Physico-chemical characterization of banana varieties resistant to black leaf streak disease for industrial purposes.

A cultura da banana tem baixa diversidade genética, tornando a espécie susceptível a doenças dizimadoras como a Sigatoka negra. No entanto, a adoção de novas variedades necessita de avaliações agronômicas e físico-químicas. Neste estudo, as variedades de banana, resistentes à Sigatoka negra, foram caracterizadas e comparadas com a variedade tradicional (Grand Naine). Cada variedade foi avaliada considerando-se critérios relevantes para a agroindústria, como pH, sólidos solúveis totais, acidez total titulável, relação SST/ATT, açúcares totais, açúcares redutores e não redutores, umidade, sólidos totais e rendimento no processamento. A variedade Thap Maeo apresentou-se como a variedade mais potencial para substituição da Gran Naine na indústria, com altos teores de sólidos solúveis totais, açúcares redutores, açúcares totais e umidade. As variedades Caipira e FHIA 2 também podem substituir a Grand Naine. Na análise de agrupamentos, verificou-se que a variedade Grand Naine esteve muito próxima das variedades do subgrupo Gros Michel (Bucaneiro, Ambroisa e Calipso) e também da variedade Caipira, apresentando no seu genoma o grupo AAA. Conclui-se que há opções de variedades resistentes para substituição da variedade tradicional, nas regiões afetadas pela Sigatoka-negra.

Population structure of Spodoptera frugiperda collected in maize from different Brazilian geographic regions.

Spodoptera frugiperda é a praga do milho de maior importância econômica no Brasil. Existe pouca informação disponível sobre a estrutura genética, utilizando marcadores SSR, de populações de S. Frugiperda coletadas em cultivos de milho.Neste estudo, 21 marcadores SSR foram utilizados para avaliar a diversidade e a estrutura genética de S. frugiperda coletadas em regiões brasileiras geograficamente distintas. Um total de 227 alelos foram obtidos, com uma média de 10,76 alelos por marcador, e os valores do Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) variaram de 0,242 a 0,933, com uma média de 0,621, indicando alto poder de discriminação. O FST geral, 0,061, indicou moderada diferenciação genética entre as populações de S. frugiperda coletadas em milho e a Amova mostrou que 87,36% da variação está dentro de populações. O teste de Mantel mostrou correlação significativa entre distâncias genéticas e distâncias geográficas. Os dados genéticos demonstraram que todos os indivíduos dos seis locais de amostragem foram estruturados em duas sub-populações, sendo uma delas composta apenas pela população CL, coletada no estado do Rio Grande do Sul. O conhecimento sobre a diversidade genética e a estrutura populacional de S. frugiperda é importante para o desenvolvimento de estratégias para os sistemas de manejo e monitoramento de insetos-praga, especialmente para a diferenciada população CL.

Geographical distribution and conservation of Cucurbita in Brazil.

The collection and conservation of the Cucurbita genus in Brazil happened in so dispersed institutions, an assessment of the storage conditions and the genetic diversity is needed, making it possible to identify new priorities for the genus. This work constitutes diagnosis of geographical distribution, storage conditions in situ and ex situ and on genetic diversity of the Cucurbita genus in Brazil. Research was done in herbariums, databases, literature and in situ (expeditions to rural areas and (markets) to map the areas of occurrence of the species. During these expeditions, questionnaires were applied to obtain information about the property and genus Cucurbita. Questionnaires were sent to 173 Brazilian institutions regarding the preservation conditions ex situ. A genetic variability of the Cucurbita genus was found in traditional Brazilian agriculture. Collections must be prioritized in the northern and southern regions (all states); the southeastern region, all states, except Minas Gerais; central-west, in Mato Grosso do Sul and Mato Grosso; the northeastern region, the states of Alagoas, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí and Sergipe. Currently 5.545 entries are being conserved in the Germplasm banks, however, C. pepo, C. ficifolia, C. argyrosperma and wild species are poorly represented. The characterization level of conserved entries is low in the ex situcollections. Participative research projects must be financed as a way to stimulate the farmers to continue planting their local varieties. A coleta e conservação do gênero Cucurbita no Brasil aconteceu de forma dispersa pelas instituições, sendo necessário um diagnóstico sobre as condições de conservação e sobre a diversidade genética, tornando possível identificar novas prioridades para o gênero. Este trabalho realizou diagnóstico sobre distribuição geográfica, condições de conservação in situ e ex situ e sobre diversidade genética do gênro Cucurbita no Brasil. Para mapear as áreas de ocorrência das espécies, foram realizados levantamentos de informações em herbários, banco de dados, literatura e levantamentos in situ (expedições para áreas rurais, feiras livres e CEASAs). Nessas expedições foram aplicados questionários, buscando informações sobre a propriedade e o gênero Cucurbita. Em relação as condições de conservação ex situ, foram enviados questionários para 173 instituições brasileiras. Foi constatado que existe variabilidade genética do gênero Cucurbita na agricultura tradicional brasileira. Devem ser priorizadas coletas nas regiões Norte e Sul (todos os estados); região Sudeste, todos os estados, exceto Minas Gerais; região Centro-Oeste, no Mato Grosso do Sul e Mato Grosso; região Nordeste, os estados de Alagoas, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí e Sergipe. Atualmente estão sendo conservados nos Bancos de Germoplasma 5.545 acessos, no entanto C. pepo, C ficifolia, C. argyrosperma e espécies silvestres estão pouco representadas. É baixa a taxa de caracterização dos acessos conservados nas coleções ex situ. Devem ser financiados projetos de pesquisa participativa como uma forma de estimular e dar condições aos agricultores de continuarem cultivado suas variedades locais.

