Animal GRIN database user manual for the management of genetic resources.

Introduction to Animal GRIN; Navigating the Database; Setting Up the Database (Super Users); Create Taxonomy Structure; Set Up Location Structure; Form Descriptions (All Users); Form Descriptions (Super Users); Entering Shipments; E-R Diagram for Incoming Orders; Entering Requests; Reports.

Molecular characterization of accessions of a rare genetic resource: sugary cassava (Manihot esculenta Crantz) from Brazilian Amazon

2016

The genetic diversity of the American oil palm, Elaeis oleifera (Kunth), Cortes revealed by nuclear RFLP markers.

The genetic diversity of E. oleifera is strongly structured by geographical origin, with four groups clearly distinguished: Brazil, Surinam/French Guyana, north of /Colombia/Central America and Peru. Within the Amazon basin, thereis a moderate structure that corresponds to the major tributaries of the Amazon river. From the 37 polymorphic RFLP probe/enzyme combinatios used, 19 probes (51%) presented simple restriction profiles, with one (1) or two bands/plant, suggesting a single locus with different alleles, allowing allelic co-dominant coding for them.

Molecular characterization of 'sweet' cassavas (Manihot esculenta) from a germplasm bank in Brazilian Eastern Amazonia.

2016

Diversidad genética de la colección de zapote [Pouteria sapota (Jacquin) H.E. Moore & Stearn] del CATIE.

This paper presents the evaluation of qualitative and quantitative characteristics of 63 accessions of the sapodilla collection held in CATTE, Costa Rica. Cluster analysis of data indicated six distinct groups with 15, 14, 8, 8, 15 and 3 trees, respectively. Canonic discriminant analysis and F and X2 tests detected the variables most affecting group differentiation. These were reducing sugars, fruit acidity, fruit and seed length, sucrose, pH, fruit diameter, fruit weight, Brix degrees, total sugar content, total solid content, proteins, carbohydrates, leaf length and width, branch architecture, fructification distribution, fruit production, flowering and fruiting season, The origin of the materiais is related to the classifications obtained.

Identificação raças bovinas criadas no Brasil por meio de morfometria cuticular de pelos guarda.

A análise tricológica é um método não invasivo com potencial para a identificação de mamíferos por meio das características microscópicas de seus pelos. Permite identificar e diferenciar amostras ao nível de Ordem, Família, Gênero, Espécie e até mesmo Subespécies em alguns grupos zoológicos. A caracterização morfométrica de estruturas da cutícula em pelos de animais de raças bovinas criadas no Brasil poderia indicar a possibilidade de uso desta técnica como marcador racial. Um total de 120 animais (machos e fêmeas), pertencentes às raças Caracu, Curraleiro Pé-Duro e Nelore, provenientes de rebanhos de diferentes regiões geográficas foi amostrado. Os dados de área e perímetro das escamas cuticulares foram submetidos à análise de variância, sendo o efeito de raça significativo (P<0,001) e as médias das variáveis estudadas significativamente diferentes entre as raças (P<0,05). A técnica tricológica apresentou elevada acurácia na diferenciação das raças bovinas estudadas. O método, que tem como característica baixo custo de execução, se mostrou como uma ferramenta de grande utilidade para identificação não invasiva de bovinos, com potencial de uso e aplicação para outras espécies de interesse para a pecuária.

Juvenile-mature genetic correlations in Pinus taeda clones propagated via somatic embryogenesis.

Objetivou-se com o presente trabalho, estimar a correlação genética entre idades de seleção (juvenil-adulta) e eficiência da seleção precoce para as características altura, diâmetro e volume de indivíduos de famílias de Pinus taeda propagados via embriogênese somática. O estudo foi realizado por meio de análise genético-estatística pelo procedimento de estimação de componentes de variância (Reml) e de predição de valores genéticos (Blup), usando-se o software Selegen-Reml/Blup. As correlações genéticas entre idades juvenis e idade de rotação foram realizadas aplicando o modelo linear desenvolvido por Lambeth (1980). Segundo os resultados do modelo estabelecido, a seleção precoce pode ser realizada em clones de Pinus taeda com alta eficiência de seleção. As idades de 4 a 6 anos são suficientes para selecionar clones de Pinus taeda propagados via embriogênese somática para colheita aos 8 e 12 anos e, as idades de 6 a 10 anos são suficientes para selecionar para colheita aos 20 anos. De acordo com as estimativas de correlação genotípicaa partir dos ambientes, a seleção de clones de Pinus taeda propagados via embriogênese somática deve ser praticada de forma específica para cada ambiente. Pode-se realizar a seleção de clones considerando o diâmetro, visto a alta correlação observada entre volume e diâmetro.

Diversity of new root nodule bacteria from Erythrina velutina Willd., a native legume from the Caatinga dry forest (Northeastern Brazil).

This study aims to evaluate the phenotypical characteristics of bacterial isolates from mulungu (Erythrina velutina Willd.) nodules and determinate their Box-PCR fingerprinting. All bacteria were evaluated by the following phenotypic characteristics: growth rate, pH change, colony color and mucus production. The bacterial isolates able to re-nodulate the original host were also evaluated regarding its tolerance to increased salinity and different incubation temperatures, ability to growth using different carbon sources, intrinsic antibiotic resistance and ?in vitro? auxin biosynthesis. The molecular fingerprints were set up using the Box-PCR technique and the isolates were clustered by their profiles. Among the 22 bacterial isolates obtained, eight were able to re-nodulate the original host. Among the nodule inducing isolates, some were tolerant to 1% of NaCl and 39° C and all of them metabolized the maltose, fructose, glucose, sucrose and arabinose, were resistant to rifampicin and produced auxin. The bacteria showed low genetic similarity among them and reference strains, which indicates the great genetic variability of the isolates. The results of this work are the first reports about the bacterial isolates able to nodulate this species. A more deep study of these bacteria may reveal the existence of isolates tolerant to environmental stresses and suitable as a future mulungu inoculant.