Entwicklung einer real-time RT-PCR zum Nachweis von equinem Influenzavirus
Data(s) |
01/04/2015
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Resumo |
Equine Influenza ist eine durch Influenza A-Viren verursachte, kontagiöse Respirationserkrankung beim Pferd. In dieser Arbeit wurde eine real-time RT-PCR in einem konservierten Abschnitt des Matrix-Segments des viralen Genoms für die schnelle und sensitive Diagnose von equinen Influenzaviren (EIV) und je eine RT-PCR Methode im Matrix- und im HA-Segment für die molekular-epidemiologische Charakterisierung der Viren entwickelt. Die Primer der real-time RT-PCR sind zu 99.4% der bekannten EIV-Sequenzen und zu 97.7% aller Influenza A-Sequenzen homolog. Die Homologie der Minor Groove Binder (MGB)-Sonde lag bei 99.3% und 99.6%. Diese hohen Werte ermöglichen die Anwendung des Assays für Influenzaviren bei anderen Spezies. Die diagnostische Eignung der Methode wurde mit Hilfe von 20 equinen, 11 porcinen sowie 2 aviären Proben verifiziert. Eine hohe Spezifität für Influenzaviren wurde experimentell und mittels Software-Simulation gezeigt. Die analytische Sensitivität des Tests lag bei 102–103 RNA-Kopien und 100–101 DNA-Kopien, was den Virusnachweis auch bei geringer Virusausscheidung ermöglicht. Alle amplifizierten EIV-Sequenzen konnten phylogenetisch den bekannten Linien zugeordnet werden. |
Formato |
application/pdf |
Identificador |
http://boris.unibe.ch/72560/1/Entwicklung%20einer%20real-time%20RT-PCR.pdf Aeschbacher, Susanne; Santschi, Elisabeth; Gerber, Vinzenz; Stalder, Hanspeter; Zanoni, Reto Giacomo (2015). Entwicklung einer real-time RT-PCR zum Nachweis von equinem Influenzavirus. Schweizer Archiv für Tierheilkunde, 157(4), pp. 191-201. Huber 10.17236/sat00015 <http://dx.doi.org/10.17236/sat00015> doi:10.7892/boris.72560 info:doi:10.17236/sat00015 urn:issn:0036-7281 |
Idioma(s) |
deu |
Publicador |
Huber |
Relação |
http://boris.unibe.ch/72560/ |
Direitos |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
Fonte |
Aeschbacher, Susanne; Santschi, Elisabeth; Gerber, Vinzenz; Stalder, Hanspeter; Zanoni, Reto Giacomo (2015). Entwicklung einer real-time RT-PCR zum Nachweis von equinem Influenzavirus. Schweizer Archiv für Tierheilkunde, 157(4), pp. 191-201. Huber 10.17236/sat00015 <http://dx.doi.org/10.17236/sat00015> |
Palavras-Chave | #630 Agriculture |
Tipo |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion PeerReviewed |