977 resultados para Polimorfismo (Genética) Teses


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Um estudo envolvendo populaes asiticas e amerndias foi realizado para avaliar os relacionamentos histricos e genticos entre eles atravs de polimorfismos moleculares autossmicos. Um deles uma seqncia polimrfica localizada na regio 16p13.3. Um total de 1558 pares de base foram investigados em 98 indivduos da Monglia, Beringia e das Amricas. Estes resultados foram comparados com aqueles obtidos em uma prvia investigao por outros autores. Cinqenta e cinco stios polimrficos foram classificados em trinta e cinco hapltipos. Uma rvore de hapltipos (median joining network) baseada neles, revelou dois grupos distintos, um mais compacto com hapltipos derivados das cinco categorias etno-geogrficas estabelecidas; enquanto o outro, com hapltipos mais divergentes, era composto principalmente por africanos e amerndios. Quase todos os parmetro de neutralidade apresentaram valores negativos. Simulaes realizadas para interpretar estes resultados foram executadas com dois conjuntos de dados: um composto exclusivamente de amerndios e outro com populaes mundiais. O primeiro, sugerindo crescimento e declnio populacional, rejeitou os cenrios com crescimento abaixo de cinco vezes e anteriores a ~18 mil anos atrs; enquanto que o segundo, sugerindo crescimento populacional, no rejeitou cenrios nos quais a magnitude de crescimento foi maior que dez vezes e anteriores a ~21 mil anos atrs, provavelmente refletindo um crescimento antigo fora da frica. Doze polimorfismos de inseres Alu foram tambm estudados em 170 indivduos pertencentes a 7 grupos nativos sul-americanos, 60 a dois siberianos, e 91 a dois mongis. Estes dados foram integrados com aqueles de 488 indivduos associados a outros 13 grupos, para determinar as relaes entre asiticos, Beringianos e amerndios. Nestes trs grupos, foi observado um decrscimo da heterozigosidade e da quantidade de fluxo gnico, na mesma ordem indicada acima. A solidez destas subdivises foi demonstrada nas distncias genéticas, nas anlises de componentes principais, de varincia molecular, no teste de Mantel, e numa abordagem Bayesiana de atribuio genética. Entretanto, no pode ser observada uma clara estrutura entre os nativos Sul-americanos, indicando a importncia dos fatores dispersivos (deriva genética, efeito fundador) na sua diferenciao. A congruncia dos resultados obtidos com os dois marcadores so: (a) no foi confirmada uma histria de declnio populacional forte associado com a chegada do homem pr-histrico nas Amricas; (b) os amerndios no apresentaram estruturao clara dentro do continente e no se diferenciaram dos asiticos do nordeste da sia (beringianos); e (c) o povo Ach foi o grupo mais divergente.

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A Mancha Foliar de Phaeosphaeria considerada uma das mais importantes molstias do milho no Brasil. Atualmente, existem dvidas quanto ao agente causal e o melhoramento gentico tem dificuldade de desenvolver cultivares resistentes estveis. Neste estudo os objetivos foram identificar os fungos causadores da molstia, estudar a herana da resistncia, sob infestao natural e artificial, e identificar marcadores moleculares ligados resistncia molstia. Quatro fungos foram associados s leses de Phaeosphaeria. Phyllosticta sp., Phoma sorghina e Sporormiella sp. foram patognicos e Phoma sp. no foi testado. Os fungos P. sorghina e Phoma sp. foram, respectivamente, o predominante e o menos freqente na leso para todos os quatro ambientes coletados. Phyllosticta sp. e Sporormiella sp. foram os de mais baixa freqncia e restritos a locais. Estudos sob infestao natural, com trs cruzamentos, em um nico ambiente e com trs tipos de avaliao de severidade evidenciaram a presena de variabilidade genética para a resistncia e proporcionaram estimativas de herdabilidade intermedirias (0,48-0,69). No estudo de mdias de geraes o modelo aditivo-dominante explicou as bases genéticas da resistncia, sendo a ao gnica de dominncia a mais importante. A inoculao artificial de um cruzamento com Phyllosticta sp. e P. sorghina, confirmaram a presena de dominncia. Nos estudos moleculares, a fenotipagem foi realizada sob infestao natural e para um nico ambiente e a genotipagem com marcadores microssatlites. A percentagem de polimorfismo obtida foi de 36%, sendo que seis QTLs foram identificados. Estes resultados indicam que vrios fungos esto envolvidos na produo dos sintomas da molstia conhecida por Mancha Foliar de Phaeosphaeria e a composio de fungos na leso pode variar conforme o ambiente. A estimativa de herdabilidade indica a possibilidade de xito com a seleo em geraes segregantes, principalmente porque os efeitos gnicos preponderantes para a resistncia envolvem aditividade e dominncia. A anlise de QTL permitiu explicar grande parte da varincia fenotpica (80%) e genotpica (58%); entretanto, outros ambientes devem ser testados para a sua efetiva confirmao.

