Investimento público em infraestruturas de transporte em Portugal continental

Investimento público em infraestruturas de transporte em Portugal continental.

The impact of the Arrábida Marine Park (Portugal) on the decapod crustacean Eualus cranchii: a case study

Dissertação de mestrado, Biologia Marinha, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Univerisdade do Algarve, 2015

Padrões de distribuição e taxonomia para os porifera da região central do Algarve

Dissertação de mest., Biologia Marinha, Faculdade de Ciências do Mar e do Ambiente, Universidade do Algarve, 2007

Estratégias de controlo da poluição das águas subterrâneas pelos nitratos de origem agrícola

Tese de dout., Ciências Agrárias, Faculdade de Engenharia de Recursos Naturais, Univ. do Algarve, 2003

Filodinâmica do vírus da tristeza dos citrinos: epidemiologia molecular e biologia evolutiva

O Citrus tristeza virus (CTV), responsável por várias doenças em citrinos, é um dos maiores condicionantes da citricultura a nível mundial. Existem diversos isolados de CTV com diferentes características biológicas e moleculares, sendo que os sintomas causados pelo vírus dependem essencialmente do isolado viral e da combinação variedade/porta-enxerto. A implementação de medidas de controlo da doença depende, em grande parte, do tipo de isolados presentes numa dada região. No Capítulo 2, efetuou-se uma análise comparativa entre dois métodos de tipificação de isolados de CTV e verificou-se que a caracterização por PCR assimétrico-ELISA, que considera a existência de sete grupos, é mais adequada à descrição da estrutura genética de CTV. Estes resultados foram complementados com o estudo da dinâmica de colonização de cada grupo filogenético através de um imuno-ensaio in situ (Capítulo 3). Os resultados obtidos sugerem que os isolados de CTV diferem na quantidade de células infetadas e que essa diferença parece estar relacionada com a severidade do isolado. No Capítulo 4, o estudo da variabilidade genómica da região 3’ terminal permitiu verificar que a estrutura de grupos obtida para o gene da proteína da cápside (CP) é extensível a toda a região 3’ terminal que contém os genes mais fortemente implicados na interação com o hospedeiro. A estabilidade da estrutura genética nesta região foi também inferida a partir da pesquisa de eventos de recombinação. Os resultados sugerem uma baixa frequência de recombinação entre isolados de CTV, mesmo em isolados contendo mistura de haplótipos e mantidos há mais de 12 anos no mesmo hospedeiro. Adicionalmente, foi estimada a taxa de evolução de CTV através de um método estatístico Bayesiano (Capítulo 5). Para tal, foram usadas sequências do gene da CP de isolados de diversas regiões do mundo, pertencentes a diferentes grupos filogenéticos e obtidas entre 1990 e 2010. A taxa média de evolução estimada foi de 1,58 X 10-4 substituições nucleotídicas / ano. No geral, os resultados destes dois capítulos mostram que os isolados de CTV mantêm uma elevada estabilidade genética ao longo do tempo. Finalmente, no Capítulo 6, foi estudada a situação epidemiológica de CTV em Portugal continental a partir de isolados de CTV recolhidos no campo, onde se verificou que a maioria das árvores infetadas era composta por isolados de CTV pertencentes ao grupo M, ou seja isolados considerados suaves e que não provocam sintomas severos.

Motivação profissional em contexto de educação: o internato médico de medicina geral e familiar

