Uso do R-shiny para execução de modelos matemáticos via web: estudo de caso sobre a dinâmica de propagação do HLB do citros.

RESUMO - O Huanglongbing (HLB ou Greening) é a doença mais importante e destrutiva da citricultura mundial. Presente de forma endêmica nos continentes asiático e africano há várias décadas, essa doença foi constatada no Brasil em 2004, sendo transmitida pelo psilídeo Diaphorina citri e causada por bactérias de floema Candidatus Liberibacter spp. Para auxiliar o estudo da doença, foram desenvolvidos modelos matemáticos para avaliação da propagação do HLB Citros. Este trabalho tem por objetivo a criação de um sistema para execução via web de um destes modelos, permitindo aos profissionais de diversas formações, em especial os das áreas biológicas, que são os especialistas do domínio em estudo, acesso rápido aos resultados fornecidos pelo modelo matemático, eliminando ainda a necessidade de conhecimento prévio em alguma linguagem de programação ou de métodos de resolução de equações diferenciais. O sistema foi completamente implementado em R, tendo sido o pacote deSolve usado para solução do modelo matemático e o framework web Shiny para a interface com usuário, sendo todos open source.

An algebraic pedotransfer function to calculate standardized in situ determined field capacity.

Despite the large applicability of the field capacity (FC) concept in hydrology and engineering, it presents various ambiguities and inconsistencies due to a lack of methodological procedure standardization. Experimental field and laboratory protocols taken from the literature were used in this study to determine the value of FC for different depths in 29 soil profiles, totaling 209 soil samples. The volumetric water content (θ) values were also determined at three suction values (6 kPa, 10 kPa, 33 kPa), along with bulk density (BD), texture (T) and organic matter content (OM). The protocols were devised based on the water processes involved in the FC concept aiming at minimizing hydraulic inconsistencies and procedural difficulty while maintaining the practical meaning of the concept. A high correlation between FC and θ(6 kPa) allowed the development of a pedotransfer function (Equation 3) quadratic for θ(6 kPa), resulting in an accurate and nearly bias-free calculation of FC for the four database geographic areas, with a global root mean squared residue (RMSR) of 0.026 m3·m-3. At the individual soil profile scale, the maximum RMSR was only 0.040 m3·m-3. The BD, T and OM data were generally of a low predicting quality regarding FC when not accompanied by the moisture variables. As all the FC values were obtained by the same experimental protocol and as the predicting quality of Equation 3 was clearly better than that of the classical method, which considers FC equal to θ(6), θ(10) or θ(33), we recommend using Equation 3 rather than the classical method, as well as the protocol presented here, to determine in-situ FC.