Measuring color differences in automotive samples with lightness flop: a test of the AUDI2000 color-difference formula

From a set of gonioapparent automotive samples from different manufacturers we selected 28 low-chroma color pairs with relatively small color differences predominantly in lightness. These color pairs were visually assessed with a gray scale at six different viewing angles by a panel of 10 observers. Using the Standardized Residual Sum of Squares (STRESS) index, the results of our visual experiment were tested against predictions made by 12 modern color-difference formulas. From a weighted STRESS index accounting for the uncertainty in visual assessments, the best prediction of our whole experiment was achieved using AUDI2000, CAM02-SCD, CAM02-UCS and OSA-GP-Euclidean color-difference formulas, which were no statistically significant different among them. A two-step optimization of the original AUDI2000 color-difference formula resulted in a modified AUDI2000 formula which performed both, significantly better than the original formula and below the experimental inter-observer variability. Nevertheless the proposal of a new revised AUDI2000 color-difference formula requires additional experimental data.

Effects of nitrogen sources on the nitrate assimilation in Haloferax mediterranei: growth kinetics and transcriptomic analysis

The haloarchaeon Haloferax mediterranei is able to grow in a defined culture media not only in the presence of inorganic nitrogen salt but also with amino acid as the sole nitrogen source. Assimilatory nitrate and nitrite reductases, respectively, catalyze the first and second reactions. The genes involved in this process are nasA, which encodes nitrate reductase and is found within the operon nasABC, and nasD, which encodes nitrite reductase. These genes are subjected to transcriptional regulation, being repressed in the presence of ammonium and induced with either nitrate or nitrite. This type of regulation has also been described when the amino acids are used as nitrogen source in the minimal media. Furthermore, it has been observed that the microorganism growth depends on nitrogen source, obtaining the lowest growth rate in the presence of nitrate and aspartate. In this paper, we present the results of a comparative study of microorganism growth and transcriptomic analysis of the operon nasABC and gene nasD in different nitrogen sources. The results are the first ever produced in relation to amino acids as nitrogen sources within the Halobacteriaceae family.

A metabolomic approach to study the rhizodeposition in the tritrophic interaction: tomato, Pochonia chlamydosporia and Meloidogyne javanica

A combined chemometrics-metabolomics approach [excitation–emission matrix (EEM) fluorescence spectroscopy, nuclear magnetic resonance (NMR) and high performance liquid chromatography–mass spectrometry (HPLC–MS)] was used to analyse the rhizodeposition of the tritrophic system: tomato, the plant-parasitic nematode Meloidogyne javanica and the nematode-egg parasitic fungus Pochonia chlamydosporia. Exudates from M. javanica roots were sampled at root penetration (early) and gall development (late). EMM indicated that late root exudates from M. javanica treatments contained more aromatic amino acid compounds than the rest (control, P. chlamydosporia or P. chlamydosporia and M. javanica). 1H NMR showed that organic acids (acetate, lactate, malate, succinate and formic acid) and one unassigned aromatic compound (peak no. 22) were the most relevant metabolites in root exudates. Robust principal component analysis (PCA) grouped early exudates for nematode (PC1) or fungus presence (PC3). PCA found (PC1, 73.31 %) increased acetate and reduced lactate and an unassigned peak no. 22 characteristic of M. javanica root exudates resulting from nematode invasion and feeding. An increase of peak no. 22 (PC3, 4.82 %) characteristic of P. chlamydosporia exudates could be a plant “primer” defence. In late ones in PC3 (8.73 %) the presence of the nematode grouped the samples. HPLC–MS determined rhizosphere fingerprints of 16 (early) and 25 (late exudates) m/z signals, respectively. Late signals were exclusive from M. javanica exudates confirming EEM and 1H NMR results. A 235 m/z signal reduced in M. javanica root exudates (early and late) could be a repressed plant defense. This metabolomic approach and other rhizosphere -omics studies could help to improve plant growth and reduce nematode damage sustainably.

