Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of an L-amino-acid oxidase from Lachesis muta venom

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Isolation and biochemical, functional and structural characterization of a novel L-amino acid oxidase from Lachesis muta snake venom

The aim of this study was the isolation of the LAAO from Lachesis muta venom (LmLAAO) and its biochemical, functional and structural characterization. Two different purification protocols were developed and both provided highly homogeneous and active LmLAAO. It is a homodimeric enzyme with molar mass around 120 kDa under non-reducing conditions, 60 kDa under reducing conditions in SDS-PAGE and 60852 Da by mass spectrometry. Forty amino acid residues were directly sequenced from LmLAAO and its complete cDNA was identified and characterized from an Expressed Sequence Tags data bank obtained from a venom gland. A model based on sequence homology was manually built in order to predict its three-dimensional structure. LmLAAO showed a catalytic preference for hydrophobic amino acids (K-m of 0.97 mmol/L with Leu). A mild myonecrosis was observed histologically in mice after injection of 100 mu g of LmLAAO and confirmed by a 15-fold increase in CK activity. LmLAAO induced cytotoxicity on AGS cell line (gastric adenocarcinoma, IC50: 22.7 mu g/mL) and on MCF-7 cell line (breast adenocarcinoma, IC50:1.41 mu g/mL). It presents antiparasitic activity on Leishmania brasiliensis (IC50: 2.22 mu g/nnL), but Trypanosoma cruzi was resistant to LmLAAO. In conclusion, LmLAAO showed low systemic toxicity but important in vitro pharmacological actions. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Identification and functional analysis of a novel bradykinin inhibitory peptide in the venoms of New World Crotalinae pit vipers.

A novel undecapeptide has been isolated and structurally characterized from the venoms of three species of New World pit vipers from the subfamily, Crotalinae. These include the Mexican moccasin (Agkistrodon bilineatus), the prairie rattlesnake (Crotalus viridis viridis), and the South American bushmaster (Lachesis muta). The peptide was purified from all three venoms using a combination of gel permeation chromatography and reverse-phase HPLC. Automated Edman degradation sequencing and MALDI-TOF mass spectrometry established its peptide primary structure as: Thr-Pro-Pro-Ala-Gly-Pro-Asp-Val-Gly-Pro-Arg-OH, with a non-protonated molecular mass of 1063.18 Da. A synthetic replicate of the peptide was found to be an antagonist of bradykinin action at the rat vascular B2 receptor. This is the first bradykinin inhibitory peptide isolated from snake venom. Database searching revealed the peptide to be highly structurally related (10/11 residues) with a domain residing between the bradykinin-potentiating peptide and C-type natriuretic peptide domains of a recently cloned precursor from tropical rattlesnake (Crotalus durissus terrificus) venom gland. BIP thus represents a novel biological entity from snake venom.

Composição, ecologia e história natural das serpentes de uma região de transição Amazônia - Cerrado, Mato grosso, Brasil

Este trabalho foi feito em formato de artigo de acordo com as normas da revista Biota Neotropica, foi desenvolvido na Fazenda Tanguro, localizada em uma região de transição Amazônia - Cerrado, município de Querência/ MT, com o objetivo de estudar a composição e história natural da comunidade de serpentes encontrada na região. Foram realizadas seis expedições a área de estudo, que resultaram no registro de 203 espécimes (194 capturas), distribuídos em 34 espécies, 26 gêneros e 8 famílias. Uma Estimativa baseada na incidência de espécies raras (Jackknife 1) indicou uma riqueza total de 38 espécies na área. As espécies mais abundantes foram Caudisona durissa (N=50), Philodryas olfersii (N=15), Philodryas nattereri (N=13), Xenodon rabdocephalus (N=12), Lachesis muta (N=10) e Liophis almadensis (N=10). Uma análise de Coordenadas Principais (PCO) demonstrou que as taxocenoses se sobrepõem, revelando uma tendência para a formação de três grupos distintos: taxocenoses amazônicas, Cerrado e Mata Atlântica. A composição de espécies na fazenda Tanguro apresentou-se intermediária em relação aos agrupamentos formados por espécies Amazônicas e de Cerrado, ocorrendo espécies tanto com ampla distribuição, como endêmicas dos biomas Cerrado ou Amazônico. O padrão de utilização de habitat da taxocenose é terrícola, seguido de semi-arboricolas e fossorial. Há predominância de espécies de serpentes generalistas quanto a alimentação. Na análise de agrupamentos ecológicos, foram observados quatro grupos funcionais, mostrando que a complexidade da taxocenose é explicada tanto por fatores ecológicos como históricos.

