The complete mitochondrial genomes of two species from Sinocyclocheilus (Cypriniformes: Cyprinidae) and a phylogenetic analysis within Cyprininae

We determined the complete mitochondrial DNA sequences for two species of surface- and cave-dwelling-cyprinid fishes, Sinocyclocheilus grahami and S. altishoulderus. Sequence comparison of 13 protein-coding genes shows that the mutation pattern of each single gene is quite similar to those of other vertebrate animal species. Analysis of the ratios of Ka/Ks at these loci between Sinocyclocheilus and two other cyprinid species (Cyprinus carpio and Procypris rabaudi) show that Ka/Ks ratios are differed, consistent with purifying selection and variation in functional constraint among genes. Bayesian analysis and maximum likelihood analysis of the concatenated mitochondrial protein sequences for 14 cyprinid taxa support the monophyly of the family Cyprininae, and further confirm the monophyly of the genus Sinocyclocheilus. The two Sinocyclocheilus species fall within the Cyprinion-Onychostoma lineage, including Cyprinus, Carassius, and Procypris, rather than among the Barbinae, as previously suggested on morphological grounds.

云南两种珍稀鱼类的形态度量学和分子系统学研究

鱇鱼良白鱼（Anabarilius grahami）、大头鲤（Cyprinus pellegrini）均隶 属于鲤形目（Cypriniformes）鲤科（Cyprinidae），是中国特有鱼类之一，仅在 云南省分布，是抚仙湖和星云湖各自的主要经济鱼类。 本研究首先基于线粒体控制区全序列来研究我国抚仙湖鱇鱼良白鱼自然种群 及人工驯养种群的遗传多样性，发现鱇鱼良白鱼人工驯养种群遗传多样性较高，种 群复壮程度良好；自然种群遗传多样性匮乏，可能种群经历过“建群者效应”和 “瓶颈效应”；并且各自然地理居群具有广泛的基因交流，不存在遗传分化，建 议应被当成一个管理单元进行整体保护；同时，对照其他已报道的鱼类控制区结 构，对鱇鱼良白鱼控制区结构进行了分析，识别了其终止序列区、中央保守区和保 守序列区，找到了终止相关的序列TAS 以及保守序列（CSB-F、CSB-D、CSB-1、 CSB-2、CSB-3）。 其次，采用主成分分析方法对大头鲤及与其相关的三个鲤鱼类群——杞麓鲤 （Cyprinus chilia）、华南鲤（Cyprinus rubrofuscus）及柏元鲤（Cyprinus carpio var. yuankiang×Cyprinus pellegrini）进行了可量性状分析，了解了 不同类群的外部差异；依据主成分分析结果，运用逐步判别方法从37 个可量性 状中筛选出能有效鉴定大头鲤的10 项形态指标：头长、吻长、吻宽、眼间距、 尾柄高、头背部末端到腹鳍起点距离、背鳍起点到腹鳍起点距离、背鳍起点到臀 鳍起点距离、背鳍末端到尾鳍背部起点距离、尾鳍背部起点到臀鳍起点距离，这 些形态指标可以简单易行的从不同鲤鱼群体中筛选出大头鲤个体；同时通过60 年代、80 年代及2007 年大头鲤的对比，发现大头鲤的外部形态已经发生了很大 变化总体趋势是头部更加宽大，身体更加延长。 最后，利用线粒体控制区序列，并结合Genbank 上的已发布的鲤鱼线粒体控 制区序列，对从星云湖采集的62 尾个体进行了分子系统学研究。结果显示：星 云湖土著鲤鱼已经被大规模非土著鲤鱼入侵，大头鲤仅以杂交品系存在，星云湖 土著鲤鱼面临严重危机，迫切需要进行有效保护。

鲤病毒病原的感染性测定

为查明养殖鲤(Cyprinus carpio)突然大批发病死亡的原因,对鲤病样品进行了细胞攻毒、空斑测定、电镜观察,以及鱼体感染等实验。先以患病鲤的组织匀浆液,经过滤后,分别接种到草鱼鳍条细胞(GCF)、鲤上皮瘤细胞(EPC)等14种培养细胞中。利用倒置显微镜观察显示,在1~2 d内,该病鱼组织匀浆液可使其中9种细胞出现典型的细胞病变。收集出现病变的细胞液(即病毒悬液),进一步进行病毒滴度检测、空斑测定和鱼体感染实验。结果显示,在GCF细胞上的病毒滴度为107.3TCID50/mL;在FHM,TSB和GC

