Defining the role of common variation in the genomic and biological architecture of adult human height.

Autoria(s): Wood A.R.; Esko T.; Yang J.; Vedantam S.; Pers T.H.; Gustafsson S.; Chu A.Y.; Estrada K.; Luan J.; Kutalik Z.; Amin N.; Buchkovich M.L.; Croteau-Chonka D.C.; Day F.R.; Duan Y.; Fall T.; Fehrmann R.; Ferreira T.; Jackson A.U.; Karjalainen J.; Lo K.S.; Locke A.E.; Mägi R.; Mihailov E.; Porcu E.; Randall J.C.; Scherag A.; Vinkhuyzen A.A.; Westra H.J.; Winkler T.W.; Workalemahu T.; Zhao J.H.; Absher D.; Albrecht E.; Anderson D.; Baron J.; Beekman M.; Demirkan A.; Ehret G.B.; Feenstra B.; Feitosa M.F.; Fischer K.; Fraser R.M.; Goel A.; Gong J.; Justice A.E.; Kanoni S.; Kleber M.E.; Kristiansson K.; Lim U.; Lotay V.; Lui J.C.; Mangino M.; Mateo Leach I.; Medina-Gomez C.; Nalls M.A.; Nyholt D.R.; Palmer C.D.; Pasko D.; Pechlivanis S.; Prokopenko I.; Ried J.S.; Ripke S.; Shungin D.; Stancáková A.; Strawbridge R.J.; Sung Y.J.; Tanaka T.; Teumer A.; Trompet S.; van der Laan S.W.; van Setten J.; Van Vliet-Ostaptchouk J.V.; Wang Z.; Yengo L.; Zhang W.; Afzal U.; Arnlöv J.; Arscott G.M.; Bandinelli S.; Barrett A.; Bellis C.; Bennett A.J.; Berne C.; Blüher M.; Bolton J.L.; Böttcher Y.; Boyd H.A.; Bruinenberg M.; Buckley B.M.; Buyske S.; Caspersen I.H.; Chines P.S.; Clarke R.; Claudi-Boehm S.; Cooper M.; Daw E.W.; De Jong P.A.; Deelen J.; Delgado G.; Denny J.C.; Dhonukshe-Rutten R.; Dimitriou M.; Doney A.S.; Dörr M.; Eklund N.; Eury E.; Folkersen L.; Garcia M.E.; Geller F.; Giedraitis V.; Go A.S.; Grallert H.; Grammer T.B.; Gräßler J.; Grönberg H.; de Groot L.C.; Groves C.J.; Haessler J.; Hall P.; Haller T.; Hallmans G.; Hannemann A.; Hartman C.A.; Hassinen M.; Hayward C.; Heard-Costa N.L.; Helmer Q.; Hemani G.; Henders A.K.; Hillege H.L.; Hlatky M.A.; Hoffmann W.; Hoffmann P.; Holmen O.; Houwing-Duistermaat J.J.; Illig T.; Isaacs A.; James A.L.; Jeff J.; Johansen B.; Johansson Å.; Jolley J.; Juliusdottir T.; Junttila J.; Kho A.N.; Kinnunen L.; Klopp N.; Kocher T.; Kratzer W.; Lichtner P.; Lind L.; Lindström J.; Lobbens S.; Lorentzon M.; Lu Y.; Lyssenko V.; Magnusson P.K.; Mahajan A.; Maillard M.; McArdle W.L.; McKenzie C.A.; McLachlan S.; McLaren P.J.; Menni C.; Merger S.; Milani L.; Moayyeri A.; Monda K.L.; Morken M.A.; Müller G.; Müller-Nurasyid M.; Musk A.W.; Narisu N.; Nauck M.; Nolte I.M.; Nöthen M.M.; Oozageer L.; Pilz S.; Rayner N.W.; Renstrom F.; Robertson N.R.; Rose L.M.; Roussel R.; Sanna S.; Scharnagl H.; Scholtens S.; Schumacher F.R.; Schunkert H.; Scott R.A.; Sehmi J.; Seufferlein T.; Shi J.; Silventoinen K.; Smit J.H.; Smith A.V.; Smolonska J.; Stanton A.V.; Stirrups K.; Stott D.J.; Stringham H.M.; Sundström J.; Swertz M.A.; Syvänen A.C.; Tayo B.O.; Thorleifsson G.; Tyrer J.P.; van Dijk S.; van Schoor N.M.; van der Velde N.; van Heemst D.; van Oort F.V.; Vermeulen S.H.; Verweij N.; Vonk J.M.; Waite L.L.; Waldenberger M.; Wennauer R.; Wilkens L.R.; Willenborg C.; Wilsgaard T.; Wojczynski M.K.; Wong A.; Wright A.F.; Zhang Q.; Arveiler D.; Bakker S.J.; Beilby J.; Bergman R.N.; Bergmann S.; Biffar R.; Blangero J.; Boomsma D.I.; Bornstein S.R.; Bovet P.; Brambilla P.; Brown M.J.; Campbell H.; Caulfield M.J.; Chakravarti A.; Collins R.; Collins F.S.; Crawford D.C.; Cupples L.A.; Danesh J.; de Faire U.; den Ruijter H.M.; Erbel R.; Erdmann J.; Eriksson J.G.; Farrall M.; Ferrannini E.; Ferrières J.; Ford I.; Forouhi N.G.; Forrester T.; Gansevoort R.T.; Gejman P.V.; Gieger C.; Golay A.; Gottesman O.; Gudnason V.; Gyllensten U.; Haas D.W.; Hall A.S.; Harris T.B.; Hattersley A.T.; Heath A.C.; Hengstenberg C.; Hicks A.A.; Hindorff L.A.; Hingorani A.D.; Hofman A.; Hovingh G.K.; Humphries S.E.; Hunt S.C.; Hypponen E.; Jacobs K.B.; Jarvelin M.R.; Jousilahti P.; Jula A.M.; Kaprio J.; Kastelein J.J.; Kayser M.; Kee F.; Keinanen-Kiukaanniemi S.M.; Kiemeney L.A.; Kooner J.S.; Kooperberg C.; Koskinen S.; Kovacs P.; Kraja A.T.; Kumari M.; Kuusisto J.; Lakka T.A.; Langenberg C.; Le Marchand L.; Lehtimäki T.; Lupoli S.; Madden P.A.; Männistö S.; Manunta P.; Marette A.; Matise T.C.; McKnight B.; Meitinger T.; Moll F.L.; Montgomery G.W.; Morris A.D.; Morris A.P.; Murray J.C.; Nelis M.; Ohlsson C.; Oldehinkel A.J.; Ong K.K.; Ouwehand W.H.; Pasterkamp G.; Peters A.; Pramstaller P.P.; Price J.F.; Qi L.; Raitakari O.T.; Rankinen T.; Rao D.C.; Rice T.K.; Ritchie M.; Rudan I.; Salomaa V.; Samani N.J.; Saramies J.; Sarzynski M.A.; Schwarz P.E.; Sebert S.; Sever P.; Shuldiner A.R.; Sinisalo J.; Steinthorsdottir V.; Stolk R.P.; Tardif J.C.; Tönjes A.; Tremblay A.; Tremoli E.; Virtamo J.; Vohl M.C.; Electronic Medical Records; Genomics (eMEMERGEGE) Consortium; MIGen Consortium; PAGEGE Consortium; LifeLines Cohort Study; Amouyel P.; Amouyel P.; Asselbergs F.W.; Assimes T.L.; Bochud M.; Boehm B.O.; Boerwinkle E.; Bottinger E.P.; Bouchard C.; Cauchi S.; Chambers J.C.; Chanock S.J.; Cooper R.S.; de Bakker P.I.; Dedoussis G.; Ferrucci L.; Franks P.W.; Froguel P.; Groop L.C.; Haiman C.A.; Hamsten A.; Hayes M.G.; Hui J.; Hunter D.J.; Hveem K.; Jukema J.W.; Kaplan R.C.; Kivimaki M.; Kuh D.; Laakso M.; Liu Y.; Martin N.G.; März W.; Melbye M.; Moebus S.; Munroe P.B.; Njølstad I.; Oostra B.A.; Palmer C.N.; Pedersen N.L.; Perola M.; Pérusse L.; Peters U.; Powell J.E.; Power C.; Quertermous T.; Rauramaa R.; Reinmaa E.; Ridker P.M.; Rivadeneira F.; Rotter J.I.; Saaristo T.E.; Saleheen D.; Schlessinger D.; Slagboom P.E.; Snieder H.; Spector T.D.; Strauch K.; Stumvoll M.; Tuomilehto J.; Uusitupa M.; van der Harst P.; Völzke H.; Walker M.; Wareham N.J.; Watkins H.; Wichmann H.E.; Wilson J.F.; Zanen P.; Deloukas P.; Heid I.M.; Lindgren C.M.; Mohlke K.L.; Speliotes E.K.; Thorsteinsdottir U.; Barroso I.; Fox C.S.; North K.E.; Strachan D.P.; Beckmann J.S.; Berndt S.I.; Boehnke M.; Borecki I.B.; McCarthy M.I.; Metspalu A.; Stefansson K.; Uitterlinden A.G.; van Duijn C.M.; Franke L.; Willer C.J.; Price A.L.; Lettre G.; Loos R.J.; Weedon M.N.; Ingelsson E.; O'Connell J.R.; Abecasis G.R.; Chasman D.I.; Goddard M.E.; Visscher P.M.; Hirschhorn J.N.; Frayling T.M.
Data(s)