Geographical distribution and conservation of Cucurbita in Brazil.

The collection and conservation of the Cucurbita genus in Brazil happened in so dispersed institutions, an assessment of the storage conditions and the genetic diversity is needed, making it possible to identify new priorities for the genus. This work constitutes diagnosis of geographical distribution, storage conditions in situ and ex situ and on genetic diversity of the Cucurbita genus in Brazil. Research was done in herbariums, databases, literature and in situ (expeditions to rural areas and (markets) to map the areas of occurrence of the species. During these expeditions, questionnaires were applied to obtain information about the property and genus Cucurbita. Questionnaires were sent to 173 Brazilian institutions regarding the preservation conditions ex situ. A genetic variability of the Cucurbita genus was found in traditional Brazilian agriculture. Collections must be prioritized in the northern and southern regions (all states); the southeastern region, all states, except Minas Gerais; central-west, in Mato Grosso do Sul and Mato Grosso; the northeastern region, the states of Alagoas, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí and Sergipe. Currently 5.545 entries are being conserved in the Germplasm banks, however, C. pepo, C. ficifolia, C. argyrosperma and wild species are poorly represented. The characterization level of conserved entries is low in the ex situcollections. Participative research projects must be financed as a way to stimulate the farmers to continue planting their local varieties. A coleta e conservação do gênero Cucurbita no Brasil aconteceu de forma dispersa pelas instituições, sendo necessário um diagnóstico sobre as condições de conservação e sobre a diversidade genética, tornando possível identificar novas prioridades para o gênero. Este trabalho realizou diagnóstico sobre distribuição geográfica, condições de conservação in situ e ex situ e sobre diversidade genética do gênro Cucurbita no Brasil. Para mapear as áreas de ocorrência das espécies, foram realizados levantamentos de informações em herbários, banco de dados, literatura e levantamentos in situ (expedições para áreas rurais, feiras livres e CEASAs). Nessas expedições foram aplicados questionários, buscando informações sobre a propriedade e o gênero Cucurbita. Em relação as condições de conservação ex situ, foram enviados questionários para 173 instituições brasileiras. Foi constatado que existe variabilidade genética do gênero Cucurbita na agricultura tradicional brasileira. Devem ser priorizadas coletas nas regiões Norte e Sul (todos os estados); região Sudeste, todos os estados, exceto Minas Gerais; região Centro-Oeste, no Mato Grosso do Sul e Mato Grosso; região Nordeste, os estados de Alagoas, Maranhão, Paraíba, Pernambuco, Piauí e Sergipe. Atualmente estão sendo conservados nos Bancos de Germoplasma 5.545 acessos, no entanto C. pepo, C ficifolia, C. argyrosperma e espécies silvestres estão pouco representadas. É baixa a taxa de caracterização dos acessos conservados nas coleções ex situ. Devem ser financiados projetos de pesquisa participativa como uma forma de estimular e dar condições aos agricultores de continuarem cultivado suas variedades locais.

Genetic diversity of the forage peanut in the Jequitinhonha, São Francisco, and Paranã River valleys of Brazil.

Arachis pintoi and A. repens are legumes with a high forage value that are used to feed ruminants in consortium systems. Not only do they increase the persistence and quality of pastures, they are also used for ornamental and green cover. The objective of this study was to analyze microsatellite markers in order to access the genetic diversity of 65 forage peanut germplasm accessions in the section Caulorrhizae of the genus Arachis in the Jequitinhonha, São Francisco and Paranã River valleys of Brazil. Fifty-seven accessions of A. pintoi and eight of A. repens were analyzed using 17 microsatellites, and the observed heterozygosity (HO), expected heterozygosity (HE), number of alleles per locus, discriminatory power, and polymorphism information content were all estimated. Ten loci (58.8%) were polymorphic, and 125 alleles were found in total. The HE ranged from 0.30 to 0.94, and HO values ranged from 0.03 to 0.88. By using Bayesian analysis, the accessions were genetically differentiated into three gene pools. Neither the unweighted pair group method with arithmetic mean nor a neighbor-joining analysis clustered samples into species, origin, or collection area. These results reveal a very weak genetic structure that does not form defined clusters, and that there is a high degree of similarity between the two species.

Genetic diversity of mango accessions (Mangifera indica) using new microsatellite markers and morphological descriptors.