鲤鱼3个亚种线粒体DNA ND5/6区段的PCR-RFLP分析及亚种间分子标记的确立

从鲤鱼3个亚种(Cyprinus carpio carpio,Cyprinus carpio haematopterus和Cyprinus carpiorubrofuscus)中选出具代表性的品系共10个,运用PCR方法,扩增出2.4 kb的mtDNA ND5/6区段.共用9种限制性内切酶进行酶切分析,结果表明,每个亚种拥有一种单倍型,有4种限制性内切酶(Dde I,Hae III,Taq I和Mbo I)酶切后产生了能将3个亚种区分开来的诊断性限制性酶切位点.可利用其作为鉴定3个亚种的遗传标记和遗传育种

鱼类转基因早期胚胎细胞的核移植研究

像许多转基因高等生物一样,用显微注射方法研制的转基因鱼均为转植基因嵌合体,培育纯合转基因品系已成为研究者们向往和追求的目标。以澎泽鲫(Carassius auratus,Pengze var.)和黄河鲤(Cyprinus carpio,Huanghe var.)为实验材料,以转基因囊胚细胞核或原肠胚细胞核为供体,进行了细胞核移植.检测了转植基因在所获得的移核胚胎和5尾澎泽鲫移核鱼及1尾黄河鲤移核鱼中的存在状况,分析了用转基因早期胚胎细胞核移植方法研制纯合转基因鱼的可能性。

人生长激素和转移的人生长激素基因对去垂体鱼的生长代偿效应

通过显微注射技术,将小鼠重金属螯合蛋白(MT-1)基因启动顺序与人生长激素基因顺序的重组体pMThGH注入鲤鱼(Cyprinus carpio)的受精卵内,由此发育的转基因鱼及其后代F1和F2均显示出快速生长效应。去垂体后,转基因鲤鱼F2持续生长,而非转基因鲤鱼和鲫鱼(Carassius auratus)的生长停止。给去垂体的鲫鱼腹腔注射生物合成的人生长激素(hGH),可恢复其生长。实验结果表明,转基因鱼体内表达和体外生物合成的hGH均能代偿鲤鱼和鲫鱼的内源生长激素并刺激去垂体鱼的生长。

鱼类远缘杂交正反交杂种胚胎发育差异的细胞遗传学分析

本文报道了鲤(Cyprinus carpio)×鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鲫(Carassiusauratus)×鲢、白鲫(Carassius auratus cuvieri)×鲢和鲢×鲤、鲢×鲫、鲢×白鲫的正反交试验。在鲤×鲢、鲫×鲢和白鲫×鲢3个正交组中,胚胎发育基本正常,尽管孵出的鱼苗绝大多数生命力弱,但孵化率都在50％左右;而在鲢×鲤、鲢×鲫和鲢×白鲫3个反交组中,胚胎发育均为畸形,不能孵化出苗。 胚胎发育细胞遗传学分析表明,鲤×鲢、鲫×鲢和白鲫×鲢的杂种胚胎几

雌核发育系红鲤8305的产生及其生物学特性

于1981年,以经过γ射线或紫外线处理的近类精子作为激活源,成功地诱发兴国红鲤(cyprinus carpio)卵子的雌核发育。经两代连续雌核发育的部分后代个体进行人工转性,使之成为“生理雄性”,并以“生理雄性”个体与其同胞姐妹交配所产后代为遗传特性纯一的个体——红鲤8305。检查了LDH,EST,MDH,SOD,IDH及运铁蛋白(transferrin)的座位,发现同一个系的不同个体之间等位基因没有差别,而且各座位的等位基因都是纯合的。血清学试验表明,控制红鲤8305雌核发育系的红细胞表面抗原的基因纯合

草鱼和鲤杂交的细胞学研究——鱼类远缘杂交核质不同步现象

以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为母本、鲤(Cyprinus carpio)为父本进行人工杂交,杂种胚胎发育至孵化期全部死亡;同时获得了少数雌核发育草鱼和雄核发育的鲤。分析比较了草鲤杂种胚胎染色体变化及胚胎发育情况。发现杂种胚胎染色体数目变化较大,一般在24—73之间,绝大部分细胞染色体在发育过程中不断丢失而出现非整倍体;极少数细胞在受精后雌性原核和雄性原核不结合而引起雌核发育和雄核发育;草鱼和鲤胚胎发育时序有较大差别;因此细胞分裂不能同步。可能是杂种胚胎染色体不断丢失的主要原因

人工诱导白鲫(♀)×红鲤(■)异源四倍体鱼的初步研究

<正> 人工诱导鱼类多倍体是动物染色体工程的重要课题。鉴于三倍体鱼的不育性和成活率高、生长快等特点,国内外采用理化手段直接诱导三倍体鱼已在三棘刺鱼(Gasterosleus aculeatus(L.))、鲽鱼(Pleuronectes platessa)、鲤鱼(Cyprinus carpio L.)、草鱼(Ctenopharyngodonidellus)、草鱼(♀)×团头鲂(Megalobrama amblycephala)(♂)杂种,以及白鲢(Hypophthalmichthysmolitrix),等十

