Structure, organization and expression of common carp (Cyprinus carpio L.) SLP-76 gene

SLP-76 is an important member of the SLP-76 family of adapters, and it plays a key role in TCR signaling and T cell function. Partial cDNA sequence of SLP-76 of common carp (Cyprinus carpio L.) was isolated from thymus cDNA Library by the method of suppression subtractive hybridization (SSH). Subsequently, the full length cDNA of carp SLP-76 was obtained by means of 3' RACE and 5' RACE, respectively. The full Length cDNA of carp SLP-76 was 2007 bp, consisting of a T-terminal untranslated region (UTR) of 285 bp, a T-terminal. UTR of 240 bp, and an open reading frame of 1482 bp. Sequence comparison showed that the deduced amino acid sequence of carp SLP-76 had an overall similarity of 34-73% to that of other species homotogues, and it was composed of an NH2-terminal domain, a central proline-rich domain, and a C-terminal SH2 domain. Amino acid sequence analysis indicated the existence of a Gads binding site R-X-X-K, a 10-aa-long sequence which binds to the SH3 domain of LCK in vitro, and three conserved tyrosine-containing sequence in the NH2-terminal domain. Then we used PCR to obtain a genomic DNA which covers the entire coding region of carp SLP-76. In the 9.2 k-long genomic sequence, twenty one exons and twenty introns were identified. RT-PCR results showed that carp SLP-76 was expressed predominantly in hematopoietic tissues, and was upregulated in thymus tissue of four-month carp compared to one-year old carp. RT-PCR and virtual northern hybridization results showed that carp SLP-76 was also upregulated in thymus tissue of GH transgenic carp at the age of four-months. These results suggest that the expression level of SLP-76 gene may be related to thymocyte development in teleosts. (c) 2007 Published by Elsevier Ltd.

普适环境下服务发现的语义支持机制

随着计算能力和通信能力的增强，计算设备所占用的体积也越来越小，各种新形态的传感器、移动设备及无线网络设备日趋普及。这极大地促进了以无线、移动和嵌入式设备为基础的普适计算模式的形成和发展。普适环境下的服务发现机制可使得用户能够使用各种移动设备无缝的、随时随地的共享和访问各种服务信息。 普适环境中的网络异构性和动态性，以及服务的多样性和异构性，均对服务发现提出了新的挑战。目前学术界和工业界在服务发现方面进行了不少的探索和研究，当前的一些服务发现协议或系统比如SLP、UPnP、INS等，一般基于语法的方法描述服务，主要关注服务的功能性需求，但基于关键字来匹配请求和服务描述，在普适环境下常常会导致较差的匹配结果。 针对服务发现在普适环境中的新需求，本文基于XML定义了一种轻量级的服务语义建模语言SML，SML定义了丰富的数据类型，以模板和属性的方式定义各领域的实体，可以表达丰富的语义知识；同时，本文以轻量级的推理引擎Jess为依托，将用服务建模语言定义的各应用领域的服务模板和语义知识自动转换成Jess的推理规则和事实。本文定义了一种类似XPath的服务查询语言规范，并在支持精确匹配的基础上，提出了服务的近似匹配策略，提供了各种的近似计算规则。鉴于不同用户对服务的各属性有不同的偏好程度，还提出了基于用户偏好的服务匹配策略。动态的上下文信息是服务匹配过程的重要考虑因素。本文以Jess规则来匹配服务和用户的上下文，选择适合于用户当前情况的服务。对服务各种QoS的描述支持也是服务语义建模语言提供的功能之一，为此，本文还提出了一种基于Pareto最优的服务选择策略，根据服务的QoS以及服务与请求的匹配程度来选择Pareto最优的服务。本文的上述工作已实现到服务发现系统Service CatalogNet Extended中。

多服务发现协议的互操作框架研究

服务发现协议（Service Discovery Protocol）是支持程序和设备自动发现并访问网络中所需服务的协议，是分布式环境特别是普适环境下进行资源共享、数据集成、流程协作的前提。目前学术界和工业界已经提出了多种服务发现协议，如UPnP SSDP、SLP、Salutation、Bluetooth SDP。这些服务发现协议提供了类似的功能，但在适用网络类型、描述模型、发现机制、服务使用方式等方面存在着高度的异构性，导致使用不同服务发现协议的设备之间无法直接进行交互，从而限制了服务使用者和服务提供者之间的交互范围及交互能力。同时这其中的一些协议已经成为事实上的工业标准，但目前并没有一个能够适用于所有场景并占据整个市场，并且在很长的一段时间内不可能出现一个通用的协议来取而代之，同时，要求服务请求者和服务提供者同时支持多种服务发现协议是不现实的，因此迫切需要一种互操作框架来实现各种服务发现协议之间的互操作，从而允许服务使用者能够以其自有的方式在网络上发现并使用所需的各种服务，而不用考虑服务发布所采用的具体服务发现协议及调用方式的不同。 目前学术界和工业界在服务发现协议的互操作方面进行了不少探索和研究，但在互操作对象的可扩展性及互操作的透明性、范围方面仍存在不少问题尚未得到有效地解决。 本文主要研究跨网络环境下的服务发现协议的互操作。本文基于抽象语义信息的互操作模型，综合考虑了上下文信息，采用分阶段事件驱动的技术处理并发请求，设计并实现了具有透明性、可扩展性、高效性的服务发现协议互操作框架（Service CatlogNet Interoperable Framework，SCNIF），本文设计与实现了三种服务发现协议（UPnP SSDP、SLP、SCN）的互操作插件，还给出了新加入服务发现协议的互操作插件的实现方案。

