Perfil de resistência genótica do HIV-1 em pacientes com falha na terapia antirretroviral atendidos pela Rede Nacional de Genotipagem (RENAGENO) na região de Botucatu, SP-Brasil

Pós-graduação em Pesquisa e Desenvolvimento (Biotecnologia Médica) - FMB

Os antirretrovirais (ARVs) interferem nas enzimas virais resultando na inibição da replicação do HIV. O uso combinado destas drogas tem demonstrado grande eficácia no controle da progressão da infecção pelo HIV e aumento da sobrevida do paciente. Entretanto estes benefícios podem ser comprometidos pelo desenvolvimento de resistência às drogas, consequência da emergência de mutações nas enzimas virais, representando um grande obstáculo para o sucesso do tratamento de pacientes infectados pelo HIV-1. Os testes de resistência, principalmente de genotipagem do HIV-1, permitem a orientação de novos esquemas, possibilitando o retorno da supressão viral. Este estudo teve como objetivo avaliar o perfil de mutações e a resistência genotípica aos Inibidores da Transcriptase Reversa análogos de Nucleosídeos (ITRN), Inibidores da Transcriptase Reversa Não-análogos de Nucleosídeos (ITRNN) e Inibidores da Protease (IP) em pacientes com falha terapêutica submetidos ao exame de genotipagem, realizado no Laboratório de Rotinas Diagnósticas em Biologia Molecular do Hemocentro da FMB - UNESP ponto executor da RENAGENO (Rede Nacional de Genotipagem do HIV-1). Foram analisadas sequências genômicas da região pol do HIV-1 provenientes de todos os pacientes com exame de genotipagem realizados durante os anos de 2008 e 2009. Dois grupos distintos foram formados: grupo “Adulto” (idade ≥ 18 anos), com 386 indivíduos, e grupo “Pediátrico” (<18 anos), com 45 pacientes, totalizando 431 pacientes. A genotipagem foi realizada pelo kit comercial Trugene HIV-1 Genotyping Kit (Siemens Healthcare Diagnostics). As sequências obtidas foram submetidas ao Algoritmo de Interpretação de Resistência Genotípica da Universidade de Stanford (HIVdb) e a subtipagem foi realizado pelo REGA HIV-1 Subtyping Tool e pelo programa RIP 3.0. O subtipo B foi o mais frequente nos dois grupos estudados...

Antiretrovirals (ARV) interfere with viral enzymes resulting in the inhibition of HIV replication. The use of antiretroviral combinations has demonstrated highly effectiveness in controlling of the progression of HIV infection and increased of the patients’ survival. However these benefits can be compromised by the development of drug resistance, as consequence of the mutations emergence in viral enzymes, representing a major obstacle to successful treatment of HIV-1 patients infected. Resistance tests, mainly HIV-1 genotyping, allow the orientation of new schemes, enabling the return of viral suppression. This study aimed to evaluate the profile of mutations and genotypic resistance to the Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors (NRTI), Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors (NNRTI) and Protease Inhibitors (PI) in the patients in therapeutic failure submitted to the genotyping test, performed in Diagnostic Routine Laboratory in Molecular Biology at the Blood Center of FMB – UNESP, part of RENAGENO (National Network of HIV-1 Genotyping). HIV-1 pol region genomic sequences from all patients with genotype test performed during the years 2008 and 2009 were analyzed. The patients were separated in two distinct groups: “Adult group” (age ≥ 18 years), with 386 individuals, and “Pediatric group” (<18 years), with 45 patients, in a total of 431 patients. Genotyping was performed by Trugene HIV-1 Genotyping Kit (Siemens Healthcare Diagnostics). The sequences obtained were submitted to the Genotypic Resistance Interpretation Algorithm of Stanford University (HIVdb) and the subtyping was performed by REGA HIV-1 Subtyping Tool and by RIP 3.0 program. Subtype B was the most frequent in both groups followed by hybrid forms B and F (BF or FB) and subtype F1. Resistance mutations were found in 97.15% of patients in the adult group... (Complete abstract click electronic access below)