Avaliação de nova estratégia extrativa, baseada em NTDs, combinada com dados de análise cromatigráfica e quimiométrica para a deteção de biomarcadores de diferentes tipos de cancro


Autoria(s): Figueira, Priscilla Felício Porto
Contribuinte(s)

Câmara, José de Sousa

Pereira, Jorge Augusto Machado

Data(s)

09/01/2017

01/09/2016

09/06/2018

Resumo

A elevada incidência e mortalidade mundiais associadas ao cancro justificam o desenvolvimento e implementação de estratégias eficazes e não-invasivas conducentes a um diagnóstico precoce. Neste contexto, pretendeu-se avaliar a performance de uma metodologia inovadora, a microextração por “needle trap” (NTME), na extração de metabolitos voláteis (VOMs) da urina de pacientes oncológicos com diferentes tipos de cancro - cólon, pulmão e mama, e de indivíduos saudáveis, com a finalidade de identificar um conjunto de VOMs potenciais biomarcadores dos diferentes tipos cancros em estudo. De modo a maximizar a eficiência da extração dos VOMs, foram otimizados diferentes parâmetros experimentais, nomeadamente a natureza do sorvente, a temperatura, o tempo de equilíbrio, o volume de headspace, a força iónica, o pH do meio e o volume e a agitação da amostra. Usando como sorvente o DVB/Car1000/CarX, os melhores resultados foram obtidos com 4 mL de urina acidificada (pH= 2), 20% NaCl, 40 mL de headspace e 40 min de equilíbrio a 50 °C. Foi ainda avaliada a estabilidade dos VOMs no sorvente até 72 h após a extração. Nos quatro grupos em estudo foram identificados, por GC-MS, 259 VOMs pertencentes a diversas famílias químicas, nomeadamente cetonas, compostos sulfurados, furânicos e terpénicos. A matriz de dados obtida para cada grupo em estudo foi submetida a análise discriminante, usando o método dos mínimos quadrados parciais (PLS-DA), que resultou em clusters distintos diferenciadores de cada grupo. A aplicabilidade do modelo foi avaliada através do método de classificação SIMCA (modelagem suave e independente de analogias de classe), com elevadas taxas de classificação, sensibilidade e especificidade. Este foi o primeiro estudo usando NTME para o estabelecimento do padrão volatómico da urina. Os resultados obtidos revelam-se muito promissores originando perfis voláteis de maior expressividade, mais completos e abrangentes, que os obtidos usando metodologias de referência.

Identificador

http://hdl.handle.net/10400.13/1333

Idioma(s)

por

Relação

Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT) pelo financiamento do projeto estratégico do CQM (UID/QUI/00674/2013) e do projeto New Indigo (New-INDIGO/0003/2012)

Direitos

embargoedAccess

Palavras-Chave #Bioquímica #Avaliação #Estratégia extrativa #NTME #MVSA #GC-qMS #Amostras #Urina #VOMs #Análise multidimensional #Doenças Tropicais #NTDs #Análise de dados #Cromotografia #Quimioterapia #Metrologia #Biometria #Biomarcadores #Cancro #Cólon #Pulmão #Mama #Bioquímica Aplicada #. #Faculdade de Ciências Exatas e de Engenharia #Domínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia::Engenharia Química #Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Biotecnologia Médica
Tipo

masterThesis