Supercritical fluid extraction from fennel (Foeniculum vulgare): global yield, composition and kinetic data

Supercritical fluid extraction (SFE) from solids has proven to be technically feasible for almost any system; nonetheless, its economical viability has been proven for a restricted number of systems. A common practice is to compare the cost of manufacturing of vegetable extracts by a variety of techniques without deeply considering the huge differences in composition and functional properties among the various types of extracts obtained; under this circumstance, the cost of manufacturing do not favor SFE. Additionally, the influence of external parameters such as the agronomic conditions and the SFE system geometry are not considered. In the present work, these factors were studied for the system fennel seeds + CO2. The effects of the harvesting season and the degree of maturation on the global yields for the system fennel seeds + CO2 were analyzed at 300 bar and 40 degrees C. The effects of the pressure on the global yields were determined for the temperatures of 30 and 40 degrees C. Kinetics experiments were done for various ratios of bed height to bed diameter. Fennel extracts were also obtained by hydrodistillation and low-pressure solvent extraction. The chemical composition of the fennel extracts were determined by gas chromatography. The SFE maximum global yield (12.5%, dry basis) was obtained with dry harvested fennel seeds. Anethole and fenchone were the major constituents of the extract; the following fat acids palmitic (C16H32O2), palmitoleic stearic (C18H36O2), oleic (C18H34O2), linoleic (C18H32O2) and linolenic (C18H30O2) were also detected in the extracts. A relation between amounts of feed and solvent, bed height and diameter, and solvent flow rate was proposed. The models of Sovova, Goto et al. and Tan and Lion were capable of describing the mass transfer kinetics. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

Supercritical extraction of pupunha (Guilielma speciosa) oil in a fixed bed using carbon dioxide

The pupunha (Guilielma speciosa) is the fruit of a palm tree typical of the Brazilian Northern region, whose stem is used as a source of heart of palm. The fruit, which is about 65% pulp, is a source of oil and carotenes. In the present work, an analysis of the kinetics of supercritical extraction of oil from the pupunha pulp is presented. Carbon dioxide was used as solvent. The extractions were carried out at 25 MPa and 323 K and 30 MPa and 318 K. The chemical composition of the extracts in terms of fatty acids was determined by gas chromatography. The amount of oleic acid, a saturated fatty acid, in the CO2 extracts was larger than that in the extract obtained with hexane. The overall extraction curves were modeled using the single-parameter model proposed in the literature to describe the desorption of toluene from activated coal.

Extratos de sementes de gergelim preto (Sesamum indicum L) obtidos via CO2 supercrítico: isotermas de rendimento global, dados cinéticos e ajustes, ácidos graxos totais, fitosteróis e efeitos neuroprotetores

Na medicina popular brasileira, sementes de gergelim preto (Sesamum indicum L) é um dos mais importantes ingrediente presentes em um chá usado para tratar vítimas de acidente vascular encefálico (AVE). Porém, o isolamento de extratos de gergelim preto para fins medicinais usando a tecnologia do fluido supercrítico não foi realizado. O objetivo deste trabalho foi investigar algumas variáveis de processo da extração com fluido supercrítico em sementes de gergelim preto para gerar extratos aplicáveis a pesquisa do AVE isquêmico focal. Duas isotermas (40 e 60 ºC) foram exploradas, combinadas com pressões de 200-400 bar, em vazão mássica de CO₂ constante de 5,9 x 10^-5 kg/s. Os rendimentos globais foram de 37-53% em base seca. O maior rendimento foi obtido em 60 ºC e 400 bar. A composição de ácidos graxos mostrou uma elevada razão de insaturados/ saturados. A análise de conteúdo de fitosteróis no extrato de maior rendimento revelou maiores quantidades de β-sitosterol + sitostanol, colesterol, campesterol + campestanol + 24-metileno colesterol, Δ-5 avenasterol and estigmasterol, enquanto que menores níveis de Δ-5,24 estigmastadienol, brassicasterol, clerosterol + Δ-5-23 estigmastadienol, Δ-7 avenasterol, eritrodiol and Δ-7 estigmastenol foram observados. As curvas de extração das extrações com fluido supercrítico no menor e maior rendimento mássico (200 e 400 bar a 60 ºC) foram ajustadas pelos modelos de Tan e Liou (1989), Martinez et al. (2003), Esquível et al. (1999), Goto et al. (1993) e Sovová (1994 e 2012). Os modelos de Tan e Liou (1989), Goto et al. (1993) e Sovová (1994 e 2012) apresentaram as melhores valores nominais de somas residuais dos quadrados. Experimentos pilotos sugerem que o extrato obtido via fluido supercrítico de gergelim preto é neuroprotetor em relação a isquemia focal por endotelina-1 no córtex motor de ratos machos adultos, observada a redução da área de infarto isquêmico.