História natural e ecologia das serpentes da Floresta Nacional de Caxiuanã e áreas adjacentes, Pará, Brasil

A busca por padrões de estrutura e composição das comunidades é essencial para prover informações que permitam o manejo sustentado de populações e monitoramento de atividades antrópicas. Na região neotropical, onde ocorre grande riqueza de espécies e complexas relações ecológicas entre elas, estudos envolvendo ofidiofauna ainda são escassos, o que faz com que o entendimento dos processos responsáveis pela estruturação de suas comunidades ainda seja incipiente. No Brasil, vários trabalhos foram desenvolvidos na tentativa de explicitar os fenômenos responsáveis pelos padrões de ocorrência e interações das espécies de serpentes. Objetivando esclarecer quais os fatores que determinam os padrões observados e que afinidades (ecológicas e/ou históricas) as espécies compartilham, foi realizado estudo da taxocenose de serpentes da FLONA de Caxiuanã e áreas adjacentes, durante os anos de 2005 e 2006. Utilizou-se conjuntamente quatro métodos de amostragem (Procura Limitada por Tempo-PLT, Encontros Ocasionais-EO, Armadilhas de Interceptação e Queda-AIQ e Coletas por Terceiros-CT), em cinco áreas (IBAMA e Caquajó, no interior da FLONA de Caxiuanã; Enseada e dois pontos com influência antrópica: Marinaú e Mojuá, estando esses três últimos localizados em áreas adjacentes à FLONA. Foram registrados 378 espécimes distribuídos em cinco famílias, 35 gêneros e 50 espécies. Com os novos registros obtidos nesse estudo, o número de espécies de serpentes para a FLONA de Caxiuanã e áreas adjacentes passa de 63 para 69. Os métodos que apresentaram melhor desempenho em número de indivíduos foram PLT (199/378) e CT (159/378). EO (11/378) e AIQ (9/378) foram os métodos menos eficazes. A riqueza estimada (Jackknife 1), a partir de dados obtidos através de PLT, foi de 56 (+ ou – 4) espécies. O número de espécies estimado para as áreas preservadas foi maior que para áreas antropizadas. A composição das espécies de serpentes da área estudada apresentou maior similaridade com outras taxocenoses de áreas amazônicas. As espécies mais abundantes, acessadas através de PLT, foram Imantodes cenchoa, Corallus hortulanus e Leptodeira annulata. Quando todos os métodos foram considerados, Bothrops atrox, Imantodes cenchoa e Corallus hortulanus foram as espécies mais representadas. As áreas mais antropizadas, localizadas fora da FLONA (Marinaú e Mojuá), apresentaram menores abundância e riqueza de espécies em comparação com áreas protegidas, localizadas no interior da FLONA. Nove espécies foram consideradas potencialmente especialistas: Lachesis muta (pequenos mamíferos), Atractus schach (minhocas), Dipsas catesbyi (moluscos - lesmas), Helicops trivitatus e Hydrops triangularis (peixes), Siphlophis compressus (lagartos), Xenopholis scalaris, Taeniophallus brevirostris (anfíbios anuros) e Tantilla melanocephala (centopéias). Os itens mais acessados foram “lagartos”, “anfíbios anuros” e “pequenos mamíferos”. Serpentes com hábitos primária ou exclusivamente diurnas prevaleceram na comunidade analisada. A ausência de sazonalidade reprodutiva foi característica da maioria das espécies e isso se deve, muito provavelmente, à pouca diferença na temperatura ao longo do ano. A taxocenose de serpentes da FLONA de Caxiuanã e áreas adjacentes está, basicamente, formada por grupos contendo espécies onde, em geral, hábitos diários e de dieta estão sobrepostos. Além dos diversos fatores ecológicos, também fatores históricos, como adaptações morfológicas das espécies, têm grande influência na composição da taxocenose analisada. A grande dificuldade na realização de estudos de comunidades de serpentes está na escassez de dados das espécies, portanto torna-se imperioso que estudos de Ecologia e História Natural continuem sendo exaustivamente conduzidos em uma mesma localidade, objetivando a elucidação dos padrões de respostas aos diversos fatores relacionados à existência das espécies nos diferentes biomas.

