2 resultados para untargeted metabolomics

em Universidad Politécnica de Madrid


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Past studies of water stress in Eucalyptus spp. generally highlighted the role of fewer than five “important” metabolites, whereas recent metabolomic studies on other genera have shown tens of compounds are affected. There are currently no metabolite profiling data for responses of stress-tolerant species to water stress. We used GC–MS metabolite profiling to examine the response of leaf metabolites to a long (2 month) and severe (Ψpredawn < −2 MPa) water stress in two species of the perennial tree genus Eucalyptus (the mesic Eucalyptus pauciflora and the semi-arid Eucalyptus dumosa). Polar metabolites in leaves were analysed by GC–MS and inorganic ions by capillary electrophoresis. Pressure–volume curves and metabolite measurements showed that water stress led to more negative osmotic potential and increased total osmotically active solutes in leaves of both species. Water stress affected around 30–40% of measured metabolites in E. dumosa and 10–15% in E. pauciflora. There were many metabolites that were affected in E. dumosa but not E. pauciflora, and some that had opposite responses in the two species. For example, in E. dumosa there were increases in five acyclic sugar alcohols and four low-abundance carbohydrates that were unaffected by water stress in E. pauciflora. Re-watering increased osmotic potential and decreased total osmotically active solutes in E. pauciflora, whereas in E. dumosa re-watering led to further decreases in osmotic potential and increases in total osmotically active solutes. This experiment has added several extra dimensions to previous targeted analyses of water stress responses in Eucalyptus, and highlights that even species that are closely related (e.g. congeners) may respond differently to water stress and re-watering

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Los sectores de detección biológica demandan continuamente técnicas de análisis y diagnóstico más eficientes y precisas para identificar enfermedades y desarrollar nuevos medicamentos. Actualmente se considera que hay una gran necesidad de desarrollar herramientas de diagnóstico capaces de asegurar sensibilidad, rapidez, sencillez y asequibilidad para aplicaciones en sectores como la salud, la alimentación, el medioambiente o la seguridad. En el ámbito clínico se necesitan profundos avances tecnológicos capaces de ofrecer análisis rápidos, exactos, fiables y asequibles en coste y que tengan como consecuencia la mejora clínica y económica a partir de un diagnóstico eficiente. En concreto, hay un interés creciente por la descentralización del diagnóstico clínico mediante plataformas de detección cercanas al usuario final, denominadas POCs (Point Of Care devices). La utilización de POCs (referidas al diagnóstico cercano al usuario final o fuera del laboratorio de análisis clínico), mediante detección in vitro (IVD), será extremadamente útil en centros de salud, clínicas o unidades hospitalarias, entornos laborales o incluso en el hogar. Por otra parte, el desarrollo de la genómica, proteómica y otras tecnologías conocidas como “omics” (sufijo en inglés para referirse, por ejemplo, a genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, lipidomics) está incrementando la demanda de nuevas tecnologías mucho más avanzadas con una clara orientación hacia la medicina personalizada y la necesidad de hacer frente a cambios en los tratamientos en el caso de enfermedades complejas. Desde hace poco tiempo se han definido las Celdas Biofónicas (BICELLs) como una metodología novedosa para la detección de agentes biológicos que ofrecen una serie de características que las hacen interesantes como son: Capacidad de multiplexación, alta sensibilidad, posibilidad de medir en gota, compatible con otras tecnologías. En este trabajo se hace un estudio y optimización sobre diferentes tipos de BICELLs y se valoran una serie de figuras de merito a tener en cuenta desde el punto de vista del lector óptico a emplear.