A motivação é essencial ao processo formativo, adquirindo particular relevância no âmbito da educação de indivíduos adultos, em contexto profissional. A percepção empírica da existência de baixos níveis de motivação para a especialidade de Medicina Geral e Familiar nos jovens médicos licenciados justifica a realização da presente investigação. Com a finalidade de analisar a motivação profissional no Internato Médico de Medicina Geral e Familiar, desenvolveu-se uma linha de investigação observacional (2005 – 2010), de natureza quantitativa (transversal e longitudinal), seguida de uma abordagem qualitativa, complementando os seus resultados (triangulação metodológica). O estudo teve como alvo a totalidade da população de médicos internos de Medicina Geral e Familiar que iniciaram a sua formação em 2005, em Portugal continental (N = 228). A colheita de dados realizou-se através de um inquérito (questionário postal), tendo respondido 109 médicos internos (análise quantitativa), seguido de entrevistas semiestruturadas a um grupo de 16 médicos, seleccionados a partir da população-alvo (análise qualitativa). Os resultados desta investigação revelam que, na sua globalidade, a população estudada se encontra motivada para o exercício da especialidade de Medicina Geral e Familiar, contrariamente ao esperado. Contudo, a evolução pouco expressiva das dimensões em estudo, ao longo daquele Internato, sugere uma ausência de influência do mesmo na motivação profissional dos médicos estudados, que consideramos pertinente, atendendo à sua estrutura, organização e programa de formação. Os dados apurados na abordagem qualitativa confirmam a existência de múltiplos factores que influenciam a motivação profissional dos médicos internos ao longo do programa no Internato, apontando o papel crucial do Orientador na manutenção (ou variação) da orientação motivacional da referida população. Limitada pela inexistência de estudos anteriores realizados nesta área em Portugal, esta investigação sugere a necessidade de uma reformulação do Programa de Internato Médico de Medicina Geral e Familiar, que deverá ser centrada na melhor preparação dos seus Orientadores e em estratégias direccionadas para a qualidade da formação dos futuros Médicos de Família, neste país.

The effect of conservation measures on the spatial and temporal variation of rocky fish assemblages in the Arrábida Marine Park

Marine protected areas (MPAs) have been widely proposed for conservation purposes and as a tool for fisheries management. The Arrábida Marine Park is the first MPA in continental Portugal having a management plan, fully implemented since 2009. The main objective of this study was to evaluate the effect of protection measures on rocky reef fish assemblages and target invertebrates through before-after and control-effect (no-take vs. fished areas) underwater visual surveys and analysis of landings trends. Second, we used surveys before, during and after implementation of the management plan to understand fishers‟ preferences for fishing grounds and adaptation to the new rules, and evaluated the reserve effect through analysis of both ecological responses and fishing effort density. Third, we identified the main oceanographic drivers influencing the structure of reef fish assemblages and predicted the community structure for the last 50 years, in light of climatic change. Overall results suggest positive responses in biomass but not yet in numbers of some commercial species, with no effects on non-target species. The reserve effect is reinforced by the increase in landings of commercial species, despite increased fishing effort density in some areas, especially with octopus traps. Fishing grounds are mainly chosen based on the distribution of target species and associated habitats, but distance to port, weather conditions and safety also influence fishers‟ choices. Moreover, different fisheries respond differently to the protection measures, and within each fishery, individual fishers show distinct strategies, with some operating in a broader area whereas others keep preferred territories. Our results also show that wind stress and temperature are the main oceanographic drivers for rocky reef fish assemblages, with tropicalization of assemblages and polewards movements of species over the last 50 years consistent with temperature trends. We believe this study provides significant lessons for marine conservation and management of coastal systems.

Estabelecimento de prioridades para a conservação dos vertebrados terrestres do Parque Natural da Ria Formosa e selecção de áreas para a sua protecção

Dissertação de mest. em Gestão e Conservação da Natureza, Faculdade de Ciências do Mar e do Ambiente, Univ. do Algarve, 2004

Decapod crustacean larvae dynamics in the west continental coast of Portugal: the region adjacent to Aveiro coastal lagoon as model

Tese de dout., Ciências do Mar, Faculdade de Ciências do Mar e do Ambiente, Univ. do Algarve, 2010

Organic-walled dinoflagellate cysts in recent sediments from the Guadiana river estuary, South-East Portugal

Dissertação de Mestrado, Biologia Marinha, Faculdade de Ciências do Mar e do Ambiente, Universidade do Algarve, 2007

Temporal distribution of the short-beaked common dolphin (Delphinus delphis) in the south of Madeira Island (Portugal) and relationship with oceanographic variables

Dissertação de mestrado, Biologia Marinha, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2015

Settlement patterns of mussel recruits at different temporal scales in the Peniche-Berlengas area (Southwest Portugal)

Dissertação de Mestrado, Biologia Marinha, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2015

