国产十大功劳属植物的分类学修订

本文通过广泛的标本室研究结合野外实地调查，对十大功劳植物进行全面的形态学性状分析研究，据此对国产十大功劳植物进行分类学修订；还开展了叶表皮形态、孢粉学和分子系统学等方面的研究，并就这些性状在十大功劳属植物中的分类价值以及属下系统发育的关系及意义进行了讨论。结果如下： 1. 形态学特征 在对国内、外18 家标本馆1500 余份标本（包括模式标本）的查阅及40 余个县针对性的野外居群考察基础上，对十大功劳属植物形态性状（包括前人使用过的）的变异式样及其分类学意义进行了分析，并对一些数量性状进行了详细的统计分析。最后确认叶柄长度、小叶形状、小叶宽度、锯齿类型、花梗与苞片的相对长度、苞片和外萼片形状、中萼片与内萼片的相对长度、花序类型、苞片形状、外萼片形状、花瓣顶端是否裂等性状在种内变异稳定，是比较可靠的分类学性状。然后，利用这些可靠的形态学性状对国产十大功劳属下种的范围进行了界定。 2. 叶表皮形态 通过对十大功劳属植物4组12个亚组53 个种及两个其它属近缘植物（Ranzania japonica and Nandina domestrica ）叶表皮特征分别在光镜和电镜下进行观察，光镜下叶表皮细胞形状多为不规则形，少数为近多边形，垂周壁为波状或近平直；电镜下根据叶片下表皮的角质层突起及气孔特征将十大功劳属植物分为10 种类型，气孔都分布于下表皮。叶表皮性状对理解该属的属下系统关系有重要意义。 3. 孢粉学研究 通过对十大功劳属植物4组9个亚组18 个种植物的花粉特征的观察，发现花粉形态在属内变化比较一致，对于讨论属内组间、亚组间和种间的演化关系意义不大。 4. 种子形态 通过对十大功劳属植物4个组9个亚组的24个种及一个相关种Nandina domestica 种子形态特征研究，发现种子形态（特别是种皮纹饰）在十大功劳属内具有重要的系统学意义。根据种皮纹饰（网眼形状、网脊等）可将十大功劳属植物分为9 个类型。 5.分子系统学 在前人的工作基础上增加了15 个种，基于44 种十大功劳植物和6 种小檗属植物ITS 序列分析，显示该属可分成4 大支，基本上支持前人的4个组的划分。但就中国种类而言，尽管有几支能被明显的划分，但总体上组下关系仍不明确。另外，以M.polydonta、M.Longibracteata、M.paucijuga 为主的一支与美洲种类聚在一起，这说明这一支所代表的种类与美洲种类有较近的关系。 6. 分类处理 基于上述研究，我们对国产十大功劳属植物进行了全面的分类学修订。与《中国植物志》相比：发现新分类群2 个，新等级4 个，增加新异名3个，省级新分布1 个，并对4 个种进行了补充及订正描述。并对一些疑难类群进行了充分讨论，最后确认国产十大功劳属植物共包括38 个种，2个亚种。同时基于叶表皮、种子形态、分子序列等证据，对十大功劳属下系统进行了讨论。

