5 resultados para Chain of custody of traces

em Repositório Institucional da Universidade de Aveiro - Portugal


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Helicobacter pylori is a bacterial pathogen that affects more than half of the worlds population with gastro-intestinal diseases and is associated with gastric cancer. The cell surface of H. pylori is decorated with lipopolysaccharides (LPSs) composed of three distinct regions: a variable polysaccharide moiety (O-chain), a structurally conserved core oligosaccharide, and a lipid A region that anchors the LPS to the cell membrane. The O-chain of H. pylori LPS, exhibits unique oligosaccharide structures, such as Lewis (Le) antigens, similar to those present in the gastric mucosa and are involved in interactions with the host. Glucan, heptoglycan, and riban domains are present in the outer core region of some H. pylori LPSs. Amylose-like glycans and mannans are also constituents of some H. pylori strains, possibly co-expressed with LPSs. The complexity of H. pylori LPSs has hampered the establishment of accurate structure-function relationships in interactions with the host, and the design of carbohydrate-based therapeutics, such as vaccines. Carbohydrate microarrays are recent powerful and sensitive tools for studying carbohydrate antigens and, since their emergence, are providing insights into the function of carbohydrates and their involvement in pathogen-host interactions. The major goals of this thesis were the structural analysis of LPSs from H. pylori strains isolated from gastric biopsies of symptomatic Portuguese patients and the construction of a novel pathogen carbohydrate microarray of these LPSs (H. pylori LPS microarray) for interaction studies with proteins. LPSs were extracted from the cell surface of five H. pylori clinical isolates and one NCTC strain (26695) by phenol/water method, fractionated by size exclusion chromatography and analysed by gas chromatography coupled to mass spectrometry. The oligosaccharides released after mild acid treatment of the LPS were analysed by electrospray mass spectrometry. In addition to the conserved core oligosaccharide moieties, structural analyses revealed the presence of type-2 Lex and Ley antigens and N-acetyllactosamine (LacNAc) sequences, typically found in H. pylori strains. Also, the presence of O-6 linked glucose residues, particularly in LPSs from strains 2191 and NCTC 26695, pointed out to the expression of a 6-glucan. Other structural domains, namely ribans, composed of O-2 linked ribofuranose residues were observed in the LPS of most of H. pylori clinical isolates. For the LPS from strain 14382, large amounts of O-3 linked galactose units, pointing to the occurrence of a galactan, a domain recently identified in the LPS of another H. pylori strain. A particular feature to the LPSs from strains 2191 and CI-117 was the detection of large amounts of O-4 linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) residues, suggesting the presence of chitin-like glycans, which to our knowledge have not been described for H. pylori strains. For the construction of the H. pylori LPS microarray, the structurally analysed LPSs, as well as LPS-derived oligosaccharide fractions, prepared as neoglycolipid (NGL) probes were noncovalently immobilized onto nitrocellulosecoated glass slides. These were printed together with NGLs of selected sequence defined oligosaccharides, bacterial LPSs and polysaccharides. The H. pylori LPS microarray was probed for recognition with carbohydratebinding proteins (CBPs) of known specificity. These included Le and blood group-related monoclonal antibodies (mAbs), plant lectins, a carbohydratebinding module (CBM) and the mammalian immune receptors DC-SIGN and Dectin-1. The analysis of these CBPs provided new information that complemented the structural analyses and was valuable in the quality control of the constructed microarray. Microarray analysis revealed the occurrence of type-2 Lex and Ley, but not type-1 Lea or Leb antigens, supporting the results obtained in the structural analysis. Furthermore, the H. pylori LPSs were recognised by DC-SIGN, a mammalian lectin known to interact with this bacterium through fucosylated Le epitopes expressed in its LPSs. The -fucose-specific lectin UEA-I, showed restricted binding to probes containing type-2 blood group H sequence and to the LPSs from strains CI-117 and 14382. The presence of H-type-2, as well Htype- 1 in the LPSs from these strains, was confirmed using specific mAbs. Although H-type-1 determinant has been reported for H. pylori LPSs, this is the first report of the presence of H-type-2 determinant. Microarray analysis also revealed that plant lectins known to bind 4-linked GlcNAc chitin oligosaccharide sequences bound H. pylori LPSs. STL, which exhibited restricted and strong binding to 4GlcNAc tri- and pentasaccharides, differentially recognised the LPS from the strain CI-117. The chitin sequences recognised in the LPS could be internal, as no binding was detected to this LPS with WGA, known to be specific for nonreducing terminal of 4GlcNAc sequence. Analyses of the H. pylori LPSs by SDS-PAGE and Western blot with STL provided further evidence for the presence of these novel domains in the O-chain region of this LPS. H. pylori LPS microarray was also applied to analysis of two human sera. The first was from a case infected with H. pylori (H. pylori+ CI-5) and the second was from a non-infected control.The analysis revealed a higher IgG-reactivity towards H. pylori LPSs in the H. pylori+ serum, than the control serum. A specific IgG response was observed to the LPS isolated from the CI-5 strain, which caused the infection. The present thesis has contributed to extension of current knowledge on chemical structures of LPS from H. pylori clinical isolates. Furthermore, the H. pylori LPS microarray constructed enabled the study of interactions with host proteins and showed promise as a tool in serological studies of H. pyloriinfected individuals. Thus, it is anticipated that the use of these complementary approaches may contribute to a better understanding of the molecular complexity of the LPSs and their role in pathogenesis.