Mutator tRNAs are encoded by the Escherichia coli mutator genes mutA and mutC: a novel pathway for mutagenesis.

We have previously described the mutator alleles mutA and mutC, which map at 95 minutes and 42 minutes, respectively, on the Escherichia coli genetic map and which stimulate transversions; the A.T-->T.A and G.C-->T.A substitutions are the most prominent. In this study we show that both mutA and mutC result from changes in the anticodon in one of four copies of the same glycine tRNA, at either the glyV or the glyW locus. This change results in a tRNA that inserts glycine at aspartic acid codons. In view of previous studies of missense suppressor tRNAs, the mistranslation of aspartic acid codons is assumed to occur at approximately 1-2%. We postulate that the mutator tRNA effect is exerted by generating a mutator polymerase and suggest that the epsilon subunit of DNA polymerase, which provides a proofreading function, is the most likely target. The implications of these findings for the contribution of mistranslation to observed spontaneous mutation rates in wild-type strains, as well as other cellular phenomena such as aging, are discussed.

Mashāriq al-uṣūl al-mutaʻalliqah bi-al-qawānīn wa-baʻḍ al-uṣūl

[Maḥmūd ibn Muḥammad].

Siyar al-mutaʼakhkhirīn: tārīkh-i mamlakat-i Hind az ibtidā-yi sanah-i 1118 h. tā 1194 h. mutābiq-i 1782 m. mubtanī bar aḥvāl-i salṭanat-i haft salāṭīn-i mutaʼakhkhirīn-i Hindūstān ʻumūman (...)

taṣnīf-i Nawwāb Sayyid Ghulām Ḥusayn Khān Ṭabāṭabāʼī ; bi-ihtimām-i ʻAbd al-Majīd.

Hādhā Mukhtaṣar yataḍammanu qawāʻid aṣlīyah min ʻilm al-mūsīqá muʼallaf fī khuṣūṣ jamīʻ al-mūsīqāt al-mutaʻalliqah bi-al-ʻasākir al-Miṣrīyah bi-ʻahd ḥaḍrat al-Khidīwī al-Aʻẓam Muḥammad Saʻīd Bāshā

Ghārdūn.

al-R add al-mubīn ʻalá jahalat al-mutaṣawwifīn

li-Wafā ibn Muḥammad Wafā al-Qūnī.

Kitāb al-Arbaʻīn ʻan arbaʻīn min arbaʻīn li-arbaʻīn fī arbaʻīn / taʼlīf al-Imām al-Ḥāfiẓ Muḥaddith al-Shām Nāṣir al-Sunnah afḍal al-Mutaʼakhkhirīn awḥad al-ʻUlamāʼ ʻAlī ibn al-Ḥasan ibn Hibat Allāh ibn ʻAbd Allāh ibn al-Ḥusayn ibn ʻAsākir al-Dimashqī al-Shāfiʻī : manuscript, 1287

Written in one column, from 17 to 23 lines per page, in black.

Hādhā kitāb al-ʻĀlim wa-al-mutaʻallim / lil-Imām al-Aʻẓam : manuscript, undated

Bound with: Baḥr al-kalām fī ʻilm al-tawḥīd / lil-Shaykh al-Imām Abū al-Muʻīn al-Nasafī (ff. 1v-25r).

Hādhihi al-Thalāthat alwāḥ al-jafrīyah al-mutaḍamminah asmāʼ mulūk Āl ʻUthmān : ibtidāʼan min al-Sulṭān ʻUthmān al-Awwal ilá al-sulṭān Muḥammad al-Akhīr al-Imām Muḥammad al-Mahdī fī ākhir al-zamān : manuscript, undated

With: Kitāb al-Talkhīṣ min mīzān al-kalimāt al-jafrīyah wa-ḥawādith al-sinīn al-hijrīyah.