基于微形态特征的中国瓦韦属植物分类的再修订

通过野外采集和观察，标本鉴定和实验研究，从植物形态学，叶柄和根状茎的解剖，叶表皮的显微观察，和孢子形态的扫描电镜观察等方面进行研究与分析，对中国瓦韦属（除薄叶组）进行了分类学修订研究。 1. 形态性状分析 研究了国内外重要标本馆的大量瓦韦属植物标本，通过对一些重要的形态性状的观察和分析，判定其变异规律及分类学意义。根状茎上的鳞片和孢子囊上的隔丝的形状和网眼结构是瓦韦属属下分类和种的划分的最主要的形态学性状。其它特征如孢子囊群着生的位置、中脉的颜色、根状茎直立或横走等在种内也具有一定的稳定性，可以帮助种的划分和鉴定。因此，在对瓦韦属植物进行分类时要结合几个相关性状而不是单一的性状进行分类。 2. 叶柄和根状茎的解剖 对瓦韦属（除薄叶组）49 个种的叶柄和根状茎进行解剖观察，发现叶柄中维管束的条数一般为1--7 条不等，排成一字形、三角形或半圆形。两根粗的维管束排列在腹面，较细的维管束排列在背面。叶柄中没有厚壁组织，但是在叶柄和根状茎的连接部位叶足处有厚壁组织的存在。根状茎横切面观察显示除了维管束外还有厚壁组织的存在，在常绿种内厚壁组织较多，落叶类型中厚壁组织较少。 3. 叶表皮形态 观察了瓦韦属51 个种的叶表皮形态和结构，发现该性状对于属下划分具有一定的系统学意义，也有助于疑难物种的鉴别。瓦韦属植物的叶表皮细胞形状通常为多边形、不规则；垂周壁式样为波状和浅波状；气孔器类型比较复杂，在所观察的类群中，气孔器都分布在下表皮上，极细胞型Polocytic type，共环极细胞型Copolocytic type ，腋下细胞型Axillocytic type ，聚腋下细胞型Coaxillocytic 是最常见的类型，不规则型Anomocytic type ，不规则四细胞型Anomotetracytic type，不等细胞型Anisocytic type，辐射状细胞型Actinocytic type 和双环不等四细胞型Amphicycloanisocytic type 也存在于瓦韦属的叶表皮中。属下同一个组的叶表皮特征近似，不同的组具有一定的差别。 4. 孢子形态 在扫描电镜下对瓦韦属50 个种的孢子形态进行了观察。瓦韦属的孢子两侧对称，极面观为椭圆形，赤道面观为肾形、豆形或半圆形。孢子的表面纹饰可以分为6 类，分别是光滑、颗粒状、瘤状、皱状、波状以及疣状的纹饰。瓦韦属的孢子周壁较薄，纹饰由外壁组成。孢子形态具有重要的系统学意义，可以为属下分类提供可靠的证据，对形态近似的物种的划分也有重要参考价值。 通过对大量标本的研究，以及模式标本的考证，结合野外居群观察，综合分析有关分类学资料，主要依据比较稳定的微观性状，对瓦韦属植物进行了新的分类学修订。结果承认中国瓦韦属（除薄叶组）有37 种，可以分为5 个组，有3 个名称被首次处理为异名，另有2 个种暂时存疑。

毛茛科铁线莲属长瓣铁线莲组的分类学修订

