Identical sequence patterns in the ends of exons and introns of human protein-coding genes

Intron splicing is one of the most important steps involved in the maturation process of a pre-mRNA. Although the sequence profiles around the splice sites have been studied extensively, the levels of sequence identity between the exonic sequences preceding the donor sites and the intronic sequences preceding the acceptor sites has not been examined as thoroughly. In this study we investigated identity patterns between the last 15 nucleotides of the exonic sequence preceding the 5' splice site and the intronic sequence preceding the 3' splice site in a set of human protein-coding genes that do not exhibit intron retention. We found that almost 60% of consecutive exons and introns in human protein-coding genes share at least two identical nucleotides at their 3' ends and, on average, the sequence identity length is 2.47 nucleotides. Based on our findings we conclude that the 3' ends of exons and introns tend to have longer identical sequences within a gene than when being taken from different genes. Our results hold even if the pairs are non-consecutive in the transcription order. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Modelo adaptativo de conforto para avaliação in loco de espaços urbanos abertos

Espaços urbanos abertos possibilitam menor controle das variáveis ambientais do que espaços fechados, que apresentam maior grau de confinamento. Por outro lado, as possibilidades de adaptação dos usuários nos espaços abertos acabam sendo maiores devido aos seus usos predominantes. O objetivo deste artigo é verificar possíveis meios de adaptação térmica, tais como atividades, vestimentas e aclimatação, para a proposição de ajustes na Temperatura Equivalente de Globo, que é utilizada para avaliação in loco de espaços urbanos abertos. Foram realizados levantamentos de campo com quantificação de variáveis ambientais e aplicação de questionários, e comparação dos resultados de modelos preditivos e diferentes bases empíricas. O estudo considerou diferentes atividades físicas, diferentes conjuntos de vestimenta e diferentes condições de aclimatação. Os resultados indicaram a necessidade de ampliações na base empírica para os dados relativos às atividades e vestimentas. Com relação à aclimatação, considerando a temperatura do ar média horária dos trinta dias anteriores a que estavam expostos os entrevistados, sua verificação demonstrou que, dentro dos limites do estudo, a abordagem adotada de propor ajustes na Temperatura Equivalente de Globo, é adequada,. Os resultados do modelo ajustado com base nos resultados de aclimatação dos entrevistados apresentaram correlação mais alta com as bases empíricas do que os resultados do modelo originalmente proposto.