牛山湖浮游生物群落DNA指纹结构与理化因子的关系

对牛山湖5个站点的浮游生物群落DNA多态性进行了RAPD指纹和PCR-DGGE指纹分析,并探讨了其与理化因子的关系.结果如下:1)从40条随机引物中筛选出9条引物,共获得93条谱带,多态率为58%;各站点所得谱带平均为67条,其中Ⅰ站最少,为61条,Ⅴ站最多,为74条;2)PCR-DGGE指纹图谱共含102条谱带,其中原核生物56条,真核生物46条,谱带总数以Ⅲ站、Ⅳ站和Ⅴ站较多,Ⅰ站和Ⅱ站较少;3)Ⅱ站的总磷、叶绿素、化学耗氧量、硬度及电导率最高;各站点间溶氧和pH差异较小.相似性聚类分析表明,浮游生物

长江江豚微卫星DNA分离的初步研究

为了开发物种特异性微卫星标记,本文采用一种改良的快速微卫星分离法(FIASCO)从长江江豚(Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis)的基因组中筛选得到72条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型、非完美型及复合型序列所占的比例分别为58.3%、22.2%和19.5%。选择其中30条序列设计PCR扩增引物,并用12个随机选择的长江江豚样品进行多态性筛选。初步结果表明其中14对引物的扩增产物稳定并且具有多态性;在每个座位上获得2-13个等位基因,平均等位基因

东湖浮游生物群落DNA指纹结构及其与环境理化因子的关系

对武汉东湖5个不同湖区的浮游生物群落DNA进行了RAPD指纹分析,并探讨了DNA指纹结构与环境理化因子的关系.结果表明:所筛选的9条随机引物共扩增210条大小为150~2 000 bp的谱带,多态率为93.3%.各站点平均有42条谱带,其中Ⅳ站最多(53条),Ⅴ站最少(35条).Ⅰ站的PO43--P、TP含量最高,Ⅴ站的NH4+-N、TN、NO2--N含量最高,Ⅳ站各理化因子含量均低于其他站点,站点间COD、碱度、硬度、钙含量差异不大.相似性聚类分析表明,基于RAPD标记的浮游生物群落指纹将5个站点划分为

嗜盐古菌启动子DNA片段的功能检测

将来源于嗜盐古菌染色体DNA的启动子片段RM07或RM13插入到启动子探针载体pYLZ_2的报告基因lacZ之前,通过β_半乳糖苷酶酶活性的检测,进一步确证RM07和RM13片段在大肠杆菌(Escherichia coli)中的启动功能。同时用微量热技术检测了大肠杆菌DH5α及其重组菌株在LB培养基中37℃生长过程的热输出功率。T2(pYLZ_2)、TE07(pYL726)、TE07_2(pYL702)、TE131(pYL131)和TE132(pYL132)菌株的生长速率分别比大肠杆菌DH5α降低了6.5

转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA指纹拓扑结构与优势种的关系

针对多福转基因鱼试验湖的浮游生物群落进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)研究,并与优势种类组成进行了相关分析．结果显示：9条引物共检测到76条长度在200—1200bp的谱带,其中共有带占5.3％,特有条带占40.8％,谱带多态率为94.7％；共观察到的25种优势种中有长额象鼻溞(Bosmina longirostris)、近邻剑水蚤(Cyclops vicinus)、螺形龟甲轮虫(Keratella cochlearis)、角甲藻(Ceratium hirundinella)和圆筒锥囊藻(Dinobr

重金属Cd~(2+)、Pb~(2+)和Zn~(2+)对泥鳅DNA损伤的研究

采用单细胞凝胶电泳技术(SCGE),研究重金属Cd2+、Pb2+、Zn2+在不同暴露时间(1—35d)、单一重金属离子不同暴露浓度(0.05mg/L、0.5mg/L、5.0mg/L)或混合重金属离子(Cd2++Pb2+、Cd2++Zn2+、Pb2++Zn2+、Cd2++Pb2++Zn2+)相同浓度(0.5mg/L)条件下对泥鳅肝胰脏细胞核DNA的损伤作用。以带彗尾核DNA百分率和彗尾长度(TL)与核直径(D)比值为指标,探讨DNA损伤级别与处理浓度间的相关性。结果显示,随着处理时间的延长,带彗尾核DNA百

长江水系草鱼遗传多样性的微卫星DNA分析

利用已发表的鲤微卫星引物在草鱼中进行PCR扩增 ,结果有 5对引物 (6个座位 )能成功扩增并且有较高多态性 ,等位基因数在 3— 7个之间。这些异种扩增的草鱼微卫星符合孟德尔遗传规律。测序证明草鱼中的微卫星核心重复序列部分与鲤中的原始核心序列相似 ,也有一些变化。随后用这 6个多态微卫星座位研究了来自长江水系的四个草鱼群体的遗传结构 ,结果显示每个群体的平均等位基因数在 3 8与 4 8之间 ,平均观测杂合度 (Ho)在0 4 0 0 0与 0 5 74 1之间 ,平均期望杂合度 (HE)在 0 4 7

