Estudio mediante dinámica molecular del efecto de la radiación e isótopos de H en diamante para su aplicación en fusión

Las recientes mejoras en la síntesis de Diamante artificial han logrado cristales de mayor tamaño, propiedades optimizadas y en muchos casos superiores a sus variantes naturales. Con ello, los cristales sintéticos de Diamante, pasan a ser una alternativa seria en aplicaciones de Fusión Nuclear. Algunas de las propiedades deseables para dichas aplicaciones son especialmente notables en Diamante, entre otras su conductividad térmica o su amplio rango de transparencia electromagnética. Sin embargo, el conocimiento acumulado acerca de su comportamiento bajo radiación, o más concretamente bajo las condiciones radiactivas de Fusión, es todavía limitado. En aplicaciones de Fusión nuclear, es imprescindible conocer el efecto de la radiación neutrónica y la interacción del material con Hidrógeno, sus isótopos y otros elementos ligeros propios de los plasmas de Fusión. No nos consta una bibliografía extensa acerca del daño por radiación en Diamante, existen estudios poco concluyentes acerca de la energía umbral de desplazamiento, se ha estudiado la grafitización o amorfización y tópicos tales como la implantación o el daño por bombardeo electrónico, iónico o gamma, pero no se han encontrado trabajos previos a esta tesis en cascadas de desplazamientos 1 y, como veremos, apenas unos pocos trabajos utilizan la técnica de la Dinámica Molecular en estudios de daño por radiación en este material. La interacción del Hidrógeno en la red de Diamante sí ha sido extensamente estudiada, se conocen multitud de líneas de absorción relacionadas con su presencia, se ha estudiado su difusión mediante técnicas experimentales y existen descripciones atomísticas de los sitios de equilibrio en la red de Diamante, aislado o formando parte de agregados...

Kinetic modeling of molecular motors: pause model and parameter determination from single-molecule experiments

Single-molecule manipulation experiments of molecular motors provide essential information about the rate and conformational changes of the steps of the reaction located along the manipulation coordinate. This information is not always sufficient to define a particular kinetic cycle. Recent single-molecule experiments with optical tweezers showed that the DNA unwinding activity of a Phi29 DNA polymerase mutant presents a complex pause behavior, which includes short and long pauses. Here we show that different kinetic models, considering different connections between the active and the pause states, can explain the experimental pause behavior. Both the two independent pause model and the two connected pause model are able to describe the pause behavior of a mutated Phi29 DNA polymerase observed in an optical tweezers single-molecule experiment. For the two independent pause model all parameters are fixed by the observed data, while for the more general two connected pause model there is a range of values of the parameters compatible with the observed data (which can be expressed in terms of two of the rates and their force dependencies). This general model includes models with indirect entry and exit to the long-pause state, and also models with cycling in both directions. Additionally, assuming that detailed balance is verified, which forbids cycling, this reduces the ranges of the values of the parameters (which can then be expressed in terms of one rate and its force dependency). The resulting model interpolates between the independent pause model and the indirect entry and exit to the long-pause state model

A study of the effect of molecular and aerosol conditions in the atmosphere on air fluorescence measurements at the Pierre Auger Observatory

The air fluorescence detector of the Pierre Auger Observatory is designed to perforin calorimetric measurements of extensive air showers created by Cosmic rays of above 10(18) eV. To correct these measurements for the effects introduced by atmospheric fluctuations, the Observatory contains a group Of monitoring instruments to record atmospheric conditions across the detector site, ail area exceeding 3000 km(2). The atmospheric data are used extensively in the reconstruction of air showers, and are particularly important for the correct determination of shower energies and the depths of shower maxima. This paper contains a summary of the molecular and aerosol conditions measured at the Pierre Auger Observatory since the start of regular operations in 2004, and includes a discussion of the impact of these measurements oil air shower reconstructions. Between 10(18) and 10(20) eV, the systematic Uncertainties due to all atmospheric effects increase from 4% to 8% in measurements of shower energy, and 4 g cm(-2) to 8 g cm(-2) in measurements of the shower maximum. (C) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.