Genome 10K: A Proposal to Obtain Whole-Genome Sequence for 10 000 Vertebrate Species

The human genome project has been recently complemented by whole-genome assessment sequence of 32 mammals and 24 nonmammalian vertebrate species suitable for comparative genomic analyses. Here we anticipate a precipitous drop in costs and increase in sequ

A 10,000 year record of dune activity；dust storms；and severe drought in the central Great Plains

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Synthesis and characterization of nano-scale Terbium (III)-trimesic acid (TMA)-1,10-phenanthroline(phen) luminescent complex

The nano-scale luminescent complex of Terbium(III)-trimesic acid (TMA)-1,10-phenanthroline(phen) was successfully synthesized by co-precipitation method in this paper. The chemical formula of the synthesized complex was speculated to be Tb(TMA)(phen)(0.0125)center dot 5H(2)O by elemental analysis, inductively coupled plasma-atomic emission spectroscopy (ICP-AES), and Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR). XRD pattern of Tb(TMA)(phen)(0.0125)center dot 5H(2)O indicated that it was a new crystalline complex since the diffraction angle, diffraction intensity and the distance of crystal plane were all different from those of the two ligands. TG curve proved that the synthesized nano-scale luminescent complex was stable in the range from ambient temperature to 464 degrees C in air. TEM images showed that the complex was spherical shape with an average size of 40 nm.

STRUCTURE OF 1,10-DIAMINODECANE TETRACHLOROZINCATE

[NH3(CH2)10NH3][ZnCl4], M(r) = 381.51, triclinic, P1BAR, a = 7.296 (1), b = 10.110 (3), c = 12.814 (4) angstrom, alpha = 90.84 (2), beta = 101.17 (2), gamma = 92.52 (2)-degrees, V = 926.13 angstrom 3, Z = 2, D(x) = 1.37 Mg m-3, lambda(Mo K-alpha) = 0.71073 angstrom, mu = 1.925 mm-1, F(000) = 396, T = 298 K, final R = 0.070 for 1237 unique reflections [I > 3-sigma(I)]. The structure is characterized by layers of inorganic ions sandwiched between layers formed by the paraffinic chains.

STRUCTURE OF CIS-DIAQUABIS(1,10-PHENANTHROLINE)ZINC SULFATE HEXAHYDRATE

[Zn(C12H8N2)2(H2O)2]SO4.6H2O, M(r) = 665.98, triclinic, P1BAR, a = 10.070 (4), b = 12.280 (3), c = 13.358 (2) angstrom, alpha = 109.12 (2), beta = 92.58 (2), gamma = 110.85 (2)-degrees, V = 1433.9 (7) angstrom 3, Z = 2, D(x) = 1.54 g cm-3, lambda(Mo K-alpha) = 0.71069 angstrom, mu = 10.1 cm-1, F(000) = 692, T = 293 K, R = 0.044 for 3985 observed reflections. The Zn atom is coordinated in a distorted octahedral geometry by four N atoms from two 1,10-phenanthroline (phen) ligands and two water molecules. The intermolecular ring-stacking interactions between the phen ligands occur in two forms: infinite chains and discrete dimers. Hydrogen bonds further stabilize the structure.

黄土丘陵沟壑区1∶1万及1∶5万比例尺DEM地形信息容量对比

黄土丘陵沟壑区地形变化异常复杂 ,1∶5万地形图对原始 1∶1万地形图等高线形态综合、取舍程度很大 ,这些都在不同程度上影响了地形分析结果的准确性。以高精度的 1∶1万比例尺DEM为校准值 ,运用 1∶1万及 1∶5万比例尺DEM叠合比较分析的方法 ,研究 1∶5万DEM的地形信息容量及提取不同地形要素的精度。试验结果表明 ,在黄土丘陵区 ,与 1∶1万DEM相比 ,1∶5万DEM在所提取的地面坡度、地面曲率、沟壑量等地形定量指标方面均都存在着较大的误差。

