Water-in-Oil Micro-Emulsion Enhances the Secondary Structure of a Protein by Confinement

A scheme is presented in which an organic solvent environment in combination with surfactants is used to confine a natively unfolded protein inside an inverse microemulsion droplet. This type of confinement allows a study that provides unique insight into the dynamic structure of an unfolded, flexible protein which is still solvated and thus under near-physiological conditions. In a model system, the protein osteopontin (OPN) is used. It is a highly phosphorylated glycoprotein that is expressed in a wide range of cells and tissues for which limited structural analysis exists due to the high degree of flexibility and large number of post-translational modifications. OPN is implicated in tissue functions, such as inflammation and mineralisation. It also has a key function in tumour metastasis and progression. Circular dichroism measurements show that confinement enhances the secondary structural features of the protein. Small-angle X-ray scattering and dynamic light scattering show that OPN changes from being a flexible protein in aqueous solution to adopting a less flexible and more compact structure inside the microemulsion droplets. This novel approach for confining proteins while they are still hydrated may aid in studying the structure of a wide range of natively unfolded proteins.

The Role of Molecular Conformation and Polarizable Embedding for One- and Two-Photon Absorption of Disperse Orange 3 in Solution

Solvent effects on the one- and two-photon absorption (IPA and 2PA) of disperse orange 3 (DO3) in dimethyl sulfoxide (DMSO) are studied using a discrete polarizable embedding (PE) response theory. The scheme comprises a quantum region containing the chromophore and an atomically granulated classical region for the solvent accounting for full interactions within and between the two regions. Either classical molecular dynamics (MD) or hybrid Car-Parrinello (CP) quantum/classical (QM/MM) molecular dynamics simulations are employed to describe the solvation of DO3 in DMSO, allowing for an analysis of the effect of the intermolecular short-range repulsion, long-range attraction, and electrostatic interactions on the conformational changes of the chromophore and also the effect of the solute-solvent polarization. PE linear response calculations are performed to verify the character, solvatochromic shift, and overlap of the two lowest energy transitions responsible for the linear absorption spectrum of DO3 in DMSO in the visible spectral region. Results of the PE linear and quadratic response calculations, performed using uncorrelated solute-solvent configurations sampled from either the classical or hybrid CP QM/MM MD simulations, are used to estimate the width of the line shape function of the two electronic lowest energy excited states, which allow a prediction of the 2PA cross-sections without the use of empirical parameters. Appropriate exchange-correlation functionals have been employed in order to describe the charge-transfer process following the electronic transitions of the chromophore in solution.

Galactose Recognition by the Apicomplexan Parasite Toxoplasma gondii

Toxosplasma gondii is the model parasite of the phylum Apicomplexa, which contains numerous obligate intracellular parasites of medical and veterinary importance, including Eimeria, Sarcocystis, Cryptosporidium, Cyclospora, and Plasmodium species. Members of this phylum actively enter host cells by a multistep process with the help of microneme protein (MIC) complexes that play important roles in motility, host cell attachment, moving junction formation, and invasion. T. gondii (Tg)MIC1-4-6 complex is the most extensively investigated microneme complex, which contributes to host cell recognition and attachment via the action of TgMIC1, a sialic acid-binding adhesin. Here, we report the structure of TgMIC4 and reveal its carbohydrate-binding specificity to a variety of galactose-containing carbohydrate ligands. The lectin is composed of six apple domains in which the fifth domain displays a potent galactose-binding activity, and which is cleaved from the complex during parasite invasion. We propose that galactose recognition by TgMIC4 may compromise host protection from galectin-mediated activation of the host immune system.

Human leukocyte antigen-G 3 ' untranslated region polymorphisms are associated with better kidney allograft acceptance

Human leukocyte antigen-G (FILA-G) plays a well-recognized role in the modulation of the immune response, and HLA-G expression has been associated with increased graft survival and decreased rejection episodes. To investigate the role of the HLA-G 3' untranslated region (3'UTR) in renal transplantation, we evaluated several polymorphic sites (14-bp Del/Ins +3003T/C, +3010C/G, +3027C/A, +3035C/T, +3142G/C, and +3187A/G) in patients exhibiting or not exhibiting rejection episodes. A total of 104 patients (15 with acute and 48 with chronic rejection, and 41 with no rejection) and 142 healthy individuals were studied. HLA-G 3'UTR was typed by direct sequencing. The +3035C-C genotype was more frequent in patients exhibiting chronic rejection compared with healthy controls, and the +3035C-T genotype was less frequent in chronic rejection compared with patients without rejection (acute plus chronic) or compared with healthy controls. The +3187G-A genotype, in which the A allele is associated with increased mRNA degradation, showed increased frequency in the rejection group (acute plus chronic) when compared with healthy controls. The 14 base pair Deletion/Insertion genotype was marginally increased in patients with acute rejection. This is the first study to show associations among numerous polymorphic sites in the HLA-G 3'UTR in kidney allotransplantation, which may contribute to the understanding of HLA-G post-transcriptional mechanisms. (C) 2012 American Society for Histocompatibility and Immunogenetics. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.

