3 resultados para Eutrophication. Ecological modeling. Eutrophication model. Top-down control

em Université de Montréal


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Lâestradiol (E2) est une hormone femelle qui joue un rôle essentiel, à la fois dans la régulation et dans la détermination de certaines conditions physiologiques in vivo, telle que la différenciation et la prolifération cellulaire. Lorsque lâE2 est donné en supplément, par exemple dans le cas de thérapie hormonale, deux effets sont observés, un effet génomique et un effet non-génomique, de par son interaction avec les récepteurs à Åstrogène du noyau ou de la membrane cellulaire, respectivement. Lâeffet non-génomique est plus difficile à étudier biologiquement parce que lâeffet se produit sur une échelle de temps extrêmement courte et à cause de la nature hydrophobe de lâE2 qui réduit sa biodisponibilité et donc son accessibilité aux cellules cibles. Câest pourquoi il est nécessaire de développer des systèmes dâadministration de lâE2 qui permettent de nâétudier que lâeffet non-génomique de lâÅstrogène. Une des stratégies employée consiste à greffer lâE2 à des macromolécules hydrophiles, comme de lâalbumine de sérum bovin (BSA) ou des dendrimères de type poly(amido)amine, permettant de maintenir lâinteraction de lâE2 avec les récepteurs dâÅstrogène de la membrane cellulaire et dâéviter la pénétration de lâE2 dans le noyau des cellules. Toutefois, ces systèmes macromolécules-E2 sont critiquables car ils sont peu stables et lâE2 peut se retrouver sous forme libre, ce qui affecte sa localisation cellulaire. Lâobjectif de cette thèse est donc de développer de nouvelles plateformes fonctionnalisées avec de lâE2 en utilisant les approches de synthèses ascendantes et descendantes. Le but de ces plateformes est de permettre dâétudier le mécanisme de lâeffet non-génomique de lâE2, ainsi que dâexplorer des applications potentielles dans le domaine biomédical. Lâapproche ascendante est basée sur un ligand dâE2 activé, lâacide 17,α-éthinylestradiol-benzoïque, attaché de façon covalente à un polymère de chitosan avec des substitutions de phosphorylcholine (CH-PC-E2). Lâestradiol est sous forme de pro-drogue attachée au polymère qui sâauto-assembler pour former un film. Lâeffet biologique de la composition chimique du film de chitosan-phosphorylcholine a été étudié sur des cellules endothéliales. Les films de compositions chimiques différentes ont préalablement été caractérisés de façon physicochimique. La topographie de la surface, la charge de surface, ainsi que la rhéologie des différents films contenant 15, 25, ou 40% molaires de phosphorylcholine, ont été étudiés par microscopie à force atomique (AFM), potentiel zêta, résonance plasmonique de surface et par microbalance à cristal de quartz avec dissipation (QCM-D). Les résultats de QCM-D ont montré que plus la part molaire en phosphorylcholine est grande moins il y a de fibrinogène qui sâadsorbe sur le film de CH-PC. Des cellules humaines de veine ombilicale (HUVECs) cultivées sur des films de CH-PC25 et de CH-PC40 forment des amas cellulaire appelés sphéroïdes au bout de 4 jours, alors que ce nâest pas le cas lorsque ces cellules sont cultivées sur des films de CH-PC15. Lâattachement de lâestradiol au polymère a été caractérisé par plusieurs techniques, telles que la résonance magnétique nucléaire de proton (1H NMR), la spectroscopie infrarouge avec transformée de Fourier à réfraction totale atténuée (FTIR-ATR) et la spectroscopie UV-visible. La nature hydrogel des films (sa capacité à retenir lâeau) ainsi que lâinteraction des films avec des récepteurs à E2, ont été étudiés par la QCM-D. Des études dâimagerie cellulaires utilisant du diacétate de diaminofluoresceine-FM ont révélé que les films hydrogels de CH-PC-E2 stimulent la production dâoxyde nitrique par les cellules endothéliales, qui joue un rôle protecteur pour le système cardiovasculaire. Lâensemble de ces études met en valeur les rôles différents et les applications potentielles quâont les films de type CH-PC-E2 et CH-PC dans le cadre de la médecine cardiovasculaire régénérative. Lâapproche descendante est basée sur lâattachement de façon covalente dâE2 sur des ilots dâor de 2 μm disposés en rangées et espacés par 12 μm sur un substrat en verre. Les ilots ont été préparés par photolithographie. La surface du verre a quant à elle été modifiée à lâaide dâun tripeptide cyclique, le cRGD, favorisant lâadhésion cellulaire. Lâattachement dâE2 sur les surfaces dâor a été suivi et confirmé par les techniques de SPR et de QCM-D. Des études dâELISA ont montré une augmentation significative du niveau de phosphorylation de la kinase ERK (marqueur important de lâeffet non-génomique) après 1 heure dâexposition des cellules endothéliales aux motifs alternant lâE2 et le cRGD. Par contre lorsque des cellules cancéreuses sont déposées sur les surfaces présentant des motifs dâE2, ces cellules ne croissent pas, ce qui suggère que lâE2 nâexerce pas dâeffet génomique. Les résultats de lâapproche descendante montrent le potentiel des surfaces présentant des motifs dâE2 pour lâétude des effets non-génomiques de lâE2 dans un modèle in vitro.