01/11/2014
Resumo

Using genome-wide data from 253,288 individuals, we identified 697 variants at genome-wide significance that together explained one-fifth of the heritability for adult height. By testing different numbers of variants in independent studies, we show that the most strongly associated ∼2,000, ∼3,700 and ∼9,500 SNPs explained ∼21%, ∼24% and ∼29% of phenotypic variance. Furthermore, all common variants together captured 60% of heritability. The 697 variants clustered in 423 loci were enriched for genes, pathways and tissue types known to be involved in growth and together implicated genes and pathways not highlighted in earlier efforts, such as signaling by fibroblast growth factors, WNT/β-catenin and chondroitin sulfate-related genes. We identified several genes and pathways not previously connected with human skeletal growth, including mTOR, osteoglycin and binding of hyaluronic acid. Our results indicate a genetic architecture for human height that is characterized by a very large but finite number (thousands) of causal variants.
Identificador

https://serval.unil.ch/?id=serval:BIB_344F80F34D5F

isbn:1546-1718 (Electronic)

pmid:25282103

doi:10.1038/ng.3097

isiid:000344131900008

http://my.unil.ch/serval/document/BIB_344F80F34D5F.pdf

http://nbn-resolving.org/urn/resolver.pl?urn=urn:nbn:ch:serval-BIB_344F80F34D5F2
Idioma(s)

en
Direitos

info:eu-repo/semantics/openAccess
Fonte

Nature Genetics, vol. 46, no. 11, pp. 1173-1186
Palavras-Chave #Adult; Analysis of Variance; Body Height/genetics; European Continental Ancestry Group/genetics; Genetic Variation/genetics; Genetics, Population; Genome-Wide Association Study/methods; Humans; Oligonucleotide Array Sequence Analysis; Polymorphism, Single Nucleotide/genetics
Tipo

info:eu-repo/semantics/article

article
Acesso ao item digital