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A actividade vitivincola possui um conjunto diverso de caractersticas presentes no solo, territrio e comunidade que fazem parte do patrimnio cultural de uma determinada regio. Quando a tradio se traduz num conceito como terroir que formado por caractersticas territoriais, sociais e culturais de uma regio rural, o vinho apresenta uma assinatura que se escreve naturalmente no paladar regionalmente identificado. Os vinhos da Regio de Nemea, na Grcia e de Basto (Regio dos Vinhos Verdes) em Portugal, esto ambos sob a proteo dos regulamentos das Denominaes de Origem. No entanto, apesar de ambos serem regulados por sistemas institucionais de certificao e controlo de qualidade, afigura-se a necessidade de questionar se o patrimnio cultural e a identidade territorial especfica, impressa em ambos os terroirs, pode ser protegida num sentido mais abrangente do que apenas origem e qualidade. Em Nemea, a discusso entre os produtores diz respeito ao estabelecimento de sub-zonas, isto incluir na regulao PDO uma diferente categorizao territorial com base no terroir. Ou seja, para alm de estar presente no rtulo a designao PDO, as garrafas incluiro ainda informao certificada sobre a rea especfica (dentro do mesmo terroir) onde o vinho foi produzido. A acontecer resultaria em diferentes status de qualidade de acordo com as diferentes aldeias de Nemea onde as vinhas esto localizadas. O que teria possveis impactos no valor das propriedades e no uso dos solos. Para alm disso, a no participao da Cooperativa de Nemea na SON (a associao local de produtores de vinho) e como tal na discusso principal sobre as mudanas e os desafios sobre o terroir de Nemea constitui um problema no sector vitivincola de Nemea. Em primeiro lugar estabelece uma relao de no-comunicao entre os dois mais importantes agentes desse sector as companhias vincolas e a Cooperativa. Em segundo lugar porque constituiu uma possibilidade real, no s para os viticultores ficarem arredados dessa discusso, como tambm (porque no representados pela cooperativa) ficar impossibilitado um consenso sobre as mudanas discutidas. Isto poder criar um clima de desconfiana levando a discusso para arenas deslocalizadas e como tal para decises desterritorializadas Em Basto, h vrios produtores que comearam a vender a sua produo para distribuidoras localizadas externamente sub-regio de Basto, mas dentro da Regio dos Vinhos Verdes, uma vez que essas companhias tem um melhor estatuto nacional e internacional e uma melhor rede de exportaes. Isto est ainda relacionado com uma competio por uma melhor rede de contactos e status mais forte, tornando as discusses sobre estratgias comuns para o desenvolvimento rural e regional de Basto mais difcil de acontecer (sobre isto a palavra impossvel foi constantemente usada durante as entrevistas com os produtores de vinho). A relao predominante entre produtores caracterizada por relaes individualistas. Contudo foi observado que essas posies so ainda caracterizadas por uma desconfiana no interior da rede interprofissional local: conflitos para conseguir os mesmos potenciais clientes; comprar uvas a viticultores com melhor rcio qualidade/preo; estratgias individuais para conseguir um melhor status poltico na relao com a Comisso dos Vinhos Verdes. Para alm disso a inexistncia de uma activa intermediao institucional (autoridades municipais e a Comisso de Vinho Verde), a inexistncia entre os produtores de Basto de uma associao ou mesmo a inexistncia de uma cooperativa local tem levado a regio de Basto a uma posio de subpromoo nas estratgias de promoo do Vinho Verde em comparao com outras sub-regies. tambm evidente pelos resultados que as mudanas no sector vitivincolas na regio de Basto tm sido estimuladas de fora da regio (em resposta tambm s necessidades dos mercados internacionais) e raramente de dentro mais uma vez, arenas no localizadas e como tal decises desterritorializadas. Nesse sentido, toda essa discusso e planeamento estratgico, tero um papel vital na preservao da identidade localizada do terroir perante os riscos de descaracterizao e desterritorializao. Em suma, para ambos os casos, um dos maiores desafios parece ser como preservar o terroir vitivincola e como tal o seu carcter e identidade local, quando a rede interprofissional em ambas as regies se caracteriza, tanto por relaes no-consensuais em Nemea como pelo modus operandi de isolamento sem comunicao em Basto. Como tal h uma necessidade de envolvimento entre os diversos agentes e as autoridades locais no sentido de uma rede localizada de governana. Assim sendo, em ambas as regies, a existncia dessa rede essencial para prevenir os efeitos negativos na identidade do produto e na sua produo. Uma estratgia de planeamento integrado para o sector ser vital para preservar essa identidade, prevenindo a sua desterritorializao atravs de uma restruturao do conhecimento tradicional em simultneo com a democratizao do acesso ao conhecimento das tcnicas modernas de produo vitivincola.

