmonar, hemorragia peri-intraventricular, leucoencefalomalácia e extravasamento de ar. Também, abordou a transição da ventilação mecânica convencional para a ventilação de alta freqüência e o manuseio específico da ventilação de alta freqüência quanto à oxigenação, eliminação de gás carbônico, realização de exame radiológico, realização de sucção traqueal e utilização de sedação e bloqueio neuromuscular. Foram abordados o desmame deste modo ventilatório e as complicações. Em crianças maiores a ventilação oscilatória de alta freqüência é uma opção terapêutica, principalmente na síndrome do desconforto respiratório agudo, devendo ser empregada precocemente. Também pode ser útil em casos de síndrome de escape de ar e doença pulmonar obstrutiva. Em recém-nascidos, não há evidências que demonstram superioridade da ventilação oscilatória de alta freqüência em relação à ventilação convencional, sendo a síndrome de escape de ar a única situação clínica em que há evidência de melhores resultados com este modo ventilatório.

Vibration-induced extra torque during electrically-evoked contractions of the human calf muscles

Background: High-frequency trains of electrical stimulation applied over the lower limb muscles can generate forces higher than would be expected from a peripheral mechanism (i.e. by direct activation of motor axons). This phenomenon is presumably originated within the central nervous system by synaptic input from Ia afferents to motoneurons and is consistent with the development of plateau potentials. The first objective of this work was to investigate if vibration (sinusoidal or random) applied to the Achilles tendon is also able to generate large magnitude extra torques in the triceps surae muscle group. The second objective was to verify if the extra torques that were found were accompanied by increases in motoneuron excitability. Methods: Subjects (n = 6) were seated on a chair and the right foot was strapped to a pedal attached to a torque meter. The isometric ankle torque was measured in response to different patterns of coupled electrical (20-Hz, rectangular 1-ms pulses) and mechanical stimuli (either 100-Hz sinusoid or gaussian white noise) applied to the triceps surae muscle group. In an additional investigation, M(max) and F-waves were elicited at different times before or after the vibratory stimulation. Results: The vibratory bursts could generate substantial self-sustained extra torques, either with or without the background 20-Hz electrical stimulation applied simultaneously with the vibration. The extra torque generation was accompanied by increased motoneuron excitability, since an increase in the peak-to-peak amplitude of soleus F waves was observed. The delivery of electrical stimulation following the vibration was essential to keep the maintained extra torques and increased F-waves. Conclusions: These results show that vibratory stimuli applied with a background electrical stimulation generate considerable force levels (up to about 50% MVC) due to the spinal recruitment of motoneurons. The association of vibration and electrical stimulation could be beneficial for many therapeutic interventions and vibration-based exercise programs. The command for the vibration-induced extra torques presumably activates spinal motoneurons following the size principle, which is a desirable feature for stimulation paradigms.

FILTERING TECHNIQUES APPLIED ON RAW CARRIER PHASE FOR GPS DETECTING SMALL DYNAMIC DISPLACEMENTS

This work is part of a research under construction since 2000, in which the main objective is to measure small dynamic displacements by using L1 GPS receivers. A very sensible way to detect millimetric periodic displacements is based on the Phase Residual Method (PRM). This method is based on the frequency domain analysis of the phase residuals resulted from the L1 double difference static data processing of two satellites in almost orthogonal elevation angle. In this article, it is proposed to obtain the phase residuals directly from the raw phase observable collected in a short baseline during a limited time span, in lieu of obtaining the residual data file from regular GPS processing programs which not always allow the choice of the aimed satellites. In order to improve the ability to detect millimetric oscillations, two filtering techniques are introduced. One is auto-correlation which reduces the phase noise with random time behavior. The other is the running mean to separate low frequency from the high frequency phase sources. Two trials have been carried out to verify the proposed method and filtering techniques. One simulates a 2.5 millimeter vertical antenna displacement and the second uses the GPS data collected during a bridge load test. The results have shown a good consistency to detect millimetric oscillations.

Molecular basis for porcine parvovirus detection in dead fetuses

Reproductive failures are still common grounds for complaint by commercial swine producers. Porcine parvovirus (PPV) is associated with different clinical reproductive signs. The aim of the present study was to investigate PPV fetal infection at swine farms having ongoing reproductive performance problems. The presence of virus in fetal tissues was determined by nested-polymerase chain reaction assay directed to the conserved NS1 gene of PPV in aborted fetuses, mummies and stillborns. Fetuses show a high frequency of PPV infection (96.4%; N = 28). In 60.7% of the fetuses, PPV were detected in all tissue samples (lung, heart, thymus, kidney, and spleen). Viral infection differed among fetal tissues, with a higher frequency in the lung and heart (P < 0.05). Fetuses with up to 99 days of gestational age and from younger sows showed a higher frequency of PPV (P < 0.05). No significant difference in the presence of PPV was detected among the three clinical presentations. The results suggest that PPV remains an important pathogenic agent associated with porcine fetal death.

Plasmodium vivax circumsporozoite genotypes: a limited variation or new subspecies with major biological consequences?

Background: Plasmodium vivax circumsporozoite variants have been identified in several geographical areas. The real implication of the genetic variation in this region of the P. vivax genome has been questioned for a long time. Although previous studies have observed significant association between VK210 and the Duffy blood group, we present here that evidences of this variation are limited to the CSP central portion. Methods: The phylogenetic analyses were accomplished starting from the amplification of conserved domains of 18 SSU RNAr and Cyt B. The antibodies responses against the CSP peptides, MSP-1, AMA-1 and DBP were detected by ELISA, in plasma samples of individuals infected with two P. vivax CS genotypes: VK210 and P. vivax-like. Results: These analyses of the two markers demonstrate high similarity among the P. vivax CS genotypes and surprisingly showed diversity equal to zero between VK210 and P. vivax-like, positioning these CS genotypes in the same clade. A high frequency IgG antibody against the N- and C-terminal regions of the P. vivax CSP was found as compared to the immune response to the R- and V-repetitive regions (p = 0.0005, Fisher's Exact test). This difference was more pronounced when the P. vivax-like variant was present in the infection (p = 0.003, Fisher's Exact test). A high frequency of antibody response against MSP-1 and AMA-1 peptides was observed for all P. vivax CS genotypes in comparison to the same frequency for DBP. Conclusions: This results target that the differences among the P. vivax CS variants are restrict to the central repeated region of the protein, mostly nucleotide variation with important serological consequences.