Development of a Rapid Multiplex PCR Assay To Genotype Pasteurella multocida Strains by Use of the Lipopolysaccharide Outer Core Biosynthesis Locus

Pasteurella multocida is a Gram-negative bacterial pathogen that is the causative agent of a wide range of diseases in many animal species, including humans. A widely used method for differentiation of P. multocida strains involves the Heddleston serotyping scheme. This scheme was developed in the early 1970s and classifies P. multocida strains into 16 somatic or lipopolysaccharide (LPS) serovars using an agar gel diffusion precipitin test. However, this gel diffusion assay is problematic, with difficulties reported in accuracy, reproducibility, and the sourcing of quality serovar-specific antisera. Using our knowledge of the genetics of LPS biosynthesis in P. multocida, we have developed a multiplex PCR (mPCR) that is able to differentiate strains based on the genetic organization of the LPS outer core biosynthesis loci. The accuracy of the LPS-mPCR was compared with classical Heddleston serotyping using LPS compositional data as the "gold standard." The LPS-mPCR correctly typed 57 of 58 isolates; Heddleston serotyping was able to correctly and unambiguously type only 20 of the 58 isolates. We conclude that our LPS-mPCR is a highly accurate LPS genotyping method that should replace the Heddleston serotyping scheme for the classification of P. multocida strains.

Ocorrência e caracterização de Estafilococos coagulase negativos isolados de recémnascidos com bacteremias em unidade de terapia intensiva neonatal no HUPE-UERJ

Staphylococcus coagulase-negativo (SCN) estão frequentemente envolvidos em infecções nosocomiais associadas com o uso de cateteres e outros procedimentos médicos invasivos. A habilidade de aderir às superfícies abióticas e de produzir biofilme tem sido reconhecida entre os principais fatores de virulência dos SCN, especialmente de S. epidermidis, a principal espécie responsável por infecções relacionadas à assistência a saúde - IRASs. Dentre as demais espécies de SCN capazes de produzir biofilme, S. haemolyticus tem sido relacionado com quadros de infecções em recém-nascidos (RNs). O presente estudo teve como objetivo principal investigar aspectos microbiológicos e epidemiológicos dos processos infecciosos invasivos relacionados com SCN em neonatos internados em unidade de terapia intensiva neonatal (UTIN) de um hospital universitário do município do Rio de Janeiro (2008-2010). A técnica de PCR multiplex-mPCR foi empregada na determinação das espécies de 40 amostras de SCN isoladas de hemoculturas de RNs fazendo uso de cateteres intravenosos e submetidos à terapia antimicrobiana empírica com vancomicina e/ou gentamicina. A fenotipagem foi realizada por três métodos distintos: Simplificado em microplaca, Vitek 2 e API-Staph. Os perfis de resistência aos antimicrobianos foram verificados através do teste de disco-difusão, determinação de CIM (Oxacilina) e presença do gene mecA. A capacidade de produção de biofilme foi investigada pelos testes do Ágar Vermelho do Congo e ensaios de aderência em superfícies abióticas (poliestireno e vidro) além da PCR para os genes icaAB, atlE e aap. O perfil genômico dos micro-organismos foi determinado pela técnica de PFGE. Os resultados demonstraram o isolamento de S. haemolyticus (77%), S. epidermidis (15%), S. captis (5%) e S. warneri (3%). A análise comparativa dos resultados obtidos pelo m-PCR com métodos fenotípicos demonstrou uma concordância de 97,5% com o esquema simplificado e de ~40% Vitek 2 e o API Staph. A maioria (82,5%) das amostras apresentou perfis variados de multiresistência aos 16 antimicrobianos testados e resistência a oxacilina, apesar de 25% destas não apresentarem o gene mecA. Apesar da maioria das amostras de SCN ter apresentado capacidade de produzir slime e/ou biofilme não foi observada total correlação com a presença dos genes mecA, icaAB, aap, atlE, enfatizando a natureza multifatorial da produção de biofilme de SCN. Diferente do observado para as demais espécies, algumas amostras de S. haemolyticus foram incapazes de aderir ao vidro e ao poliestireno e/ou apresentaram os genes aap (38,7%), atlE (42%) além de icaAB (71%). Na UTIN foi detectada a presença de seis diferentes tipos clonais da espécie prevalente, indicando a disseminação de S. haemolyticusnesta unidade hospitalar e a endemicidade em nossa comunidade.