Analysis of the sea-level variability along the Chinese coast and estimation of the impact of a CO2-perturbed atmospheric circulation

The relationship between monthly sea-level data measured at stations located along the Chinese coast and concurrent large-scale atmospheric forcing in the period 1960-1990 is examined. It is found that sea-level varies quite coherently along the whole coast, despite the geographical extension of the station set. A canonical correlation analysis between sea-level and sea-level pressure (SLP) indicates that a great part of the sea-level variability can be explained by the action of the wind stress on the ocean surface. The relationship between sea-level and sea-level pressure is analyzed separately for the summer and winter half-years. In winter, one factor affecting sea-level variability at all stations is the SLP contrast between the continent and the Pacific Ocean, hence the intensity of the winter Monsoon circulation. Another factor that affects coherently all stations is the intensity of the zonal circulation at mid-latitudes. In the summer half year, on the other hand, the influence of SLP on sea-level is spatially less coherent: the stations in the Yellow Sea are affected by a more localized circulation anomaly pattern, whereas the rest of the stations is more directly connected to the intensity of the zonal circulation. Based on this analysis, statistical models (different for summer and winter) to hindcast coastal sealevel anomalies from the large-scale SLP field are formulated. These models have been tested by fitting their internal parameters in a test period and reproducing reasonably the sea-level evolution in an independent period. These statistical models are also used to estimate the contribution of the changes of the atmospheric circulation on sea-level along the Chinese coast in an altered climate. For this purpose the ouput of 150 year-long experiment with the coupled ocean-atmosphere model ECHAM1-LSG has been analyzed, in which the atmospheric concentration of greenhouse gases was continuously increased from 1940 until 2090, according to the Scenario A projection of the Intergovermental Panel on Climate Change. In this experiment the meridional (zonal) circulation relevant for sea-level tends to become weaker (stronger) in the winter half year and stronger (weaker) in summer. The estimated contribution of this atmospheric circulation changes to coastal sea-level is of the order of a few centimeters at the end of the integration, being in winter negative in the Yellow Sea and positive in the China Sea with opposite signs in the summer half-year.

