云南吕合中新世木贼属草问荆比较种及其古生态学研究

位于我国西南边陲的云南省今天以丰富的植物种类、复杂的植被类型，被誉为“绿色明珠”和“植物王国”，其现今格局的形成无疑是长期历史演化的结晶。探讨其植物区系成分的由来、植被演替的规律及其与环境的关系已经成为研究的热点问题。 新生代是云南植物王国形成和环境演变过程中的关键地质时期。本论文以新生代晚第三纪中新世吕合地区植物群为研究的切入点，对其中的木贼属（Equisetum L.）化石做了深入研究。 木贼属为早期陆地维管植物楔叶类唯一的现存代表，过去报道和研究的化石记录多集中在古生代和中生代，新生代的较少。 本文首次报道云南吕合中新世地层中发现的以地下根状茎和块茎形式保存的木贼属草问荆比较种（E. cf. pratense Ehrhart）。化石根状茎分明显的节和节间， 节部簇生1-4 串串珠状的块茎（每串块茎数目2-4 个），单个块茎椭圆形、圆球形、卵形或纺锤形，通常位于串珠末端的块茎顶端较尖。 木贼属现存两亚属：问荆亚属（8 个种，气孔与表皮齐平，地上茎一年生， 通常分枝，孢子囊穗顶端钝）和木贼亚属（7 个种，气孔凹陷于表皮，地上茎宿存，通常不分枝，孢子囊穗顶端尖）。问荆亚属中，除溪木贼（E. fluviatile L.） 和E. bogotense Kunth 外，其余6 个种都有块茎，而从未在木贼亚属中发现过块茎。具块茎的问荆亚属6 个种中，仅发现草问荆有2-3 个串联的块茎，其余种均为单个块茎。鉴于吕合发现的化石根状茎上着生块茎之特征和现代草问荆的情形一致，表明二者之间亲缘相近，故将吕合化石标本鉴定为草问荆比较种。 前人在北美、欧洲和亚洲的早白垩世到第三纪地层中，报道过14 种具根状茎和块茎的木贼类化石，其中具串珠状块茎的仅5 种。这些化石种与吕合标本有明显区别，如美国怀俄明州始新世的E. haydenii Lesquereux 根状茎的节部收缩，块茎有分枝。美国蒙大纳州渐新世至中新世的E. cf. arcticum Heer 和中国吉林始新世的E. hunchunense Guo 块茎在根状茎节上轮生。尽管据报道加拿大白垩纪E. perlaevigatum Cockerell 和辽宁北票早白垩世Equisetites longevaginatus Wu 有串珠状块茎结构，但原文提供的照片显示却只有单个块茎。 根据将今论古的原理，似可将化石的现存最近亲缘种草问荆的生境和物候调查结论，推演到发现草问荆比较种的云南吕合中新世地点及相应层位上。这样，不仅可以推测当时环境湿润，而且化石沉积的时间应为块茎形成的秋冬季节。结合前人在该产地发现喜热的亚热带成分壳斗科青冈属、栲属、金缕梅科枫香属等花粉和喜湿的桦木科桤木属花粉、杉科落羽杉型木以及红杉属的枝叶和球果，表明云南吕合中新世植被类型为常绿落叶阔叶混交林，气候类型为温暖湿润的亚热带气候。

