Effect of different exercise modalities plus a hypocaloric diet on inflammation markers in overweight patients

Summary Background & aims Inflammation markers (IM) have been associated with the development of chronic diseases. This study compares the effects on IM of three exercise programs combined with a hypocaloric diet. Methods 119 overweight participants (73 women, 46 men) aged 18–50 years were randomised into four treatment groups: strength training (S; n = 30), endurance training (E; n = 30), combined S + E (SE; n = 30), and a diet and physical activity recommendations group (D; n = 29). Energy intake, anthropometric variables (AV), training variables (VO2peak, strength index, dynamometric strength index [DSI]) and plasma IM were recorded at baseline and after 22 weeks of treatment. Results 84 participants completed the study. At 22 weeks, all groups showed a significantly reduced energy intake (P < 0.001) and improved AV (P < 0.001). VO2peak significantly increased in all groups (P < 0.01). DSI increased in the exercise groups only (P < 0.05). Plasma leptin fell significantly (P < 0.001) in the S and E groups, but not significantly in the SE group (P = 0.029) (no significant differences between these groups). Tumour necrosis factor-α (TNF-α), and C-reactive protein (CRP) concentrations decreased in all groups when examined together, but not when examined separately. No significant differences were seen in interleukin-6 (IL-6). Conclusions Combining strength or endurance training with a hypocaloric diet improved AV and reduced plasma leptin concentrations. No differences were seen between groups in terms of TNF-α, IL-6 or CRP reduction. This trial was registered at clinical trials.gov as NCT01116856. http://clinicaltrials.gov/.

Fusarium proliferatum isolated from garlic in Spain: Identification, toxigenic potential and pathogenicity on related Allium species

Fusarium proliferatum has been reported on garlic in the Northwest USA, Spain and Serbia, causing water-soaked tan-colored lesions on cloves. In this work, Fusarium proliferatum was isolated from 300 symptomatic garlic bulbs. Morphological identification of Fusarium was confirmed using species-specific PCR assays and EF-1α sequencing. Confirmation of pathogenicity was conducted with eighteen isolates. Six randomly selected F. proliferatum isolates from garlic were tested for specific pathogenicity and screened for fusaric acid production. Additionally, pathogenicity of each F. proliferatum isolate was tested on healthy seedlings of onion (Allium cepa), leek (A. porrum), scallions (A. fistulosum), chives (A. schoenoprasum) and garlic (A. sativum). A disease severity index (DSI) was calculated as the mean severity on three plants of each species with four test replicates. Symptoms on onion and garlic plants were observed three weeks after inoculation. All isolates tested produced symptoms on all varieties inoculated. Inoculation of F. proliferatum isolates from diseased garlic onto other Allium species provided new information on host range and pathogenicity. The results demonstrated differences in susceptibility with respect to host species and cultivar. The F. proliferatum isolates tested all produced fusaric acid (FA); correlations between FA production and isolate pathogenicity are discussed. Additionally, all isolates showed the presence of the FUM1 gene suggesting the ability of Spanish isolates to produce fumonisins.

Brain tissue segmentation on Diffusion Weighted Magnetic Resonance data

Introduction Diffusion weighted Imaging (DWI) techniques are able to measure, in vivo and non-invasively, the diffusivity of water molecules inside the human brain. DWI has been applied on cerebral ischemia, brain maturation, epilepsy, multiple sclerosis, etc. [1]. Nowadays, there is a very high availability of these images. DWI allows the identification of brain tissues, so its accurate segmentation is a common initial step for the referred applications. Materials and Methods We present a validation study on automated segmentation of DWI based on the Gaussian mixture and hidden Markov random field models. This methodology is widely solved with iterative conditional modes algorithm, but some studies suggest [2] that graph-cuts (GC) algorithms improve the results when initialization is not close to the final solution. We implemented a segmentation tool integrating ITK with a GC algorithm [3], and a validation software using fuzzy overlap measures [4]. Results Segmentation accuracy of each tool is tested against a gold-standard segmentation obtained from a T1 MPRAGE magnetic resonance image of the same subject, registered to the DWI space. The proposed software shows meaningful improvements by using the GC energy minimization approach on DTI and DSI (Diffusion Spectrum Imaging) data. Conclusions The brain tissues segmentation on DWI is a fundamental step on many applications. Accuracy and robustness improvements are achieved with the proposed software, with high impact on the application’s final result.