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O gnero Paspalum L. compreende aproximadamente 400 espcies no mundo e cerca de 220 no Brasil. Paspalum ecologicamente e economicamente importante e tem sido utilizado como pastagem. Paspalum notatum Flgge (grama-forquilha) uma valorosa gramnea forrageira nos subtrpicos. Esta espcie consiste de vrios bitipos sexuais (diplides) e apomticos (tetraplides, ocasionalmente tri e pentaplides). Neste trabalho, os Inter Simple Sequence repeat (ISSR) foram utilizados para acessar a diversidade genética da grama-forquilha (Paspalum notatum). Os tecidos vegetativos de 95 acessos de grama-forquilha foram obtidos de vrios locais da Amrica do Sul (Brasil, Argentina e Uruguai). Um total de 91 de fragmentos reproduzvel ISSR foi observado. Oitenta e nove fragmentos (97,5% do total observado) foram polimrficos. A anlise de agrupamento (UPGMA) foi realizada para o conjunto de dados ISSR. Os resultados ilustram as relaes genéticas entre 95 acessos de Paspalum notatum. A comparao entre dados moleculares, morfolgicos e nvel de ploidia foi realizada. Em resumo, os marcadores moleculares ISSR mostraram-se eficientes para distino dos gentipos analisados e observou-se uma variabilidade ampla para a espcie. Estes resultados adicionam novas informaes sobre a diversidade genética em Paspalum notatum, conseqentemente contribuindo para o conhecimento biolgico desta espcie e fornecendo subsdios para futuros programas de melhoramento gentico e para programas de conservao.