河北中新世球果和果实及云南、浙江上新世化石木研究

本研究以河北围场县广发永化石点早中新世地层中的球果和果实、浙江宁海县杜岙化石点早上新世地层中的半矿化化石木、云南寻甸县金所和先锋化石点晚上新世地层中的丝炭和褐煤化木材为研究对象，对这三个化石点数百个植物大化石的形态或解剖结构进行了详细研究，鉴定出6个新的化石种，4个新记录种，7个未定种;其中2个化石属为我国新记录。根据其结构特征探讨这些化石类群与相关化石和现代植物的系统关系。并依据其现代亲缘种生长的生态和气候范围，对化石点沉积时期的植被和气候类型进行了推测。 果实中含有多种有价值的分类和系统发育的信息，对于种子植物的演化和系统发育研究具有重要的意义。在河北围场县发现大量保存较好的松科球果和姜科化石，为我们进一步研究松科植物和姜科植物解剖结构，以及探讨其系统演化提供难得的机会和直接的证据，同时为该化石地的植被演替和地层对比研究提供更多的植物学证据。对河北围场县广发永化石点球果和果实的形态研究，鉴定出三种松科球果化石种和一种姜科植物。分别为围场松（Pinus weichangensis sp. nov.）、围场云杉（Picea weichangensis sp. nov.）、围场铁杉（Tsuga weichangensis sp. nov.）以及化石Spirematospermum属未定种。其中围场云杉、围场铁杉球果在形态上与相应现代类群具有明显的差异，可能代表已灭绝的种类。Spirematospermum属未定种为一绝灭类型，是该属在我国的首次记录。这四种化石类群发现，反映早中新世化石该化石点气候与现代完全不同，为湿润的暖温带和亚热带气候。 浙江省在地质结构上位于东亚大陆边缘，是环太平洋岩浆活动带的重要组成部分。宁海县属于浙东南区属华南地层区，其第三纪地层嵊县群在该区分布广泛，其古植物研究仅限于孢粉和叶化石。本报告中首次对该层铜岭祝组的木化石进行了报道。对浙江宁海杜岙化石点早上新世地层中化石木样品的解剖研究，鉴定出三种木材类型，为史马库栎型木Quercus shimakurae、Liqumdambar cf. hisauchi和蔷薇科未定种。前者与现代栎属槲栎类、后者与枫香树属分别具有密切的亲缘关系，是我国首次报道栎属和枫香树属化石木。 云南现今复杂的地势地貌，独特的气候，丰富的植物种类和多样的植被类型是经历了长达数百万年的地质构造运动和自然环境演变的结果。第三纪时期由于大陆板块运动导致印度板块与亚洲板块的对接和碰撞，其地壳构造运动异常活跃。其第三系陆相地层广泛分布于古生代褶皱区的200多个互不相连的中、小型盆地及中、新生代断陷和拗陷型山间盆地中，并蕴涵了丰富的植物化石，为我们研究植被和植物演化提供了众多的证据。本次研究基于云南中部寻甸县金所煤矿和先锋煤矿的大量褐煤化和丝炭化材料，为进一步恢复云南晚第三纪气候和植被提供更多的依据，尤其是丝炭材料保存了木材精细而真实的结构，为木材准确鉴定和演化提供了可靠的依据。根据对云南金所和先锋化石点晚上新世沉积中褐煤化材料和丝炭样品解剖结构的研究，鉴定出8种化石木，包括2种裸子植物，5种双子叶植物和1种单子叶植物;分属5科7属。化石类群包括松属（Pinus）五针松组未定种Section Cembra sp.、云杉属未定种Picea sp、寻甸含笑Michelia xundianensis sp. nov.、多角含笑 Michelia angulata sp. nov.、Lithocarpoxylon cf. radiporosum、Castanoradix sp.、寻甸珍珠花Lyonia xundianensis sp. nov.、竹亚科未定种Bambusoideae sp。根据现今这些化石对应类群的生长和分布的气候区域，沉积时期的气候与现代气候较为接近。

