Sexage et phylogénie, à partir des gènes CHD (-Z et -W) et COX-1, des oiseaux de proie du Québec et de perroquets d’attrait vétérinaire

Connaître le sexe d’un oiseau est important pour divers domaines notamment pour les vétérinaires, les écologistes ainsi que pour les éleveurs d’oiseaux qui veulent former des couples qui serviront à la reproduction. Plusieurs espèces d’oiseaux, juvéniles et adultes, n’ont pas de dimorphisme sexuel. L’utilisation de l’ADN est une façon rapide de déterminer le sexe à partir d’un échantillon de sang, de muscle, de plumes ou de fèces. Par contre, la méthode devrait être validée pour chaque espèce et idéalement, standardisée. Le premier objectif de cette étude est de développer une méthode de sexage par séquençage des oiseaux à partir des séquences du gène CHD, en utilisant les oiseaux de proie et les perroquets vus en clinique au Québec. Un deuxième objectif est de faire l’identification de l’espèce à sexer, à partir du gène mitochondrial COX-1 et aussi à partir des séquences CHD-Z et CHD-W, utilisés pour le sexage. Un troisième objectif est d’évaluer les séquences sorties (CHD-Z, CHD-W et COX-1) en vue d’une étude phylogénique. Une extraction d’ADN a été effectuée chez 27 espèces de perroquets, 34 espèces d’oiseaux de proie, une corneille (Corvus brachyrhynchos) et un poulet (Gallus gallus). Une amplification par PCR a été exécutée pour les exons partiels 23 et 24 du gène CHD. Le séquençage de cet amplicon permettait de savoir s’il s’agissait d’un mâle (séquence simple CHD-Z) ou d’une femelle (séquences CHD-Z et CHD-W qui se chevauchent). Afin d’avoir des séquences CHD-W distinctes, un sous-clonage a été fait chez les femelles de chaque espèce. De cette manière, les séquences partielles du gène CHD, Z et W, ont été trouvées pour les espèces échantillonnées. Une étude phylogénique a été effectuée avec les séquences de COX-1, CHD-Z et CHD-W grâce au site « Clustal-Omega ». La méthode de sexage des oiseaux par séquençage du gène CHD est standard et efficace. Le gène COX-1 permet une meilleure identification des espèces parentes et le gène CHD-Z est le plus utile pour étudier la phylogénie profonde.

Interaction entre le GM-CSF et PU.1 dans la survie des précurseurs myéloïdes

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Resistance to colistin : what is the fate for this antibiotic in pig production?

Colistin, a cationic polypeptide antibiotic, has reappeared in human medicine as a last-line treatment option for multidrug-resistant Gram-negative bacteria (MDR-GNB). Colistin is widely used in veterinary medicine for the treatment of gastrointestinal infections caused by Enterobacteriaceae. GNB resistant to colistin owing to chromosomal mutations have already been reported both in human and veterinary medicine, however several recent studies have just identified a plasmid-mediated mcr-1 gene encoding for colistin resistance in Escherichia coli colistin resistance. The discovery of a non-chromosomal mechanism of colistin resistance in E. coli has led to strong reactions in the scientific community and to concern among physicians and veterinarians. Colistin use in food animals and particularly in pig production has been singled out as responsible for the emergence of colistin resistance. The present review will focus mainly on the possible link between colistin use in pigs and the spread of colistin resistance in Enterobacteriaceae. First we demonstrate a possible link between Enterobacteriaceae resistance emergence and oral colistin pharmacokinetics/pharmacodynamics and its administration modalities in pigs. We then discuss the potential impact of colistin use in pigs on public health with respect to resistance. We believe that colistin use in pig production should be re-evaluated and its dosing and usage optimised. Moreover, the search for competitive alternatives to using colistin with swine is of paramount importance to preserve the effectiveness of this antibiotic for the treatment of MDR-GNB infections in human medicine.