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O polimorfismo dos genes HLA-A, HLA-B e HLA-DRB1 foi estudado em trs populaes Portuguesas (Portugal continental, Madeira e Aores) e em duas Africanas (Guin-Bissau e Cabo Verde). Os dados em alta resoluo, obtidos por sequenciao (SBT), foram comparados com a caracterizao efectuada pelo mtodo SSOP revelando 4,6% de incongruncias entre os resultados destes dois mtodos. Os alelos mais frequentes em cada um dos loci foram: HLA-A*0201 em todas as populaes (13,5-26%); HLA-B*5101 em Portugal continental (12%, o mesmo para o B*440301), Madeira (9,7%) e Aores (9,8%) e B*350101 na Guin-Bissau (14,4%) e Cabo Verde (13,2%); HLADRB1*0701 em Portugal continental (15%), Madeira (15,7%) e Aores (18,3%), DRB1*1304 na Guin-Bissau (19,6%) e DRB1*110101 em Cabo Verde (10,1%). Os haplotipos 3-loci mais predominantes em cada populao foram: A*020101-B*440301-DRB1*070101 em Portugal continental (3,1%), A*020101-B*510101- DRB1*130101 na Madeira (2,7%), A*2902-B*4403-DRB1*0701 nos Aores (2,4%), A*2301-B*1503-DRB1*110101 na Guin-Bissau (4,6%) e A*3002-B*350101-DRB1*1001 em Cabo Verde (2,8%). O presente trabalho revela que a populao continental Portuguesa tem sido influenciada geneticamente por Europeus e Norte Africanos devido a vrias imigraes histricas. O Norte de Portugal parece concentrar, provavelmente devido presso da expanso rabe, um antigo pool gentico originado pela influncia milenar de Europeus e Norte Africanos. Os dados obtidos nos genes do sistema HLA corroboram as fontes histricas que confirmam que o povoamento dos Aores teve o contributo de outros Europeus, essencialmente Flamengos, para alm dos Portugueses. As frequncias allicas e haplotpicas neste arquiplago no apresentam uma distribuio homognea entre as ilhas do grupo Oriental e Central. O grupo Central revela uma influncia clara daEuropa Central e uma muito menor afinidade a Portugal continental. As frequncias allicas e haplotpicas mostram que a ilha da Madeira foi povoada por Europeus, a maioria Portugueses, mas tambm por sub-Saharianos devido ao comrcio de escravos. Cabo Verde no uma populao tipicamente sub-Sahariana pois revela uma importante influncia genética Europeia, para alm da base genética Africana. A anlise dos haplotipos e dendrogramas mostram uma influncia genética Caucasiana no actual pool gentico Cabo-Verdiano. Os dendrogramas e a anlise das coordenadas principais mostram que os Guineenses so mais semelhantes aos Norte Africanos do que qualquer outra populao sub-Sahariana j estudada ao nvel do sistema HLA, provavelmente devido a contactos histricos com outros povos, nomeadamente rabes do Este Africano e Berberes.

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Pertencente famlia Lauraceae, o abacateiro compreende trs raas hortcolas: antilhana, guatemalense e mexicana. Os marcadores moleculares so uma ferramenta rpida e eficaz para estudos genmicos, uma vez que detectam o polimorfismo diretamente ao nvel do DNA e no sofrem qualquer tipo de influncia ambiental. Com base nesse polimorfismo, possvel fazer inferncias sobre as relaes entre o gentipo e o fentipo dos indivduos, o que, em ltima anlise, permite aumentar a eficincia dos programas de melhoramento. Diante o exposto, o objetivo foi investigar a diversidade genética entre sete variedades de abacate a partir de 5 lcus de marcadores moleculares microssatlites (SSR). Nas amostras de abacateiros avaliadas, encontrou-se um total de 18 alelos, com uma mdia de 3,6 alelos por lcus. O dendrograma gerado a partir de anlise de agrupamento UPGMA agrupou, separadamente do resto dos gentipos, a cultivar Geada da raa Antilhana, possivelmente por esta variedade ser uma raa pura, e o restante foi agrupado em dois grandes grupos das raas, a Guatemalense e a Mexicana. Os gentipos das sete variedades de abacate apresentam diversidade genética nos cinco lcus de marcadores moleculares microssatlites (SSR) avaliados, o que indica que so materiais promissores para utilizao em futuros programas de melhoramento.

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Fundao de Amparo Pesquisa do Estado de So Paulo (FAPESP)

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Objetivando a verificao da existncia de plntulas originadas de embrio zigtico em viveiros comerciais de mudas ctricas, realizou-se o presente trabalho, utilizando a tcnica de fAFLP e quatro espcies de porta-enxertos para citros. Verificou-se uma base genética estreita entre as espcies testadas, alm de grande variabilidade entre os materiais, independentemente do viveiro em que foram coletados, o que permite concluir que a seleo visual, comumente realizada nos viveiros, ineficiente.

