不产子实体蛹虫草单孢子分离株的获得及RAPD分析

对优势蛹虫草原始菌株WWM04进行单孢子分离,共获得9个单孢子分离株,采用米饭培养基培养确证并且获得6个完全不产子实体的单孢子分离株。利用随机扩增多态性DNA(RAPD)分子标记方法对菌落差异的4个菌落特征典型的不产子实体单孢子分离株(SSP2、SSP7、SSP19和SSP21)、原始菌株以及由原始菌株12次转接后退化的菌株进行遗传多样性分析。结果表明,引物S37、S61对6个菌株的扩增谱带具有非常明显的特异性,该结果为蛹虫草退化分子标记奠定基础,并且在一定程度上也印证了蛹虫草异核现象和准性生殖理论。

利用RAPD-PCR探讨天蓝喇叭虫生物群系分化

选择天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)作为研究对象,对武汉市南湖、月湖、关桥3个水体共5个样点天蓝喇叭虫(S.coeruleus)样本的总DNA进行随机扩增多态DNA聚类分析,以检测各个样本的遗传相似性和趋异程度,借以评估样本间的遗传变异度。结果如下:(1)从98条随机引物中筛选12条引物共扩增出89条大小为100～1500bp的清晰条带,平均每条引物扩增出7.4条片段。(2)用Rapdistance1.04分析显示,不同样点样本之间存在着一定的变异,其遗传距离在0.076～0.416之间。

黄颡鱼与长须黄颡鱼种间的RAPD标记

国家重点基础研究发展计划项目(2004CB117405)资助

乌龟遗传多样性的RAPD分析

运用RAPD技术对乌龟的遗传多样性进行了分析。用 2 0个随机引物对 2 4个个体的基因组DNA进行了PCR扩增 ,一共扩增出 32 88条DNA片段 ,平均每个个体扩增出 137条带。在检测到的 137个位点中 ,多态位点数为 119个 ,占 86 9% ,标记的分子量在 0 .2kb— 3kb之间。个体间最大的遗传距离为 0 4 6 7,个体间最小的遗传距离为0 16 8。 2 4个个体的平均遗传距离为 0 32 4 +0 0 6 31。表明乌龟的遗传多样性水平较高。采用类平均聚类法(NJTREE)构

青海湖裸鲤繁殖群体遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对青海湖裸鲤的3个洄游繁殖群体-黑马河(HM)、布哈河(BH)及沙柳河(SL)群体各30个个体的DNA多态性进行了分析。用13个引物在三个群体中共检测出85个位点,其中多态性位点68个。青海湖裸鲤群体总的DNA多态位点百分率为80.0%。数据分析结果显示:青海湖裸鲤3个群体总的Nei基因多样性为0.3395,Shannon遗传多样性信息指数为0.4861,存在着较为丰富的遗传多样性。青海湖裸鲤3个群体间平均遗传距离为0.0788,基因分化系数Gst为0.1070,表

以RAPD方法分析岩原鲤分类地位

采用opaopoopq等系列44个随机引物对鲤亚科与亚科的几个种类进行随机扩增多态DNA(RAPD)扩增,通过对电泳结果进行系统分析,得出各种间遗传距离分支图.按节点的遗传距离最大数值0.232可以分出亲缘关系最远的两个群体,即由两种普通鲤为一群体,以及由岩原鲤、倒刺和白甲鱼组成的另一群体.从节点间遗传距离数值叠加计算可以得出岩原鲤与其他各种鱼类亲缘关系,遗传距离由近到远分别是:岩原鲤与倒刺(0.344)<岩原鲤与白甲鱼(0.388)<岩原鲤与普通鲤(0.443),岩原鲤与倒刺的遗传距离最小,这一