Extraction and purification of triterpenic acids from eucalypt bark

A indústria da pasta e do papel é um sector importante da economia mundial, particularmente a que assenta em espécies de Eucalyptus. No entanto, essas indústrias geram quantidades significativas de correntes secundárias de subprodutos e resíduos de biomassa que podem ser exploradas em aplicações de valor acrescentado em vez de serem queimadas para produção de energia. Um exemplo nobre pode ser a produção de ácidos triterpénicos com estruturas dos tipos lupano, oleanano e ursano, dada a sua abundância em alguns destes resíduos, em particular na casca, adotando o conceito de biorrefinaria integrada numa fábrica de pasta. Estes compostos são conhecidos pelas suas inúmeras actividades biológicas, por exemplo, antioxidante, anti-inflamatória e antitumoral, e podem encontrar aplicações em produtos de elevado valor, tais como cosméticos, nutracêuticos ou farmacêuticos. Neste sentido, o estudo das potencialidades das cascas das espécies de eucalipto mais exploradas enquanto fontes de compostos triterpénicos é um tópico relevante. Por conseguinte, foram analisados e comparados em pormenor os teores e composições em ácidos triterpénicos (TTAs) das cascas externas de várias espécies de eucalipto (E. globulus, E. grandis, E. urograndis, E. maidenii e E. nitens). Os teores dos principais TTAs identificados nestas espécies variaram entre 4.5 g/kg no E. urograndis e 21.6 g/kg no E. nitens. Observou-se que as cascas externas de Eucalyptus de zonas temperadas e Mediterrânicas, nomeadamente E. nitens e E. globulus, são mais ricas em TTAs que as espécies de regiões tropicais e subtropicais. Além disso, a casca externa do E. globulus é claramente a mais rica em ácidos com estruturas do tipo ursano enquanto a do E. nitens é a mais rica em ácidos do tipo oleanano e lupano. Estes resultados levaram-nos a estudar a extração dos TTAs da casca de Eucalyptus, bem como a sua posterior concentração e purificação, a qual foi efetuada por extração sólido-líquido convencional combinada com a precipitação de solutos, e por extração com fluidos supercríticos (SFE). No que diz respeito à primeira abordagem referida, foi desenvolvido neste trabalho um método patenteado que permite obter extratos enriquecidos em TTAs das cascas de eucalipto baseado em tecnologias disponíveis no imediato. Em relação à segunda abordagem, e de forma a apostar em processos de baixo impacto ambiental exigidos pelas biorrefinarias do futuro, a SFE surge como uma opção natural. Assim, foi efetuada a SFE da casca caduca do E. globulus com dióxido de carbono puro e modificado para recuperar a fração de TTAs, e os resultados foram comparados com os obtidos por extração em Soxhlet com diclorometano. Foram realizados estudos preliminares sobre a influência da pressão (100-200 bar), a adição de co-solvente (0, 5 e 8% m/m de etanol), e operação em múltiplos passos a fim de avaliar a aplicabilidade da alternativa supercrítica para a sua produção eficiente e selectiva. Os resultados destacaram a influência da pressão e o importante papel resumo (cont.) desempenhado pelo co-solvente neste processo, cujo efeito foi mais relevante do que o aumento da pressão em várias dezenas de bar. Este trabalho foi depois otimizado, usando o planeamento factorial de experiências e a metodologia de superfícies de resposta, para analisar a influência da temperatura (40-60 ºC), pressão (100-200 bar), e teor de etanol (0.0-5.0% m/m) na recuperação dos TTAs e respectiva concentração nos extractos. Nestes