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The objective of this study was to identify DNA polymorphisms at the genes leptin, β-lactoglobulin and pituitary-specific transcription factor in three genetic groups of Holstein x Guzerat dairy cows and investigate the relationship between their genotypes and the composition and quality of milk of dairy cows. Samples were collected in August 2009, being 113 blood samples from lactating crossbred cows and 58 milk samples. For analysis of DNA polymorphisms blood samples were collected, analyzed later in the Genetic Laboratory affiliated to the Zootechny Institute of So Paulo and individual milk samples were collected according to standards established by the laboratory of Management Program of Northeast Dairy Herds (PROGEN), at Federal Rural University of Pernambuco (UFRPE) for analysis of milk composition and quality. The characterization of genotypes was performed by PCR-RFLP, for which were designed specific primers for each studied gene and restriction enzymes Kpn2I, HaeIII and HinfI that cut the DNA of the following genes: leptin, β-lactoglobulin and a PIT, respectively. The leptin estimate genotypic frequence were CC 0.112, TT 0.225 and CT 0.661, for β-lactoglobulin were AA 0.136, AB 0.323 and BB 0.539, and for PIT were ++ 0.655, -- 0.311 and +- 0.032. The results show that the population is in Hardy-Weinberg disequilibrium for leptin, β-lactoglobulin and a PIT due to excess of heterozygotes in the population, however, as these genes are associated with the milk production it is considered that the animals have genetic potential for milk production in the Brazilian semi-arid conditions. Through the characterization of the studied herd there were not found implications of the polymorphism of leptin, β-lactoglobulin and PIT in the composition and quality of milk from cows in the different genetic groups 1/2, 3/4 and 7/8 Holstein x Guzerat. Key words: β-lactoglobulin, crossbred cows, leptin, PCR-RFLP, PIT1, semi-arid.

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O objetivo deste trabalho foi caracterizar biolgica e molecularmente trs isolados de Sugarcane mosaic virus (SCMV) de lavouras de milho, analis-los filogeneticamente e discriminar polimorfismos do genoma. Plantas com sintomas de mosaico e nanismo foram coletadas em lavouras de milho, no Estado de So Paulo e no Municpio de Rio Verde, GO, e seus extratos foliares foram inoculados em plantas indicadoras e submetidos anlise sorolgica com antissoros contra o SCMV, contra o Maize dwarf mosaic virus (MDMV) e contra o Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Mudas de sorgo 'Rio' e 'TX 2786' apresentaram sintomas de mosaico aps a inoculao dos trs isolados, e o DAS-ELISA confirmou a infeco pelo SCMV. O RNA total foi extrado e usado para amplificao por transcriptase reversa seguida de reao em cadeia de polimerase (RT-PCR). Fragmentos especficos foram amplificados, submetidos anlise por polimorfismo de comprimento de fragmento de restrio (RFLP) e sequenciados. Foi possvel discriminar os gentipos de SCMV isolados de milho de outros isolados brasileiros do vrus. Alinhamentos mltiplos e anlises dos perfis filogenticos corroboram esses dados e mostram diversidade nas sequncias de nucleotdeos que codificam para a protena capsidial, o que explica o agrupamento separado desses isolados e sugere sua classificao como estirpes distintas, em lugar de simples isolados geogrficos.

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Fundao de Amparo Pesquisa do Estado de So Paulo (FAPESP)

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As doenas que afetam o sistema msculo-esqueltico acometem centenas de milhes de pessoas no mundo e esto entre as causas mais comuns de invalidez e sofrimento crnico. A doena vertebral degenerativa constitui uma exacerbao do processo de envelhecimento, podendo estar envolvidos os fatores genticos, ambientais ou leses traumticas, deformidades e doenas preexistentes. Muito se tem discutido sobre os mltiplos fatores envolvidos na degenerao discal, mas sua etiologia permanece indeterminada. Contudo, atualmente a participao da genética parece muito mais forte do que se suspeitava anteriormente. Neste artigo, abordada a participao de alguns genes no processo discognico, bem como o que isso representa para o melhor entendimento da etiopatognese da doena e na melhora de seu tratamento.

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Coordenao de Aperfeioamento de Pessoal de Nvel Superior (CAPES)

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