不同比例尺DEM提取地面坡度的精度研究——以在黄土丘陵沟壑区的试验为例

以陕北绥德县韭园沟流域为试验样区 ,采用高精度 1∶ 1万 DEM所提取的坡度为准值 ,应用多层面复合分析和比较分析的方法 ,研究该地区 1∶ 5万 DEM提取地面坡度的误差特征与纠正方法。试验结果显示 ,所获得的不同空间尺度下 DEM所提取坡度值的转换图谱 ,可对 1∶ 5万 DEM计算的地面坡度统计值进行有效修正。该成果对于 DEM数据在水土保持领域若干应用标准的制定 ,提供了重要的理论依据与技术路线

Syncytin蛋白的原核表达及其多克隆抗体的制备和鉴定

目的克隆人syncytin基因并在大肠杆菌中表达,并用表达后的融合蛋白制备syncytin蛋白多克隆抗体。方法 PCR扩增人syncytin基因编码区的DNA片段,将其克隆入原核表达质粒pET30a(+),转化大肠杆菌BL21,诱导产生syncytin-His融合蛋白。采用割胶回收的方法纯化目的蛋白,免疫新西兰白兔,制备多克隆抗体。通过ELISA、Western-Blot和免疫组织化学等方法来检测抗体的灵敏度和特异性。结果成功表达并纯化了syncytin-His融合蛋白,SDS-PAGE分析表明融合蛋白主要以包涵体形式存在;ELISA法测定抗体效价为1:10 000;Western-Blot和免疫组织化学结果显示所制备的抗体能特异性识别syncytin蛋白。结论成功制备和鉴定了人syncytin多克隆抗体,多克隆抗体特异性强和效价高,为下一步研究Syncytin的生物学功能奠定了基础。

合胞素在白血病和淋巴瘤细胞中的表达及意义研究

人类内源性病毒(HERVs)是远古具有感染能力的逆转录病毒整合于人类基因组的遗迹, 大约占人类基因组的3%~8%，至少包括31个家族。它们通过不同的途径参与人类各种生理和病理活动的调节过程。大多数人类内源性病毒的基因, 由于基因的突变或部分缺失而失去了转录的能力。但有些基因依然保持完整的开放读码框, 能翻译成有功能的蛋白, 如HERV-W家族的囊膜蛋白合胞素基因, 可以被转录并翻译成有功能的蛋白质。目前合胞素的生理功能以及在各种病理过程中的作用机制仍然不清楚。国内对于合胞素的功能研究处于起步阶段，尚无商品化试剂，而且也没有合胞素抗体制备的报道。我们通过PCR扩增人合胞素基因编码区的DNA片段，将其克隆入原核表达质粒pET30a (+)，转化大肠杆菌 BL21，诱导产生了合胞素-His融合蛋白。采用割胶回收的方法纯化目的蛋白, 免疫新西兰白兔, 制备了多克隆抗体。最后通过ELISA、Western-Blot和免疫组织化学等方法检测抗体的效价和特异性。我们成功表达并纯化了合胞素-His融合蛋白, SDS-PAGE分析表明融合蛋白主要以包涵体形式存在；ELISA法测定抗体效价为 1:10 000；Western-Blot和免疫组织化学结果显示所制备的抗体能特异性识别合胞素蛋白，为下一步研究合胞素的生物学功能奠定了基础。我们首次发现，合胞素能够在白血病和淋巴瘤细胞系中表达。利用我们制备的抗合胞素多克隆抗体，我们进一步检测该基因是否在白血病和淋巴瘤患者的外周血中表达，所有患者的外周血标本，均来自云南省有关医院。作为对照，我们还检测了20 名健康志愿者的外周血细胞。实验证明，合胞素基因(包括 mRNA 和蛋白)也在白血病患者的外周血细胞表达，而不表达于健康志愿者的血细胞。在30 名不同的白血病和淋巴瘤患者中，有22 名有合胞素的表达。荧光实时定量RT-PCR 的方法比较了合胞素在细胞系和白血病患者外周血中表达的相对定量，发现合胞素基因在所检测的5 种淋巴细胞系、3 种粒细胞系和1 种淋巴瘤细胞系中都有相对稳定的表达，表达水平与C8166 细胞系相比，介于0.5-2 倍之间。而在白血病患者中的表达则介于1.8-33.4 倍不等。我们的结果提示，合胞素可能与白血病的形成有关，因为该基因表达的囊膜蛋白具有很强的促细胞融合活性，含有具有免疫抑制活性的肽段，而且已发现某些与其类似的蛋白有致瘤能力。