intervalos, as melhores condições de operação encontradas foram 200 bar, 40 °C e 5% de etanol, para as quais os modelos de regressão estatisticamente validados previram um rendimento de extração de 1.2% com 50% de concentração em TTAs, correspondendo ao rendimento em TTAs de 5.1 g/kg de casca e uma recuperação de 79.2% comparativamente ao valor do Soxhlet. Os TTAs livres e acetilados apresentaram tendências de extracção bastante distintas devido às suas diferentes afinidades para o CO2 causadas pelas diferentes polaridades: os derivados acetilados aproximam-se de um patamar máximo a cerca de 200 bar e 5% de etanol, enquanto a extração dos TTAs livres apresenta uma tendência sempre crescente no intervalo de condições estudado. Foram também medidas curvas cumulativas de SFE da casca do E. globulus de forma a analisar o comportamento cinético do processo em termos de rendimento total, rendimento em TTAs, rendimento em TTAs livres, rendimento em TTAs acetilados, e concentração dos TTAs nos extractos. Foi analisada a influência da pressão, temperatura, teor de co-solvente e caudal do dióxido de carbono sobre as respostas anteriores. Os dados experimentais foram modelados com os modelos Logístico, de Dessorção, de Placa Plana Simples, e de Difusão. Na globalidade, os resultados confirmaram que a pressão e o teor de etanol têm um efeito significativo sobre as curvas de extração, os rendimentos finais e as concentrações dos extratos, e mostraram a presença de limitações externas à transferência de massa em alguns ensaios. Mais uma vez, as famílias individuais de TTAs livres e acetilados apresentaram diferentes tendências de extracção. A modelação permitiu-nos confirmar não só o importante papel desempenhado pela difusão intraparticular na SFE, mas também a contribuição da resistência no filme em alguns ensaios. Após a análise de todos os resultados, foi efetuado um ensaio em duas etapas em série, possibilitando o enriquecimento do teor em TTAs no extracto devido às diferentes condições adotadas em cada etapa. Por último, um éster metílico de um ácido triterpénico do tipo oleanano - morolato de metilo - foi identificado pela primeira vez enquanto componente da casca de Eucalyptus na casca externa do Eucalyptus grandis x globulus, onde ocorre em teores elevados. A sua extração com CO2 supercrítico foi também realizada, visando a conceção de uma alternativa de extração ambientalmente benigna para este composto. A 200 bar e 60 ºC, a remoção do morolato de metilo atingiu um patamar às 6 h para 5.1 kg h-1 de CO2 / kg de casca. Em geral, e de forma semelhante à SFE da casca do E. globulus, os TTAs acetilados foram mais significativamente extraídos quando comparados com os seus ácidos livres, o que está diretamente relacionado com a natureza menos polar destas moléculas. O trabalho apresentado nesta tese é uma contribuição para a valorização de uma corrente de biomassa com baixo valor na indústria de pasta em duas vertentes complementares. Por um lado, aumentou o conhecimento da composição lipofílica das cascas de Eucalyptus spp. com interesse comercial para a produção de pasta, destacando o seu potencial enquanto fontes de ácidos triterpénicos. Por outro lado, foram desenvolvidos dois processos alternativos e facilmente integráveis numa fábrica de pasta para a sua exploração a partir da casca: um baseado em tecnologias convencionais bem estabelecidas a nível industrial, prevendo a sua aplicação a curto prazo, e um outro baseado na SFE, seguindo as tendências das futuras biorrefinarias.