应用RAPD技术初步分析无裂栉江珧四种类型的基因组DNA

利用 3个随机引物 (S4 5 3,S4 5 4 ,S4 6 3)对无裂栉江珧 (Atrina pectinata L inaeus)的 4种类型 :青口、黄口、沙螺、棘螺基因组 DNA进行 RAPD分析 ,并对 RAPD的实验条件行了优化研究。10～ 2 0 ng的高纯度 DNA用作模板 ,退火温度为 39℃时 ,RAPD扩增的效率较高 ,扩增的带纹清晰可辨。3个引物中 ,引物 S4 5 3和 S4 6 3获得了清晰的 RAPD扩增结果 ,引物 S4 5 4未获得有效扩增 ,共扩增出 8条清晰的 DNA

中国鮡科鱼类RAPD分析及鰋鮡鱼类单系性的初步研究

国家自然科学重点基金课题 ( 39830 0 5 0 )资助

似鮈属鱼类遗传多样性的RAPD分析及种的划分问题

国家自然科学基金 ( 49832 0 10 )资助

鲢两个人工雌核发育家系的RAPD分析

国家科技攻关项目; 中国科学院知识创新工程项目 (KSCX21 0 5 )资助

两个人工雌核发育红白锦鲤群体的RAPD标记分析

采用 RAPD方法 ,对两个人工雌核发育红白锦鲤群体进行了多态性及分子标记分析。结果表明 ,同一雌核发育群体具有基本一致的扩增产物 ,而不同雌核发育群体间的扩增产物则有较大不同 ;并从 3 0个随机引物的扩增谱带中找到了 7个引物 (Opo- 7,Opo- 9,Opo- 1 2 ,Opo- 1 4,Opj- 4,Opj- 8和 Opj- 1 0 )的扩增谱带可以作为两个不同雌核发育群体间的遗传标记。由 UPGMA聚类法构建的分支系统树清晰地反映了两个雌核发育群体及其个体间的相互关系。

利用RAPD技术分析绵羊品种间遗传关系

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术研究分析了三种绵羊杂交品种及一种纯种绵羊的基因组DNA多态性。用 10个随机引物对各品种实验羊的基因组DNA进行扩增 ,平均每个品种观察到约 94个标记。扩增结果以RAPDistanceProgram软件分析表明 :中国美利奴羊A品系与中国美利奴羊B品系的随机扩增多态DNA共享度最高 ,它们构成的姊妹群依次与哈萨克羊、中国美利奴羊多胎品系成为对应的姊妹品种。

日本产和中国产中华细鲫的RAPD分析

使用 2 0个随机引物对日本和中国辽宁产中华细鲫、日本产Hemigrammocyprissp .和中国产稀有鲫各 4个个体的随机扩增 ,得到了大量DAN多态片段。通过Rapdplot程序将DAN的多态片段转换成遗传距离 (d =1 -S ,S =2NxNy/Nx +Ny)。该遗传距离的矩阵经Phylip软件包中Neighbor程序计算 ,生成了四个物种的相互关系分支图。从图中可以看出 ,分布于日本和中华细鲫有较近的遗传距离 ,然后是Hemigrammocypris,最后是稀有鲫。该结果说明分布于日本和

基于RAPD分析的高体鳑鮍地理分化研究

国家自然科学基金 3 9670 1 0 1、4 983 2 0 1 0资助

用RAPD技术对特化等级裂腹鱼类亲缘关系的探讨

为确定特化等级裂腹鱼类的遗传分化关系 ,对 7种 2 2个裂腹鱼个体进行随机扩增多态DNA(RAPD)研究。从所使用的 40个随机引物中 ,选择了 37个扩增带谱清晰的引物进行分析。根据构建的分子系统树显示 ,特化等级裂腹鱼类划分为 3个属级分类单元较为合适 ,这与采用形态学特征进行系统分析所得出的结论一致。在 2 2个个体之间遗传距离矩阵中 ,最大的遗传距离指数达到了 90 38% ,此外 ,还有较多的遗传距离指数也在 6 0 %～ 90 %之间。通过分析 ,认为用RAPD标记技术来分析属级或属级以上分