家马核基因组中线粒体核内插入序列分析
Data(s) |
2008
|
---|---|
Resumo |
在各种真核生物核基因组中,存在一些由线粒体基因组转移进入核基因组中的DNA片段,这些被认为是分子化石的片段叫做线粒体核内插入序列(Numt).由于Numt与真实的线粒体序列高度相似,因此它的存在必然会成为PCR扩增线粒体DNA的不利因素.利用已经公布的家马(Equus caballus)基因组序列(2007年9月公布,GenBank登录号为NC 009144--NC 009175)对家马Numt进行了深入分析,其发现200个可能的Numt,长度范围为29到3727bp,其中有10个的长度大于800bp.分析结果显示由于不存在线粒体控制区域的疑似Numt,因此对基于此区域的群体遗传学研究不会产生影响.本研究还发现在家马进化过程中,第1号和27号染色体更倾向于接受线粒体序列的转移.以上结果将为今后马科动物的研究提供重要的参考信息,有助于避免在线粒体DNA研究中由于Numt污染的存在而得出错误的实验结果. 国家自然科学基金,云南省应用基础研究项目,云南省应用基础研究计划面上项目 |
Identificador | |
Idioma(s) |
中文 |
Fonte |
姜枫, 苗永旺, 刘斌 ,申欣 ,任建峰, 何帆.家马核基因组中线粒体核内插入序列分析 .动物学研究,2008, 29(6):577-584 |
Palavras-Chave | #线粒体DNA #核内插入序列 #Numt #家马 #假基因 |
Tipo |
期刊论文 |