Organization and dynamics of Conselho Municipal de Seguranca Alimentar e Nutricional de Sao Paulo: implications of their participation on the creation of a municipal food and nutrition security policy

Objective This study analyzed the internal functioning, organization and political participation of the local food and nutrition security council and possible implications of their participation on the creation of a municipal food and nutrition security policy in the city of Sao Paulo. Methods This qualitative study was done in three stages: document analysis; observation of meetings and semi-structured interviews with board members considered key informants. The axis of analysis was the political participation of the council, considering its internal aspects, like board members, operating dynamics of political participation of its members and the relationship between these topics and the council's actions for the definition and creation of a food and nutrition security policy. Results The intellectual profile of the board members does not represent the majority of the population, thereby facilitating the omission of actual issues in council discussions. Its strict internal dynamics and the asymmetry of its members generally prevent the active participation of board members and, specifically, discussions about a food and nutrition security policy. The so-called "militant members" have a differentiated, more aggressive participation, with greater mastery of the subject and its topics. Conclusion The board member profiles, internal organization of the council, complexity of the subject and its low insertion in the society distance the council from social needs and lead them to act incipiently with regard to the municipal policies of food and nutrition security.

A Atuação de conselhos do meio ambiente na gestão ambiental local

A complexidade do desenvolvimento sustentável configura um paradigma em que são necessárias ações efetivas de gestão ambiental que, em última instância, têm relação com a formulação e a implementação de políticas públicas. Para que haja uma efetiva gestão ambiental no âmbito municipal é necessária a participação da sociedade nos processos de gestão. Logo, os conselhos municipais do meio ambiente são peças fundamentais na promoção da gestão ambiental local com vistas a uma melhor qualidade de vida. A literatura enfatiza que a efetividade dessas instâncias está ligada, principalmente, à sua estrutura e funcionamento. Assim sendo, essa pesquisa objetivou a identificação de oportunidades de melhoria na estrutura e no funcionamento do Conselho Municipal de Gestão e Saneamento Ambiental de Santo André (COMUGESAN) como uma contribuição para sua atuação na gestão ambiental. Para tanto, utilizou-se a pesquisa bibliográfica, documental e qualitativa, no ano de 2008, caracterizando-se como estudo de caso exploratório no Município de Santo André, SP. Observou-se que a atuação de Conselhos Municipais do Meio Ambiente na gestão ambiental transcende as ações de tomada de decisão, formulação e implementação das políticas locais, constituindo-se, sobretudo, como espaço educativo e de construção da cidadania. Como oportunidades de melhoria, identificaram-se seis aspectos primordiais a serem fortalecidos em sua atuação: estrutura; composição e representatividade; capacitação; educação em meio ambiente; informação; avaliação constante. Com os resultados obtidos, sugere-se que o COMUGESAN adote atividades de capacitação para aperfeiçoar a representatividade, instituindo cursos de formação de conselheiros e atividades em educação continuada, bem como a realização de diagnósticos internos.

Integração dos aspectos ambientais nas decisões: diferenciação de interesses no conselho municipal de política urbana de Santo André / SP

A integração dos aspectos ambientais pode ser potencializada por meio da inserçãoem políticas de outras áreas é a busca de objetivos ambientais em políticas setorias, tais como de habitação, saúde, desenvolvimento urbano, entro outras. Dessa forma, o objetivo do presente estudo foi verificar se a integração dos aspectos ambientais ocorre nas decisões do Conselho Municipal de Política Urbana de Santo André, São Paulo. Para isso, foram feitas a análise da legislação relativa ao Conselho e entrevistas com conselheiros. Foi usada técnica da análise de conteúdo temática para tratamento dos dados. Os resultados mostraram que na legislação ocorre a integração dos aspectos ambientais. Nas entrevistas foram verificados diferentes entendimentos de integração e encontradas dificuldades similares àquelas encontradas na literatura internacional. Concluiu-se que o processo de integração dos aspectos ambientais ainda é incipiente e que o Conselho pode contribuir para seu avanço.

Organização e dinâmica do Conselho Municipal de Segurança Alimentar e Nutricional de São Paulo: implicações para a sua atuação na construção da política municipal de Segurança Alimentar e Nutricional

OBJETIVO: Analisar o funcionamento, a organização e a participação política internas do Conselho Municipal de Segurança Alimentar e Nutricional de São Paulo e quais as possíveis implicações decorrentes na sua atuação no processo de construção de uma política municipal de segurança alimentar e nutricional. MÉTODOS: O estudo de abordagem qualitativa constituiu-se em três etapas: análise documental de atas; observação de reuniões e realização de entrevistas semi-estruturadas com conselheiros, considerados informantes-chave. O eixo de análise foi a participação política do Conselho considerando seus aspectos internos, como composição, dinâmica de funcionamento e participação política de seus membros e a relação destes tópicos com a atuação do Conselho na definição e elaboração de uma política municipal de segurança alimentar e nutricional. RESULTADOS: O perfil "intelectualizado" dos conselheiros não é representativo da maioria da população e facilita o afastamento de questões concretas nas discussões do conselho; a rígida dinâmica interna e a assimetria entre seus membros dificultam, de forma geral, a participação ativa dos conselheiros e, especificamente, as discussões sobre políticas de segurança alimentar e nutricional. Os denominados "conselheiros-militantes" apresentam participação diferenciada, mais crítica, com maior domínio sobre o tema e suas discussões. CONCLUSÃO: O perfil dos conselheiros, a organização interna do Conselho, além da complexidade do tema e sua pequena inserção na sociedade, fazem que o conselho atue distante das demandas sociais e de forma incipiente com relação às políticas de segurança alimentar e nutricional no município.