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During the last years tropical forest has been a target of intense study especially due to its recent big scale destruction. Although a lot still needs to be explored, we start realizing how negative can the impact of our actions be for the ecosystem. Subsequently, the living community have been developing strategies to overcome this problem avoiding bottlenecks or even extinctions. Cooperative breeding (CB) has been recently pointed out as one of those strategies. CB is a breeding system where more than two individuals raise one brood. In most of the cases, extra individuals are offspring that delay their dispersal and independent breeding what allows them to help their parents raising their siblings in the subsequent breeding season. Such behavior is believed to be due, per example, to the lack of mates or breeding territories (ecological constraints hypothesis), a consequence of habitat fragmentation and/or disturbance. From this point, CB is easily promoted by a higher reproductive success of group vs pairs or single individuals. Accordingly, during this thesis I explore the early post-fledging survival of a cooperative breeding passerine, namely the impact of individual/habitat quality in its survival probability during the dependence period of the chicks. Our study species is the Cabaniss greenbul (Phyllastrephus cabanisi), a medium-sized, brownish passerine, classified within the Pycnonotidae family. It is found over part of Central Africa in countries such as Angola, Democratic Republic of the Congo, Mozambique and Kenya, inhabiting primary and secondary forests, as well as woodland of various types up to 2700m of altitude. Previous studies have concluded that PC is a facultative cooperative breeder. This study was conducted in Taita Hills (TH) at the Eastern Arc Mountains (EAM), a chain of mountains running from Southeast Kenya to the South of Tanzania. TH comprises an area of 430 ha and has been suffering intense deforestation reflecting 98% forest reduction over the last 200 years. Nowadays its forest is divided in fragments and our study was based in 5of those fragments. We access the post-fledging survival through radio-telemetry. The juvenile survey was done through the breeding females in which transmitters were placed with a leg-loop technique. Ptilochronology is consider to be the study of feather growth bars and has been used to study the nutritional state of a bird. This technique considers that the feather growth rate is positively proportional to the individual capability of ingesting food and to the food availability. This technique is therefore used to infer for individual/habitat quality. Survival was lowest during the first 5 days post-fledging representing 53.3%. During the next 15 days, risk of predation decreased with only 14.3% more deceased individuals. This represents a total of only 33% survived individuals in the end of the 50 days. Our results showed yet a significant positive relationship between flock size and post-fledging survival as well as between ptilochronology values and post-fledgling survival. In practice, these imply that on this population, as bigger the flock, as greater the post fledging survival and that good habitat quality or good BF quality, will lead to a higher juvenile survival rate. We believe that CB is therefore an adaptive behaviour to the lack of mates/breeding territory originated from the mass forest destruction and disturbance. Such results confirms the critical importance of habitat quality in the post-fledging survival and, for the first time, demonstrates how flock size influences the living probability of the juveniles and therefore how it impacts the (local) population dynamics of this species. In my opinion, future research should be focus in disentangle individual and habitat quality from each other and verify which relationship exist between them. Such study will allow us to understand which factor has a stronger influence in the post-fledging survival and therefore redirect our studies in that direction. In order to confirm the negative impact of human disturbance and forest fragmentation, it would be of major relevance to compare the reproductive strategies and reproductive success of populations living in intact forests and disturbed patches.