新疆野生果树生物多样性及其保护研究

新疆野生果树种类独特，起源古老，栽培果树种质资源丰富，在我国生物多样性中占有特殊的地位。在国家自然科学基金项目(C39770085)和中国科学院生物分类区系学科发展特别支持费项目的资助下，通过大量国内外有关文献的查阅，本研究以全新疆范围内的野生果树资源为研究对象，以中国生物多样性关键地区一伊犁、塔城地区为重点区域(重点考察面积约30000km~2)，进行了行程12,000km的野外考察、标本和样品采集，并进行了实验测试分析。首次在物种、生态系统和遗传水平三个层次上，比较系统地对新疆野生果树资源进行了生物多样性研究，得出了以下主要结果。1．在前人工作基础上，较系统全面地研究报道了新疆境内的野生果树种类，计有105种，含变种和亚种(不包括半野生果树、野生果树近缘种)。其中，蔷薇科野生果树为主要类群，有13属50种，占新疆野生果树总属的46.4％，总种数的47.6％：蔷薇科、忍冬科、虎耳草科以及小檗科四个大科含17属80种，占新疆野生果树总科数33.3％，总属数的60.7％，总种数的77.6％，显示出该四科的野生果树在新疆野生果树区系组成中的重要地位。2．新疆野生果树不但物种丰富，而且种类独特，其分布与新疆的地理、气候等生态环境因子密切相关，呈现出北疆多于南疆，西部多于东部，山地多于平原的分布格局。其中，北疆的野生果树种类多达92种，占新疆野生果树总种数的87.6％，而南疆仅有28种，占26.6％。受降水条件的影响，新疆山地与平原野生果树物种多样性的差异十分明显，塔里木和准噶尔两大盆地中仅有野生果树18种，而天山山区的就多达81种。这进一步证明，高海拔的山地是干旱区中的“湿岛”，有利于多数中生性的野生果树的分布和生长。几大山系中，以天山山区的野生果树种类最为丰富。3．伊犁和塔城两地区是我国落叶阔叶野果林分布面积最大，富有代表性的地区，但是果树林呈不连续分布。落叶阔叶野果林主要分布在新疆的伊犁、塔城以及阿克苏三个地区的十四个县市范围内。在野外调查和资料分析的基础上，采用MAPGIS软件首次分别绘制1：1,500,000比例尺的新疆伊犁地区和塔城地区野果林分布图，以及1：10,000,000比例尺的中国新疆及中亚部分国家野果林分布图。4．新疆野生果树林类型相对单调和贫乏，这主要与该区的地理与生态气候因子有关。据初步研究结果，新疆野生果树林可划分为：寒性落叶针叶林、典型落叶阔叶林、落叶阔叶灌丛、荒漠落叶阔叶灌丛和荒漠落叶阔叶小灌丛、半灌丛五种植被亚型。对主要的野生果树林的种群结构分析表明，不同强度的人为干扰明显地影响着种群的年龄结构，使种群更新困难。5．以不同性状为指标的新疆野苹果地理和生境居群特征测定和聚类分析表明，叶片性状受到生态环境的影响；而花粉、果实以及过氧化物酶分析显示出新疆野苹果丰富的种下变异，这种变异与居群所在的环境条件并没有明显的对应性，具有丰富的遗传基础。6. 昆虫及菌类是野果林生态系统的重要组成部分。对伊犁地区新源县交托海野果林区的昆虫进行了调查和标本采集，初步鉴定出昆虫11目，62科，178种。调查还表明，新疆野生果树已有病害31种，为害严重的病虫害8种。7. 由于新疆野生果树生态系统受到人类经济活动的强烈影响，野果林分布范围缩减、面积下降，物种减少，有的濒临灭绝状态，必须引起重视。通过本项研究，提出了新疆野生果树资源保护和可持续利用的建议及对策：(1)加强新疆野生果树种质资源的收集和保存；(2)应及早建立新疆新源野苹果林自然保护区和霍城大西沟野生樱桃李白然保护区；(3)保育和开发利用并重，实现资源的永续利用；做到因地制宜、重点突破、综合开发；(4)自然资源的获取应严格纳入到政府的管理范围之中。