翻译速率与蛋白质二级结构的关系

统计分析了人的119种蛋白质和大肠杆菌的92种蛋白质密码子翻译速率和蛋白质二级结构的关系。据 二密码子片段在不同二级结构中的频数分布，我们发现人和大肠杆菌中翻译速率与蛋白质二级结构之间有一定 关系:高翻译速率时倾向编码。螺旋、不倾向编码线团(coil);低翻译速率时倾向编码线团、不倾向编码。螺旋;R 折叠结构则随翻译速率表现出明显的振荡。同时，密码子的使用在不同片段内一般也是不均匀的:在。螺旋片段 内，结构尾部偏向使用高翻译速率密码子;中部倾向使用中翻译速率密码子;而头部使用的密码子翻译速率偏 低。这样的倾向性不大可能归结为随机起伏的影响。

国家自然科学基金重大项目(No.90103030)和昆明动物所细胞与分子进化开放实验室课题基金资助