武汉东湖浮游生物群落DNA多态性与富营养化

对武汉东湖不同程度富营养化湖区 ,即站 、站 与站 浮游生物进行了群落级 DNA多态性的 DNA指纹研究 ,并就其拓扑结构与富营养化特征参数之间关系进行了分析。实验结果如下 :(1)各站点总氮、总磷及叶绿素 a分别为 1.14 6～ 2 .2 35mg/ L、0 .0 13～ 0 .2 10 mg/ L 和 4 0 .2 5～ 10 9.2 2 μg/ L;(2 )所筛选的 5个随机引物共获得 2 9个扩增位点 ,其中多态位点占75 .9% ,各引物扩增谱带数在 2～ 6间。站 的扩增条带数最多、谱带多态

DNA指纹分析技术在群落级生命系统应用的可能性

DNA指纹分析是一种关于整体遗传结构分析的强有力的分子生物学技术 ,广泛应用于种群及个体水平层次生命系统。本文以东湖浮游生物为对象 ,用随机引物和特异引物进行扩增探讨了DNA指纹分析技术在群落级生命系统应用的可能性。实验表明 :取自分别处于超富营养水平、富营养水平和中营养水平的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ站样本的模板DNA ,无论是以随机引物M 0 1、M 0 2、M 0 3、M 18及M 19还是特异引物CW15 94 6 / 4 7、EGMS6、EGMS4、ITS1及HSP扩增均获得清晰且稳定的图谱 ;各站间浮游生物群

黄喉拟水龟细胞核DNA含量的分析

以黄喉拟水龟 (Mauremysmutica)的红血细胞为材料 ,以鸡红血细胞为DNA标准 ( 2 5pg/2c) ,采用流式细胞仪测定了黄喉拟水龟及其两个种群的细胞核基因组DNA含量。黄喉拟水龟的细胞基因组DNA含量为 5 16± 0 2 9pg/2c (n =6 0 ) ;南方种群的细胞核DNA含量为 5 19± 0 30pg/2c (n =30 ) ,北方种群为 5 14±0 30pg/2c (n =30 ) ,两个种群的核DNA含量无显著差异 (t=0 6 84 7,df =5 8,P >0 0

应用RAPD技术初步分析无裂栉江珧四种类型的基因组DNA

利用 3个随机引物 (S4 5 3,S4 5 4 ,S4 6 3)对无裂栉江珧 (Atrina pectinata L inaeus)的 4种类型 :青口、黄口、沙螺、棘螺基因组 DNA进行 RAPD分析 ,并对 RAPD的实验条件行了优化研究。10～ 2 0 ng的高纯度 DNA用作模板 ,退火温度为 39℃时 ,RAPD扩增的效率较高 ,扩增的带纹清晰可辨。3个引物中 ,引物 S4 5 3和 S4 6 3获得了清晰的 RAPD扩增结果 ,引物 S4 5 4未获得有效扩增 ,共扩增出 8条清晰的 DNA

中国鲿科鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析

采用PCR技术获得了中国科鱼类代表种类线粒体DNA控制区基因的全序列 ,对控制区基因结构进行了分析 ,并选用粒鲇科的中华粒鲇 ,科的三线纹胸作为外类群 ,用最大简约法 (MP)和邻接法 (NJ)构建了系统发育树。结果显示科鱼类中控制区基因适于系统发育分析 ,科鱼类构成一个单系类群 ;圆尾拟应该放入属里。

大口胭脂鱼线粒体DNA控制区序列的研究

采用PCR扩增、直接测序的方法得到了大口胭脂鱼线粒体DNA控制区的序列 ,经过对比分析 ,其序列全长为 92 0bp,碱基含量分别为 :胸腺嘧啶 (T) 2 9.8% ,胞嘧啶 (C) 2 1 .6% ,腺嘌呤 (A) 3 2 .4 % ,鸟嘌呤 (G)1 6.2 % ,与其它鲤科鱼类相比 ,胸腺嘧啶含量略低 ,鸟嘌呤含量略高 ,其它则相似 .成功地识别了终止序列区(nt.1～ 2 3 5处 )、中央保守区 (nt2 3 6～ 5 66处 )和保守序列区 (nt.5 67～ 92 0处 ) ,并找到了终止

7种鲟形目鱼类亲缘关系的随机扩增多态性DNA研究

为阐明鲟形目鱼类的系统发育关系,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对中华鲟、达氏鲟、史氏鲟、意大利鲟、短吻鲟、长江白鲟和匙吻鲟的基因组进行了研究。13个引物在每个种共产生127个信息座位。按UPGMA聚类法构建这7种鲟形目鱼类的分子系统树。分子系统树首先分成两大支,即长江白鲟和匙吻鲟为一支,其他5种鲟科鱼类为对应的另一支。在5种鲟科鱼类中,我国3种鲟科鱼类中华鲟、达氏鲟和史氏鲟聚在一起,与意大利鲟和短吻鲟分开。我国3种鲟科鱼类又可分成两小支,中华鲟和达氏鲟为一支与史氏鲟相对应。由分子系统树得到的各个

一种改进的快速有效的裸藻DNA抽提方法

<正>大多数裸藻为单细胞游动种类,无细胞壁,细胞质外层特化为表质,部分种类细胞具胶质的囊壳,表质、囊壳的主要成分为蛋白质,使之具有柔韧的类牛皮糖的特性,给裸藻破细胞、DNA抽提及进行下一步工作造成一定的难度,本文在比较、改进的基础上,得到一种快速有效的裸藻DNA抽提方法。