The greener grass: da autorrepresentação em Alanis Morissette

Tese de Doutoramento em Ciências da Literatura - Especialidade em Teoria da Literatura

Mechanism of extracellular silver nanoparticles synthesis by Stereum hirsutum and Fusarium oxysporum

The increasing interest for greener and biological methods of synthesis has led to the development of non-toxic and comparatively more bioactive nanoparticles. Unlike physical and chemical methods of nanoparticle synthesis, microbial synthesis in general and mycosynthesis in particular is cost-effective and environment-friendly. However, different aspects, such as the rate of synthesis, monodispersity and downstream processing, need to be improved. Many fungal-based mechanisms have been proposed for the formation of silver nanoparticles (AgNPs), mainly those involving the presence of nitrate reductase, which has been detected in filtered fungus cell used for AgNPs production. There is a general acceptance that nitrate reductase is the main responsible for the reduction of Ag ions for the formation of AgNPs. However, this generally accepted mechanism for fungal AgNPs production is not totally understood. In order to elucidate the molecules participating in the mechanistic formation of metal nanoparticles, the current study is focused on the enzymes and other organic compounds involved in the biosynthesis of AgNPs. The use of each free fungal mycelium of both Stereum hirsutum and Fusarium oxysporum will be assessed. In order to identify defective mutants on the nitrate reductase structural gene niaD, fungal cultures of S.hirsutum and F.oxysporum will be selected by chlorate resistance. In addition, in order to verify if each compound identified as key-molecule influenced on the production of nanoparticles, an in vitro assay using different nitrogen sources will be developed. Lately, fungal extracellular enzymes will be measured and an in vitro assay will be done. Finally, The nanoparticle formation and its characterization will be evaluated by UV-visible spectroscopy, electron microscopy (TEM), X-ray diffraction analysis (XRD), Fourier transforms infrared spectroscopy (FTIR), and LC-MS/MS.

Extracting kinetic information from literature with KineticRE

To better understand the dynamic behavior of metabolic networks in a wide variety of conditions, the field of Systems Biology has increased its interest in the use of kinetic models. The different databases, available these days, do not contain enough data regarding this topic. Given that a significant part of the relevant information for the development of such models is still wide spread in the literature, it becomes essential to develop specific and powerful text mining tools to collect these data. In this context, this work has as main objective the development of a text mining tool to extract, from scientific literature, kinetic parameters, their respective values and their relations with enzymes and metabolites. The approach proposed integrates the development of a novel plug-in over the text mining framework @Note2. In the end, the pipeline developed was validated with a case study on Kluyveromyces lactis, spanning the analysis and results of 20 full text documents.

Da modelação matemática à simulação computacional: a experimentação matemática no ensino

Tese de Doutoramento em Ciências (área de especialização em Matemática).

Da modelação matemática à simulação computacional: a experimentação matemática no ensino

Tese de Doutoramento em Ciências (área de especialização em Matemática).

Inkjet printing technology for flexible pressure sensors

Tese de Doutoramento Ciência e Engenharia de Polímeros e Compósitos.

Spontaneous healing of Mycobacterium ulcerans lesions in the guinea pig model

Buruli Ulcer (BU) is a necrotizing skin disease caused by Mycobacterium ulcerans infection. BU is characterized by a wide range of clinical forms, including non-ulcerative cutaneous lesions that can evolve into severe ulcers if left untreated. Nevertheless, spontaneous healing has been reported to occur, although knowledge on this process is scarce both in naturally infected humans and experimental models of infection. Animal models are useful since they mimic different spectrums of human BU disease and have the potential to elucidate the pathogenic/protective pathway(s) involved in disease/healing. In this time-lapsed study, we characterized the guinea pig, an animal model of resistance to M. ulcerans, focusing on the macroscopic, microbiological and histological evolution throughout the entire experimental infectious process. Subcutaneous infection of guinea pigs with a virulent strain of M. ulcerans led to early localized swelling, which evolved into small well defined ulcers. These macroscopic observations correlated with the presence of necrosis, acute inflammatory infiltrate and an abundant bacterial load. By the end of the infectious process when ulcerative lesions healed, M. ulcerans viability decreased and the subcutaneous tissue organization returned to its normal state after a process of continuous healing characterized by tissue granulation and reepethelialization. In conclusion, we show that the experimental M. ulcerans infection of the guinea pig mimics the process of spontaneous healing described in BU patients, displaying the potential to uncover correlates of protection against BU, which can ultimately contribute to the development of new prophylactic and therapeutic strategies.