中国西南地区晚二叠世莲座蕨目植物研究

本论文应用揭膜方法（Peeling Method）对产于我国西南地区滇东黔西一带晚二叠世地层中的保存有解剖构造的莲座蕨目化石进行了较为深入的研究，包括3 种茎和一种生殖器官。3 种茎中有二种为本文首次研究，均归入辉木属Psaronius Cotta，建立了二个新种：盘县辉木P. panxianensis 和老屋基辉木P. laowujiensis；另外一个种－田氏辉木P. tianii Li（MS）为前人所建立，但未正式发表，本文做了重新研究，新发现了一些特征，并对一些已有特征做了修订。讨论了这3 个种一些重要特征的分类和系统演化意义，这些特征包括：叶迹最后分出时的维管构型、维管束鞘和边缘茎维管束内侧的厚壁组织束。通过对不同地区和不同时代辉木属已有种的特征分析，对辉木属属下分类做了尝试，根据维管束是否结成环状、叶迹维管构型、是否具维管束鞘、边缘茎维管束内侧的厚壁组织束的发育与否、边缘茎维管束是否分叉等特征将辉木属已有种（包括本文所研究的3 个种）分为5 个组：1. Blicklei 组，代表种为Psaronius blicklei Morgan，包括欧美植物区目前已知各种，可能还包括华夏植物区的一些种。它们的主要特征是：不具维管束鞘；边缘茎维管束内侧的厚壁组织束不发育。2．Panxianensis 组，代表种为盘县辉木Psaronius panxianensis He，Wang，Hilton,Tian et Zhou，包括王氏辉木、老屋基辉木、江苏辉木，可能还有八角辉木和六角辉木。最主要特征是：具维管束鞘，简单，仅由薄壁细胞构成；边缘茎维管束内侧具树枝状和伞状或锚状厚壁组织束；叶迹由3 根维管束构成。该组目前仅发现于华南地区二叠系。3. Tianii 组，以田氏辉木Psaronius tianii Li（MS）为代表，目前只有这一个种。该组的主要特征：具维管束鞘，复杂，可分为两层；边缘茎维管束内侧具菊花状厚壁组织束，且每两环维管束之间具两条厚壁组织束，其中一条连续，另一条不连续；叶迹呈歪斜的弓形或M 形；叶迹维管束与茎维管束等粗；边缘茎维管束可分叉。该组目前仅发现于华南地区二叠系。4. Brasiliensis 组，以巴西辉木Psaronius brasiliensis Brongniart 为代表，除巴西辉木外，可能还包括P. sp. Herbst。该组的最主要特征就是其维管束的一端内卷并与主体部分连接形成一个封闭的环状构造；茎中央的维管束小，形态多变，而且排列十分不规则。该组目前仅发现于南美地区二叠系。5. Sinuosus 组，以P. sinuosus Herbst 为代表，目前也只有此一个种。其最主要的特征就是叶迹具多个维管束，且排列无规则；茎维管束非常长，呈盘绕状。该组目前仅发现于南美地区二叠系。生殖器官归入虫囊蕨属Scolecopteris（Zenker）Millay，建立一新种：贵州虫囊蕨。该种仅保存有聚合囊和分散的孢子囊，生殖小羽片不明。孢子囊面向外的壁较厚，但分化，自内向外可分为三部分；孢子具三缝，较大，直径55-60μm。由于该种同时拥有Millay 认为的原始特征（大的孢子）和进化特征（即分化的孢子囊面向外的壁）。很可能Millay 的观点仅仅反映了欧美植物区虫囊蕨属的演化规律。

The Homology and Relationship of Human (Homo sapiens) Chromosomes 1, 19 and Dusky Langur (Trachypithacus obscurus) Chromosomes 6, 8 Demonstrated with Chromosome Painting

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云南基诺族及汉族特发性全面强直-阵挛性癫(癎)与CLCN2基因的相关性

目的 研究氯离子通道CLC-2基因是否与中国云南地区基诺族及汉族特发性全面强直-阵挛性癫(癎)(IGTCS)相关.方法 以14例云南西双版纳傣族自治州景洪市基诺乡基诺族IGTCS患者及其16名未发病亲属、67例云南籍汉族IGTCS患者及57名云南籍汉族健康体检者为对照,对常染色体3q26上CLCN2基因的内含子2及外显子5、19(内含子18)进行研究,采用PCR及直接基因测序技术,应用病例-对照研究法对CLCN2基因与云南基诺族及汉族IGTCS进行相关性分析.结果 CLCN2基因的内含子2及外显子5、19在病例组和对照组中均没有发现已报道的易患突变,但我们在对外显子19的序列测定过程中发现了其上游内含子18的146位上存在1个单核苷酸多态性位点:146T→C.该位点的3种基因型(TT、TC、CC)在汉族病例组(9、3、29例)和汉族对照组(22、9、26例)之间的分布差异有统计学意义(x2=16.079,P＜0.05);在基诺族组(基诺族病例组+基诺族亲属组,6、12、12例)与汉族对照组(22、9、26例)之间分布差异亦有统计学意义(x2=7.027,P＜0.05).汉族病例组与汉族对照组间TT型与非TT型基因型(分别为9、32例和22、35例)、TC型与非TC型基因型(分别为3、38例和9、48例)比较差异有统计学意义(x2=10.694,OR=4.121,P＜0.05;x2=11.592,OR=0.238,P＜0.05).结论 CLCN2基因内含子18的多态性位点146T→C可能是中国云南地区基诺族与汉族IGTCS患者的1个相关性位点,且在本组有限的样本数量研究中,此SNP位点在两个民族IGTCS患者之间的分布无民族差异.基因型TT为IGTCS的1个保护性因素,基因型TC则增加了患者的易患性.

