家马核基因组中线粒体核内插入序列分析


Autoria(s): 姜枫; 苗永旺; 刘斌; 申欣; 任建峰; 何帆
Data(s)

2008

Resumo

在各种真核生物核基因组中,存在一些由线粒体基因组转移进入核基因组中的DNA片段,这些被认为是分子化石的片段叫做线粒体核内插入序列(Numt).由于Numt与真实的线粒体序列高度相似,因此它的存在必然会成为PCR扩增线粒体DNA的不利因素.利用已经公布的家马(Equus caballus)基因组序列(2007年9月公布,GenBank登录号为NC 009144--NC 009175)对家马Numt进行了深入分析,其发现200个可能的Numt,长度范围为29到3727bp,其中有10个的长度大于800bp.分析结果显示由于不存在线粒体控制区域的疑似Numt,因此对基于此区域的群体遗传学研究不会产生影响.本研究还发现在家马进化过程中,第1号和27号染色体更倾向于接受线粒体序列的转移.以上结果将为今后马科动物的研究提供重要的参考信息,有助于避免在线粒体DNA研究中由于Numt污染的存在而得出错误的实验结果.

国家自然科学基金,云南省应用基础研究项目,云南省应用基础研究计划面上项目

Identificador

http://159.226.149.42/handle/152453/949

http://www.irgrid.ac.cn/handle/1471x/50014

Idioma(s)

中文

Fonte

姜枫, 苗永旺, 刘斌 ,申欣 ,任建峰, 何帆.家马核基因组中线粒体核内插入序列分析 .动物学研究,2008, 29(6):577-584

Palavras-Chave #线粒体DNA #核内插入序列 #Numt #家马 #假基因
Tipo

期刊论文