程海鱼类区系的来源及其物种的分化

程海共有土著鱼类15种,它位于青藏高原横断山区的东缘,云南高原的西北,鱼类区系却独具一格,表现出江河平原鱼类区系的特点,显示程海鱼类区系来自长江的事实。程海自与金沙江隔离之后,湖内存在空白生态灶(niche)是产生物种分化的重要因素,尤以鲤鱼Cyprinus carpio L.的形态,表现出一系列的适应性变异,这些变异发生在近300年内,与处于海拔和纬度较高的甘子河裸鲤Gymnocypris przewalskii ganzihoensis Zhu et Wu形成的时间相比,相对而言是比较快的,然而却慢于

中国淡水鱼寄生蛭类的二新种

<正> 在进行湖北省鱼病病原区系调查和云南省鲤科鱼类调查过程中,发现二种寄生蛭是科学的新记录,现概述如下。1.湖北拟扁蛭Hemiclepsis hubeiensis,新种(图1) 正模及2幼蛭,湖北省黄冈县黄沙湖,鲤Cyprinus carpio haematopterus Temm.etSchl.及似刺鳊鮈Paracanthobrama guichenoti Bleeker的鳃上,1963年10月。模式标本保存于中国科学院水生生物研究所。 身体呈柳叶形,前部三分之一狭细,后部较宽。体长11毫米,最大宽度

梁子湖鲤鱼的生物学

<正> 鲤鱼 Cyprinus carpio Linnasus 是我国重要的经济鱼类,在淡水渔业产量上一向占很大的比重。根据梁子湖的渔业情况,它约占梁子湖鱼产量的40％;就全国范围来讲,其经济价值之大,可以想见。但是关于鲤鱼在我国天然水体中的生长情况,生活习性等问题,过去研究得很少,因此,1955年2月至1956年3月我们在梁子湖进行了鲤鱼的生态调查,希望从了解鲤鱼的生态着手,探索在天然水体中提高鲤鱼产量的途径。解剖用的材料主要取自梁子镇鲜鱼收购站。每周检查一定数量的鲜鱼,前后共解剖

Comparison of evolutionary rates in the mitochondrial DNA cytochrome b gene and control region and their implications for phylogeny of the Cobitoidea (Teleostei : Cypriniformes)

It is widely accepted that mitochondrial DNA (mtDNA) control region evolves faster than protein encoding genes with few exceptions. In the present study, we sequenced the mitochondrial cytochrome b gene (cyt b) and control region (CR) and compared their rates in 93 specimens representing 67 species of loaches and some related taxa in the Cobitoidea (Order Cypriniformes). The results showed that sequence divergences of the CR were broadly higher than those of the cyt b (about 1.83 times). However, in considering only closely related species, CR sequence evolution was slower than that of cyt b gene (ratio of CR/cyt b is 0.78), a pattern that is found to be very common in Cypriniformes. Combined data of the cyt b and CR were used to estimate the phylogenetic relationship of the Cobitoidea by maximum parsimony, neighbor-joining, and Bayesian methods. With Cyprinus carpio and Danio rerio as outgroups, three analyses identified the same four lineages representing four subfamilies of loaches, with Botiinae on the basal-most clade. The phylogenctic relationship of the Cobitoidea was ((Catostomidae + Gyrinocheilidae) + (Botiinae + (Balitorinae + (Cobitinae + Nemacheilinae)))), which indicated that Sawada's Cobitidae (including Cobitinae and Botiinae) was not monophyletic. Our molecular phylogenetic analyses are in very close agreement with the phylogenetic results based on the morphological data proposed by Nalbant and Bianco, wherein these four subfamilies were elevated to the family level as Botiidae, Balitoridae, Cobitidae, and Nemacheilidae. (c) 2005 Elsevier Inc. All rights reserved.

Molecular variation of Bothriocephalus acheilognathi Yamaguti, 1934 (Cestoda : Pseudophyllidea) in different fish host species based on ITS rDNA sequences

The molecular variation in Bothriocephalus acheilognathi Yamaguti, 1934 from 11 species of freshwater fish collected in Australia, China, the Czech Republic, England and Hawaii was investigated by determining the nucleotide sequences of the internal transcribed spacer region. The length of the first and second internal transcribed spacer sequences of multiple individuals ranged from 553 to 571 bp and 553 to 615 bp, and the G + C content from 53.1 to 53.5%. The percentage sequence divergence varied between 0 and 0.9% in the ITS1 and 0 and 6.6% in the ITS2, respectively, indicating the occurrence of intraspecific variation. It is demonstrated that the fragment length variation resulted primarily from microsatellite polymorphisms present in the ITS region, especially in the ITS2 region. Phylogenetic analyses revealed that B. acheilognathi examined in this study consisted of three closely related genotypes with certain degrees of host-specificity, and the genotype representing isolates from Cyprinus carpio L. was the most common and diverse form within the species B. acheilognathi.