云南僰人源流的父系和母系遗传研究

对云南僰人32份男性DNA样本进行Y染色体单倍型以及mitochondrial DNA (mtDNA)单倍型分析,结果发现云南僰人的父系和母系遗传组分都表现出典型的南方人群的遗传特征.由僰人的数据结合已经发表的东亚人群的Y染色体和mtDNA单倍型(haplotype)数据进行Multidimensional Scaling(MDS)分析,结果表明,在MDS分布图中僰人群体的Y染色体单倍型和mtDNA单倍型都与南方人群聚在一起.这一结果支持僰人的遗传族源为东亚南方人群后裔,与考古学的推论相一致.结合历史和考古学证据来探讨僰人的起源和史前迁移,为揭开"僰人悬棺"这种独特的考古文化的起源和史前传播提供遗传学的研究证据.

利用相互染色体涂色技术分析两株人肺腺癌细胞系(A549和GLC-82)的核型特征(英文)

肺癌是全世界癌症死亡中的一个主要的原因。除吸烟外,一些肺癌患者的发病与氡气污染相关。该研究采用包括染色体分选、正向和反向染色体涂色技术,分析了两株肺腺癌细胞系A549和GLC-82的核型特征。A549和GLC-82细胞系都属于非小细胞肺癌细胞系,但诱因不同,后者来源于一个长期生活在氡气污染环境肺癌病人的癌组织。染色体涂色结果表明,这两株肺癌细胞系发生了复杂的染色体重排。在A549和GLC-82细胞系中,除正常染色体拷贝数变化外,还分别存在13条和24条畸变染色体。约一半的畸变染色体是通过非相互易位形成的,其余的畸变染色体则是通过一些正常染色体的片段缺失或重复而产生的。尽管这两株肺癌细胞系都没有共同的畸变染色体,但它们似共享两个染色体易位断裂点:HSA8q24和12q14。

云南不同地区绵羊血液蛋白多态性研究

本研究采用平板式淀粉胶蛋白电泳技术对来自德钦县、巧家县、腾冲县的绵羊进行了 34个同功酶及血液蛋白的研究 ,共检测 36个遗传座位 ,其中有 8个座位显示多态 ,德钦绵羊多态百分率P =0 .194 4 ,平均杂合度H =0 .0 6 4 7,平均等位基因数A =1.2 2 2 2 ;昭通绵羊P =0 .2 2 2 2 ,H =0 .0 6 5 1;A =1.2 2 2 2 ;腾冲绵羊P =0 .16 6 7,H =0 .0 6 0 8;A =1.16 6 7。表明云南不同地区绵羊在蛋白水平上遗传多样性较为丰富。运用Phylip3.5软件包中的”GENETDIST”计算标准遗传距离 ,再结合以往研究的数据 ,运用该软件包中的”NEIGHBOR”和”UPGMA”法进行聚类分析 ,结果表明 ,云南绵羊起源于同一共同祖先 ,云南绵羊与印度绵羊、尼泊尔绵羊关系较近 ,而与西藏绵羊关系较远

云南保种山羊血液同工酶遗传多样性研究

采用水平式淀粉胶电泳技术 ,对云南龙陵黄山羊、宁蒗黑头山羊、马关无角山羊和路南圭山羊等 4个保种山羊的 1 2 0个个体共 3 9个基因座位的基因多态性进行了研究。结果显示 ,云南 4个保种山羊品种在AKP、CES - 1、ESD、GOI、LAP、MDH、ME和NP基因座位出现多态。多态座位基因在不同保种山羊中分布不同。多态基因座位百分比 (P)在 4个保种山羊中分别为 0 .2 0 51 ,0 .1 53 8,0 .1 2 82和 0 .1 53 8。平均杂合度 (H)分别为 0 .0 95,0 .0 61 4 ,0 .0 4 67和 0 .0 662。用UPGMA法对由基因频率计算得到的Nei氏标准遗传距离进行聚类分析 ,结果表明云南保种山羊具地理分布及品种特点 ,龙陵黄山羊和其它 3个品种的遗传距离最远。

云南中甸尼西鸡的血液蛋白多态性研究

　采用水平式淀粉胶凝胶电泳技术和垂直式聚丙烯酰胺凝胶电泳技术检测了云南中 甸尼西鸡的血液蛋白多态，对33个样本的37个基因座位进行了分析，共有9个座位出现多态，分 别为ES-1、ES-2、AKP-1、AKP-2、LAP、PGM、CK、Tf及6PGD。多态位点百分比P=0.2432,平 均杂合度=0.1015,每个座位等位基因的平均数A=1.3784,结果表明尼西鸡的血液蛋白多态程度较 高，在蛋白质水平上的遗传多样性较为丰富。同时发现Amy-1座位只出现杂合子AB型。