毛茛科（Ranunculaceae ）铁线莲属(Clematis L.)长瓣铁线莲组(Sect. Atragene) 植物全世界约有14－18 种，我国约有6 种，广泛分布于北温带的高山上。该组植物由于外部形态变异大，种间或种下划分十分困难，目前已发表的种及种下分类群名称多达130 余个，名称使用较为混乱，组内系统关系尚存争议。本文通过文献考证、标本研究、野外观察及形态性状统计分析的综合研究，对长瓣铁线莲组进行了全面的分类学修订，结果如下： 1、性状分析 深入研究了1000 余号该组植物标本的形态性状变异式样、范围及其相关性，发现复叶类型、小叶大小、萼片毛被和质地、萼片脉突出与否、退化雄蕊长度等是较为稳定的分种性状。生长习性、萼片颜色、萼片边缘是否具短绒毛带、退化雄蕊形状等对种下划分具有重要的意义。 2、分类学处理 1）根据该组植物的萼片和退化雄蕊的特征和演化趋势，建立了5 个新系：Ser. 1. Occidentales、Ser. 2. Alpinae、Ser. 3. Koreanae 、Ser.4. Tomentosae 和Ser. 5. Macropetalae 。 2）对长期以来分类上争议很大，且分类十分困难的类群作出以下新的处理：把C. sibirica 和C. ochotensis 作为C. alpina 的亚种；把日本的C. fusijamana 和C. fauriei 降级为半钟铁线莲C. alpina ssp. ochotensis 的变种；把伊犁铁线莲C. iliensis 降级为西伯利亚铁线莲C. alpina ssp. sibirica 的变种；把C. chiisanensis 降级为朝鲜铁线莲C. koreana 的变种；把紫红花长瓣铁线莲C. macropetala var. punicoflora 和石生长瓣铁线莲C. macropetala var. rupestris 处理为长瓣铁线莲C. macropetala 的异名；把C. dianae 归并入白色长瓣铁线莲C. macropetala var. albiflora；支持长白铁线莲C. nobilis 作为一个独立的种。此外，还新指定了5 个名称的后选模式；纠正了前人对中国C. subtriternata 的鉴定错误。 3）确认该组植物有9 种2 亚种和9 变种（包括3 新等级），给出了各个分类群详细的文献引证、描述、生境、地理分布、标本引证和外部形态图，并编写了组下分系和分种检索表。认为亚洲东北部是本组植物分布的多样性中心。 3、形态性状演化趋势和各系的亲缘关系 探讨了该组植物形态性状演化的趋势和新建立的5 个系的亲缘关系，提出：退化雄蕊可能由外部雄蕊演化而来，并沿两条路线演化发展：其一是退化雄蕊伸长，与萼片近等长或长于萼片，顶端渐狭，呈披针形；其二是退化雄蕊不伸长，与雄蕊近等长，上部加宽，顶端由钝形、圆形发展至微凹，呈匙形。萼片演化的趋势可能由质地薄到质地厚，萼片脉由不凸出到3 条脉凸出。由此推测北美洲类群Ser. Occidentales 可能是本组的原始类群；Ser. Macropetalae 可能是退化雄蕊在第一条演化路线上最进化的类群；Ser. Alpinae 和Ser. Koreanae 之间亲缘关系较近；Ser. Tomentosae 的系统位置尚未确定。