Determinação de parâmetros de transferência de massa do processo de extração supercrítica

A extração com fluido supercrítico de materiais líquidos e sólidos despertou o interesse para aplicações industriais nas últimas décadas, mais particularmente sob o conceito de química verde e biorrefinarias, portanto é fundamental que se faça uma modelagem desse processo a fim de otimizar as condições operacionais e simular o processo. O objetivo geral deste trabalho consiste na determinação de parâmetros de transferência de massa do processo de extração supercrítica de matriz sólida, empregando o dióxido de carbono como solvente, a partir de dados cinéticos de extração e na avaliação sistemática de cinco modelos matemáticos para descrever as cinéticas de extração dos óleos da polpa e da casca do buriti, do óleo de açaí de da oleoresina de cúrcuma, medidas no Laboratório de Extração Supercrítica, da Faculdade de Engenharia Química (UFPA), a fim de contribuir para o estudo de ampliação de escala e análise de custo de produção. Foram avaliados os modelos de Tan e Liou, Goto et al. (1993), Martinez et al. (2003), Esquível et al. (1999), e Sovová (1994). A modelagem das cinéticas de extração foi realizada utilizando aplicativos computacionais desenvolvidos e validados neste trabalho a partir de diferentes dados experimentais publicados na literatura. Diante de 40 cinéticas medidas com diferentes equipamentos de extração, configurações de leito, tipos de matérias primas, preparo dos materiais, pressão e temperatura e outros parâmetros de processo (com destaque ao rendimento global e a vazão de solvente), foi construído um panorama dos resultados acerca da capacidade dos modelos de transferência de massa em descrever as mais diferentes curvas globais de extração. De forma geral, os modelos de Goto et al. (1993) e Sovová (1994) apresentaram as melhores previsões aos dados experimentais das matérias primas tratadas neste trabalho com menores valores de quadrado, erros relativo, faixa de erro e desvios padrão e valores de R² próximos da unidade.

Extracção supercrítica de óleo de grainha de uva combinada com pré-tratamentos enzimáticos