Propiedades físicas y mecánicas de una calcarenita: la Piedra de San Julián

En este trabajo se estudian las características físico-mecánicas de la Piedra de San Julián y su comportamiento frente a procesos de calentamiento a temperaturas similares a las alcanzadas en un incendio, así como la puesta a punto y validación de métodos dinámicos no destructivos para el dictamen del estado de desgaste del material. El enfoque está orientado a los parámetros que más interesan en la utilización de la Piedra como material de construcción. Dado que esta Tesis se realiza por compendio de artículos, por razones prácticas y necesidades de publicación, el contenido de la misma está dividido en tres grandes bloques, como son: fluencia, exposición a altas temperaturas y relación entre módulos estáticos y dinámicos. Para el estudio de la fluencia o deformabilidad a largo plazo bajo carga constante se han realizado ensayos de carga estáticos de larga duración. Por otra parte, se ha efectuado un análisis del comportamiento reológico del hormigón en las distintas normativas, especialmente en el Código Modelo FIB (2010), y se ha buscado un paralelismo entre las previsiones del Código y los resultados obtenidos en los ensayos. Al mismo tiempo se han probado varios modelos reológicos que reproduzcan de forma precisa el comportamiento de la fluencia según el Código y los ensayos. Esto ha permitido ajustar una función, adaptando las especificaciones del Código modelo, que describe la deformación en el tiempo de la Piedra de San Julián. La validez teórica de esta ecuación alcanza períodos temporales similares a los existentes para los ensayos realizados con hormigón. El modelo reológico que se ha obtenido por ajuste de todo el período anterior, consta de cuatro celdas de Kelvin y predice igualmente la deformación por fluencia de la roca. La correcta evaluación de las deformaciones a largo plazo es necesaria siempre que se estudie la intervención en edificaciones históricas, bien sea variando la distribución de cargas, o simplemente realizando obras de mantenimiento de cierto calado. La influencia de la temperatura alcanzada y del proceso de enfriamiento utilizado, se ha analizado sobre 55 muestras de roca calentando a temperaturas de hasta 600 ºC y enfriando por dos métodos: al aire y mediante inmersión en agua, ambas a temperatura ambiente. Los parámetros controlados antes y después del proceso térmico han sido: porosidades abierta y total velocidad de propagación de ondas ultrasónicas, módulo de elasticidad, coeficiente de Poisson, resistencia a compresión uniaxial (UCS) y durabilidad según el ensayo de sequedad, humedad y desmoronamiento, Slake Durability Test (SDT). Como conclusiones más notables cabe destacar: la UCS disminuye en un 35% y en un 5O% según el enfriamiento se haya realizado al aire o por inmersión, mientras que el módulo de elasticidad se reduce entre un 75% y un 80%. Las conclusiones obtenidas son importantes para la determinación del daño estructural producido en un incendio, así como para evaluar la influencia del método de extinción. Por otra parte, pueden servir para estimar indirectamente la temperatura máxima alcanzada en un incendio, de cara a la determinación de los posibles efectos sobre otros elementos constructivos. Para la relación entre módulos estáticos y dinámicos se han estudiado 24 muestras con diferentes grados de deterioro. Con los datos obtenidos en los ensayos se han analizado estadísticamente quince modelos de relación con diferentes combinaciones de variables, y se ha construido la correspondiente matriz de correlación. El coeficiente de determinación más alto corresponde a una relación lineal entre ambos módulos. La determinación del módulo de elasticidad por medios no destructivos y de fácil implementación es muy útil cuando se trata de dictaminar sobre el envejecimiento de un material estructural de este tipo. El valor del módulo con respecto al de la roca intacta es un indicador de las características resistentes y grado de debilitamiento del material. Sin embargo, el módulo bajo cargas gravitatorias -estáticas- difiere en general del obtenido dinámicamente, de una manera diferente según el material que se analice. Aquí se ha obtenido una expresión, que correlaciona con un alto valor del coeficiente de determinación ambos módulos, para la roca estudiada. Los parámetros, relaciones y modelos estudiados y propuestos en esta tesis, suponen un importante avance científico de gran utilidad para la conservación y restauración del patrimonio de edificios y otras obras de carácter histórico-cultural construidas con la Piedra de San Julián. Asimismo, las conclusiones obtenidas y los medios y métodos empleados podrán ser extrapolados a otros materiales similares con las adaptaciones oportunas.

PipX, the coactivator of NtcA, is a global regulator in cyanobacteria

To modulate the expression of genes involved in nitrogen assimilation, the cyanobacterial PII-interacting protein X (PipX) interacts with the global transcriptional regulator NtcA and the signal transduction protein PII, a protein found in all three domains of life as an integrator of signals of the nitrogen and carbon balance. PipX can form alternate complexes with NtcA and PII, and these interactions are stimulated and inhibited, respectively, by 2-oxoglutarate, providing a mechanistic link between PII signaling and NtcA-regulated gene expression. Here, we demonstrate that PipX is involved in a much wider interaction network. The effect of pipX alleles on transcript levels was studied by RNA sequencing of S. elongatus strains grown in the presence of either nitrate or ammonium, followed by multivariate analyses of relevant mutant/control comparisons. As a result of this process, 222 genes were classified into six coherent groups of differentially regulated genes, two of which, containing either NtcA-activated or NtcA-repressed genes, provided further insights into the function of NtcA–PipX complexes. The remaining four groups suggest the involvement of PipX in at least three NtcA-independent regulatory pathways. Our results pave the way to uncover new regulatory interactions and mechanisms in the control of gene expression in cyanobacteria.