秦岭苔类植物的研究和中国剪叶苔属（Herbertus S. Gray）的分类学修订

本论文包括两部分的内容，第一部分是秦岭苔类植物的区系研究，第二部分是中国剪叶苔属Herbertus的分类学修订。 秦岭位于我国的中部，东经104º30´～112º52´，北纬32º50´～34º45´N，约76 500 km2。它主要位于陕西省的南部地区，并包括了河南、甘肃和湖北的部分县、市。秦岭的最高峰是太白山，海拔3 767米。秦岭是长江和黄河的分水岭，也是我国温带和亚热带气候的过渡地带。 本研究包含了对自19世纪开始对秦岭苔藓植物的主要采集活动的回顾，和截止2008年以来对秦岭苔类和角苔类植物报道的总结和分析，且首次给出了一份秦岭地区详细的苔类植物的名录，并包括了各个种在秦岭地区的详细分布。根据目前的研究，现已知秦岭的苔类植物有226种（包括种下单位，以下同），其中角苔纲1科3属6种，苔纲30科59属220种；提出了1个新异名：Radula constricta Steph.被处理为Radula lindenbergiana Gottsche var. atypa Massalongo的异名；并提出了1个新组合Metzgeria pubescens var. kinabaluensis (Kuwah) F.X. Li & Y. Jia；发现秦岭新分布的苔类有78种。根据种数，秦岭地区苔类的优势科为光萼苔科（34种），其次为耳叶苔科（23种），裂叶苔科（23种）和羽苔科（19种）。 通过对这些种地理成分的统计，发现秦岭苔类的地理成分以北温带成分为主，占35.05%；其次是东亚成分占到31.78%，这两种地理成分在秦岭占了很大比例，高达66.83%。热带成分相对较少，有22种，占到10.29%。对于苔类来说，中国特有成分在秦岭地区较多，已知有34种，占到15.89%。说明秦岭地区苔类地理成分以温带为主，热带成分占少量比例，且秦岭地区的特有性也比较高。 文章第二部分是对中国剪叶苔属Herbertus S. Gray的分类学修订。剪叶苔属隶属于剪叶苔科，是一个古老而自然的类群，广泛分布于热带和南北温带地区。剪叶苔属植物由于其叶横生或近于横生，侧叶2裂，腹叶2裂或部分不对称3裂，并具假肋，叶细胞具大的三角体而明显区别于苔类的其它属。虽然这个属的概念比较清楚，但在属内种间的划分上存在较大的问题，是苔类中分类较混乱的一个类群。剪叶苔属种的概念多基于叶片形态，包括裂瓣的顶端细胞和假肋的形态及叶基盘边缘附属物的形态。但这些形态特征具很大的可塑性，性状不稳定，造成该属种的概念很模糊。目前全世界剪叶苔属约100余种。中国剪叶苔属的种类尚不确定，《中国苔藓志》中报道了中国有25种l亚种，但Juslen在2006年对亚洲剪叶苔属的修订中，提到中国分布的仅有6种。二者的研究中都存在有一些疏漏和不足之处，对有些种还有争议；且他们的研究中引证的标本都很少，不能全面反映中国剪叶苔属的种类和分布情况。 本研究着手于中国的剪叶苔属，从模式标本入手，从模式标本入手，结合对前人文献中引证标本的查阅，并检视了全国各大标本馆收藏的大量该属的普通标本，对于分类归并上有争议的种，采用扫描电镜和分子生物学的手段进行实验性的研究，对中国的剪叶苔属进行一个全面系统的分类学修订。期望通过本研究，明确中国剪叶苔属的种类和分布情况，为东亚乃至世界剪叶苔属的分类修订提供一份翔实的资料。共查阅了剪叶苔属26个种的模式标本，并检视了中科院北京植物研究所、华南植物园和深圳仙湖植物园馆藏的大量该属植物标本，约600余份。 通过本研究，提出2个新异名：将H. buchii Juslén和H. longispinus var calvs Massalongo处理为H. dicranus (Taylor) Trevis.；将樱井剪叶苔H. sakuraii (Warnst.) S. Hatt.（原并入H. dicranus）和H. minimus Horik.（原并入H. dicranus）重新提出；发现1个中国新分布：H. setigerus (Steph.) H. A. Mill.；确认中国的剪叶苔属17种1亚种：剪叶苔H. aduncus (Dicks.) Gray，剪叶苔纤细亚种H. aduncus subsp. tenuis (A. Evans) H. A. Mill.et E. B. Bohrer，H. armitanus (Steph.) H. A. Mill.，南亚剪叶苔H. ceylanicus (Steph.) Abeyw.，长角剪叶苔H. dicranus (Taylor) Trevis.，高氏剪叶苔H. gaochienii Fu，广东剪叶苔H. guangdongii P.J. Lin & Piippo，卵叶剪叶苔H. herpocladioides Scott. et. Miller，红枝剪叶苔H. huerlimannii Miller，细指剪叶苔H. kurzii (Steph.) H. A. Mill.，长肋剪叶苔H. longifissus Steph.，长刺剪叶苔H. longispinus Jack et Steph.，H. minimus Horik.，长茎剪叶苔H. parisii (Steph.) H. A. Mill.，多枝剪叶苔H. ramosus (Steph.) H. A. Mill.，樱井剪叶苔H. sakuraii (Warnst.) S. Hatt.，短叶剪叶苔H. sendtneri (Nees) Lindb.和H. setigerus (Steph.) H. A. Mill.。本研究还在扫描电镜下观察了H. armitanus、长角剪叶苔H. dicranus和多枝剪叶苔H. ramosus的孢子形态。对于剪叶苔属的修订，还需要更多模式标本的借阅，随着研究深入，剪叶苔属的种类可能会有大量的减少，中国剪叶苔属的种类也将会有一定的减少。