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A tese analisa o empreendedorismo do imigrante portugus na cidade do Recife, Estado de Pernambuco, Nordeste do Brasil, durante a primeira metade do sculo XX. O foco da tese pode ser assim formulado: teria o imigrante portugus sido empreendedor nesse cenrio de mudana econmica e cultural dos primeiros cinquenta anos do sculo XX, seja como grupo tnico, seja como pessoa de comportamento empreendedor? O corpus terico principal , portanto, derivado do campo do empreendedorismo. uma pesquisa interdisciplinar, que se ampara nas reas de histria, estudos migratrios, econmicos e organizacionais. De acordo com a literatura consultada, esse tipo de abordagem no incomum no vasto campo do empreendedorismo (Fillion, 1999 e Martinelli, 2007). luz dessa viso interdisciplinar, a investigao debrua-se sobre o perodo referido, resgata a trajetria desse imigrante no pas e no Recife e discute sua insero na economia e sociedade locais. Identifica caractersticas do dinamismo econmico comercial existente no perodo e reconstri a atmosfera de modernidade que a cidade atravessava no mesmo interregno histrico. Para seu desenvolvimento, a pesquisa se apia em contedos de estudos migratrios, histricos e econmicos porque nesse interregno de tempo, a cidade do Recife estava atravessando a chamada era da modernidade nas esferas econmica, cultural e comportamental. No que diz respeito s questes migratrias, a pertinncia bvia porque o tema do trabalho tem como alvo o imigrante luso. J quanto esfera econmica e ao contexto histrico da modernidade, seus contedos so trabalhados como o cenrio ou o teatro de operaes no qual o ator social, imigrante luso, movimentou-se. O trabalho adota, portanto, o olhar de ourives a procurar e a espiar nos textos, livros, discursos visitados e entrevistas realizadas, eventos ou sinais que conduzam compreenso e interpretao do comportamento do ator econmico, o imigrante portugus, na histria empresarial da cidade do Recife, na condio de empreendedor. Trata-se, por assim dizer, de uma pesquisa de postura quase arqueolgica voltada a procurar achados, materiais e imateriais, que denunciem e permitam a discusso e anlise do foco acima citado. Diferentemente de pesquisas recentes a serem referidas no captulo III que exploram o comportamento empreendedor e o empreendedorismo tnico no cenrio dos dias de hoje, o estudo olha pelo retrovisor para quase um sculo atrs e tenta reconstituir e identificar, na histria do imigrante portugus na cidade, contedos empreendedorsticos. Est estruturada em 09 (nove) captulos. No primeiro, so indicados os objetivos perseguidos, a relevncia do estudo sob o ponto de vista terico e os percalos que a pesquisa atravessou para atingir seu termo final. Faz-se, ainda, uma apresentao detalhada dos demais captulos do trabalho. No corpo do texto, esto ainda, estampadas imagens que testemunham a presena lusa na cidade e documentam a atmosfera da vida do Recife, no perodo pesquisado. Os resultados encontrados sinalizam para evidncias consistentes de empreendedorismo de natureza tnico lusitana nas cadeias produtivas conceito a ser definido no 9 captulo das indstrias da panificao; de terreno, ferragens e construo; e alimentos em geral. Indica, ainda, comportamento empreendedor do imigrante portugus em diversas atividades econmicas, desde exportao e importao, cafs, restaurantes at o setor de entretenimento em geral. Acredita-se, destarte, que os resultados alcanados podem aditar contribuies relevantes nos campos referidos acima, bem como indicar novos temas de investigao que desdobrem sugestes formuladas nas consideraes finais da investigao.

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A gesto de um armazm de componentes de uma qualquer empresa produtiva uma das principais tarefas a desempenhar no seio desta, pois a mesma afecta toda a cadeia de abastecimento de entrega do produto final, sendo o armazm de componentes o incio da cadeia interna. Qualquer dificuldade que surja no desenrolar das actividades associadas poder causar impactos prejudiciais nos processos consequentes. A melhoria do principal processo do armazm, correspondente satisfao dos pedidos de material dos processos a jusante, algo que trar benefcios a toda a cadeia, ao mesmo tempo que so melhoradas as condies de trabalho, eliminando o desperdcio e tornando o processo mais eficiente. No obstante deste processo, ainda existe a necessidade de recolher e gerir informaes referentes aos diferentes processos do armazm da maneira mais rpida possvel, para actuar de acordo com as necessidades. A falta de informao relativamente ao estado de um processo tambm poder influenciar os processos seguintes de forma negativa. O projecto aqui apresentado foi realizado no armazm de componentes da Bosch Termotecnologia S.A., em Aveiro, tendo como objectivo mostrar a importncia da movimentao de material e tambm de informao dentro desta rea, criando ao mesmo tempo a melhoria tanto dos fluxos de material como dos fluxos de informao. Sero apresentadas diferentes implementaes que foram desenvolvidas com o intuito de criar melhoria nos fluxos: a criao de novos fluxos de informao para o processo de recepo de material, com o intuito de recolher informao que at agora no era perceptvel, para depois actuar na melhoria do processo; a criao de reas dedicadas dentro da rea de picking, de modo a atingir uma reduo no nmero de colaboradores afectos ao processo de picking; a implementao de uma clula de repacking, de modo a remover esta actividade do processo de picking; bem como todas as actividades realizadas com o objectivo de implementar as melhorias propostas.