Neste trabalho estudou-se a extracção supercrítica do óleo de grainha de uva, usando dióxido de carbono, e combinou-se este processo com um prétratamento enzimático da semente para aumentar o rendimento global da extracção. A qualidade dos extractos obtidos foi avaliada pelo seu conteúdo em triacilglicerídeos, perfil de ácidos gordos e capacidade antioxidante. Realizaram-se também alguns estudos exploratórios sobre a aplicação de um pré-tratamento de alta pressão (HPP) à grainha da uva. Adicionalmente, efectuou-se o estudo da extracção, fraccionamento e caracterização estrutural das procianidinas da grainha da uva, bem como a avaliação da sua capacidade antioxidante. A extracção de procianidinas da grainha da uva foi efectuada sequencialmente com metanol e acetona/água, tendo sido posteriormente fraccionadas por adição sucessiva de misturas metanol/clorofórmio progressivamente mais concentradas em clorofórmio. A caracterização das procianidinas foi feita por HPLC-UV e LC–MS, antes e depois de sujeitar as amostras a uma tiólise, e também por ESI-MS e ESI-MS/MS. Este estudo permitiu reportar, pela primeira vez, a ocorrência de procianidinas do tipo-A galoiladas na grainha da uva. Os resultados de HPLC-UV permitiram determinar o grau médio de polimerização das procianidinas e a sua composição monomérica em (+)- catequina, (-)-epicatequina e (-)-epicatequina-O-galato. Mostrou-se que a (+)- catequina é o flavan-3-ol terminal mais abundante e a (-)-epicatequina predomina largamente como unidade de extensão. No caso de procianidinas do tipo A, a ligação interflavânica C2-C7 encontra-se essencialmente nas unidades terminais. O grau médio de polimerização das diversas fracções varia entre 1.0 e 10.8. A sua capacidade antioxidante, medida pelo método espectrofotométrico de DPPH•, mostrou-se ser equivalente à de uma amostra comercial de (+)-catequina usada como referência. A partir dos graus médios de polimerização experimentais e das análises de FTIR das fracções correspondentes foi possível obter um modelo preditivo O-PLS com apenas uma variável latente. O pré-tratamento enzimático justificou-se pelo conhecimento existente acerca do uso de enzimas específicas que destroem parcialmente as paredes celulares. Atendendo à composição das paredes celulares da grainha da uva preparou-se uma suspensão contendo protease, xilanase, pectinase e celulase. Para determinar as condições experimentais do pré-tratamento que maximizam o rendimento da extracção, estudou-se o efeito do tempo de reacção, temperatura, pH, diâmetro médio das partículas de grainha moída e a concentração das enzimas. Os incrementos do rendimento da extracção de óleo observados atingiram 163.2%. O estudo da extracção supercrítica (SFE) do óleo da grainha de uva tratada e não-tratada permitiu obter as curvas de extracção correspondentes, bem com analisar a influência das condições operatórias sobre o seu andamento. Montou-se uma instalação laboratorial onde se realizaram experiências com dióxido de carbono a 160, 180, 200 e 220 bar e temperaturas de 313.15 e 323.15 K. Os rendimentos obtidos por SFE foram semelhantes aos de Soxhlet com n-hexano. As curvas de extracção medidas compreendem um primeiro período de extracção, onde se remove cerca de 92-97% do óleo disponível, e um segundo período, essencialmente difusional, com pouco impacto no rendimento final. Os vários extractos recolhidos e o óleo global obtido foram caracterizados para avaliar a sua qualidade e relacioná-la com as condições operatórias de SFE. Determinaram-se o conteúdo total em triacilglicerídeos, o seu perfil de ácidos gordos e a capacidade antioxidante (AOC). Os resultados mostraram que a AOC aumenta com a elevação da pressão e, acentuadamente, com o acréscimo da temperatura. Ao longo da curva de extracção, a AOC é mais pronunciada nos extractos iniciais, nomeadamente nos primeiros 30 a 40% da extracção. A modelação efectuada considerou que o óleo extractável se reparte entre células rompidas, predominantes na periferia da semente, e células intactas, mais interiores. Admitiu-se que o transporte de massa ocorre em série, i.e. das células intactas para as rompidas e destas para o solvente; mostrou-se que a dispersão axial era desprezável. Os balanços materiais à fase fluida e aos volumes de células rompidas e intactas, combinados com os fluxos interno, externo e a relação de equilíbrio foram resolvidos numericamente pelo método das linhas combinado com diferenças finitas atrasadas. O modelo reproduziu bem as curvas experimentais e permitiu simular curvas de eluição e os três perfis de concentração no leito.

Avaliação da influência da natureza da matriz sólida sobre a extração supercrítica de óleos vegetais

A extração de substâncias de substratos sólidos tanto a baixas como a altas pressões envolve pelo menos duas fases, uma sólida e outra fluida. O conteúdo de soluto em cada fase é expresso em termos do volume da fase e/ou do volume do solvente. Então para modelar a transferência de massa interfacial, é necessário um coeficiente de partição. Em geral a forma mais simples para tratar o problema é modelar as fases separadamente. O mecanismo de transferência de massa predominante pode variar de sistema para sistema. Para alguns substratos a maior resistência pode estar na fase sólida e para outros ela está na fase fluida. Como na interface as concentrações referentes a cada fase são representadas por grandezas diferentes, as fases têm de ser modeladas separadamente. No entanto, dependendo do sistema, pode haver um mecanismo de transferência predominando sobre o outro e, muitos efeitos podem ser desprezados para a simplificação do modelo. A utilização de modelos matemáticos mais simples requer uma combinação das variáveis na definição de parâmetros mais abrangentes que possam representar o fenômeno. Neste trabalho as curvas de extração foram ajustadas a um modelo que descreve a transferência de massa interfacial como uma cinética de primeira ordem, tendo a constante da velocidade de extração único parâmetro de ajuste. Propõe-se que este parâmetro de ajuste depende da solubilidade do soluto no solvente supercrítico e das características do substrato solido. Para isto foram feitos experimentos de extração com babaçu, açaí em pó e polpa de pupunha, usando dióxido de carbono supercrítico nas condições de 20, 25 e 30 MPa a uma temperatura de 50 ºC. Os resultados mostraram que os dados experimentais se ajustam bem a um modelo com uma constante característica de cada material, com valores 4,1983 x 10-5 m/kg∙s para o babaçu, 4,2258 x 10-5 m/kg∙s para a pupunha e 3,9115 x 10-5 m/kg∙s para o açaí em pó.