Genetic diversity estimates based on morphological and molecular data can provide different information on the relationship between cultivars of a species. This study aimed to develop new microsatellite markers as additional tools in genetic studies on mangoes (Mangifera indica L.), and to analyze the genetic variability of 20 mango cultivars based on morphological descriptors and microsatellite markers. We aimed to better understand the cultivars enhanced breeding histories and to support crossbreeding planning. Positive clones were selected from a DNA library enriched for microsatellite regions for sequencing and primer design. Four plants of each of the 20 accessions were used for observations, based on 48 morphological descriptors. Twenty accessions were analyzed using 27 microsatellite markers, of which 16 were developed during this study. The clusters, based on the morphological descriptors by Ward - MLM strategy and the microsatellite markers, suggested that Brazilian mango cultivars have extensive genetic diversity and are related to cultivars with different provenances, demonstrating their different enhanced breeding histories.

Caracterização de Fusarium decemcellulare isolado de guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis) por meio de ERIC-PCR.

A presente pesquisa visa analisar a diversidade genética De F. decemcellulare isolado de mudas e plantas adultas de guaranazeiro com sintomas de superbrotamento, hipertrofia floral ou galhas por meio do marcador molecular ERIC-PCR.

Seleção de marcadores microssatélites e otimização de protocolo de amplificação em alfafa.

2016

Geographic pattern of genetic diversity in natural populations of rosewood (Aniba rosaeodora), in the Central Amazonia.

Padrão geográfico de diversidade genética em populações naturais de Pau-rosa (Aniba rosaeodora), na Amazônia Central.

Genetic analysis of 'Moscato branco' and other muscat grapes held by the grape germplasm bank in Brazil.

2012

Aplicações de marcadores moleculares em Byrsonima crassifolia.

O uso de marcadores moleculares em espécies vegetais pode auxiliar no estudo da diversidade genética ao verificar a forma de distribuição da variação genética entre e dentro de populações naturais e os locais de maior ocorrência de variação. Também pode contribuir para inferir acerca da forma de reprodução das espécies. Os marcadores podem indicar locais no quais está ocorrendo maior incidência de cruzamentos entre aparentados, taxas de fluxo gênico entre as populações e relações entre os componentes da população. Além disso, auxiliam no melhoramento genético ao determinar a variação existente nas coleções/bancos de germoplasma, no direcionamento de cruzamentos, em testes de paternidade, verificação de métodos que geram variabilidade, seleção assistida por marcadores e obtenção de marcas que possam descrever clones/variedades/cultivares recomendadas. Dessa forma, o uso de marcadores moleculares em Byrsonima crassifolia pode contribuir em diversos aspectos.

Diversidade e similaridade dos parasitos em Megalechis thoracata e Callichthys callichthys, Callichthyidae da Amazônia Oriental (Brasil).

Em populações de peixes habitando um mesmo ambiente (simpatria) e que são ecologicamente similares e geneticamente relacionadas, aumenta a possibilidade dessas populações de hospedeiros apresentar uma similar estrutura e composição das comunidades de parasitos. Porém, as comunidades de parasitos são sistemas ecológicos altamente complexos e dinâmicos, resultantes da interação de diversos fatores bióticos e abióticos. No sistema do Rio Amazonas, Callichthys callichthys Linnaeus, 1758 e Megalechis thoracata Valenciennes 1840 (Callichthyidae) são onívoras, com dieta composta de vegetais, algas, insetos e detritos. Este estudo comparou a estrutura e composição das comunidades de parasitos dessas duas espécies de Callichthyidae coletados na bacia Igarapé Fortaleza, um tributário do Rio Amazonas, na região de Macapá, estado do Amapá. Dos 38 espécimes de C. callichthys (17,3 ± 1,3 cm e 94,2 ± 22,3 g) e 38 espécimes de M. thoracata (15,3 ± 1,1 cm e 68,5 ± 16,8 g), 44,7% e 36,8%, respectivamente, estavam infectados por uma ou mais espécies de parasitos, e um total de 447 parasitos foram coletados em ambos os hospedeiros. A similaridade entre as comunidades de parasitos das duas espécies de hospedeiros foi elevada (61%), uma vez que compartilharam Genarchella genarchella, larvas de Eustrogylides sp., Rhabdochona sp. e plerocercoides de Proteocephalidae e níveis de infecção similares. Porém, Posthodiplostomum sp. infectou somente C. callichthys, enquanto Gorytocephalus spectabilis infectou somente M. thoracata. Metacercária de Posthodiplostomum sp. foi o parasito dominante para C. callichthys e G. genarchella, para M. thoracata. A maioria das infracomunidades de parasitos apresentou padrão de dispersão agregada. A comunidade de parasitos mostrou predominância de endoparasitos e similar riqueza de espécies, índice de Shannon e equitabilidade entre C. callichthys e M. thoracata. A condição corporal de ambos os hospedeiros não foi influenciada pelo baixo parasitismo. Os resultados indicam C. callichthys e M. thoracata como hospedeiros intermediários ou paratênico dos endohelmintos encontrados. A variação na comunidade parasitária, entre hospedeiros simpátricos, provavelmente ocorreu pela distribuição destes no ambiente, estrutura genética e imunológica, bem como a composição de espécies de parasitos nas comunidades.