Avaliação do desempenho relativo de bancos de dados NoSQL para arquivos de genótipos.


Autoria(s): SCHETTINO, V. J.; ALMEIDA, A. L.; SILVA, L. R. M.; ARBEX, W. A.
Contribuinte(s)

Vinícius Junqueira Schettino, UFJF; Arthur Lorenzi Almeida, UFJF; Leojayme Rodrigues Manso Silva, UFJF; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL.

Data(s)

2016

12/09/2016

Resumo

A bioinformática e a genômica trabalham com bases de dados fora do padrão tradicional ou clássico que, por sua vez, caracterizam-se pela organizacão tabular e pelo tratamento destas em SGBDRs. Arquivos de genótipos são exemplos de bases de dados não clássicas e são caracterizados por serem gerados como arquivos textos, com dados desbalanceados, com alta dimensionalidade e por ocuparem muito espaço, entre outros aspectos. Os SGBDRs não têm se mostrado uma boa solucão para o tratamento de tais bases e, portanto, o presente trabalho busca avaliar o desempenho relativo entre bancos de dados NoSQL que representam duas famílias de diferentes modelo de dados, a partir de cenários de teste para a manipulação de arquivos de genótipo.

2016

Formato

p. 306-309

Identificador

22899

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1052648

Idioma(s)

pt_BR

Publicador

In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO, 36., 2016, Porto Alegre. Anais... Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2016.

Relação

Embrapa Gado de Leite - Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-Chave #Bioinformática #Genômica
Tipo

Artigo em anais de congresso (ALICE)