Extraction of spin periods of space debris from optical light curves

The population of space debris increased drastically during the last years. These objects have become a great threat for active satellites. Because the relative velocities between space debris and satellites are high, space debris objects may destroy active satellites through collisions. Furthermore, collisions involving massive objects produce large number of fragments leading to significant growth of the space debris population. The long term evolution of the debris population is essentially driven by so-called catastrophic collisions. An effective remediation measure in order to stabilize the population in Low Earth Orbit (LEO) is therefore the removal of large, massive space debris. To remove these objects, not only precise orbits, but also more detailed information about their attitude states will be required. One important property of an object targeted for removal is its spin period, spin axis orientation and their change over time. Rotating objects will produce periodic brightness variations with frequencies which are related to the spin periods. Such a brightness variation over time is called a light curve. Collecting, but also processing light curves is challenging due to several reasons. Light curves may be undersampled, low frequency components due to phase angle and atmospheric extinction changes may be present, and beat frequencies may occur when the rotation period is close to a multiple of the sampling period. Depending on the method which is used to extract the frequencies, also method-specific properties have to be taken into account. The astronomical Institute of the University of Bern (AIUB) light curve database will be introduced, which contains more than 1,300 light curves acquired over more than seven years. We will discuss properties and reliability of different time series analysis methods tested and currently used by AIUB for the light curve processing. Extracted frequencies and reconstructed phases for some interesting targets, e.g. GLONASS satellites, for which also SLR data were available for the period confirmation, will be presented. Finally we will present the reconstructed phase and its evolution over time of a High-Area-to-Mass-Ratio (HAMR) object, which AIUB observed for several years.

GYAN: A methodology for rule extraction from artificial neural networks

Artificial neural network (ANN) learning methods provide a robust and non-linear approach to approximating the target function for many classification, regression and clustering problems. ANNs have demonstrated good predictive performance in a wide variety of practical problems. However, there are strong arguments as to why ANNs are not sufficient for the general representation of knowledge. The arguments are the poor comprehensibility of the learned ANN, and the inability to represent explanation structures. The overall objective of this thesis is to address these issues by: (1) explanation of the decision process in ANNs in the form of symbolic rules (predicate rules with variables); and (2) provision of explanatory capability by mapping the general conceptual knowledge that is learned by the neural networks into a knowledge base to be used in a rule-based reasoning system. A multi-stage methodology GYAN is developed and evaluated for the task of extracting knowledge from the trained ANNs. The extracted knowledge is represented in the form of restricted first-order logic rules, and subsequently allows user interaction by interfacing with a knowledge based reasoner. The performance of GYAN is demonstrated using a number of real world and artificial data sets. The empirical results demonstrate that: (1) an equivalent symbolic interpretation is derived describing the overall behaviour of the ANN with high accuracy and fidelity, and (2) a concise explanation is given (in terms of rules, facts and predicates activated in a reasoning episode) as to why a particular instance is being classified into a certain category.

Optimisation of bio-oil extraction process from Beauty Leaf (Calophyllum inophyllum) oil seed as a second generation biodiesel source