A phylogeny of Chinese leaf monkeys using mitochondrial ND3-ND4 gene sequences

The phylogeny of Chinese leaf monkeys, especially the snub-nosed monkeys (Rhinopithecus), has not been thoroughly investigated using molecular sequence data, perhaps due to their rarity in the wild and their poor representation in institutional collections. Despite several proposed classifications, systematic relationships of these species remain poorly defined and this has hindered their conservation. To clarify the phylogenetic relationships of the leaf monkey clade in China, we sequenced the mitochondrial ND3, ND4L, ND4, tRNA(Arg), tRNA(His), tRNA(Ser), and tRNA(Leu) genes for Rhinopithecus bieti, R. roxellana, Trachypithecus francoisi, T. f. leucocephalus, and T. phayrei as well as Pygathrix nemaeus and Colobus guereza. We included a rotal of 2252 characters for each individual, excluding gaps in primary sequences. Our interpretation of the results from character- and distance-based phylogenetic analyses suggest that (1) Pygathrix nemaeus is sister to Rhinopithecus rather than to Trachypithecus though it is quite divergent from the former; (2) the Yunnan snub-nosed monkey, Rhinopithecus bieti, represents a valid species; (3) the white-headed leaf monkey is not a distinct species, but instead is a subspecies of Trachypithecus francoisi (T. f. leucocephalus), though it should still be considered a separate evolutionarily significant unit (ESU); and (4) because two individuals of the Phayrei's leaf monkey, T. phayrei, are genetically distinct from one another, a more extensive revision of the taxonomy of this putative species in China is needed. These results, plus ongoing work on the molecular systematics of the entire Asian leaf monkey radiation, can provide a sound basis for identifying the appropriate units of conservation for this endangered group of primates.

Sequencing, annotation and comparative analysis of nine BACs of giant panda (Ailuropoda melanoleuca)

A 10-fold BAC library for giant panda was constructed and nine BACs were selected to generate finish sequences. These BACs could be used as a validation resource for the de novo assembly accuracy of the whole genome shotgun sequencing reads of giant panda newly generated by the Illumina GA sequencing technology. Complete sanger sequencing, assembly, annotation and comparative analysis were carried out on the selected BACs of a joint length 878 kb. Homologue search and de novo prediction methods were used to annotate genes and repeats. Twelve protein coding genes were predicted, seven of which could be functionally annotated. The seven genes have an average gene size of about 41 kb, an average coding size of about 1.2 kb and an average exon number of 6 per gene. Besides, seven tRNA genes were found. About 27 percent of the BAC sequence is composed of repeats. A phylogenetic tree was constructed using neighbor-join algorithm across five species, including giant panda, human, dog, cat and mouse, which reconfirms dog as the most related species to giant panda. Our results provide detailed sequence and structure information for new genes and repeats of giant panda, which will be helpful for further studies on the giant panda.

Differentiation of subspecies of asiatic striped squirrels (Tamiops swinhoei) (Milne-Edwards) (Rodentia : Sciuridae) in China with description of a new subspecies

Based on the pelage characteristics and results of multivariate and univariate analyses, a new subspecies is described in this study, and a taxonomic revision of Tamiops swinhoei from China is presented. In total, 123 specimens of Tamiops swinhoei were in

Altitudinal Ranging of Black-Crested Gibbons at Mt. Wuliang, Yunnan: Effects of Food Distribution, Temperature and Human Disturbance

We studied the altitudinal ranging of one habituated group of black-crested gibbons (Nomascus concolor) at Dazhaizi, Mt. Wuliang, Yunnan, China, between March 2005 and April 2006. The group ranged from 1,900 to 2,680 m above sea level. Food distribution was the driving force behind the altitudinal ranging patterns of the study group. They spent 83.2% of their time ranging between 2,100 and 2,400 m, where 75.8% of important food patches occurred. They avoided using the area above 2,500 m despite a lack of human disturbance there, apparently because there were few food resources. Temperature had a limited effect on seasonal altitudinal ranging but probably explained the diel altitudinal ranging of the group, which tended to use the lower zone in the cold morning and the higher zone in the warm afternoon. Grazing goats, the main disturbance, were limited to below 2,100 m, which was defined as the high-disturbance area (HDA). Gibbons spent less time in the HDA and, when ranging there, spent more time feeding and travelling and less time resting and singing. Human activities directly influenced gibbon behaviour, might cause forest degradation and create dispersal barriers between populations. Copyright (C) 2010 S. Karger AG, Basel

A homogenous nature of native Chinese duck matrilineal pool

Background: China, with around 30 unique breeds, has a diverse duck genetic pool. Currently, there is no systematic report which investigates the genetic diversity, phylogenetic relationship, and matrilineal genetic structure of these domestic breeds and

A preliminary phylogenetic analysis of Metapenaeopsis (Decapoda : Penaeidae) based on mitochondrial dna sequences of selected species from the Indo-West Pacific