Staphylococcus haemolyticus e Staphylococcus epidermidis isolados de fômites de origem hospitalar: perfis de resistência aos agentes antimicrobianos e produção de biofilme

Os Staphylococcus coagulase-negativos (SCN) são encontrados na pele e mucosas de seres humanos e outros animais, já que algumas espécies são parte constituinte da microbiota normal destes mesmos sítios, e podem constituir um reservatório para SCN. A espécie Staphylococcus epidermidis, é reconhecida como grande oportunista e agente de graves infecções nosocomiais e comunitárias, além de associado com infecções em pacientes submetidos a implantes com dispositivos médicos, e a espécie Staphyloccus haemolyticus é a segunda espécie mais isolada de hemoculturas humanas, sendo uma das espécies que apresenta elevada resistência aos antimicrobianos. O presente estudo teve como objetivo principal investigar a presença de SCN em fômites (estetoscópios, termômetros e esfigmomanômetros) no ambiente hospitalar, identificar as espécies S. haemolyticus e S. epidermidis e correlacionar seus perfis de resistência aos antimicrobianos com a capacidade de produção de biofilme. A técnica de multiplex-mPCR foi empregada na determinação das espécies e a fenotipagem foi realizada pelos testes fenotípicos convencionais. Os perfis de resistência aos antimicrobianos foram verificados através do teste de disco-difusão, determinação da CIM (oxacilina e vancomicina), determinação da CBM e presença do gene mecA. A capacidade de produção de biofilme foi investigada pelos testes do Ágar Vermelho do Congo e ensaios de aderência em superfícies abióticas (poliestireno e vidro) na presença e ausência de oxacilina e vancomicina, além da PCR para o gene icaAD. Os resultados demonstraram que pelos testes bioquímicos convencionais, a espécie mais encontrada foi S. epidermidis (43,5%). Após a confirmação pela técnica de PCR, 29 amostras (82%) foram identificadas como S. epidermidis, e 6 amostras (18%) foram identificadas como S. haemolyticus. Todas as amostras foram multirresistentes, oxacilina resistentes e vancomicina sensíveis, sendo que apenas 5 amostras S. epidermidis (17,2%) foram tolerantes a oxacilina. A presença do gene mecA foi detectada em 71,4% das amostras. Apesar da maioria das amostras ter apresentado capacidade de produzir slime e/ou biofilme não foi observada total correlação com a presença do gene icaAD enfatizando a natureza multifatorial da produção de biofilme. As amostras aderiram melhor ao esfigmomanômetro, e também, neste fômites, foi encontrado a maior porcentagem de amostras positivas para a produção de slime. Para aderência ao vidro e aderência ao poliestireno não foi encontrada correlação com os fômites. Foram isoladas amostras S. epidermidis de todos os sítios hospitalares estudados e S. haemolyticus só não foi encontrado em Enfermaria de Clínica Médica. Em relação aos fômites, S. epidermidis foi encontrado em todos os fômites estudados, e S. haemolyticus, apenas foi encontrado em esfigmomanômetro e em outros fômites. Os fômites estão servindo como fontes de transmissão e disseminação de micro-organismos, sendo necessário maiores estudos a respeito.

Inteligência emocional: a compreensão das emoções em crianças do pré-escolar

A inteligência emocional (IE) tem sido geralmente estudada no contexto da compreensão do funcionamento do adulto (Hall, Geher, & Brackett, 2004). Como tal, muitos aspectos da IE têm sido raramente estudados em crianças (Lahaye et al., 2010). Este estudo procura estudar e medir em crianças do pré-escolar a compreensão emocional (CE), um construto complexo, considerado componente-chave da IE das crianças pequenas (Denham et al., 2003). Especificamente, o estudo analisa as relações do desenvolvimento cognitivo, temperamento, relação com os pares, género, idade, estatuto socioeconómico e número de irmãos com a CE. A amostra é constituída por 140 crianças entre os 4 e 6 anos, às quais foram administradas o Test of Emotion Comprehension (TEC, Pons, Harris, & de Rosnay, 2004), as Matrizes Progressivas Coloridas de Raven (MPCR, aferida por Simões, 2000), a Escala de Personalidade da Criança (EPC, Dibble & Cohen, 1974) e uma análise sociométrica (Peceguina, Santos, & Daniel, 2008). Os resultados indicam correlações entre a CE e o desenvolvimento cognitivo e o temperamento, não existindo uma sobreposição entre estes três construtos. A CE é um construto desenvolvimental que vai aumentando através da idade, e que influencia as relações da criança com os pares. Os resultados desten estudo fornecem pistas relevantes para intervenções que visem a promoção de competências socio-emocionais.

A relação entre inteligência emocional e o rendimento escolar em crianças do 1º Ciclo do Ensino Básico da R.A.M.