Desarrollo de un API RESTFUL en Symfony2 y un SDK isomorfo para dicho API en ECMAScript6

Resumen El documento que se desarrolla en los siguientes capítulos ha sido realizado como Proyecto de Fin de Grado para el Grado de Ingeniería del Software (Plan 2009) impartido por la Escuela Técnica Superior de Ingeniería de Sistemas Informáticos de la Universidad Politécnica de Madrid durante el curso académico 2014-2015 y bajo la tutela del Dr. Francisco Javier Gil Rubio, profesor del Departamento de Organización y Estructura de la Información (Actualmente DSI). La empresa Radmas Technologies pretende proporcionar con el producto Mejora Tu Ciudad —su solución para la gestión integral de Smart-Cities— un servicio REST interoperable y una capa de abstracción para el lenguaje Javascript. El presente proyecto se centra en la definición y creación de un API RESTFUL sobre la que los distintos clientes puedan interactuar con la plataforma independientemente de las herramientas de desarrollo utilizadas. Tras la definición del servicio se llevará a cabo la creación de un SDK1 válido en distintas plataformas basadas en Javascript, que facilite el acceso a aquellos clientes que utilicen dichas plataformas como punto de partida para iniciar otros desarrollos derivados. Con este pretexto nace un proyecto que pretende también cubrir todas las fases del ciclo de vida de un producto de software, ciertamente particular en este caso, ya que se trata de un ecosistema que comprende dos soluciones enfocadas hacia la interoperabilidad, una genérica y otra orientada a una única plataforma de destino, y que a su vez servirán como base para llevar a cabo futuros desarrollos. Por todo lo expuesto, el proyecto cubrirá las siguientes etapas:  Estudio de la problemática: se describe la situación en la que se encuentra la compañía y los motivos por los que se propone la creación de un API REST2 y más tarde la elaboración de un Kit de Desarrollo de Software (SDK) orientado exclusivamente a plataformas basadas en Javascript como solución a las necesidades de los potenciales clientes.  Estudio teórico de las distintas tecnologías y protocolos disponibles en los cuales se sustentarán los desarrollos que se lleven a cabo.  Estimación de tiempos, planificación y gestión de tareas mediante metodologías ágiles y desarrollo del producto.  Creación de una batería de pruebas y generación de un entorno para ejecutarlas que permita cubrir los distintos casos de uso requeridos por el usuario. También se hará uso, siempre que sea posible, de la metodología de trabajo conocida como TDD3 o Desarrollo Dirigido por las Pruebas.  Generación de documentación orientada a desarrolladores exponiendo las bondades y las técnicas de uso del ecosistema definido.  Creación de un conjunto de ejemplos que sirvan como punto de partida para llevar a cabo futuros desarrollos. Las fases anteriormente descritas se apoyan en los conocimientos recibidos en las distintas asignaturas que ofrece la titulación. Por tanto, haré frecuentes referencias a aquellas que tratan aspectos como los procesos de Ingeniería de Software (a través de un análisis y diseño coherentes de la estructura de la aplicación) y a la gestión de proyectos (haciendo especial hincapié en lo aprendido sobre metodologías ágiles), así como algunas de carácter más técnico que sin duda influirán en la generación de un código correcto y probado. Por todo ello este Trabajo de Fin de Grado pretende ser un desarrollo multidisciplinar en el que se obtenga como resultado un producto profesional, que haga uso de tecnologías y servicios de rabiosa actualidad y ejemplifique la realidad de los desarrollos de software modernos.