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La vision joue un rôle très important dans la prévention du danger. La douleur a aussi pour fonction de prévenir les lésions corporelles. Nous avons donc testé lâhypothèse quâune hypersensibilité à la douleur découlerait de la cécité en guise de compensation sensorielle. En effet, une littérature exhaustive indique quâune plasticité intermodale sâopère chez les non-voyants, ce qui module à la hausse la sensibilité de leurs sens résiduels. De plus, plusieurs études montrent que la douleur peut être modulée par la vision et par une privation visuelle temporaire. Dans une première étude, nous avons mesuré les seuils de détection thermique et les seuils de douleur chez des aveugles de naissance et des voyants à lâaide dâune thermode qui permet de chauffer ou de refroidir la peau. Les participants ont aussi eu à quantifier la douleur perçue en réponse à des stimuli laser CO2 et à répondre à des questionnaires mesurant leur attitude face à des situations douloureuses de la vie quotidienne. Les résultats obtenus montrent que les aveugles congénitaux ont des seuils de douleur plus bas et des rapports de douleur plus élevés que leurs congénères voyants. De plus, les résultats psychométriques indiquent que les non-voyants sont plus attentifs à la douleur. Dans une deuxième étude, nous avons mesuré lâimpact de l'expérience visuelle sur la perception de la douleur en répliquant la première étude dans un échantillon dâaveugles tardifs. Les résultats montrent que ces derniers sont en tous points similaires aux voyants quant à leur sensibilité à la douleur. Dans une troisième étude, nous avons testé les capacités de discrimination de température des aveugles congénitaux, car la détection de changements rapides de température est cruciale pour éviter les brûlures. Il sâest avéré que les aveugles de naissance ont une discrimination de température plus fine et quâils sont plus sensibles à la sommation spatiale de la chaleur. Dans une quatrième étude, nous avons examiné la contribution des fibres A∠et C au traitement nociceptif des non-voyants, car ces récepteurs signalent la première et la deuxième douleur, respectivement. Nous avons observé que les aveugles congénitaux détectent plus facilement et répondent plus rapidement aux sensations générées par lâactivation des fibres C. Dans une cinquième et dernière étude, nous avons sondé les changements potentiels quâentrainerait la perte de vision dans la modulation descendante des intrants nociceptifs en mesurant les effets de lâappréhension dâun stimulus nocif sur la perception de la douleur. Les résultats montrent que, contrairement aux voyants, les aveugles congénitaux voient leur douleur exacerbée par lâincertitude face au danger, suggérant ainsi que la modulation centrale de la douleur est facilitée chez ces derniers. En gros, ces travaux indiquent que lâabsence dâexpérience visuelle, plutôt que la cécité, entraine une hausse de la sensibilité nociceptive, ce qui apporte une autre dimension au modèle dâintégration multi-sensorielle de la vision et de la douleur.

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L'entraînement sans surveillance efficace et inférence dans les modèles génératifs profonds reste un problème difficile. Une approche assez simple, la machine de Helmholtz, consiste à entraîner du haut vers le bas un modèle génératif dirigé qui sera utilisé plus tard pour l'inférence approximative. Des résultats récents suggèrent que de meilleurs modèles génératifs peuvent être obtenus par de meilleures procédures d'inférence approximatives. Au lieu d'améliorer la procédure d'inférence, nous proposons ici un nouveau modèle, la machine de Helmholtz bidirectionnelle, qui garantit qu'on peut calculer efficacement les distributions de haut-vers-bas et de bas-vers-haut. Nous y parvenons en interprétant à les modèles haut-vers-bas et bas-vers-haut en tant que distributions d'inférence approximative, puis ensuite en définissant la distribution du modèle comme étant la moyenne géométrique de ces deux distributions. Nous dérivons une borne inférieure pour la vraisemblance de ce modèle, et nous démontrons que l'optimisation de cette borne se comporte en régulisateur. Ce régularisateur sera tel que la distance de Bhattacharyya sera minisée entre les distributions approximatives haut-vers-bas et bas-vers-haut. Cette approche produit des résultats de pointe en terme de modèles génératifs qui favorisent les réseaux significativement plus profonds. Elle permet aussi une inférence approximative amérliorée par plusieurs ordres de grandeur. De plus, nous introduisons un modèle génératif profond basé sur les modèles BiHM pour l'entraînement semi-supervisé.