Este estudo insere-se no domínio da investigação sobre a relação entre inteligência emocional e o rendimento escolar. A pesquisa foi desenvolvida no sentido de dar resposta às questões: Será que existe alguma relação entre a IE, a IE percebida e o rendimento escolar? Será que o género, a idade, o índice de participação social, o estatuto socioeconómico dos pais e a retenção escolar influenciam a IE, a IE percebida e o rendimento escolar? Participaram neste estudo 129 crianças de ambos os géneros, feminino e masculino, que frequentavam o 1.º Ciclo do Ensino Básico, com idades compreendidas entre os seis e os treze anos. A metodologia utilizada foi a quantitativa transversal correlacional. Os instrumentos usados: Informação Sociodemográfica e Educativa, Matrizes Coloridas de Raven (MPCR, Raven et al., 2001), Questionário de Inteligência Emocional de Bar-On (Candeias & Rebocho, 2007; Candeias et al., 2008) e o Test of Emotional Comprehension (TEC, Pons, Harris, & Rosnay, 2004). Os resultados revelam que apenas alguns aspetos da IE se relacionam com algumas das variáveis do rendimento escolar não sendo, neste caso, consideradas as variáveis género, participação social e retenção, se relacionando com a IE.

Myonecrosis by Clostridium septicum in a dog, diagnosed by a new multiplex-PCR

Clostridial myositis is an acute, generally fatal toxemia that is considered to be rare in pet animals. The present report describes an unusual canine clostridial myositis that was diagnosed by a new multiplex-PCR (mPCR) designed for simultaneous identification of Clostridium sordellii, Clostridium septicum, Clostridium perfringens type A, Clostridium chauvoei, and Clostridium novyi type A. A ten-month-old male Rottweiler dog, that had displayed lameness and swelling of the left limb for 12 h, was admitted to a veterinary hospital. The animal was weak, dyspneic and hyperthermic, and a clinical examination indicated the presence of gas and edema in the limb. Despite emergency treatment, the animal died in only a few minutes. Samples of muscular tissue from the necrotic area were aseptically collected and plated onto defibrinated sheep blood agar (5%) in anaerobic conditions. Colonies suggestive of Clostridium spp. were submitted to testing by multiplex-PCR. Impression smears of the tissues, visualized with Gram and also with panoptic stains, revealed long rod-shaped organisms, and specimens also tested positive using the fluorescent antibody technique (FAT). The FAT and mPCR tests enabled a diagnosis of C. septicum myonecrosis in the dog. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Multiplex polymerase chain reaction to identify and determine the toxigenicity of Corynebacterium spp with zoonotic potential and an overview of human and animal infections

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Padronização da técnica de multiplex PCR para a detecção de Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae e Escherichia coli em amostras de leite bovino, obtidas de tanques de expansão

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Five-year results of a randomized controlled clinical trial comparing zirconia and titanium abutments supporting single-implant crowns in canine and posterior regions

OBJECTIVES: To test the survival rates, and the technical and biological complication rates of customized zirconia and titanium abutments 5 years after crown insertion. MATERIAL AND METHODS: Twenty-two patients with 40 single implants in maxillary and mandibular canine and posterior regions were included. The implant sites were randomly assigned to zirconia abutments supporting all-ceramic crowns or titanium abutments supporting metal-ceramic crowns. Clinical examinations were performed at baseline, and at 6, 12, 36 and 60 months of follow-up. The abutments and reconstructions were examined for technical and/or biological complications. Probing pocket depth (PPD), plaque control record (PCR) and Bleeding on Probing (BOP) were assessed at abutments (test) and analogous contralateral teeth (control). Radiographs of the implants revealed the bone level (BL) on mesial (mBL) and distal sides (dBL). Data were statistically analyzed with nonparametric mixed models provided by Brunner and Langer and STATA (P < 0.05). RESULTS: Eighteen patients with 18 zirconia and 10 titanium abutments were available at a mean follow-up of 5.6 years (range 4.5-6.3 years). No abutment fracture or loss of a reconstruction occurred. Hence, the survival rate was 100% for both. Survival of implants supporting zirconia abutments was 88.9% and 90% for implants supporting titanium abutments. Chipping of the veneering ceramic occurred at three metal-ceramic crowns supported by titanium abutments. No significant differences were found at the zirconia and titanium abutments for PPD (meanPPD(ZrO2) 3.3 ± 0.6 mm, mPPD(T) (i) 3.6 ± 1.1 mm), PCR (mPCR(Z) (rO) (2) 0.1 ± 0.3, mPCR(T) (i) 0.3 ± 0.2) and BOP (mBOP(Z) (rO) (2) 0.5 ± 0.3, mBOP(T) (i) 0.6 ± 0.3). Moreover, the BL was similar at implants supporting zirconia and titanium abutments (mBL(Z) (rO) (2) 1.8 ± 0.5, dBL(Z) (rO) (2) 2.0 ± 0.8; mBL(T) (i) 2.0 ± 0.8, dBL(T) (i) 1.9 ± 0.8). CONCLUSIONS: There were no statistically or clinically relevant differences between the 5-year survival rates, and the technical and biological complication rates of zirconia and titanium abutments in posterior regions.

