Bioinformática: base de datos de matrices de expresión génica para su análisis vía web


Autoria(s): Sánchez Santolaya, Daniel
Contribuinte(s)

Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria

Huerta Casado, Mario

Gonzàlez i Sabaté, Jordi

Data(s)

01/09/2012

Resumo

El IBB ha desarrollado un servidor de aplicaciones: http://revolutionresearch.uab.es para el análisis de microarrays. Estas microarrays las obtienen y las suben a la base de datos local los usuarios de la aplicación. En la presente memoria se detalla el proceso realizado para automatizar la subida de microarrays públicas a la base de datos local. Estas microarrays se obtendrán del NCBI. El proceso de descarga de microarrays se realizará cada dos meses y estará sincronizado con un proceso de descarga de genes marcadores de microarrays del NCBI. En la memoria también se describen las fases realizadas para crear la interfaz web para gestionar estas microarrays públicas y las modificaciones realizadas sobre el aplicativo web para permitir realizar análisis con estas microarrays.

L' IBB ha desenvolupat un servidor d‘aplicacions: http://revolutionresearch.uab.es per l‘anàlisi de microarrays. Aquestes microarrays les obtenen y les pugen a la base de dades local els usuaris de l‘aplicació. En la present memòria es detalla el procés realitzat para automatitzar la pujada de microarrays públiques a la base de dades local. Aquestes microarrays s‘obtindran del NCBI. El procés de descarrega de microarrays es realitzarà cada dos mesos y estarà sincronitzat amb un procés de descarrega de gens marcadors de microarrays del NCBI. A la memòria també es descriuen las fases realitzades per crear la interfície web para gestionar aquestes microarrays públiques y las modificacions realitzades sobre l‘aplicatiu web per permetre realitzar anàlisis amb aquestes microarrays.

The IBB center has developed a application server: http://revolutionresearch.uab.es to analyze the microarrays. These microarrays are obtained and uploaded to the local database by the application users. This report details the process undertaken in order to automate the public microarrays upload to the local database. These microarrays will obtain from the NCBI. The download process will perform every two months and will be synchronized with a download process of gene markers of the NCBI. The report also describes the steps taken to create the web interface to manage these public microarrays and the changes made on the web application to allow these microarray analysis.

Formato

79 p.

Identificador

http://hdl.handle.net/2072/212585

Idioma(s)

spa

Direitos

info:eu-repo/semantics/openAccess

L'accés als continguts d'aquest document queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/

Fonte

RECERCAT (Dipòsit de la Recerca de Catalunya)

Palavras-Chave #Gens -- Expressió -- Processament de dades #Interfícies d'usuari (Sistemes d'ordinadors) -- Disseny #Bases de dades web #004 - Informàtica
Tipo

info:eu-repo/semantics/bachelorThesis