Functional characterization of Gne (UDP-N-acetylglucosamine-4-epimerase), Wzz (chain length determinant), and Wzy (O-antigen polymerase) of Yersinia enterocolitica serotype O:8

The lipopolysaccharide (LPS) O-antigen of Yersinia enterocolitica serotype O:8 is formed by branched pentasaccharide repeat units that contain N-acetylgalactosamine (GalNAc), L-fucose (Fuc), D-galactose (Gal), D-mannose (Man), and 6-deoxy-D-gulose (6d-Gul). Its biosynthesis requires at least enzymes for the synthesis of each nucleoside diphosphate-activated sugar precursor; five glycosyltransferases, one for each sugar residue; a flippase (Wzx); and an O-antigen polymerase (Wzy). As this LPS shows a characteristic preferred O-antigen chain length, the presence of a chain length determinant protein (Wzz) is also expected. By targeted mutagenesis, we identify within the O-antigen gene cluster the genes encoding Wzy and Wzz. We also present genetic and biochemical evidence showing that the gene previously called galE encodes a UDP-N-acetylglucosamine-4-epimerase (EC 5.1.3.7) required for the biosynthesis of the first sugar of the O-unit. Accordingly, the gene was renamed gne. Gne also has some UDP-glucose-4-epimerase (EC 5.1.3.2) activity, as it restores the core production of an Escherichia coli K-12 galE mutant. The three-dimensional structure of Gne was modeled based on the crystal structure of E. coli GalE. Detailed structural comparison of the active sites of Gne and GalE revealed that additional space is required to accommodate the N-acetyl group in Gne and that this space is occupied by two Tyr residues in GalE whereas the corresponding residues present in Gne are Leu136 and Cys297. The Gne Leu136Tyr and Cys297Tyr variants completely lost the UDP-N-acetylglucosamine-4-epimerase activity while retaining the ability to complement the LPS phenotype of the E. coli galE mutant. Finally, we report that Yersinia Wzx has relaxed specificity for the translocated oligosaccharide, contrary to Wzy, which is strictly specific for the O-unit to be polymerized.

Characterization of the six glycosyltransferases involved in the biosynthesis of Yersinia enterocolitica serotype O:3 lipopolysaccharide outer core

Yersinia enterocolitica (Ye) is a gram-negative bacterium; Ye serotype O:3 expresses lipopolysaccharide (LPS) with a hexasaccharide branch known as the outer core (OC). The OC is important for the resistance of the bacterium to cationic antimicrobial peptides and also functions as a receptor for bacteriophage phiR1-37 and enterocoliticin. The biosynthesis of the OC hexasaccharide is directed by the OC gene cluster that contains nine genes (wzx, wbcKLMNOPQ, and gne). In this study, we inactivated the six OC genes predicted to encode glycosyltransferases (GTase) one by one by nonpolar mutations to assign functions to their gene products. The mutants expressed no OC or truncated OC oligosaccharides of different lengths. The truncated OC oligosaccharides revealed that the minimum structural requirements for the interactions of OC with bacteriophage phiR1-37, enterocoliticin, and OC-specific monoclonal antibody 2B5 were different. Furthermore, using chemical and structural analyses of the mutant LPSs, we could assign specific functions to all six GTases and also revealed the exact order in which the transferases build the hexasaccharide. Comparative modeling of the catalytic sites of glucosyltransferases WbcK and WbcL followed by site-directed mutagenesis allowed us to identify Asp-182 and Glu-181, respectively, as catalytic base residues of these two GTases. In general, conclusive evidence for specific GTase functions have been rare due to difficulties in accessibility of the appropriate donors and acceptors; however, in this work we were able to utilize the structural analysis of LPS to get direct experimental evidence for five different GTase specificities.

L'accord sujet-verbe en français contemporain: une étude de variation sociolinguistique

Cette communication a pour objectif de présenter et d’analyser les résultats d’une enquête portant sur l’accord sujet-verbe en français contemporain. Dans le domaine de l’accord sujet-verbe, bien que dans la plupart des cas le locuteur n’ait pas le choix de l’accord – c’est–à-dire qu’il n’y a qu’un accord possible – il existe néanmoins des contextes dans lesquels on peut trouver une variation entre l’accord singulier et le pluriel (cf. Corbett 2006 ; Grevisse 1993 ; Riegel et al 1994). Cette variation est souvent liée à une discordance entre le nombre syntaxique et le nombre sémantique. C’est le cas de certaines expressions de quantité, comme dans les exemples suivants : Singulier : « On a affaire à une minorité qui fait la loi à l’université » (Ouest France, 23-24 mai 2009, p.13) Pluriel : « Un petit millier de producteurs allemands, français et belges se sont déplacés, hier, à Bruxelles […] » (Ouest France, 26 mai 2009, p.3) Cette variation nous offre plusieurs pistes de recherche : dans une perspective linguistique, elle peut nous aider à mieux comprendre comment interagissent les différents facteurs linguistiques qui ont une influence sur l’accord, et dans une perspective sociolinguistique, elle représente un nouveau domaine à explorer pour l’étude sociolinguistique de la variation grammaticale en français, ce qui reste jusqu’à présent relativement peu étudiée. Nous traitons dans cette communication de la perspective sociolinguistique, c'est-à-dire les facteurs externes tels que l’âge, le sexe, et le niveau d’éducation du locuteur qui jouent un rôle dans l’accord sujet-verbe avec les expressions de quantité. Nous considérons en particulier la variation sexolectale : dans un premier temps, nous examinons les résultats de quelques études précédentes de la variation morphosyntaxique en français contemporain par rapport à l’influence du sexe du locuteur. Nous en concluons que les Principes élaborés par Labov (1990) pour décrire la variation sexolectale en anglais semblent être moins valables pour le cas du français de la France ; ou bien, qu’ils ne s’appliquent pas de façon simpliste. Dans un deuxième temps, nous présentons les résultats de nôtre étude, et nous voyons que pour nôtre projet aussi, les résultats pour la variation sexolectale ne s’expliquent pas facilement dans le cadre des Principes de Labov (1990).

L'accord sujet-verbe en français contemporain: une étude de variation grammaticale et sociale

Dans cet article, nous évaluons le rôle du cotexte (les facteurs internes ou linguistiques) et du contexte (les facteurs externes ou sociaux, et la situation de l’interaction) dans l’accord sujet-verbe induit par les expressions de quantité en français contemporain. Dans l’emploi de ces expressions, par exemple la majorité, le reste etc., il existe une variation entre l’accord singulier et le pluriel, qui est liée à une discordance entre le nombre syntaxique et le nombre sémantique de l’expression. Dans un premier temps, nous présentons la méthodologie d’une première enquête dont le but était d’identifier les principaux facteurs internes et externes qui ont une influence sur les accords de ce type. Dans un deuxième temps, nous présentons les résultats pour les facteurs sociaux avant d’en tirer quelques conclusions pour l’étude principale.