GENETIC DIVERSITY IN THE CHINESE PANGOLIN (MANIS-PENTADACTYLA) INFERRED FROM PROTEIN ELECTROPHORESIS

We examined protein polymorphism of Chinese pangolins (Manis pentadactyla) from Yunnan Province of China, including two forms of three brown and nine dusky Chinese pangolins. Sixty-two genetic loci were screened; 12 loci were found to be polymorphic. The percentage of polymorphic loci (P) is 0.194, the mean individual heterozygosity (H) is 0.078, and the mean number of alleles (A) is 1.258. Furthermore, we calculated the genetic distance (D) between the two forms and found a low level of genetic divergence (D = 0.0206) between them, which indicates an almost-indistinguishable divergence at the level of proteins.

The origin of Mosuo people as revealed by mtDNA and Y chromosome variation

The Mosuo, living in the Lugu Lake area in northwest Yunnan Province, China, is the only matriarchal population in China. The Mosuo was officially identified as Naxi nationality although its relationship with Naxi remains controversial. We studied the gen

Characterization and Comparison of the Tissue-Related Modules in Human and Mouse

Background: Due to the advances of high throughput technology and data-collection approaches, we are now in an unprecedented position to understand the evolution of organisms. Great efforts have characterized many individual genes responsible for the interspecies divergence, yet little is known about the genome-wide divergence at a higher level. Modules, serving as the building blocks and operational units of biological systems, provide more information than individual genes. Hence, the comparative analysis between species at the module level would shed more light on the mechanisms underlying the evolution of organisms than the traditional comparative genomics approaches. Results: We systematically identified the tissue-related modules using the iterative signature algorithm (ISA), and we detected 52 and 65 modules in the human and mouse genomes, respectively. The gene expression patterns indicate that all of these predicted modules have a high possibility of serving as real biological modules. In addition, we defined a novel quantity, "total constraint intensity,'' a proxy of multiple constraints (of co-regulated genes and tissues where the co-regulation occurs) on the evolution of genes in module context. We demonstrate that the evolutionary rate of a gene is negatively correlated with its total constraint intensity. Furthermore, there are modules coding the same essential biological processes, while their gene contents have diverged extensively between human and mouse. Conclusions: Our results suggest that unlike the composition of module, which exhibits a great difference between human and mouse, the functional organization of the corresponding modules may evolve in a more conservative manner. Most importantly, our findings imply that similar biological processes can be carried out by different sets of genes from human and mouse, therefore, the functional data of individual genes from mouse may not apply to human in certain occasions.

Global distribution of Y-chromosome haplogroup C reveals the prehistoric migration routes of African exodus and early settlement in East Asia

The regional distribution of an ancient Y-chromosome haplogroup C-M130 (Hg C) in Asia provides an ideal tool of dissecting prehistoric migration events. We identified 465 Hg C individuals out of 4284 males from 140 East and Southeast Asian populations. We genotyped these Hg C individuals using 12 Y-chromosome biallelic markers and 8 commonly used Y-short tandem repeats (Y-STRs), and performed phylogeographic analysis in combination with the published data. The results show that most of the Hg C subhaplogroups have distinct geographical distribution and have undergone long-time isolation, although Hg C individuals are distributed widely across Eurasia. Furthermore, a general south-to-north and east-to-west cline of Y-STR diversity is observed with the highest diversity in Southeast Asia. The phylogeographic distribution pattern of Hg C supports a single coastal 'Out-of-Africa' route by way of the Indian subcontinent, which eventually led to the early settlement of modern humans in mainland Southeast Asia. The northward expansion of Hg C in East Asia started similar to 40 thousand of years ago (KYA) along the coastline of mainland China and reached Siberia similar to 15 KYA and finally made its way to the Americas. Journal of Human Genetics (2010) 55, 428-435; doi:10.1038/jhg.2010.40; published online 7 May 2010

A new family of antimicrobial peptides from skin secretions of Rana pleuraden

While conducting experiments to investigate antimicrobial peptides of amphibians living in the Yunnan-Guizhou region of southwest China, a new family of antimicrobial peptides was identified from skin secretions of the Yunnan frog, Rana pleuraden. Members