The Beauty Leaf tree (Calophyllum inophyllum) is a potential source of non-edible vegetable oil for producing future generation biodiesel because of its ability to grow in a wide range of climate conditions, easy cultivation, high fruit production rate, and the high oil content in the seed. This plant naturally occurs in the coastal areas of Queensland and the Northern Territory in Australia, and is also widespread in south-east Asia, India and Sri Lanka. Although Beauty Leaf is traditionally used as a source of timber and orientation plant, its potential as a source of second generation biodiesel is yet to be exploited. In this study, the extraction process from the Beauty Leaf oil seed has been optimised in terms of seed preparation, moisture content and oil extraction methods. The two methods that have been considered to extract oil from the seed kernel are mechanical oil extraction using an electric powered screw press, and chemical oil extraction using n-hexane as an oil solvent. The study found that seed preparation has a significant impact on oil yields, especially in the screw press extraction method. Kernels prepared to 15% moisture content provided the highest oil yields for both extraction methods. Mechanical extraction using the screw press can produce oil from correctly prepared product at a low cost, however overall this method is ineffective with relatively low oil yields. Chemical extraction was found to be a very effective method for oil extraction for its consistence performance and high oil yield, but cost of production was relatively higher due to the high cost of solvent. However, a solvent recycle system can be implemented to reduce the production cost of Beauty Leaf biodiesel. The findings of this study are expected to serve as the basis from which industrial scale biodiesel production from Beauty Leaf can be made.

Response to chemotherapy is predictive in relation to longer overall survival in an individual patient combined-analysis with pleural mesothelioma

Background: There is currently no early predictive marker of survival for patients receiving chemotherapy for malignant pleural mesothelioma (MPM). Tumour response may be predictive for overall survival (OS), though this has not been explored. We have thus undertaken a combined-analysis of OS, from a 42 day landmark, of 526 patients receiving systemic therapy for MPM. We also validate published progression-free survival rates (PFSRs) and a progression-free survival (PFS) prognostic-index model. Methods: Analyses included nine MPM clinical trials incorporating six European Organisation for Research and Treatment of Cancer (EORTC) studies. Analysis of OS from landmark (from day 42 post-treatment) was considered regarding tumour response. PFSR analysis data included six non-EORTC MPM clinical trials. Prognostic index validation was performed on one non-EORTC data-set, with available survival data. Results: Median OS, from landmark, of patients with partial response (PR) was 12·8 months, stable disease (SD), 9·4 months and progressive disease (PD), 3·4 months. Both PR and SD were associated with longer OS from landmark compared with disease progression (both p < 0·0001). PFSRs for platinum-based combination therapies were consistent with published significant clinical activity ranges. Effective separation between PFS and OS curves provided a validation of the EORTC prognostic model, based on histology, stage and performance status. Conclusion: Response to chemotherapy is associated with significantly longer OS from landmark in patients with MPM. © 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Parameter extraction and calorimetric validation for a silicon carbide jfet pspice model

This paper focuses on the PSpice model of SiC-JFET element inside a SiCED cascode device. The device model parameters are extracted from the I-V and C-V characterization curves. In order to validate the model, an inductive test rig circuit is designed and tested. The switching loss is estimated both using oscilloscope and calorimeter. These results are found to be in good agreement with the simulated results.

Simultaneous Determination of Multi-Organotin Compounds in Seawater by Liquid-Liquid Extraction-High Performance Liquid Chromatography-Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry

The hyphenated technique of high performance liquid chromatography coupled with inductively coupled plasma mass spectrometry (HPLC-ICP-MS) was applied to the simultaneous determination of five organotin compounds (trimethyltin, dibutyltin, tributyltin, diphenyltin and triphenyltin) in seawater samples. Agilent TC-C18 column was used for the separation, the mobile phase of HPLC was CH3CN : H2O: CH3COOH=65 : 23 : 12 (phi), 0.05% TEA, and pH value was adjusted to 3.0 by diluent ammonia. The flow rate was 0.6 mL . min(-1). Five mixed organotin compounds in a mix standard solution from 100 to 0.5 mu g . L-1 were applied for the method assessment. The experimental results indicate that the correlation coefficient of calibration curves (R-2) for each organotin compound was over 0.998 and the detection limits of the five organotin compounds were lower than 3 ng . L-1. Different mixed organic solvents including dichloromethane or toluene were used for extraction of organotin and the extraction condition of organotin from seawater was optimized. The 100 mL seawater acidized by hydrochloric acid was extracted by 10 mL carbon dichloride (CH2Cl2) with 2% tropolone for 10 min twice. Extracted organic solvents were mixed And blown to one drop by nitrogen with the rate of 1.7 mL . min(-1), then 1 mL acetonitrile was added to the drop for redissolving the organotin compounds. Finally, the mixed redissolution was filtered by 0.22 mu m organic filter membrane before analysis. it was found that the only organotin compound in seawater was triphenyltin (TPHT) and the content was 53.2 ng . L-1. The recoveries test from the standard addition for diphenyltin (DPHT), dibutyltin (DBT), tributyltin (TBT) and triphenyltin (TPHT) were over 80%. However, the recovery for trimethyltin (TMT) was relatively low and the value was 50%. The reason might be attributed to the decomposition or adsorption of those compounds during the extraction procedure. Further study on this subject is in progress.