A multiplex PCR for the simultaneous detection and genotyping of the Echinococcus granulosus complex.

Echinococcus granulosus is characterized by high intra-specific variability (genotypes G1-G10) and according to the new molecular phylogeny of the genus Echinococcus, the E. granulosus complex has been divided into E. granulosus sensu stricto (G1-G3), E. equinus (G4), E. ortleppi (G5), and E. canadensis (G6-G10). The molecular characterization of E. granulosus isolates is fundamental to understand the spatio-temporal epidemiology of this complex in many endemic areas with the simultaneous occurrence of different Echinococcus species and genotypes. To simplify the genotyping of the E. granulosus complex we developed a single-tube multiplex PCR (mPCR) allowing three levels of discrimination: (i) Echinococcus genus, (ii) E. granulosus complex in common, and (iii) the specific genotype within the E. granulosus complex. The methodology was established with known DNA samples of the different strains/genotypes, confirmed on 42 already genotyped samples (Spain: 22 and Bulgaria: 20) and then successfully applied on 153 unknown samples (Tunisia: 114, Algeria: 26 and Argentina: 13). The sensitivity threshold of the mPCR was found to be 5 ng Echinoccoccus DNA in a mixture of up to 1 µg of foreign DNA and the specificity was 100% when template DNA from closely related members of the genus Taenia was used. Additionally to DNA samples, the mPCR can be carried out directly on boiled hydatid fluid or on alkaline-lysed frozen or fixed protoscoleces, thus avoiding classical DNA extractions. However, when using Echinococcus eggs obtained from fecal samples of infected dogs, the sensitivity of the mPCR was low (<40%). Thus, except for copro analysis, the mPCR described here has a high potential for a worldwide application in large-scale molecular epidemiological studies on the Echinococcus genus.

Assessment of iodine intake and related cognitive function impairments in elementary schoolchildren from Terceira Island, Azores (Portugal)

Dissertação de Mestrado, Ciências Biomédicas, 28 de Junho de 2016, Universidade dos Açores.

Competências sócio-emocionais em crianças com dificuldades de aprendizagem : Estudo de caracterização em alunos do 1º ciclo do ensino básico

As dificuldades de aprendizagem são tema de grande relevância no campo da educação, pelas repercussões que têm no desenvolvimento das crianças que as possuem, quer a nível pessoal, familiar, escolar e social. A compreensão das competências sócio-emocionais destas crianças surge como objecto de estudo desta investigação. A amostra é constituída por 74 crianças com dificuldades de aprendizagem do 1° Ciclo do Ensino Básico. Os instrumentos utilizados foram: o Inventário de Quociente Emocional Bar-On: Versão para crianças (EQ-i:YV; versão portuguesa; Candeias et al., 2008), o Teste de Resolução de Problemas lnterpessoais da Inteligência Social para Crianças (PRPI - 6/11; Candeias et al., 2008), o Teste de Competências Sociais para Crianças (PACS - Socialmente em Acção 6/11, Candeias et al., 2008), o Teste de Percepção de Emoções (Franco & Candeias, 2008) e as Matrizes Progressivas Coloridas de Raven (MPCR, Raven, 1965). Estudaram-se as relações entre a inteligência social, inteligência emocional, competência social e variáveis sócio-demográficas como a idade, o nível sócio-económico e a participação social destas crianças. Conclui-se que, quanto mais elevada é a competência emocional destes alunos, menores serão as suas dificuldades em termos de competência social. Estes achados permitem aumentar o conhecimento teórico sobre esta problemática, possibilitando a aplicação prática na intervenção psicológica e psicopedagógica. / ABSTRACT: Learning difficulties are the subject of great relevance in education, the impact they have on the development of children who have, whether for personal, familial, educational and social. Understanding of the socio-emotional skills of these children appears to be the subject of this research study. This study used a sample of 74 children with learning difficulties the first cycle of the cities of Évora and Montemor-o­ Novo. We applied: Emotional Quocient lnventory Bar-On: young version (EQ-i: YV; Candeias et al., 2008); Perception and Recognition Emotions (Franco & Candeias, 2008); Cognitive Test of Social lntelligence for Children (PRPI-6/11; Candeias et al., 2008); Social Competence Test for Children (PACS-6/11; Candeias et al., 2008) and Coloured Progressive Matrices (CPM, Raven, 1965). We studied the relationship between social intelligence, emotional intelligence, social competence and socio-demographic variables such as age, socio-economic and social participation of these children. lt was concluded that, the higher the emotional competence of these students, lower their difficulties in terms of social competence. These findings increase the theoretical knowledge on this issue, enabling the practical application in psychological and pedagogic. This study leaves open some suggestions for future work.