三维定量结构-性质/活性相关性研究

该研究中,建议了一些新的方法,并且应用到QSAR/QSPR研究中,较好的预测了化合物的活性.研究工作主要集中在如下几个方面:[1]用相似度矩阵构造数学模型,预测化合物的活性.相似度矩阵是通过提取分子三维结构特征—广义二面角,原子三角和原子对空间距离来得到.[2]在三维空间对分子进行投影,计算出每一个平面上的投影面积来描述分子的形状.并进一步对分子投影进行了研究.用每一个平面的投影边缘代替面积预测化合物的活性.得到了更好的结果.[3]传统的拓朴指数很难区分属于3-D范畴的手性异构体.研究中扩展了由该实验室提出的Am指数,并利用该指数预测了手性药物的活性.[4]比较不同物种的β-球蛋白基因的第一个外显子.该方法不是直接进行DNA序列的比较,而是将DNA编码序列转化为图,然后模拟表征分子图的方法对之进一步处理.[5]利用VC++编写了一个包含三十多个分子拓扑指数的软件.