台风海面风场的动力分析、四维同化及数值试验

台风是最具破坏性的海洋大气系统。台风及其引起的沿海强风暴潮和海上巨浪不仅给沿海地区人民的生命财产造成严重的损失，而且对海上交通运输、军事活动、海洋工程和渔业都带来严重影响。准确的台风海面风场是获得比较真实的海浪、风暴潮等海洋现象的关键所在。由于不准确的海面初始场和台风海面风场数值模式中物理过程不完善等问题，模拟预报台风海面风场的精度达不到要求，极大的影响了海浪、风暴潮等海洋过程的模拟预报精度。因此获得准确真实的台风海面风场不仅对国民经济的顺利健康发展起到至关重要的作用，而且会很好地促进海浪、风暴湖等过程的研究。中尺度大气数值模式MM5在灾害性天气的预报研究方面具有重要的地位，并在暴雨研究方面取得了成功。在本论文中，我们结合气象工作者和海洋学者在台风研究中的不同侧重点，耦合自由大气和边界层过程，考察海气相互作用对台风海面风场的作用，首次将MM5应用于台风海面风场的研究之中，这对台风海面风场的研究来说是一个新的起点。本论文在MM5中，将中国国家气象中心中期预报谱模式T63／T106分析和预报场与常规地面和探空观测资料相结合，合理调整模式参数(海面粗糙度等参数)，建立了一套适用于中国区域的台风海面风场的模拟、预报系统。本论文利用改造过的中尺度大气数值模式MM5对两个台风个例：9608号台风(HERB)和9711号台风(WINNIE)进行数值试验。对海面风场而言，海气热通量交换对海面风场发挥着重要作用。因此本论文研究海面热量通量交换对9608号台风的强度和中心位置的影响，这也是以前国内台风数值模式中疏于考虑的方面。最后将模式模拟风场用于波浪的模拟研究之中，考察模拟海面风场在海洋环境研究中应用的有效性；并与目前国内较先进的LAGFD-WIN海面动力风场模式对比，检验MM5在台风海面风场研究中的性能。研究结果表明，MM5较好的反映出台风特性，并且优于LAGFD-WIN海面动力风场模式结果。在考察台风不稳定扰动特征时，我们区别于以往的本征值方法，利用中尺度二维扰动模式，由MM5提供9711号台风数值试验结果作为扰动模式的初始场，从动力学角度研究台风过程的扰动特征。初始资料问题对台风模式的预报模拟精度来说是一个最大、最重要的问题。因此改善、弥补模式初始场所造成的不足是本研究论文的重点工作之一。目前，在国内关于MM5中的四维资料同化(FDDA)方案试验刚刚起步。在本论文中，我们成功的启动MM5的四维资料同化方案：分析逼近和观测逼近。我们改造模式，同时启动这两种逼近方法，充分发挥探空资料和地面观测资料各自的优越性，I探索不同尺度、不同类型的资料在台风海面风场的应用。尝试卫星高度计风场资料溶于MM5中的同化方案中，这是本研究论文的另一个创新之处。本文的主要结论是(1)对两个台风个例：9608号台风(HERB)和9711号台风(WINNIE)进行了控制试验(CNTL)研究，分析台风模拟过程的温度距平、海平面气压及海面风场分布特点。研究表明，两个台风过程分别在不同高度上具有暖中心结构；模拟出的两个台风环流都呈现出台风的非对称及涡旋型态，模拟出的台风强度令人满意。对移动路径来说，对9608号台风过程，12h模拟台风路径误差为1.3个纬度，0.7个经度，而24h的模拟误差则为0.4个纬度，0.2个纬度；而对于9711号台风过程，其12h模拟台风路径误差为1.2个纬度，1.6个经度；24h路径误差为1.9个纬度，1．5个经度；36h模拟路径误差为3.2个纬度，2.8个经度。我们认为，由于9711号台风过程不准确的初始场，9711号台风模拟路径精度逊色于9608号台风过程的结果。(2)9608号台风过程中感热通量和潜热通量交换，在台风中心附近，热通量较小，但在台风周围，存在热通量的高值压，随着台风强度的减弱，热量通量交换也随之减小。在海面上始终是海水给大气提供热量。海面潜热通量总为正通量，并且都大于相应时刻的感热通量，表明水汽通量对台风系统比感热通量更重要。在分析热通量在不同下垫面演变特征时发现，在下午2h左右，在水陆交界处的次之，上最大，陆地上最小。感热通量在陆地下垫面上最大，其峰值出现而在水域上的最小，对于潜热通量则是水域(3)应用9608号台风的模拟海面风场到海浪的数值模拟研究中，发现由于台风海面风场分布的不对称性(在台风前进方向的右侧风速最大)，也因此造成了海浪有效波高分布的不对称性，同时在台风影响的右前方也传播得较远。随着台风海面风场减弱，风浪能量也逐渐消耗，有效波高也逐渐降低。(4)在台风发展的动力学特征研究方面，首先从不稳定扰动理论角度出发，讨论了台风发展的条件，得到了和天气学分析的台风形成发展条件一致的判据；在台风不稳定扰动的数值试验方面，针对9711号台风过程进行了数值试验，数值试验结果表明：扰动环流型以倾斜的扰动特征出现，并略向西倾斜，这是发展型的扰动型态；促使中尺度扰动发展和维持的能源主要来自于基本流场的有效位能和扰动场的有效位能。(5)利用标准探空资料和卫星高度计风场资料，在MM5中对9608号台风进行了七个试验：一个控制试验，三个分析逼近试验(AW，AWTQ，ATQ)，两个观测逼近试验(IWT，IW)和一个同时进行分析和观测逼近的试验(AWTQ+IWT)。七个试验中海平面气压场都形成了闭合低压中心，海面风场具有台风的气旋型态，再次证明MM5对台风的模拟能力；在定量的描述上，AWTQ+IWT试验较好地模拟出台风的中心位置和强度。因此联合有相对好的垂直分辨率的探空资料以及相对于探空资料有好的时间和水平分辨率的地面资料，能有效地提高台风海面风场的模拟预报精度。由于没有同化SLP的观测资料到模式中，SLP成为确定FDDA有效程度的有力手段。我们发现同时同化风场和质量场(温度场和湿度场)的试验AWTQ对风场和质量场均有一致的正面影响；对由强烈动力作用和大尺度强迫的台风过程，风场优于质量场。试验AWTQ，AW和ATQ的结果表明在风场中只有非常少的质量场诱导信息。试验ATQ，IWT对风场，海平面气压场具有负面影响。而利用包含常规气象观测资料无法拥有的海面风场信息的高度计风场资料，仅进行风场同化的IW试验，对海面气压场有非常好的效果。结果表明而AW，AWTQ，IW，AWTQ+IWT在24h模拟期间，则对SLP的平均RMS有明显的减小，分别约为3％，9％，12％和8％。