Conceção técnica e avaliação económica de um veículo solar para venda de produtos refrigerados

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Mecânica

Transferência de Energia sem fios para carregamento de baterias

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Eletrónica Industrial e Computadores

Data supporting the role of enzymes and polysaccharides during cassava postharvest physiological deterioration

This data article is referred to the research article entitled The role of ascorbate peroxidase, guaiacol peroxidase, and polysaccharides in cassava (Manihot esculenta Crantz) roots under postharvest physiological deterioration by Uarrota et al. (2015). Food Chemistry 197, Part A, 737746. The stress duo to PPD of cassava roots leads to the formation of ROS which are extremely harmful and accelerates cassava spoiling. To prevent or alleviate injuries from ROS, plants have evolved antioxidant systems that include non-enzymatic and enzymatic defence systems such as ascorbate peroxidase, guaiacol peroxidase and polysaccharides. In this data article can be found a dataset called newdata, in RData format, with 60 observations and 06 variables. The first 02 variables (Samples and Cultivars) and the last 04, spectrophotometric data of ascorbate peroxidase, guaiacol peroxidase, tocopherol, total proteins and arcsined data of cassava PPD scoring. For further interpretation and analysis in R software, a report is also provided. Means of all variables and standard deviations are also provided in the Supplementary tables (data.long3.RData, data.long4.RData and meansEnzymes.RData), raw data of PPD scoring without transformation (PPDmeans.RData) and days of storage (days.RData) are also provided for data analysis reproducibility in R software.

Ranking procedure based on mechanical, durability and thermal behavior of mortars with incorporation of phase change materials

Nowadays, considering the high variety of construction products, adequate material selection, based on their properties and function, becomes increasingly important. In this research, a ranking procedure developed by Czarnecki and Lukowski is applied in mortars with incorporation of phase change materials (PCM). The ranking procedure transforms experimental results of properties into one numerical value. The products can be classified according to their individual properties or even an optimized combination of different properties. The main purpose of this study was the ranking of mortars with incorporation of different contents of PCM based in different binders. Aerial lime, hydraulic lime, gypsum and cement were the binders studied. For each binder, three different mortars were developed. Reference mortars, mortars with incorporation of 40% of PCM and mortars with incorporation of 40% of PCM and 1% of fibers, were tested. Results show that the incorporation of PCM in mortars changes their global performance.

Big data e data analysis: visualização de informação

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia e Gestão de Sistemas de Informação

Escritas da utopia na literatura contemporânea – da utopia à distopia

Tese de Doutoramento em Ciências da Literatura (Especialidade em Literatura Comparada)

Divulgação de informação sobre o governo das sociedades em Portugal: Extensão e determinantes

Tese de Doutoramento em Contabilidade

Abordagem histórica e institucional da mudança em contabilidade de gestão: o caso da normalização nos hospitais públicos portugueses

A teoria institucional constituiu o enquadramento no qual foi suportada a pergunta geral desta investigação: como e porquê a Normalização da Contabilidade de Gestão (NCG) nos hospitais públicos portugueses surgiu e evoluiu? O objetivo geral foi compreender de forma profunda o surgimento e a mudança nas regras de NCG dos hospitais públicos portugueses no período histórico 1954-2011. Face ao enquadramento institucional que justificou uma investigação interpretativa, foi usado como método de investigação um estudo de caso explanatório. A evidência sobre o caso da NCG nos hospitais públicos portugueses foi recolhida em documentos e através de 58 entrevistas realizadas em 47 unidades de análise (nos serviços centrais de contabilidade do Ministério da Saúde e em 46 hospitais públicos, num total de 53 existentes). Quanto aos principais resultados obtidos, no período 1954-1974, as regras criadas pelo poder político para controlo dos gastos públicos e a contabilidade orçamental de base de caixa estiveram na génese dos primeiros conceitos de Contabilidade de Gestão (CG) para os serviços públicos de saúde portugueses. A transição de um regime ditatorial para um regime democrático (25 de Abril de 1974), a criação do Plano Oficial de Contabilidade (POC/77) e a implementação de um estado social com Serviço Nacional de Saúde (SNS) criaram a conjuntura crítica necessária para o surgimento de um Plano Oficial de Contabilidade para os Serviços de Saúde (POCSS/80) que incluiu regras de CG. A primeira edição do Plano de Contabilidade Analítica dos Hospitais (PCAH), aprovada em 1996, não foi uma construção de raiz, mas antes uma adaptação para os hospitais das regras de CG incluídas no POCSS/91 que havia revisto o POCSS/80. Após o início da implementação do PCAH, em 1998, ocorreram sequências de autorreforço institucionalizadoras destas normas, no período 1998-2011, por influência de pressões isomórficas coercivas que delinearam um processo de evolução incremental cujo resultado foi uma reprodução por adaptação, num contexto de dependência de recursos. Vários agentes internos e externos pressionaram, no período 2003-2011, através de sequências reativas para a desinstitucionalização do PCAH em resposta ao persistente fenómeno de loose coupling. Mas o PCAH só foi descontinuado nos hospitais com privatização da governação e rejeição dos anteriores sistemas de informação. Ao nível da extensão da teoria, este estudo de caso adotou o institucionalismo histórico na investigação em CG, quanto se sabe pela primeira vez, que se mostra útil na interpretação dos processos e dos resultados da criação e evolução de instituições de CG num determinado contexto histórico. Na condição de dependência de recursos, as sequências de autorreforço, via isomorfismo coercivo, tendem para uma institucionalização com fenómeno de loose coupling. Como resposta a este fenómeno, ocorrem sequências reativas no sentido da desinstitucionalização. Perante as pressões (políticas, funcionais, sociais e tecnológicas) desinstitucionalizadoras, o fator governação privada acelera o processo de desinstitucionalização, enquanto o fator governação pública impede ou abranda esse processo.