酵母内含子在基因序列中的分布对基因转录效率的影响

对酵母中高效转录和低效转录基因内含子序列寡核苷酸使用情况的对照分析,显示两类内含子的序列结构有差异,并且高效转录基因内含子序列含有较多潜在的转录因子结合位点,由此推测内含子可能参与基因转录的调控。这个结论有待更多的数据证实。对内含子和外显子在两组基因序列中的分布(长度、位置等)进行详细比较分析后显示,高效转录基因内含子和低效转录基因内含子的长度有比较明显的界限。两组基因中外显子长度的均值虽然有些差异,却没有明显的界限。基因序列长度与外显子长度的情况相似。虽然内含子的相对位置在两类基因中都很靠近5^端,但是从实际位置看,高效转录基因中比较多的内含子很靠近基因的5^端,有些则位于5^-UTR区域。这些结果提示,基因的转录效率与内含子的长度有关,与外显子及基因序列的长度无关,内含子的位置也可能影响转录效率,内含子对基因转录的调控可能与基因上游的转录调控有关联,或者是上游调控的延续。

国家自然科学基金资助项目;云南大学理(工)科校级科研项目资助