High-quality RNA extraction from copepods for Next Generation Sequencing: A comparative study

Despite the ecological importance of copepods, few Next Generation Sequencing studies (NGS) have been performed on small crustaceans, and a standard method for RNA extraction is lacking. In this study, we compared three commonly-used methods: TRIzol®, Aurum Total RNA Mini Kit and Qiagen RNeasy Micro Kit, in combination with preservation reagents TRIzol® or RNAlater®, to obtain high-quality and quantity of RNA from copepods for NGS. Total RNA was extracted from the copepods Calanus helgolandicus, Centropages typicus and Temora stylifera and its quantity and quality were evaluated using NanoDrop, agarose gel electrophoresis and Agilent Bioanalyzer. Our results demonstrate that preservation of copepods in RNAlater® and extraction with Qiagen RNeasy Micro Kit were the optimal isolation method for high-quality and quantity of RNA for NGS studies of C. helgolandicus. Intriguingly, C. helgolandicus 28S rRNA is formed by two subunits that separate after heat-denaturation and migrate along with 18S rRNA. This unique property of protostome RNA has never been reported in copepods. Overall, our comparative study on RNA extraction protocols will help increase gene expression studies on copepods using high-throughput applications, such as RNA-Seq and microarrays.

Paralytic shellfish poisoning detection by surface plasmon resonance-based biosensors in shellfish matrixes.

The detection of paralytic shellfish poisoning (PSP) toxins in contaminated shellfish is essential for human health preservation. Ethical and technical reasons have prompted the search for new detection procedures as an alternative to the mouse bioassay. On the basis of the detection of molecular interactions by surface plasmon resonance (SPR) biosensors, an inhibition assay was developed using an anti-GTX2/3 antibody (GT13-A) and a saxitoxin-CM5 chip. This assay allowed for quantification of saxitoxin (STX), decarbamoyl saxitoxin (dcSTX), gonyautoxin 2,3 (GTX2/3), decarbamoyl gonyautoxin 2,3 (dcGTX2/3), gonyautoxin 5 (GTX5), and C 1,2 (C1/2) at concentrations from 2 to 50 ng/mL. The interference of five shellfish matrixes with the inhibition assay was analyzed. Mussels, clams, cockles, scallops, and oysters were extracted with five published methods. Ethanol extracts and acetic acid/heat extracts (AOAC Lawrence method) performed adequately in terms of surface regeneration and baseline interference, did not inhibit antibody binding to the chip surface significantly, and presented STX calibration curves similar to buffer controls in all matrixes tested. Hydrochloric acid/heat extracts (AOAC mouse bioassay method) presented surface regeneration problems, and although ethanol-acetic acid/dichloromethane extracts performed well, they were considered too laborious for routine sample testing. Overall the best results were obtained with the ethanol extraction method with calibration curves prepared in blank matrix extracts. STX recovery rate with the ethanol extraction method was 60.52 ± 3.72%, with variations among species. The performance of this biosensor assay in natural samples, compared to two AOAC methods for PSP toxin quantification (mouse bioassay and HPLC), suggests that this technology can be useful as a PSP screening assay. In summary, the GT13-A-STX chip inhibition assay is capable of PSP toxin detection in ethanol shellfish extracts, with sufficient sensitivity to quantify the toxin in the range of the European regulatory limit of 80 g/100 g of shellfish meat.