A study of neolignan compounds with biological activity against Paracoccidioides brasiliensis by using quantum chemical and chemometric methods

Métodos quimiométricos (estatísticos) são empregados para classificar um conjunto de compostos derivados de neolignanas com atividade biológica contra a Paracoccidioides brasiliensis. O método AM1 (Austin Model 1) foi utilizado para calcular um conjunto de descritores moleculares (propriedades) para os compostos em estudo. A seguir, os descritores foram analisados utilizando os seguintes métodos de reconhecimento de padrões: Análise de Componentes Principais (PCA), Análise Hierárquica de Agrupamentos (HCA) e o método de K-vizinhos mais próximos (KNN). Os métodos PCA e HCA mostraram-se bastante eficientes para classificação dos compostos estudados em dois grupos (ativos e inativos). Três descritores moleculares foram responsáveis pela separação entre os compostos ativos e inativos: energia do orbital molecular mais alto ocupado (EHOMO), ordem de ligação entre os átomos C1'-R7 (L14) e ordem de ligação entre os átomos C5'-R6 (L22). Como as variáveis responsáveis pela separação entre compostos ativos e inativos são descritores eletrônicos, conclui-se que efeitos eletrônicos podem desempenhar um importante papel na interação entre receptor biológico e compostos derivados de neolignanas com atividade contra a Paracoccidioides brasiliensis.

ABSTRACT: Chemometric (statistical) methods are employed to classify a set of neolignan compounds with activity against Paracoccidioides brasiliensis. The AM1 (Austin Model 1) method was used to calculate a set of molecular descriptors (properties) of the neolignan compounds under study. The descriptors were further analyzed using Principal Components Analysis (PCA), Hierarchical Cluster Analysis (HCA) and K-Nearest Neighbor (KNN) chemometric methods. The PCA and HCA methods were quite efficient to classify the compounds into two groups (active and inactive) and three descriptors were found to be important in the classification: the highest occupied molecular orbital energy (EHOMO), the bond order between C1'-R7 atoms (L14) and the bond order between C5' -R6 atoms (L22). The three variables responsible for the separation between active and inactive compounds are all electronic descriptors, therefore we can conclude that electronic effects should have an important role when one is trying to understand the activity of neolignan compounds against Paracoccidioides brasiliensis.