Phylogenetic relationships within Metapenaeopsis remain largely unknown. The modern revision of the genus suggests that the shape of the petasma, followed by the presence of a stidulating organ, are the most important distinguishing taxonomic features. In the present study, phylogenetic relationships were studied among seven Metapenaeopsis species from the Indo-West Pacific based on partial sequences of mitochondrial 16S rRNA and cytochrome c oxidase I (COI) genes. Mean sequence divergence was 6.4% for 16S and 15.8% for COI. A strikingly large nucleotide distance (10.0% for 16S and 16.9% for COI) was recorded between M. commensalis, the only Indo-West Pacific species with a one-valved petasma, and the other species with a two-valved petasma. Phylogenetic analyses using neighbor-joining, maximum parsimony, and maximum likelihood generated mostly identical tree topologies in which M. commensalis is distantly related to the other species. Two clades were resolved for the remaining species, one with and the other without a stridulating organ, supporting the main groupings of the recent taxonomic revision. Results of the present study also indicate that the deep-water forms represent a relatively recent radiation in Metapenaeopsis.

A logic for default reasoning

The need to make default assumptions is frequently encountered in reasoning about incompletely specified worlds. Inferences sanctioned by default are best viewed as beliefs which may well be modified or rejected by subsequent observations. It is this property which leads to the non-monotonicity of any logic of defaults. In this paper we propose a logic for default reasoning. We then specialize our treatment to a very large class of commonly occuring defaults. For this class we develop a complete proof theory and show how to interface it with a top down resolution theorem prover. Finally, we provide criteria under which the revision of derived beliefs must be effected.

有限信念集上修正的一种方法

讨论了信念集是有限子句集时的信念修正方法.首先给出了一阶逻辑上求所有极小不协调子集的一个过程,证明了该过程的正确性;然后讨论了由有极小不协调的子集来实现信念修正的方法,介绍所开发的信念修正的原型系统;最后与相关工作进行了比较.

信念修正的实现方法

本文对信念修正的典型方法,如基于语法结构的方法,基于模型测试方法,修正理论,修正理论基础,重复方法等用我们的算法来实现,并且完成了其相关工作。

岭鳅属(Oreonectes)鱼类的分类整理

本研究对岭鳅属鱼类进行了分类整理。对目前鉴定出的岭鳅属鱼类6 个种63 尾鱼类标本的28 个可量性状和6 个可数性状进行了测量和计数；对分类学上存 在疑问的种的测量数据进行了主成分分析。结合测量、计数以及主成分分析的结 果，并应用系统发育物种概念，评价岭鳅属鱼类物种的有效性，并描述岭鳅属鱼 类两新种。主要结论如下： 1. 岭鳅属的主要鉴别特征为：前、后鼻孔分开一短距离，前鼻孔位于一个管状 系统中，管状系统的末端延长成须状；骨质鳔囊为敞开型；上颌无齿状突起。 借此特征岭鳅属鱼类与条鳅亚科（Nemachilinae）其它属级类群完全区分开 来。 2. 小眼岭鳅（Oreonectes microphthalmus）采自广西都安、罗城。根据其尾鳍叉 形，眼睛退化仅残留一黑色素眼点，全身裸露无鳞，头部的眶下管孔为3+0 以及眶上管孔为7，将小眼岭鳅描述成岭鳅属一新种。 3. 多斑岭鳅（Oreonectes polystigmus）采自广西桂林大埠。根据其侧线不完全， 仅在头部后方有6 个侧线孔，头部的眶上管孔为7，眶下管孔为4+7 以及身 体布满不规则的斑点或斑块而将其描记成岭鳅属一新种。 4. 分布于广西都安的透明岭鳅（Oreonecetes translucens）与分布于贵州荔波的 长须盲副鳅（Paracobitis longibarbatus）、荔波盲条鳅（Nemacheilus liboensis） 和荔波岭鳅（Oreonectes liboensis）是同一物种，并根据其前鼻孔与后鼻孔紧 相邻、骨质鳔囊侧囊的后壁为骨质、雄性胸鳍外侧鳍条增宽变硬的特征，将 它们归属为高原鳅属（Triplophysa），有效名称为长须盲高原鳅（Triplophysa longibarbatus）。