H5N2亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析


Autoria(s): 张素霞; 王建新; 刘次全
Data(s)

2009

Resumo

以H5N2亚型禽流感病毒毒株血凝素蛋白裂解位点碱性氨基酸为研究对象,对其密码子偏好性和对应mRNA序列的折叠二级结构特点进行研究和分析.旨在探讨裂解位点氨基酸对应mRNA核苷酸片段的二级结构与病毒致病力的关系,希望能对禽流感病毒的研究提供一些基础性信息.将mRNA样本按照序列等步长递增的方法,用RNAstructure 4.1程序预测这些样本的动态延伸折叠二级结构.序列和结构的分析结果:裂解位点的碱性氨基酸对富含腺嘌呤的密码子有强烈偏好;与碱性氨基酸对应的mRNA片段上的核苷酸主要位于折叠二级结构的单链环区,少数位于配对螺旋区.结果表明:裂解位点氨基酸对应的mRNA核苷酸形成发夹端环的大小与其碱性氨基酸的多少具有正相关性.

国家自然科学基金,中国科学院知识创新工程前沿交叉项目

Identificador

http://159.226.149.42/handle/152453/883

http://www.irgrid.ac.cn/handle/1471x/50009

Idioma(s)

中文

Fonte

张素霞 ,王建新, 刘次全.H5N2亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析.生物信息学 ,2009, 7(2):155-158

Palavras-Chave #禽流感 #血凝素 #裂解位点 #mRNA二级结构 #动态折叠
Tipo

期刊论文