AINFO versão 5.0: manual on-line.

Introdução; Conhecendo o AINFO; Gerenciador de Dados e outros procedimentos especiais; Administrando o AINFO; Atualizando as bases de dados; Sobre as bases de dados; Imprimindo relatórios; Sobre o SIR - Recuperação de Informação; Descrição dos campos; Descrição dos relatórios; Anexos.

Determinação da estrutura e estudo da função da metalotioneína de Synechococcus com ferramentas da bioinformática.

Este trabalho abordou a análise estrutural das MTs a fim de se modelar esta proteína e com isso compreender melhor o funcionamento da mesma. O conhecimento da cianobactéria e uma completa análise da MT poderia ser muito útil em um estudo de utilização desta na técnica da biorremediação para remover metais pesados do solo e da água decorrentes das praticas agrícolas atuais.

Utilização de alinhamento estrutural de proteínas no estudo de Interface Forming Residues de proteína-quinases com inibidores protéicos.

Alinhamento estrutural de proteínas e análise de interação proteína-inibidor. As proteínas-quinases (PK) como alvo biológico. Três grupos de estruturas diferentes no domínio catalítico de PK. Superposição dos dados obtidos no alinhamento sequencial e estrutural.

Manual de catalogação: descrição de recursos eletrônicos na Agência de Informação Embrapa: versão 1.2.

2005

CodeCharge: gerador de códigos para aplicações Web.

Características do CodeCharge.

Uso da técnica de mínimos quadrados ponderados para ajuste de modelos ao semivariograma.

O objetivo deste trabalho é comparar o método de estimação dos mínimos quadrados ponderados para ajuste de modelos ao semivariograma com o método de tentativa e erro, muito usado na prática, pela técnica de auto-validação "jack- knifing".

MIPWeb: uso da internet na gestão dos dados gerados pelo manejo integrado de pragas.

Sistema MIPWeb. Arquitetura do sistema. Versão cliente ou local. Versão servidor. Requisitos computacionais. Dados gerenciados. Operação do sistema. Operações realizadas na versão local do sistema. Operações realizadas na versão servidor.

Proposta de utilização de mineração de textos para seleção, classificação e qualificação de documentos.

Introduçaõ. Revisão de literatura. proposta de aplicação da Agência. Hipóteses. Resultados esperados. Trabalhos futuros.

Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas.

Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles obtidos pelas principais técnicas para seleção de parâmetros na literatura.Termos para indexação classificação de enzimas,predição de função de proteínas, estruturas de proteínas, banco de dados de proteínas, seleção de parâmetros, métodos para classsificação de dados.

Modelo de difusão anisotrópica para detecção de bordas.

Modelo de difusão anisotrópica. Estudo de caso . Referências bibliográficas. Conclusões.

Sistema de suporte ao planejamento e levantamento agrícola municipal.

2006

Implementação da transformada de Fourier com o Java Advanced Imaging.

O objetuvo deste comunicado é apresentar a implementação Java da transformada discreta de Fourier e sua inversa, usando a biblioteca Java Advanced Imaging (JAI), para mapeamento entre os domínios espacial e de frequência em imagens digitais.

Filtro de difusão linear complexa para detecção de bordas: implementação Java.

O objetivo deste comunicado é mostrar a implementação Java do filtro de difusão linear complexa para a detecção de bordas.

Rotâmeros raros no Java Protein Dossier.

O objetivo do STING é oferecer uma plataforma para análise e visualização de estruturas proteicas.

Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer.

O software Sting é um software voltado para a Bioinformática e, d eforma geral, faz análise de estrutura de proteínas e mostra de forma especializada qualquer proteína cuja estrutura está em arquivos .pdf, que contém dados sobre proteínas, podendo ser acessados em Research Collaboratory for Structural Bionformatics.