5 resultados para Proteina

em Repositório Alice (Acesso Livre à Informação Científica da Embrapa / Repository Open Access to Scientific Information from Embrapa)


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Para identificar as cultivares de capim buffel (Cenchrus ciliaris L.), melhor adaptadas a regiao semi-arida do Nordeste, foi conduzido um experimento no periodo de 1979/1983, no Campo Experimental de Manejo da Caatinga, do Centro de Pesquisa Agropecuaria do Tropico Semi-Arido (CPATSA-EMBRAPA), localizado em Petrolina, PE. Foram avaliadas treze cultivares de capim buffel, estabelecidas vegetativamente em parcelas de 4 m x 2,5 m. O delineamento experimental adotado foi o de blocos ao acaso com cinco repeticoes. Entre as cultivares de porte alto, destacou-se o Molopo com maiores produtividades (6.750 kg de materia seca/ha-ano), relacao colmo/folha e altura (106 cm). Comparativamente, a Biloela, que e atualmente a mais utilizada no CPATSA, apresentou menor altura (97 cm) e produtividade (5.455 kg de materia seca/ha-ano). Entre as cultivares de porte medio, observou-se a Gayndah com menor altura (77 cm) e a F1 Hibrido 171, com menor produtividade (3.745 kg de materia seca/ha-ano). Com relacao ao valor nutritivo, temos a Gayndah (12,43%) e o Molopo (9,51%), com maior e menor teor de proteina bruta, na materia seca, respectivamente.

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Avaliou-se a produtividade de doze leguminosas forrageiras, associadas ou nao a adubacao fosfatada. As doze especies selecionadas foram estabelecidas em parcelas de 6 m x 3 m, em fileiras espacadas de 0,60 m. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com parcelas divididas e tres repeticoes. As especies constituiram as parcelas, e a adubacao ( 0 e 60 kg/ha de P2O5) as subparcelas. As leguminosas Macrotillium sp CPATSA 80218 (BRA-004537) e Indigofera sp CPATSA 7620 (BRA-000701) apresentaram melhores resultados nos tres anos de estudo. A primeira apresentou produtividade de: 5.430 e 4.862 e a segunda 3.972 e 3.736 kg de materia seca/ha/ano, nas parcelas com e sem adubacao, respectivamente. Apesar de o nivel de P no solo ser baixo, as leguminoas apresentaram uma resposta de apenas 9,0% a adubacao fosfatada.

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In this study, we carried out a comparative analysis between two classical methodologies to prospect residue contacts in proteins: the traditional cutoff dependent (CD) approach and cutoff free Delaunay tessellation (DT). In addition, two alternative coarse-grained forms to represent residues were tested: using alpha carbon (CA) and side chain geometric center (GC). A database was built, comprising three top classes: all alpha, all beta, and alpha/beta. We found that the cutoff value? at about 7.0 A emerges as an important distance parameter.? Up to 7.0 A, CD and DT properties are unified, which implies that at this distance all contacts are complete and legitimate (not occluded). We also have shown that DT has an intrinsic missing edges problem when mapping the first layer of neighbors. In proteins, it may produce systematic errors affecting mainly the contact network in beta chains with CA. The almost-Delaunay (AD) approach has been proposed to solve this DT problem. We found that even AD may not be an advantageous solution. As a consequence, in the strict range up ? to 7.0 A, the CD approach revealed to be a simpler, more complete, and reliable technique than DT or AD. Finally, we have shown that coarse-grained residue representations may introduce bias in the analysis of neighbors in cutoffs up to ? 6.8 A, with CA favoring alpha proteins and GC favoring beta proteins. This provides an additional argument pointing to ? the value of 7.0 A as an important lower bound cutoff to be used in contact analysis of proteins.

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2016