Tietokannan hallintajärjestelmän optimointi flash-muistia varten

Viime aikoina yleistyneet flash-muistiin perustuvat tallennusvälineet ovat monessa suhteessa kiintolevyä parempia. Flash-muistissa on kuitenkin useita erityispiirteitä, jotka vaikeuttavat sen käyttöönottoa tietokantajärjestelmässä. Flash-muistissa kirjoittaminen on hitaampaa kuin lukeminen. Erityisesti hajanaisten sivujen päivittäminen on hidasta. Hajaluku flash-muistista on huomattavasti nopeampaa kuin kiintolevyltä. Näiden erityispiirteiden vuoksi tietokannan hallintajärjestelmä on optimoitava erikseen flash-muistia varten. Tässä optimoinnissa lähes kaikki tietokannan hallintajärjestelmän osa-alueet on toteutettava uudelleen flash-muistin näkökulmasta. Flash-muistin nopean hajaluvun ansiosta relaatioiden tiedot voidaan sijoitella flash-muistiin vapaammin kuin kiintolevylle. Yleisin tietokannoissa käytetty hakemistorakenne B+-puu ei toimi tehokkaasti flash-muistissa hajapäivitysten suuren määrän vuoksi. Flashmuistia varten on kehitetty useita B+-puun muunnelmia, joissa hajapäivitysten määrää on onnistuttu vähentämään. Puskurin hallintaa voidaan optimoida flash-muistia varten vähentämällä hitaiden kirjoitusten määrää nopeiden lukujen määrän kustannuksella sekä muuttamalla hitaita hajakirjoituksia nopeammiksi peräkkäisten sivujen kirjoituksiksi. B.3 (hardware, memory structures) H.2.2 (database management, physical design)

Accumulation of point mutations and reassortment of genomic RNA segments are involved in the microevolution of Puumala hantavirus in a bank vole (Myodes glareolus) population

"The genetic diversity of Puumala hantavirus (PUUV) was studied in a local population of its natural host, the bank vole (Myodes glareolus). The trapping area (2.5x2.5 km) at Konnevesi, Central Finland, included 14 trapping sites, at least 500 m apart; altogether, 147 voles were captured during May and October 2005. Partial sequences of the S, M and L viral genome segments were recovered from 40 animals. Seven, 12 and 17 variants were detected for the S, M and L sequences, respectively; these represent new wild-type PUUV strains that belong to the Finnish genetic lineage. The genetic diversity of PUUV strains from Konnevesi was 0.2-4.9% for the S segment, 0.2-4.8% for the M segment and 0.2-9.7% for the L segment. Most nucleotide substitutions were synonymous and most deduced amino acid substitutions were conservative, probably due to strong stabilizing selection operating at the protein level. Based on both sequence markers and phylogenetic clustering, the S, M and L sequences could be assigned to two groups, 'A' and 'B'. Notably, not all bank voles carried S, M and L sequences belonging to the same group, i.e. SAMALA or SBMBLB.. A substantial proportion (8/40, 20%) of the newly characterized PUUV strains possessed reassortant genomes such as SBMALA, SAMBLB or SBMALB. These results suggest that at least some of the PUUV reassortants are viable and can survive in the presence of their parental strains."