Discards of the Algarve (southern Portugal) crustacean trawl fishery

The crustacean trawl fishery off the Algarve coast (southern Portugal) takes place on the lower continental shelf and upper continental slope at depths between 150 and 600 m. This is a multi-species fishery targeting the shrimps Parapenaeus longirostris and Aristeus antennatus and the Norway lobster Nephrops norvegicus, with the latter two species the most important in the landings. The fishery is characterised by significant by-catch and discarding of a large number of species. As part of a study on the fate of trawl fishery discards, this component of the study focused on the quantification of the by-catch and discards of crustacean trawlers. Sampling took place on board seven commercial trawlers from June 1998 to October 1999. Data was collected from 48 tows in 22 fishing trips. The observers collected all of the catch that was discarded by the crew during the sorting operation and samples were taken to the laboratory for identification, weighing and measuring. The quantities of target species were recorded along with the presence of retained by-catch. Commercially valuable species that were retained included Plesiopenaeus edwardsianus, Aristeomorpha foliacea, Plesionika sp., and the fishes Lophius piscatorius and Merluccius merluccius. However, most of the species had no or little commercial value and were almost always discarded to the sea (90%). A total of 91 species were identified, 47 vertebrates and 44 invertebrates corresponding to 65 families. The Teleostei (78% and 68%) were the dominant group, both in number and weight. The species Micromesistius poutassou (34%), Gadiculus argenteus (10%) and Hoplostethus mediterraneus (8%) were the most important in weight. Ten species represented more than 82% of all discards in weight. Gadiculus argenteus (29%), Hoplostethus mediterraneus (21%) and Nezumia sclerorhynchus (10%) accounted for 60% of all discards in numbers. Data on the landed species composition is also presented.

Feeding habits of the velvet belly lanternshark Etmopterus spinax (Chondrichthyes : Etmopteridae) off the Algarve, southern Portugal

Etmopterus spinax is one of the most abundant predators of the upper continental slope off the Algarve (southern Portugal), where it is captured in large quantities in deep-water fisheries. The feeding habits of E. spinax off the Algarve were investigated through the analysis of stomach contents of 376 individuals. Prey composition was described and maturity, sex and size related variations in the diet analysed. The overall diet of E. spinax suggested a fairly generalized benthopelagic foraging behaviour primarily tuned to pelagic macroplankton/microneckton, teleost fish and cephalopods. Sex and maturity related differences in the diet were not significant. Two main ontogenic diet shifts were observed at about 17 and 28 cm total length. Small and medium sized immature sharks had a diet dominated by eurybathic crustaceans, chiefly Meganyctiphanes norvegica and Pasiphaea sivado. Larger individuals consumed more teleosts and cephalopods, in part associated with scavenging as a new feeding strategy. With increasing shark size the diet diversified both in terms of resources exploited and prey size.

Molluscan diversity caught by trawling fisheries: a case study in southern Portugal

The effects of commercial trawling on the malacological communities (except for the Cephalopoda) were examined, based on a study undertaken between 1996 and 2000 on the continental shelf and slope of southern Portugal. More than 50% of species caught by trawling in southern Portugal were discarded, with molluscs representing about 19%. Forty-four species of molluscs (15 bivalves, 28 gastropods and one polyplacophoran) were identified from the discarded specimens. Crustacean trawlers accounted for 34 molluscs species, and fish trawlers for 24. Twenty species were only caught by the crustacean trawl, compared with 10 species by the fish trawl, and 14 species were common to both trawls. The bivalve Venus nux Gmelin was the most numerous species discarded in the fish trawl, accounting for 42.0% of the total number of individuals, followed by the gastropods Ampulla priamus (Meuschen) (7.8%) and Ranella olearium (L.) (7.3%). In the crustacean trawl, the most numerous species discarded were the bivalve Anadara diluvii (Lamarck) (19.4%), the gastropod Calliostoma granulatum (Born) (15.5%), and the bivalve V. nux (15.1%). The third most discarded species from fish trawls in Algarve waters, the gastropod species R. olearium, is a species listed in Annex II of the Bern Convention. The difficulties of managing the real impact of fisheries on the molluscan populations and in defining a conservation strategy are discussed.