Determining the elastic-plastic properties of metallic materials through instrumented indentation

En los últimos años, y asociado al desarrollo de la tecnología MEMS, la técnica de indentación instrumentada se ha convertido en un método de ensayo no destructivo ampliamente utilizado para hallar las características elástico-plásticas de recubrimientos y capas delgadas, desde la escala macroscópica a la microscópica. Sin embargo, debido al complejo mecanismo de contacto debajo de la indentación, es urgente proponer un método más simple y conveniente para obtener unos resultados comparables con otras mediciones tradicionales. En este estudio, el objetivo es mejorar el procedimiento analítico para extraer las propiedades elástico-plásticas del material mediante la técnica de indentación instrumentada. La primera parte se centra en la metodología llevada a cabo para medir las propiedades elásticas de los materiales elásticos, presentándose una nueva metodología de indentación, basada en la evolución de la rigidez de contacto y en la curva fuerza-desplazamiento del ensayo de indentación. El método propuesto permite discriminar los valores de indentación experimental que pudieran estar afectados por el redondeo de la punta del indentador. Además, esta técnica parece ser robusta y permite obtener valores fiables del modulo elástico. La segunda parte se centra en el proceso analítico para determinar la curva tensión-deformación a partir del ensayo de indentación, empleando un indentador esférico. Para poder asemejar la curva tension-deformación de indentación con la que se obtendría de un ensayo de tracción, Tabor determinó empíricamente un factor de constricción de la tensión () y un factor de constricción de la deformación (). Sin embargo, la elección del valor de y  necesitan una derivación analítica. Se describió analíticamente una nueva visión de la relación entre los factores de constricción de tensión y la deformación basado en la deducción de la ecuación de Tabor. Un modelo de elementos finitos y un diseño experimental se realizan para evaluar estos factores de constricción. A partir de los resultados obtenidos, las curvas tension-deformación extraidas de los ensayos de indentación esférica, afectadas por los correspondientes factores de constricción de tension y deformación, se ajustaron a la curva nominal tensión-deformación obtenida de ensayos de tracción convencionales. En la última parte, se estudian las propiedades del revestimiento de cermet Inconel 625-Cr3C2 que es depositado en el medio de una aleación de acero mediante un láser. Las propiedades mecánicas de la matriz de cermet son estudiadas mediante la técnica de indentación instrumentada, haciendo uso de las metodologías propuestas en el presente trabajo. In recent years, along with the development of MEMS technology, instrumented indentation, as one type of a non-destructive measurement technique, is widely used to characterize the elastic and plastic properties of metallic materials from the macro to the micro scale. However, due to the complex contact mechanisms under the indentation tip, it is necessary to propose a more convenient and simple method of instrumented indention to obtain comparable results from other conventional measurements. In this study, the aim is to improve the analytical procedure for extracting the elastic plastic properties of metallic materials by instrumented indentation. The first part focuses on the methodology for measuring the elastic properties of metallic materials. An alternative instrumented indentation methodology is presented. Based on the evolution of the contact stiffness and indentation load versus the depth of penetration, the possibility of obtaining the actual elastic modulus of an elastic-plastic bulk material through instrumented sharp indentation tests has been explored. The proposed methodology allows correcting the effect of the rounding of the indenter tip on the experimental indentation data. Additionally, this technique does not seem too sensitive to the pile-up phenomenon and allows obtaining convincing values of the elastic modulus. In the second part, an analytical procedure is proposed to determine the representative stress-strain curve from the spherical indentation. Tabor has determined the stress constraint factor (stress CF), and strain constraint factor (strain CF), empirically but the choice of a value for and is debatable and lacks analytical derivation. A new insight into the relationship between stress and strain constraint factors is analytically described based on the formulation of Tabor’s equation. Finite element model and experimental tests have been carried out to evaluate these constraint factors. From the results, representative stress-strain curves using the proposed strain constraint factor fit better with the nominal stress-strain curve than those using Tabor’s constraint factors. In the last part, the mechanical properties of an Inconel 625-Cr3C2 cermet coating which is deposited onto a medium alloy steel by laser cladding has been studied. The elastic and plastic mechanical properties of the cermet matrix are studied using depth-sensing indentation (DSI) on the micro scale.